Doublet Group distance statistics: 51246

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.016, 0.039, 0.062, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.039 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.006, 0.031, 0.056, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.031 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.015, 0.042, 0.070, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.042 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.021, 0.050, 0.079, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.050 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.063, 0.182, 0.300, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.182 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.054, 0.184, 0.313, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.184 std_dev=0.129
C4'	A	0, 0.025, 0.202, 0.380, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.202 std_dev=0.177
O2'	A	0, 0.058, 0.266, 0.474, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.266 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.112, 0.321, 0.530, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.321 std_dev=0.209
O3'	A	0, 0.166, 0.478, 0.790, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.478 std_dev=0.312
C5'	A	0, 0.106, 0.426, 0.745, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.426 std_dev=0.319
O5'	A	0, 0.100, 0.445, 0.790, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.445 std_dev=0.345
O2'	B	0, 0.161, 0.514, 0.868, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.514 std_dev=0.354
C2'	B	0, 0.103, 0.460, 0.816, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.460 std_dev=0.356
OP2	A	0, 0.052, 0.464, 0.875, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.464 std_dev=0.411
N3	B	0, 0.131, 0.549, 0.967, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.549 std_dev=0.418
P	A	0, 0.063, 0.497, 0.931, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.497 std_dev=0.434
C1'	B	0, 0.134, 0.583, 1.032, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.583 std_dev=0.449
C2	B	0, 0.083, 0.609, 1.136, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.609 std_dev=0.526
OP1	A	0, 0.098, 0.675, 1.252, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.675 std_dev=0.577
C3'	B	0, 0.113, 0.729, 1.345, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.729 std_dev=0.616
C4	B	0, 0.020, 0.705, 1.391, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.705 std_dev=0.685
N9	B	0, 0.032, 0.772, 1.513, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.772 std_dev=0.741
N2	B	0, 0.032, 0.807, 1.583, 2.039 max_d=2.039 avg_d=0.807 std_dev=0.775
N1	B	0, -0.100, 0.847, 1.795, 2.426 max_d=2.426 avg_d=0.847 std_dev=0.947
O4'	B	0, 0.067, 1.136, 2.204, 2.549 max_d=2.549 avg_d=1.136 std_dev=1.068
C4'	B	0, 0.099, 1.174, 2.249, 2.485 max_d=2.485 avg_d=1.174 std_dev=1.075
