Doublet Group distance statistics: 51251

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.004, 0.042, 0.079, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.042 std_dev=0.037
C2'	B	0, 0.081, 0.345, 0.609, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.345 std_dev=0.264
O2'	B	0, 0.104, 0.411, 0.717, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.411 std_dev=0.306
O3'	B	0, 0.083, 0.399, 0.716, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.399 std_dev=0.316
C3'	B	0, 0.089, 0.410, 0.731, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.410 std_dev=0.321
C1'	B	0, 0.163, 0.651, 1.139, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.651 std_dev=0.488
C4'	B	0, 0.184, 0.787, 1.390, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.787 std_dev=0.603
O2'	A	0, -0.017, 0.598, 1.214, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.598 std_dev=0.616
O4'	B	0, 0.215, 0.844, 1.473, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.844 std_dev=0.629
C2'	A	0, -0.016, 0.640, 1.296, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.640 std_dev=0.656
O4'	A	0, -0.040, 0.647, 1.334, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.647 std_dev=0.687
N9	B	0, 0.099, 0.945, 1.790, 2.053 max_d=2.053 avg_d=0.945 std_dev=0.846
C5'	B	0, 0.236, 1.187, 2.138, 2.329 max_d=2.329 avg_d=1.187 std_dev=0.951
C4'	A	0, -0.039, 0.999, 2.038, 2.431 max_d=2.431 avg_d=0.999 std_dev=1.038
C4	B	0, 0.095, 1.162, 2.230, 2.578 max_d=2.578 avg_d=1.162 std_dev=1.068
N3	B	0, 0.119, 1.193, 2.267, 2.604 max_d=2.604 avg_d=1.193 std_dev=1.074
C3'	A	0, -0.040, 1.049, 2.137, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.049 std_dev=1.088
O5'	B	0, 0.189, 1.292, 2.395, 2.695 max_d=2.695 avg_d=1.292 std_dev=1.103
C8	B	0, 0.016, 1.149, 2.283, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.149 std_dev=1.134
C5	B	0, 0.055, 1.440, 2.824, 3.309 max_d=3.309 avg_d=1.440 std_dev=1.385
C2	B	0, 0.116, 1.520, 2.923, 3.385 max_d=3.385 avg_d=1.520 std_dev=1.403
N7	B	0, -0.008, 1.413, 2.835, 3.359 max_d=3.359 avg_d=1.413 std_dev=1.422
O3'	A	0, -0.019, 1.456, 2.930, 3.477 max_d=3.477 avg_d=1.456 std_dev=1.475
N2	B	0, 0.114, 1.657, 3.199, 3.714 max_d=3.714 avg_d=1.657 std_dev=1.542
N1	B	0, 0.110, 1.771, 3.433, 3.994 max_d=3.994 avg_d=1.771 std_dev=1.662
C6	B	0, 0.075, 1.757, 3.439, 4.025 max_d=4.025 avg_d=1.757 std_dev=1.682
OP2	B	0, -0.130, 1.555, 3.240, 3.897 max_d=3.897 avg_d=1.555 std_dev=1.685
P	B	0, -0.309, 1.384, 3.077, 3.768 max_d=3.768 avg_d=1.384 std_dev=1.693
OP1	B	0, 0.112, 1.808, 3.504, 4.077 max_d=4.077 avg_d=1.808 std_dev=1.696
C5'	A	0, -0.092, 1.605, 3.303, 3.954 max_d=3.954 avg_d=1.605 std_dev=1.698
O5'	A	0, -0.131, 1.697, 3.526, 4.236 max_d=4.236 avg_d=1.697 std_dev=1.829
O6	B	0, 0.064, 2.043, 4.023, 4.723 max_d=4.723 avg_d=2.043 std_dev=1.980
