Doublet Group distance statistics: 51241

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C6	A	0, -0.004, 0.008, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.008 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C5	A	0, -0.002, 0.019, 0.040, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.019 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.026, 0.048, 0.070, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.048 std_dev=0.022
C4	A	0, -0.001, 0.024, 0.050, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.024 std_dev=0.026
N9	A	0, -0.002, 0.028, 0.059, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.028 std_dev=0.030
O6	A	0, -0.009, 0.033, 0.075, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.033 std_dev=0.042
N7	A	0, -0.014, 0.033, 0.080, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.033 std_dev=0.047
C8	A	0, -0.019, 0.038, 0.096, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.038 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.091, 0.194, 0.298, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.194 std_dev=0.103
O4'	A	0, 0.042, 0.146, 0.250, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.146 std_dev=0.104
O2'	A	0, 0.110, 0.231, 0.352, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.231 std_dev=0.121
P	A	0, 0.140, 0.296, 0.453, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.296 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.094, 0.268, 0.441, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.268 std_dev=0.173
C3'	A	0, 0.114, 0.292, 0.470, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.292 std_dev=0.178
O5'	A	0, 0.047, 0.238, 0.428, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.238 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.168, 0.378, 0.587, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.378 std_dev=0.210
C2'	B	0, 0.232, 0.451, 0.670, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.451 std_dev=0.219
C5'	A	0, 0.138, 0.362, 0.586, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.362 std_dev=0.224
O4'	B	0, 0.183, 0.437, 0.692, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.437 std_dev=0.254
O3'	A	0, 0.181, 0.461, 0.741, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.461 std_dev=0.280
O2'	B	0, 0.263, 0.658, 1.054, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.658 std_dev=0.396
OP2	A	0, -0.151, 0.534, 1.219, 2.294 max_d=2.294 avg_d=0.534 std_dev=0.685
N9	B	0, -0.177, 0.668, 1.514, 2.851 max_d=2.851 avg_d=0.668 std_dev=0.846
C4'	B	0, -0.191, 0.692, 1.575, 2.992 max_d=2.992 avg_d=0.692 std_dev=0.883
OP1	A	0, -0.205, 0.683, 1.571, 2.985 max_d=2.985 avg_d=0.683 std_dev=0.888
C8	B	0, -0.210, 0.691, 1.592, 3.033 max_d=3.033 avg_d=0.691 std_dev=0.901
C3'	B	0, -0.176, 0.729, 1.635, 3.073 max_d=3.073 avg_d=0.729 std_dev=0.906
O3'	B	0, -0.470, 0.928, 2.326, 4.596 max_d=4.596 avg_d=0.928 std_dev=1.398
C5'	B	0, -0.428, 0.983, 2.394, 4.683 max_d=4.683 avg_d=0.983 std_dev=1.411
O5'	B	0, -0.383, 1.037, 2.457, 4.743 max_d=4.743 avg_d=1.037 std_dev=1.420
C4	B	0, -0.631, 1.010, 2.651, 5.308 max_d=5.308 avg_d=1.010 std_dev=1.641