C5	B	0, -0.314, 1.071, 2.456, 3.445 max_d=3.445 avg_d=1.071 std_dev=1.385
O3'	B	0, -0.175, 1.230, 2.636, 3.560 max_d=3.560 avg_d=1.230 std_dev=1.405
C8	B	0, -0.298, 1.174, 2.647, 3.689 max_d=3.689 avg_d=1.174 std_dev=1.473
C5'	B	0, 0.128, 1.657, 3.187, 3.636 max_d=3.636 avg_d=1.657 std_dev=1.530
C6	B	0, -0.371, 1.167, 2.705, 3.802 max_d=3.802 avg_d=1.167 std_dev=1.538
O5'	B	0, 0.118, 1.782, 3.446, 4.191 max_d=4.191 avg_d=1.782 std_dev=1.664
N7	B	0, -0.536, 1.370, 3.276, 4.654 max_d=4.654 avg_d=1.370 std_dev=1.906
O6	B	0, -0.601, 1.555, 3.710, 5.257 max_d=5.257 avg_d=1.555 std_dev=2.156
P	B	0, -0.317, 2.240, 4.797, 6.450 max_d=6.450 avg_d=2.240 std_dev=2.557
OP2	B	0, -0.481, 2.397, 5.275, 7.274 max_d=7.274 avg_d=2.397 std_dev=2.878
OP1	B	0, -0.543, 2.370, 5.282, 7.264 max_d=7.264 avg_d=2.370 std_dev=2.913

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.09	0.05
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.05	0.05	0.01	0.05	0.14	0.06
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.08	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.10	0.08	0.08	0.06	0.11	0.07	0.02	0.00	0.01	0.03	0.12	0.07	0.08	0.04
C4	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.04	0.06	0.01	0.06	0.13	0.07
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.06	0.06	0.02	0.09	0.17	0.09
C5'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.06	0.02	0.07	0.04	0.02	0.01	0.04	0.11	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.05	0.07	0.01	0.09	0.17	0.09
C8	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.07	0.07	0.02	0.09	0.15	0.11
N1	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.10	0.06	0.05	0.01	0.07	0.16	0.08
N2	0.02	0.01	0.08	0.08	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.10	0.09	0.04	0.06	0.01	0.05	0.14	0.05
N3	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.04	0.05	0.01	0.05	0.12	0.05
N7	0.03	0.01	0.03	0.11	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.14	0.07	0.06	0.03	0.12	0.18	0.12
N9	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.07	0.03	0.07	0.01	0.07	0.12	0.07
O2'	0.03	0.09	0.00	0.02	0.06	0.07	0.04	0.07	0.04	0.04	0.07	0.10	0.09	0.04	0.04	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03	0.12	0.06	0.05
O3'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.08	0.01	0.12	0.04	0.13	0.12	0.10	0.09	0.07	0.14	0.07	0.03	0.00	0.01	0.05	0.16	0.12	0.14	0.07
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.05	0.07	0.06	0.04	0.04	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.08	0.07	0.03
O5'	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.02	0.06	0.01	0.07	0.07	0.05	0.06	0.05	0.06	0.07	0.05	0.05	0.03	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01
O6	0.00	0.01	0.04	0.12	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.16	0.05	0.07	0.00	0.12	0.18	0.11
OP1	0.06	0.05	0.04	0.07	0.06	0.09	0.09	0.11	0.09	0.09	0.07	0.05	0.05	0.12	0.07	0.12	0.12	0.08	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00