OP2	A	0, -0.751, 2.099, 4.948, 6.127 max_d=6.127 avg_d=2.099 std_dev=2.850
P	A	0, -0.598, 2.303, 5.203, 6.394 max_d=6.394 avg_d=2.303 std_dev=2.901
OP1	A	0, -0.838, 3.011, 6.860, 8.444 max_d=8.444 avg_d=3.011 std_dev=3.849

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.13	0.01	0.23	0.27	0.35
C2	0.04	0.00	0.25	0.09	0.00	0.25	0.01	0.49	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.16	0.36	0.57	0.03	1.19	0.98	1.16
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.03	0.05	0.02	0.11	0.15	0.19	0.29	0.24	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.09	0.11	0.08	0.11
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.08	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.05	0.30	0.12	0.09
C4	0.02	0.00	0.13	0.04	0.00	0.13	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.07	0.19	0.41	0.01	0.80	0.74	0.86
C4'	0.00	0.25	0.03	0.01	0.13	0.00	0.08	0.00	0.13	0.09	0.21	0.30	0.22	0.03	0.02	0.13	0.04	0.00	0.01	0.11	0.05	0.01	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.08	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.09	0.37	0.01	0.80	0.78	0.84
C5'	0.04	0.49	0.02	0.02	0.29	0.00	0.24	0.00	0.33	0.08	0.45	0.57	0.43	0.05	0.11	0.12	0.08	0.02	0.00	0.30	0.02	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.11	0.05	0.00	0.13	0.00	0.33	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.16	0.45	0.01	1.03	0.94	1.02
C8	0.02	0.00	0.15	0.06	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.10	0.19	0.06	0.01	0.23	0.31	0.31
N1	0.02	0.01	0.19	0.08	0.00	0.21	0.00	0.45	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.14	0.28	0.55	0.01	1.20	1.03	1.16
N2	0.05	0.01	0.29	0.10	0.00	0.30	0.02	0.57	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.32	0.19	0.43	0.63	0.04	1.32	1.04	1.25
N3	0.04	0.00	0.24	0.08	0.00	0.22	0.01	0.43	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.14	0.35	0.51	0.02	1.00	0.84	1.02
N7	0.02	0.01	0.08	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.09	0.17	0.01	0.47	0.53	0.53
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.22	0.01	0.44	0.46	0.54
O2'	0.04	0.26	0.01	0.03	0.13	0.13	0.06	0.12	0.12	0.11	0.20	0.32	0.26	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.07	0.09	0.27	0.03	0.04
O3'	0.02	0.16	0.02	0.00	0.07	0.04	0.04	0.08	0.08	0.10	0.14	0.19	0.14	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.14	0.07	0.67	0.33	0.35
O4'	0.00	0.36	0.02	0.01	0.19	0.00	0.09	0.02	0.16	0.19	0.28	0.43	0.35	0.09	0.01	0.09	0.02	0.00	0.07	0.11	0.29	0.22	0.32
O5'	0.13	0.57	0.07	0.05	0.41	0.01	0.37	0.00	0.45	0.06	0.55	0.63	0.51	0.17	0.22	0.07	0.14	0.07	0.00	0.42	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.03	0.09	0.05	0.01	0.11	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.07	0.11	0.42	0.00	1.03	0.94	0.99
