Doublet Group distance statistics: 51236

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 4, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.004, 0.024, 0.045, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.024 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.004, 0.025, 0.046, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.025 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.007, 0.029, 0.052, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.029 std_dev=0.023
N3	A	0, -0.004, 0.023, 0.050, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.023 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.005, 0.034, 0.063, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.034 std_dev=0.029
C2	A	0, -0.010, 0.019, 0.048, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.019 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.008, 0.042, 0.075, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.042 std_dev=0.034
O6	A	0, -0.004, 0.030, 0.065, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.030 std_dev=0.034
C1'	A	0, -0.013, 0.022, 0.057, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.022 std_dev=0.035
N2	A	0, -0.018, 0.041, 0.101, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.041 std_dev=0.059
C2'	A	0, -0.008, 0.106, 0.220, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.106 std_dev=0.114
O4'	A	0, -0.028, 0.093, 0.214, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.093 std_dev=0.121
O2'	A	0, 0.044, 0.184, 0.325, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.184 std_dev=0.140
C4'	A	0, -0.002, 0.144, 0.291, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.144 std_dev=0.146
P	A	0, 0.112, 0.259, 0.406, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.259 std_dev=0.147
O5'	A	0, 0.067, 0.217, 0.366, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.217 std_dev=0.149
C3'	A	0, 0.007, 0.172, 0.337, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.172 std_dev=0.165
N1	B	0, 0.154, 0.324, 0.494, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.324 std_dev=0.170
C2'	B	0, 0.169, 0.339, 0.509, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.339 std_dev=0.170
C4	B	0, 0.133, 0.313, 0.493, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.313 std_dev=0.180
O2'	B	0, 0.195, 0.391, 0.586, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.391 std_dev=0.195
O3'	A	0, 0.034, 0.259, 0.484, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.259 std_dev=0.225
N3	B	0, 0.084, 0.331, 0.578, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.331 std_dev=0.247
C1'	B	0, 0.078, 0.349, 0.620, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.349 std_dev=0.271
C6	B	0, 0.112, 0.389, 0.667, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.389 std_dev=0.278
C3'	B	0, 0.124, 0.426, 0.727, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.426 std_dev=0.302
C2	B	0, 0.058, 0.366, 0.674, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.366 std_dev=0.308
N9	B	0, 0.063, 0.382, 0.702, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.382 std_dev=0.319
C5'	A	0, -0.074, 0.258, 0.590, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.258 std_dev=0.332
C5	B	0, 0.061, 0.416, 0.772, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.416 std_dev=0.356
O3'	B	0, 0.075, 0.466, 0.857, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.466 std_dev=0.391
OP2	A	0, -0.043, 0.370, 0.783, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.370 std_dev=0.413
O6	B	0, 0.029, 0.487, 0.945, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.487 std_dev=0.458
C8	B	0, -0.085, 0.547, 1.179, 2.606 max_d=2.606 avg_d=0.547 std_dev=0.632
N2	B	0, -0.148, 0.490, 1.128, 2.643 max_d=2.643 avg_d=0.490 std_dev=0.638
O4'	B	0, -0.108, 0.537, 1.182, 2.663 max_d=2.663 avg_d=0.537 std_dev=0.645
N7	B	0, -0.104, 0.576, 1.256, 2.797 max_d=2.797 avg_d=0.576 std_dev=0.680
C4'	B	0, -0.202, 0.558, 1.319, 3.091 max_d=3.091 avg_d=0.558 std_dev=0.761