OP2	0.09	0.14	0.07	0.08	0.13	0.04	0.17	0.03	0.17	0.15	0.16	0.14	0.12	0.18	0.12	0.06	0.14	0.07	0.03	0.18	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.06	0.05	0.04	0.07	0.02	0.09	0.02	0.09	0.11	0.08	0.05	0.05	0.12	0.07	0.05	0.07	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.19	0.18	0.21	0.42	0.09	0.71	0.12	0.68	0.73	0.41	0.40	0.17	0.86	0.43	0.31	0.45	0.10	0.30	0.81	1.42	1.02	0.79
C2	0.32	0.18	0.25	0.38	0.11	0.52	0.14	0.69	0.05	0.32	0.10	0.32	0.13	0.26	0.25	0.50	1.11	0.82	0.67	0.06	0.18	0.40	0.60
C2'	0.11	0.18	0.17	0.17	0.48	0.16	0.89	0.25	0.84	1.00	0.44	0.50	0.21	1.17	0.56	0.13	0.16	0.09	0.43	1.04	1.76	1.30	1.09
C3'	0.16	0.19	0.17	0.16	0.65	0.10	1.18	0.34	1.19	1.22	0.68	0.48	0.16	1.49	0.69	0.12	0.11	0.09	0.60	1.48	2.00	1.61	1.34
C4	0.16	0.19	0.25	0.34	0.16	0.33	0.30	0.32	0.33	0.29	0.26	0.27	0.12	0.36	0.15	0.49	0.84	0.51	0.25	0.41	0.63	0.31	0.12
C4'	0.20	0.23	0.14	0.14	0.68	0.07	1.19	0.38	1.25	1.13	0.76	0.47	0.17	1.41	0.68	0.16	0.20	0.17	0.63	1.50	1.94	1.61	1.31
C5	0.18	0.21	0.26	0.35	0.17	0.39	0.32	0.43	0.38	0.27	0.32	0.24	0.10	0.36	0.14	0.48	0.89	0.58	0.34	0.46	0.47	0.20	0.11
C5'	0.20	0.29	0.14	0.15	0.68	0.07	1.20	0.37	1.33	1.11	0.87	0.38	0.19	1.41	0.66	0.18	0.24	0.17	0.64	1.65	1.95	1.65	1.31
C6	0.26	0.19	0.25	0.37	0.07	0.50	0.16	0.65	0.21	0.19	0.23	0.28	0.09	0.20	0.14	0.48	1.00	0.73	0.57	0.26	0.06	0.22	0.45
C8	0.08	0.23	0.24	0.31	0.38	0.24	0.65	0.14	0.71	0.58	0.51	0.17	0.12	0.75	0.33	0.41	0.66	0.32	0.10	0.86	1.08	0.74	0.47
N1	0.31	0.17	0.25	0.38	0.08	0.55	0.11	0.76	0.05	0.30	0.12	0.32	0.09	0.24	0.23	0.48	1.09	0.83	0.72	0.07	0.26	0.47	0.69
N2	0.40	0.19	0.24	0.39	0.27	0.60	0.35	0.89	0.27	0.56	0.17	0.32	0.16	0.52	0.42	0.44	1.23	0.96	0.91	0.31	0.58	0.77	0.95
N3	0.24	0.20	0.25	0.35	0.01	0.38	0.09	0.43	0.10	0.20	0.14	0.32	0.17	0.18	0.13	0.52	0.95	0.63	0.39	0.14	0.39	0.12	0.21
N7	0.13	0.25	0.26	0.34	0.30	0.33	0.51	0.31	0.59	0.43	0.46	0.17	0.12	0.58	0.24	0.45	0.78	0.46	0.18	0.72	0.76	0.46	0.19
N9	0.07	0.20	0.23	0.29	0.31	0.21	0.54	0.10	0.57	0.53	0.39	0.29	0.13	0.65	0.30	0.42	0.66	0.31	0.11	0.69	1.07	0.70	0.46
O2'	0.27	0.22	0.19	0.17	0.54	0.16	0.94	0.52	0.79	1.23	0.33	0.58	0.25	1.33	0.72	0.08	0.09	0.27	0.71	0.97	2.11	1.58	1.43
O3'	0.25	0.18	0.16	0.13	0.75	0.12	1.38	0.53	1.37	1.48	0.75	0.50	0.16	1.80	0.83	0.11	0.17	0.24	0.83	1.75	2.38	1.98	1.70
O4'	0.13	0.22	0.14	0.18	0.53	0.02	0.86	0.23	0.89	0.81	0.58	0.42	0.14	0.99	0.51	0.27	0.42	0.08	0.44	1.03	1.56	1.22	0.95
O5'	0.09	0.25	0.14	0.16	0.56	0.09	1.03	0.19	1.15	0.96	0.75	0.37	0.14	1.23	0.54	0.21	0.31	0.05	0.44	1.46	1.72	1.40	1.07
O6	0.26	0.21	0.24	0.37	0.08	0.53	0.16	0.72	0.22	0.19	0.25	0.30	0.09	0.19	0.15	0.46	1.01	0.76	0.64	0.28	0.10	0.31	0.56
OP1	0.08	0.23	0.11	0.12	0.54	0.09	1.02	0.23	1.17	0.95	0.75	0.39	0.13	1.25	0.52	0.17	0.24	0.03	0.49	1.55	1.83	1.53	1.17
OP2	0.15	0.32	0.20	0.25	0.54	0.15	0.94	0.07	1.07	0.85	0.77	0.12	0.18	1.10	0.50	0.30	0.52	0.19	0.34	1.35	1.49	1.20	0.85