OP1	0.23	1.19	0.11	0.30	0.80	0.05	0.80	0.02	1.03	0.23	1.20	1.32	1.00	0.47	0.44	0.27	0.67	0.29	0.01	1.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.98	0.08	0.12	0.74	0.01	0.78	0.02	0.94	0.31	1.03	1.04	0.84	0.53	0.46	0.03	0.33	0.22	0.01	0.94	0.01	0.00	0.00
P	0.35	1.16	0.11	0.09	0.86	0.06	0.84	0.01	1.02	0.31	1.16	1.25	1.02	0.53	0.54	0.04	0.35	0.32	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.25	0.08	0.30	0.16	0.62	0.30	0.98	0.18	0.64	0.14	0.46	0.15	0.57	0.36	0.11	0.11	0.59	0.99	0.25	2.07	1.20	1.51
C2	0.25	0.42	0.06	0.27	0.06	0.64	0.02	0.83	0.13	0.37	0.33	0.61	0.30	0.25	0.18	0.07	0.16	0.54	0.80	0.11	1.51	0.60	1.00
C2'	0.83	0.37	0.54	0.76	0.72	1.12	0.89	1.52	0.77	1.22	0.52	0.20	0.44	1.18	0.92	0.30	0.49	1.13	1.50	0.86	2.54	1.76	2.06
C3'	0.68	0.13	0.35	0.54	0.52	0.97	0.68	1.36	0.53	1.06	0.26	0.20	0.21	1.00	0.75	0.14	0.25	1.02	1.36	0.62	2.42	1.61	1.94
C4	0.30	0.36	0.09	0.31	0.04	0.69	0.14	0.97	0.05	0.50	0.26	0.58	0.24	0.40	0.28	0.07	0.17	0.61	0.93	0.05	1.84	0.90	1.28
C4'	0.18	0.47	0.16	0.09	0.05	0.46	0.11	0.82	0.05	0.52	0.33	0.72	0.34	0.44	0.22	0.30	0.21	0.49	0.89	0.02	2.02	1.16	1.49
C5	0.28	0.46	0.07	0.30	0.05	0.69	0.04	0.96	0.13	0.43	0.36	0.69	0.31	0.32	0.22	0.08	0.18	0.61	0.89	0.10	1.76	0.79	1.20
C5'	0.19	0.88	0.45	0.27	0.40	0.25	0.28	0.60	0.46	0.26	0.76	1.15	0.72	0.17	0.17	0.56	0.49	0.28	0.68	0.40	1.83	0.90	1.28
C6	0.24	0.55	0.06	0.26	0.14	0.67	0.08	0.88	0.25	0.32	0.48	0.78	0.40	0.19	0.15	0.09	0.18	0.57	0.81	0.24	1.57	0.60	1.02
C8	0.31	0.36	0.09	0.32	0.06	0.70	0.17	1.02	0.04	0.55	0.25	0.61	0.23	0.46	0.31	0.08	0.17	0.64	0.97	0.07	1.98	1.03	1.40
N1	0.23	0.54	0.06	0.24	0.15	0.63	0.10	0.81	0.26	0.29	0.46	0.74	0.39	0.16	0.13	0.09	0.17	0.54	0.76	0.24	1.44	0.50	0.92
N2	0.22	0.40	0.06	0.23	0.08	0.57	0.02	0.69	0.15	0.30	0.33	0.56	0.30	0.19	0.14	0.06	0.15	0.47	0.71	0.13	1.28	0.44	0.82
N3	0.30	0.32	0.09	0.31	0.06	0.67	0.15	0.93	0.05	0.50	0.22	0.52	0.21	0.40	0.28	0.06	0.17	0.59	0.91	0.07	1.74	0.84	1.22
N7	0.29	0.45	0.08	0.31	0.02	0.71	0.08	1.00	0.10	0.48	0.35	0.69	0.30	0.36	0.25	0.08	0.18	0.64	0.93	0.07	1.87	0.89	1.29
N9	0.31	0.31	0.09	0.32	0.09	0.68	0.21	1.01	0.08	0.58	0.20	0.54	0.20	0.49	0.33	0.08	0.16	0.62	0.98	0.13	1.98	1.06	1.42
O2'	0.84	0.52	0.60	0.82	0.84	1.08	1.03	1.51	0.94	1.32	0.69	0.33	0.56	1.31	1.00	0.31	0.55	1.10	1.54	1.04	2.65	1.95	2.17
O3'	0.88	0.37	0.52	0.70	0.77	1.13	0.97	1.54	0.83	1.33	0.54	0.14	0.45	1.29	1.00	0.28	0.36	1.22	1.55	0.93	2.61	1.90	2.19
O4'	0.13	0.70	0.34	0.16	0.30	0.21	0.17	0.55	0.33	0.23	0.58	0.93	0.58	0.14	0.10	0.48	0.35	0.20	0.62	0.27	1.76	0.84	1.18
O5'	0.23	0.96	0.49	0.29	0.46	0.32	0.34	0.67	0.54	0.28	0.85	1.25	0.79	0.19	0.23	0.60	0.51	0.35	0.71	0.49	1.83	0.83	1.26
O6	0.22	0.64	0.06	0.24	0.21	0.65	0.16	0.85	0.35	0.26	0.57	0.87	0.46	0.12	0.11	0.10	0.18	0.56	0.77	0.34	1.51	0.51	0.94
OP1	0.76	1.90	1.20	0.95	1.24	0.29	1.12	0.15	1.41	0.49	1.79	2.26	1.64	0.67	0.83	1.26	1.23	0.25	0.25	1.37	1.39	0.30	0.81