OP1	A	0, -0.279, 0.520, 1.319, 3.229 max_d=3.229 avg_d=0.520 std_dev=0.799
C5'	B	0, -0.389, 0.849, 2.087, 5.006 max_d=5.006 avg_d=0.849 std_dev=1.238
O5'	B	0, -0.277, 0.982, 2.241, 5.203 max_d=5.203 avg_d=0.982 std_dev=1.259
P	B	0, -0.748, 1.041, 2.831, 7.113 max_d=7.113 avg_d=1.041 std_dev=1.789
OP2	B	0, -0.942, 1.158, 3.259, 8.336 max_d=8.336 avg_d=1.158 std_dev=2.100
OP1	B	0, -0.878, 1.227, 3.333, 8.371 max_d=8.371 avg_d=1.227 std_dev=2.105

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.09	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.38	0.06	0.07
C2	0.07	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.07	0.05	0.16	0.01	0.60	0.27	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.14	0.05	0.19	0.19	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.09	0.06	0.07	0.05	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.21	0.07	0.05	0.28	0.12
C4	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.15	0.01	0.59	0.24	0.09
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.02	0.16	0.01	0.70	0.29	0.12
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.10	0.06	0.09	0.05	0.04	0.09	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.13	0.04	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.17	0.00	0.75	0.31	0.13
C8	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.04	0.16	0.02	0.63	0.24	0.10
N1	0.05	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.07	0.03	0.17	0.00	0.69	0.30	0.11
N2	0.09	0.00	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.09	0.08	0.17	0.02	0.57	0.27	0.08
N3	0.07	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.15	0.01	0.53	0.23	0.07
N7	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.17	0.02	0.74	0.30	0.12
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.13	0.01	0.52	0.19	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04	0.07	0.02	0.09	0.13	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.06	0.07	0.12	0.07	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.11	0.07	0.09	0.06	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.23	0.09	0.20	0.32	0.19
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.08	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.03	0.34	0.09	0.12
O5'	0.04	0.16	0.14	0.21	0.15	0.01	0.16	0.01	0.17	0.16	0.17	0.17	0.15	0.17	0.13	0.06	0.23	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.03	0.16	0.00	0.81	0.33	0.16
OP1	0.38	0.60	0.19	0.05	0.59	0.09	0.70	0.04	0.75	0.63	0.69	0.57	0.53	0.74	0.52	0.12	0.20	0.34	0.01	0.81	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.27	0.19	0.28	0.24	0.01	0.29	0.01	0.31	0.24	0.30	0.27	0.23	0.30	0.19	0.07	0.32	0.09	0.01	0.33	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.09	0.05	0.12	0.09	0.03	0.12	0.01	0.13	0.10	0.11	0.08	0.07	0.12	0.07	0.03	0.19	0.12	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.18	0.23	0.10	0.29	0.18	0.23	0.16	0.27	0.07	0.26	0.15	0.31	0.14	0.22	0.43	0.22	0.21	0.22	0.41	0.26	0.18
C2	0.13	0.19	0.19	0.18	0.15	0.12	0.33	0.27	0.25	0.50	0.06	0.40	0.19	0.54	0.25	0.13	0.35	0.12	0.52	0.35	0.96	0.48	0.65
C2'	0.08	0.07	0.18	0.22	0.09	0.30	0.19	0.27	0.17	0.25	0.08	0.16	0.08	0.28	0.13	0.29	0.40	0.21	0.18	0.23	0.29	0.35	0.15
C3'	0.07	0.09	0.20	0.22	0.16	0.30	0.26	0.31	0.27	0.28	0.19	0.07	0.07	0.33	0.17	0.33	0.39	0.19	0.18	0.33	0.24	0.44	0.18
C4	0.12	0.15	0.22	0.23	0.14	0.17	0.30	0.20	0.25	0.44	0.07	0.34	0.15	0.49	0.23	0.18	0.41	0.14	0.39	0.34	0.79	0.26	0.48
C4'	0.10	0.05	0.16	0.21	0.10	0.37	0.20	0.37	0.21	0.23	0.13	0.09	0.05	0.28	0.12	0.27	0.37	0.25	0.24	0.28	0.20	0.54	0.24
C5	0.12	0.20	0.21	0.22	0.14	0.17	0.33	0.21	0.27	0.48	0.06	0.43	0.19	0.54	0.23	0.17	0.41	0.14	0.44	0.39	0.91	0.34	0.56
C5'	0.08	0.13	0.18	0.21	0.18	0.35	0.29	0.37	0.32	0.29	0.24	0.07	0.08	0.36	0.17	0.29	0.36	0.22	0.23	0.39	0.21	0.55	0.24
C6	0.12	0.25	0.19	0.20	0.13	0.14	0.34	0.25	0.28	0.51	0.05	0.52	0.23	0.58	0.24	0.14	0.38	0.13	0.53	0.41	1.05	0.49	0.69
C8	0.12	0.15	0.21	0.24	0.13	0.23	0.30	0.18	0.26	0.42	0.09	0.34	0.15	0.47	0.21	0.21	0.43	0.17	0.32	0.36	0.71	0.18	0.38