N7	B	0, -0.648, 1.012, 2.672, 5.378 max_d=5.378 avg_d=1.012 std_dev=1.660
N3	B	0, -0.737, 1.130, 2.998, 6.012 max_d=6.012 avg_d=1.130 std_dev=1.867
P	B	0, -0.828, 1.095, 3.019, 6.155 max_d=6.155 avg_d=1.095 std_dev=1.923
OP2	B	0, -0.864, 1.075, 3.013, 6.167 max_d=6.167 avg_d=1.075 std_dev=1.938
C5	B	0, -0.918, 1.217, 3.352, 6.834 max_d=6.834 avg_d=1.217 std_dev=2.135
OP1	B	0, -1.039, 1.173, 3.386, 7.009 max_d=7.009 avg_d=1.173 std_dev=2.212
C2	B	0, -1.193, 1.482, 4.157, 8.502 max_d=8.502 avg_d=1.482 std_dev=2.675
N2	B	0, -1.336, 1.649, 4.634, 9.476 max_d=9.476 avg_d=1.649 std_dev=2.985
C6	B	0, -1.410, 1.597, 4.604, 9.520 max_d=9.520 avg_d=1.597 std_dev=3.007
N1	B	0, -1.520, 1.708, 4.936, 10.202 max_d=10.202 avg_d=1.708 std_dev=3.228
O6	B	0, -1.721, 1.832, 5.384, 11.204 max_d=11.204 avg_d=1.832 std_dev=3.553

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.27	0.11	0.07
C2	0.03	0.00	0.16	0.17	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.21	0.03	0.09	0.01	0.62	0.19	0.11
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.11	0.01	0.14	0.03	0.17	0.17	0.14	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.15	0.13	0.06	0.04
C3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.17	0.05	0.19	0.17	0.14	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.18	0.04	0.06	0.03
C4	0.01	0.01	0.10	0.11	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.13	0.02	0.07	0.01	0.58	0.17	0.10
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.06	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.22	0.02
C5	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.16	0.02	0.08	0.01	0.71	0.31	0.12
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.04	0.07	0.06	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.24	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.17	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.22	0.02	0.09	0.00	0.77	0.36	0.12
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.07	0.01	0.61	0.22	0.11
N1	0.03	0.01	0.17	0.19	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.24	0.03	0.09	0.01	0.72	0.29	0.12
N2	0.03	0.00	0.17	0.17	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.22	0.04	0.09	0.02	0.59	0.16	0.11
N3	0.02	0.00	0.14	0.14	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.16	0.03	0.08	0.01	0.53	0.13	0.10
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.08	0.01	0.76	0.36	0.12
N9	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.07	0.01	0.48	0.11	0.10
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.09	0.02	0.09	0.02	0.13	0.02	0.16	0.17	0.14	0.05	0.03	0.00	0.05	0.02	0.04	0.14	0.05	0.09	0.04
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.13	0.01	0.16	0.01	0.22	0.05	0.24	0.22	0.16	0.11	0.06	0.05	0.00	0.01	0.04	0.24	0.19	0.06	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.17	0.29	0.08
O5'	0.04	0.09	0.03	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.07	0.09	0.09	0.08	0.08	0.07	0.04	0.04	0.04	0.00	0.10	0.03	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.15	0.18	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.24	0.02	0.10	0.00	0.84	0.45	0.12