OP2	0.48	1.58	0.89	0.63	0.95	0.02	0.83	0.42	1.11	0.24	1.47	1.93	1.34	0.42	0.56	0.96	0.88	0.02	0.42	1.07	1.51	0.44	0.92
P	0.73	1.77	1.12	0.87	1.17	0.26	1.04	0.16	1.31	0.47	1.66	2.10	1.54	0.63	0.79	1.20	1.11	0.25	0.21	1.26	1.35	0.27	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.08	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.04	0.63	0.25
C2	0.06	0.00	0.13	0.21	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.26	0.06	0.24	0.00	0.18	0.64	0.24
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.10	0.15	0.14	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.27	0.05	0.27	0.38	0.04
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.11	0.01	0.07	0.03	0.12	0.11	0.18	0.24	0.19	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.39	0.11	0.45	0.21	0.21
C4	0.03	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.02	0.25	0.00	0.18	0.65	0.25
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.08	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.16	0.45	0.09
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.29	0.00	0.28	0.63	0.27
C5'	0.01	0.11	0.02	0.03	0.07	0.01	0.07	0.00	0.10	0.03	0.12	0.12	0.09	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.16	0.34	0.01
C6	0.03	0.00	0.06	0.12	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.01	0.29	0.01	0.32	0.60	0.27
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.13	0.04	0.30	0.01	0.23	0.65	0.26
N1	0.04	0.00	0.10	0.18	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.22	0.03	0.27	0.00	0.27	0.62	0.26
N2	0.08	0.00	0.15	0.24	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.31	0.08	0.23	0.01	0.14	0.63	0.23
N3	0.06	0.01	0.14	0.19	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.22	0.06	0.22	0.00	0.13	0.64	0.23
N7	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.31	0.01	0.33	0.61	0.27
N9	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.23	0.00	0.14	0.65	0.25
O2'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.13	0.02	0.30	0.41	0.07
O3'	0.02	0.26	0.02	0.00	0.12	0.01	0.08	0.03	0.14	0.13	0.22	0.31	0.22	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.40	0.13	0.70	0.17	0.38
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.08	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.12	0.01	0.14	0.71	0.36
O5'	0.09	0.24	0.27	0.39	0.25	0.01	0.29	0.01	0.29	0.30	0.27	0.23	0.22	0.31	0.23	0.13	0.40	0.12	0.00	0.29	0.01	0.03	0.00
O6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.13	0.01	0.29	0.00	0.40	0.56	0.28
OP1	0.04	0.18	0.27	0.45	0.18	0.16	0.28	0.16	0.32	0.23	0.27	0.14	0.13	0.33	0.14	0.30	0.70	0.14	0.01	0.40	0.00	0.02	0.01
OP2	0.63	0.64	0.38	0.21	0.65	0.45	0.63	0.34	0.60	0.65	0.62	0.63	0.64	0.61	0.65	0.41	0.17	0.71	0.03	0.56	0.02	0.00	0.00
P	0.25	0.24	0.04	0.21	0.25	0.09	0.27	0.01	0.27	0.26	0.26	0.23	0.23	0.27	0.25	0.07	0.38	0.36	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00