Doublet Group distance statistics: 51255

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.001, 0.022, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.006, 0.029, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.007, 0.032, 0.057, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.032 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.010, 0.036, 0.061, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.036 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.041 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.013, 0.049, 0.084, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.049 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.006, 0.046, 0.085, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.046 std_dev=0.039
N9	A	0, -0.006, 0.034, 0.073, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.034 std_dev=0.039
N2	A	0, 0.009, 0.056, 0.103, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.056 std_dev=0.047
C2'	A	0, -0.084, 0.384, 0.852, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.384 std_dev=0.468
O4'	B	0, 0.207, 0.709, 1.210, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.709 std_dev=0.502
C1'	B	0, 0.207, 0.709, 1.210, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.709 std_dev=0.502
O5'	B	0, 0.199, 0.711, 1.223, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.711 std_dev=0.512
C4'	B	0, 0.219, 0.766, 1.312, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.766 std_dev=0.546
O4'	A	0, -0.158, 0.419, 0.995, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.419 std_dev=0.576
O2'	B	0, 0.226, 0.803, 1.380, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.803 std_dev=0.577
O2'	A	0, -0.087, 0.496, 1.079, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.496 std_dev=0.583
C2'	B	0, 0.245, 0.840, 1.436, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.840 std_dev=0.595
P	B	0, 0.103, 0.719, 1.336, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.719 std_dev=0.616
C3'	B	0, 0.255, 0.872, 1.488, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.872 std_dev=0.617
O3'	B	0, 0.221, 0.886, 1.552, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.886 std_dev=0.665
N9	B	0, 0.213, 0.892, 1.571, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.892 std_dev=0.679
C5'	B	0, 0.269, 0.961, 1.654, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.961 std_dev=0.692
C8	B	0, 0.196, 0.909, 1.622, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.909 std_dev=0.713
C3'	A	0, -0.199, 0.621, 1.441, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.621 std_dev=0.820
C4'	A	0, -0.250, 0.697, 1.644, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.697 std_dev=0.947
N7	B	0, 0.285, 1.235, 2.185, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.235 std_dev=0.950
O5'	A	0, 0.383, 1.338, 2.292, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.338 std_dev=0.955
O3'	A	0, -0.241, 0.715, 1.671, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.715 std_dev=0.956
C4	B	0, 0.306, 1.272, 2.237, 2.337 max_d=2.337 avg_d=1.272 std_dev=0.965
N3	B	0, 0.375, 1.469, 2.562, 2.622 max_d=2.622 avg_d=1.469 std_dev=1.093
C5	B	0, 0.348, 1.462, 2.576, 2.702 max_d=2.702 avg_d=1.462 std_dev=1.114
OP2	B	0, 0.480, 1.649, 2.818, 2.583 max_d=2.583 avg_d=1.649 std_dev=1.169
C2	B	0, 0.470, 1.860, 3.249, 3.340 max_d=3.340 avg_d=1.860 std_dev=1.390
C6	B	0, 0.474, 1.898, 3.322, 3.430 max_d=3.430 avg_d=1.898 std_dev=1.424
P	A	0, 0.269, 1.794, 3.318, 3.727 max_d=3.727 avg_d=1.794 std_dev=1.525
N1	B	0, 0.526, 2.072, 3.618, 3.712 max_d=3.712 avg_d=2.072 std_dev=1.546
N2	B	0, 0.525, 2.094, 3.662, 3.774 max_d=3.774 avg_d=2.094 std_dev=1.568
OP1	B	0, 0.594, 2.192, 3.789, 3.761 max_d=3.761 avg_d=2.192 std_dev=1.597
O6	B	0, 0.557, 2.160, 3.763, 3.836 max_d=3.836 avg_d=2.160 std_dev=1.603