OP1	0.27	0.62	0.13	0.04	0.58	0.09	0.71	0.24	0.77	0.61	0.72	0.59	0.53	0.76	0.48	0.05	0.19	0.17	0.03	0.84	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.06	0.06	0.17	0.22	0.31	0.27	0.36	0.22	0.29	0.16	0.13	0.36	0.11	0.09	0.06	0.29	0.01	0.45	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.04	0.03	0.10	0.02	0.12	0.01	0.12	0.11	0.12	0.11	0.10	0.12	0.10	0.04	0.05	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	1.43	0.11	0.49	0.84	0.56	0.93	0.96	1.24	0.42	1.47	1.69	1.07	0.67	0.46	0.29	0.44	0.18	0.42	1.28	0.19	0.49	0.49
C2	0.09	1.13	0.05	0.21	0.81	0.27	0.95	0.20	1.18	0.41	1.26	1.14	0.89	0.70	0.43	0.09	0.48	0.10	0.42	1.20	0.79	0.35	0.52
C2'	0.25	0.96	0.08	0.28	0.61	0.31	0.67	0.69	0.86	0.37	1.00	1.11	0.74	0.52	0.39	0.33	0.16	0.08	0.22	0.90	0.11	0.33	0.30
C3'	0.23	1.08	0.10	0.36	0.67	0.37	0.76	0.76	1.01	0.39	1.16	1.27	0.81	0.59	0.41	0.31	0.24	0.09	0.27	1.07	0.05	0.36	0.35
C4	0.17	1.65	0.04	0.38	1.03	0.48	1.18	0.61	1.57	0.51	1.79	1.79	1.23	0.85	0.55	0.21	0.56	0.13	0.08	1.62	0.41	0.04	0.10
C4'	0.18	1.31	0.19	0.57	0.75	0.59	0.87	1.04	1.18	0.39	1.39	1.58	0.95	0.63	0.41	0.27	0.45	0.20	0.55	1.26	0.42	0.64	0.67
C5	0.16	1.81	0.03	0.38	1.13	0.46	1.37	0.52	1.86	0.58	2.07	1.95	1.32	1.00	0.60	0.18	0.65	0.12	0.18	1.99	0.55	0.16	0.27
C5'	0.17	1.52	0.20	0.63	0.87	0.64	1.02	1.07	1.41	0.44	1.65	1.83	1.08	0.74	0.47	0.26	0.57	0.21	0.54	1.53	0.43	0.62	0.65
C6	0.12	1.66	0.05	0.30	1.08	0.37	1.36	0.30	1.84	0.57	1.96	1.74	1.21	1.02	0.57	0.11	0.66	0.10	0.40	2.00	0.80	0.41	0.54
C8	0.20	1.93	0.05	0.48	1.14	0.56	1.34	0.79	1.84	0.58	2.13	2.21	1.39	0.98	0.61	0.27	0.63	0.15	0.15	1.97	0.17	0.18	0.13
N1	0.10	1.35	0.07	0.22	0.93	0.28	1.17	0.16	1.51	0.49	1.57	1.37	1.01	0.89	0.49	0.07	0.58	0.10	0.52	1.61	0.90	0.50	0.66
N2	0.07	0.63	0.09	0.11	0.48	0.13	0.56	0.15	0.67	0.25	0.70	0.62	0.50	0.43	0.26	0.07	0.35	0.11	0.61	0.67	0.90	0.49	0.69
N3	0.14	1.28	0.04	0.30	0.85	0.39	0.94	0.47	1.19	0.41	1.35	1.33	1.01	0.68	0.46	0.17	0.46	0.11	0.15	1.20	0.50	0.07	0.19
N7	0.19	1.98	0.03	0.44	1.20	0.52	1.45	0.65	2.00	0.62	2.26	2.20	1.42	1.06	0.64	0.23	0.69	0.13	0.07	2.17	0.40	0.05	0.12
N9	0.19	1.72	0.07	0.46	1.02	0.55	1.16	0.81	1.56	0.51	1.83	1.97	1.26	0.84	0.55	0.26	0.55	0.15	0.20	1.63	0.13	0.24	0.19
O2'	0.25	0.55	0.09	0.21	0.38	0.23	0.40	0.68	0.49	0.27	0.55	0.63	0.44	0.33	0.28	0.35	0.13	0.10	0.35	0.49	0.12	0.52	0.52
O3'	0.22	0.75	0.11	0.29	0.48	0.28	0.56	0.67	0.72	0.32	0.81	0.87	0.56	0.45	0.32	0.29	0.12	0.08	0.25	0.77	0.06	0.37	0.35
O4'	0.15	1.57	0.20	0.66	0.88	0.71	1.00	1.15	1.38	0.41	1.65	1.91	1.13	0.71	0.45	0.24	0.62	0.26	0.61	1.46	0.49	0.67	0.71
O5'	0.20	1.72	0.15	0.59	1.00	0.62	1.19	0.98	1.64	0.52	1.90	2.04	1.23	0.87	0.54	0.27	0.61	0.19	0.39	1.79	0.20	0.44	0.44
O6	0.12	1.69	0.07	0.29	1.10	0.35	1.42	0.24	1.94	0.59	2.04	1.78	1.22	1.08	0.58	0.08	0.71	0.10	0.48	2.19	0.90	0.53	0.66
OP1	0.60	2.30	0.27	0.30	1.58	0.33	1.87	0.71	2.41	1.11	2.63	2.56	1.74	1.56	1.07	0.61	0.40	0.23	0.10	2.67	0.09	0.22	0.21
OP2	0.30	2.13	0.10	0.47	1.24	0.55	1.41	0.91	1.96	0.60	2.32	2.56	1.55	1.00	0.68	0.51	0.53	0.16	0.33	2.12	0.14	0.40	0.39