N1	0.12	0.25	0.18	0.18	0.14	0.12	0.34	0.28	0.27	0.52	0.05	0.51	0.23	0.59	0.25	0.13	0.35	0.13	0.56	0.40	1.07	0.57	0.74
N2	0.14	0.19	0.16	0.15	0.16	0.10	0.33	0.32	0.25	0.52	0.07	0.37	0.19	0.56	0.27	0.15	0.29	0.14	0.58	0.33	1.01	0.59	0.72
N3	0.13	0.14	0.21	0.22	0.15	0.15	0.30	0.22	0.24	0.45	0.07	0.30	0.14	0.48	0.24	0.16	0.39	0.13	0.42	0.32	0.80	0.31	0.51
N7	0.12	0.19	0.21	0.23	0.13	0.20	0.32	0.19	0.28	0.46	0.07	0.42	0.18	0.52	0.22	0.19	0.42	0.16	0.39	0.40	0.85	0.26	0.50
N9	0.12	0.13	0.21	0.24	0.13	0.22	0.27	0.18	0.23	0.39	0.08	0.29	0.14	0.43	0.20	0.21	0.42	0.17	0.30	0.32	0.64	0.17	0.34
O2'	0.16	0.15	0.15	0.21	0.10	0.38	0.09	0.37	0.09	0.13	0.10	0.21	0.16	0.14	0.10	0.29	0.38	0.30	0.27	0.11	0.17	0.54	0.28
O3'	0.07	0.15	0.20	0.20	0.16	0.33	0.24	0.40	0.26	0.22	0.21	0.11	0.11	0.27	0.15	0.37	0.37	0.22	0.24	0.30	0.17	0.61	0.30
O4'	0.13	0.10	0.18	0.23	0.10	0.33	0.19	0.28	0.18	0.26	0.08	0.20	0.12	0.30	0.13	0.22	0.42	0.24	0.22	0.25	0.33	0.37	0.17
O5'	0.19	0.21	0.18	0.22	0.09	0.42	0.10	0.38	0.09	0.18	0.08	0.35	0.23	0.22	0.09	0.26	0.41	0.35	0.23	0.17	0.26	0.50	0.20
O6	0.12	0.29	0.19	0.19	0.12	0.14	0.34	0.26	0.28	0.51	0.07	0.59	0.26	0.60	0.23	0.14	0.38	0.13	0.56	0.43	1.12	0.56	0.75
OP1	0.31	0.43	0.46	0.35	0.54	0.18	0.74	0.20	0.78	0.73	0.62	0.28	0.37	0.85	0.54	0.54	0.40	0.14	0.31	0.91	0.65	0.24	0.29
OP2	0.29	0.43	0.22	0.24	0.21	0.46	0.07	0.37	0.08	0.14	0.27	0.63	0.42	0.17	0.15	0.28	0.44	0.43	0.21	0.06	0.35	0.42	0.16
P	0.11	0.07	0.20	0.22	0.14	0.34	0.29	0.31	0.29	0.34	0.15	0.19	0.09	0.41	0.17	0.28	0.39	0.25	0.20	0.40	0.39	0.40	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.23	0.01	0.19	0.02	0.25	0.22	0.21
C2	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.36	0.08	0.30	0.00	0.46	0.48	0.40
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.14	0.07	0.08	0.09	0.11	0.09	0.07	0.04	0.00	0.09	0.02	0.20	0.08	0.27	0.17	0.21
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.07	0.12	0.05	0.07	0.05	0.12	0.06	0.04	0.01	0.01	0.14	0.09	0.14	0.19	0.17
C4	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.24	0.04	0.31	0.01	0.45	0.47	0.40
C4'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.06	0.02	0.16	0.05	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.17	0.03	0.36	0.01	0.57	0.60	0.49
C5'	0.07	0.10	0.14	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.16	0.20	0.13	0.08	0.09	0.21	0.12	0.11	0.19	0.02	0.01	0.18	0.03	0.08	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.20	0.05	0.37	0.00	0.60	0.65	0.52
C8	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.09	0.04	0.36	0.02	0.52	0.53	0.47
N1	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.29	0.07	0.34	0.01	0.54	0.58	0.47
N2	0.02	0.01	0.11	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.43	0.08	0.27	0.01	0.43	0.43	0.36
N3	0.02	0.00	0.09	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.36	0.07	0.27	0.01	0.40	0.40	0.34
N7	0.01	0.00	0.07	0.12	0.00	0.06	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.10	0.03	0.39	0.02	0.62	0.64	0.54
N9	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.17	0.01	0.29	0.02	0.39	0.40	0.35
O2'	0.03	0.16	0.00	0.04	0.14	0.16	0.19	0.11	0.20	0.20	0.18	0.17	0.14	0.22	0.12	0.00	0.16	0.11	0.15	0.22	0.30	0.11	0.17
O3'	0.23	0.36	0.09	0.01	0.24	0.05	0.17	0.19	0.20	0.09	0.29	0.43	0.36	0.10	0.17	0.16	0.00	0.16	0.34	0.16	0.39	0.50	0.48
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.08	0.07	0.03	0.01	0.11	0.16	0.00	0.14	0.05	0.20	0.18	0.17
O5'	0.19	0.30	0.20	0.14	0.31	0.01	0.36	0.01	0.37	0.36	0.34	0.27	0.27	0.39	0.29	0.15	0.34	0.14	0.00	0.38	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.22	0.16	0.05	0.38	0.00	0.65	0.71	0.56
OP1	0.25	0.46	0.27	0.14	0.45	0.06	0.57	0.03	0.60	0.52	0.54	0.43	0.40	0.62	0.39	0.30	0.39	0.20	0.01	0.65	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.48	0.17	0.19	0.47	0.04	0.60	0.08	0.65	0.53	0.58	0.43	0.40	0.64	0.40	0.11	0.50	0.18	0.02	0.71	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.40	0.21	0.17	0.40	0.02	0.49	0.02	0.52	0.47	0.47	0.36	0.34	0.54	0.35	0.17	0.48	0.17	0.00	0.56	0.01	0.01	0.00