P	0.12	0.29	0.15	0.18	0.56	0.07	0.99	0.16	1.14	0.90	0.78	0.23	0.16	1.17	0.52	0.25	0.41	0.09	0.43	1.44	1.66	1.37	1.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.28	0.01	0.13	0.02	0.84	0.48	0.39
C2	0.04	0.00	0.25	0.19	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.26	0.17	0.31	0.01	1.03	0.79	0.57
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.02	0.09	0.19	0.13	0.13	0.20	0.30	0.24	0.09	0.03	0.00	0.04	0.01	0.12	0.10	1.09	0.45	0.52
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.23	0.00	0.32	0.02	0.32	0.35	0.25	0.17	0.16	0.38	0.23	0.01	0.00	0.03	0.29	0.36	0.43	0.16	0.05
C4	0.02	0.00	0.14	0.23	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.10	0.12	0.23	0.01	1.03	0.69	0.52
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.09	0.05	0.09	0.06	0.07	0.03	0.31	0.01	0.00	0.01	0.03	0.27	0.15	0.10
C5	0.01	0.00	0.09	0.32	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.10	0.10	0.21	0.01	1.11	0.72	0.56
C5'	0.09	0.18	0.19	0.02	0.13	0.01	0.13	0.00	0.16	0.05	0.18	0.19	0.16	0.08	0.09	0.11	0.23	0.02	0.02	0.16	0.05	0.04	0.02
C6	0.01	0.00	0.13	0.32	0.01	0.03	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.09	0.13	0.25	0.01	1.12	0.78	0.59
C8	0.02	0.01	0.13	0.35	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.30	0.23	0.06	0.09	0.02	1.09	0.54	0.47
N1	0.03	0.01	0.20	0.25	0.01	0.05	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.12	0.17	0.30	0.01	1.10	0.82	0.60
N2	0.05	0.00	0.30	0.17	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.31	0.37	0.19	0.34	0.01	1.00	0.80	0.56
N3	0.05	0.00	0.24	0.16	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.30	0.16	0.28	0.01	0.99	0.72	0.52
N7	0.02	0.01	0.09	0.38	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.26	0.05	0.13	0.02	1.12	0.62	0.52
N9	0.00	0.01	0.03	0.23	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.03	0.04	0.14	0.02	1.00	0.58	0.47
O2'	0.02	0.24	0.00	0.01	0.16	0.31	0.21	0.11	0.20	0.30	0.19	0.31	0.24	0.31	0.16	0.00	0.06	0.21	0.11	0.24	0.93	0.42	0.38
O3'	0.28	0.26	0.04	0.00	0.10	0.01	0.10	0.23	0.09	0.23	0.12	0.37	0.30	0.26	0.03	0.06	0.00	0.19	0.45	0.16	0.06	0.39	0.29
O4'	0.01	0.17	0.01	0.03	0.12	0.00	0.10	0.02	0.13	0.06	0.17	0.19	0.16	0.05	0.04	0.21	0.19	0.00	0.15	0.13	0.48	0.41	0.24
O5'	0.13	0.31	0.12	0.29	0.23	0.01	0.21	0.02	0.25	0.09	0.30	0.34	0.28	0.13	0.14	0.11	0.45	0.15	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.36	0.01	0.03	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.24	0.16	0.13	0.24	0.00	1.14	0.77	0.60
OP1	0.84	1.03	1.09	0.43	1.03	0.27	1.11	0.05	1.12	1.09	1.10	1.00	0.99	1.12	1.00	0.93	0.06	0.48	0.01	1.14	0.00	0.02	0.01
OP2	0.48	0.79	0.45	0.16	0.69	0.15	0.72	0.04	0.78	0.54	0.82	0.80	0.72	0.62	0.58	0.42	0.39	0.41	0.01	0.77	0.02	0.00	0.00
P	0.39	0.57	0.52	0.05	0.52	0.10	0.56	0.02	0.59	0.47	0.60	0.56	0.52	0.52	0.47	0.38	0.29	0.24	0.01	0.60	0.01	0.00	0.00