P	0.24	1.98	0.10	0.60	1.17	0.63	1.39	0.98	1.92	0.63	2.21	2.32	1.41	1.04	0.65	0.32	0.67	0.16	0.36	2.12	0.21	0.42	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.06	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.15	0.01	0.12	0.01	0.05	0.28	0.13
C2	0.07	0.00	0.31	0.28	0.01	0.19	0.00	0.58	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.13	0.11	0.11	0.85	0.01	0.63	1.81	1.14
C2'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.19	0.02	0.12	0.14	0.18	0.10	0.25	0.35	0.31	0.03	0.04	0.00	0.01	0.03	0.45	0.16	0.45	0.55	0.48
C3'	0.02	0.28	0.00	0.00	0.14	0.00	0.06	0.01	0.12	0.15	0.21	0.35	0.27	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.09	0.33	0.07	0.21
C4	0.03	0.01	0.19	0.14	0.00	0.08	0.00	0.27	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.15	0.05	0.42	0.00	0.20	1.00	0.55
C4'	0.01	0.19	0.02	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.06	0.13	0.13	0.24	0.19	0.09	0.02	0.08	0.05	0.01	0.02	0.04	0.04	0.16	0.03
C5	0.02	0.00	0.12	0.06	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.16	0.02	0.24	0.01	0.05	0.86	0.36
C5'	0.03	0.58	0.14	0.01	0.27	0.01	0.13	0.00	0.24	0.20	0.44	0.74	0.54	0.12	0.04	0.05	0.15	0.01	0.01	0.19	0.13	0.31	0.01
C6	0.03	0.00	0.18	0.12	0.01	0.06	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.15	0.03	0.38	0.01	0.17	1.18	0.56
C8	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.13	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.15	0.10	0.17	0.02	0.28	0.17	0.13
N1	0.06	0.00	0.25	0.21	0.02	0.13	0.00	0.44	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.16	0.13	0.06	0.64	0.01	0.44	1.60	0.91
N2	0.09	0.00	0.35	0.35	0.02	0.24	0.01	0.74	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.09	0.13	1.07	0.01	0.92	2.26	1.48
N3	0.06	0.01	0.31	0.27	0.01	0.19	0.00	0.54	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.12	0.13	0.81	0.00	0.55	1.53	1.00
N7	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.16	0.08	0.09	0.02	0.23	0.39	0.03
N9	0.00	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.11	0.15	0.02	0.13	0.01	0.04	0.48	0.19
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.14	0.08	0.18	0.05	0.19	0.15	0.16	0.12	0.11	0.19	0.11	0.00	0.05	0.03	0.40	0.22	0.40	0.58	0.45
O3'	0.15	0.11	0.01	0.00	0.15	0.05	0.16	0.15	0.15	0.15	0.13	0.09	0.12	0.16	0.15	0.05	0.00	0.07	0.05	0.17	0.09	0.24	0.04
O4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.06	0.13	0.13	0.08	0.02	0.03	0.07	0.00	0.08	0.02	0.20	0.07	0.08
O5'	0.12	0.85	0.45	0.23	0.42	0.02	0.24	0.01	0.38	0.17	0.64	1.07	0.81	0.09	0.13	0.40	0.05	0.08	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.16	0.09	0.00	0.04	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.17	0.02	0.29	0.00	0.09	1.10	0.47
OP1	0.05	0.63	0.45	0.33	0.20	0.04	0.05	0.13	0.17	0.28	0.44	0.92	0.55	0.23	0.04	0.40	0.09	0.20	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	1.81	0.55	0.07	1.00	0.16	0.86	0.31	1.18	0.17	1.60	2.26	1.53	0.39	0.48	0.58	0.24	0.07	0.01	1.10	0.01	0.00	0.00
P	0.13	1.14	0.48	0.21	0.55	0.03	0.36	0.01	0.56	0.13	0.91	1.48	1.00	0.03	0.19	0.45	0.04	0.08	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00