C5'	A	0, -0.452, 1.207, 2.865, 3.552 max_d=3.552 avg_d=1.207 std_dev=1.658
OP1	A	0, 0.623, 2.319, 4.014, 4.006 max_d=4.006 avg_d=2.319 std_dev=1.695
OP2	A	0, 0.482, 2.946, 5.409, 6.030 max_d=6.030 avg_d=2.946 std_dev=2.464

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.12	0.04	0.11	0.52	0.21
C2	0.04	0.00	0.21	0.11	0.01	0.26	0.01	0.28	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.31	0.10	0.00	0.16	0.47	0.03
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.10	0.02	0.03	0.02	0.06	0.14	0.16	0.24	0.21	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.03	0.04	0.32	0.04
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.14	0.00	0.20	0.00	0.19	0.22	0.16	0.05	0.09	0.25	0.15	0.01	0.01	0.01	0.21	0.21	0.13	0.18	0.07
C4	0.03	0.01	0.10	0.14	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.17	0.25	0.02	0.18	0.57	0.26
C4'	0.02	0.26	0.02	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.03	0.30	0.15	0.38	0.25	0.24	0.08	0.11	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.50	0.17
C5	0.03	0.01	0.03	0.20	0.01	0.05	0.00	0.19	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.07	0.45	0.01	0.47	0.85	0.53
C5'	0.03	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.00	0.10	0.54	0.11	0.47	0.27	0.49	0.18	0.09	0.00	0.01	0.01	0.19	0.08	0.20	0.01
C6	0.04	0.01	0.06	0.19	0.02	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.10	0.15	0.14	0.40	0.01	0.40	0.86	0.48
C8	0.01	0.03	0.14	0.22	0.01	0.30	0.01	0.54	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.26	0.17	0.19	0.72	0.01	0.78	0.95	0.80
N1	0.03	0.01	0.16	0.16	0.01	0.15	0.02	0.11	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.11	0.23	0.23	0.02	0.14	0.65	0.25
N2	0.06	0.01	0.24	0.05	0.01	0.38	0.00	0.47	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.20	0.03	0.40	0.16	0.01	0.39	0.40	0.17
N3	0.04	0.01	0.21	0.09	0.00	0.25	0.01	0.27	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.14	0.03	0.31	0.08	0.03	0.15	0.45	0.05
N7	0.00	0.01	0.08	0.25	0.00	0.24	0.01	0.49	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.21	0.11	0.72	0.02	0.84	1.15	0.87
N9	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.08	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.08	0.00	0.35	0.02	0.32	0.57	0.38
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.11	0.13	0.09	0.10	0.26	0.03	0.20	0.14	0.24	0.11	0.00	0.05	0.12	0.07	0.15	0.14	0.62	0.22
O3'	0.04	0.05	0.01	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.15	0.17	0.11	0.03	0.03	0.21	0.08	0.05	0.00	0.02	0.21	0.18	0.12	0.26	0.06
O4'	0.01	0.31	0.00	0.01	0.17	0.00	0.07	0.01	0.14	0.19	0.23	0.40	0.31	0.11	0.00	0.12	0.02	0.00	0.09	0.10	0.14	0.59	0.25
O5'	0.12	0.10	0.15	0.21	0.25	0.01	0.45	0.01	0.40	0.72	0.23	0.16	0.08	0.72	0.35	0.07	0.21	0.09	0.00	0.49	0.01	0.01	0.00
O6	0.04	0.00	0.03	0.21	0.02	0.03	0.01	0.19	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.15	0.18	0.10	0.49	0.00	0.56	1.04	0.63
OP1	0.11	0.16	0.04	0.13	0.18	0.07	0.47	0.08	0.40	0.78	0.14	0.39	0.15	0.84	0.32	0.14	0.12	0.14	0.01	0.56	0.00	0.01	0.00
OP2	0.52	0.47	0.32	0.18	0.57	0.50	0.85	0.20	0.86	0.95	0.65	0.40	0.45	1.15	0.57	0.62	0.26	0.59	0.01	1.04	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.03	0.04	0.07	0.26	0.17	0.53	0.01	0.48	0.80	0.25	0.17	0.05	0.87	0.38	0.22	0.06	0.25	0.00	0.63	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.41	0.17	0.20	0.33	0.25	0.34	0.52	0.37	0.26	0.40	0.43	0.38	0.32	0.25	0.26	0.13	0.25	0.33	0.39	0.43	0.25	0.10
C2	0.08	0.51	0.01	0.18	0.33	0.31	0.31	0.45	0.39	0.11	0.49	0.55	0.45	0.19	0.17	0.10	0.22	0.17	0.23	0.37	0.16	0.25	0.12
C2'	0.39	0.61	0.31	0.24	0.50	0.26	0.48	0.40	0.53	0.34	0.60	0.63	0.57	0.39	0.41	0.38	0.17	0.36	0.54	0.52	0.36	0.47	0.33
C3'	0.22	0.43	0.20	0.44	0.38	0.41	0.46	0.78	0.50	0.44	0.47	0.45	0.38	0.51	0.33	0.04	0.40	0.30	0.17	0.56	0.75	0.41	0.30
C4	0.18	0.49	0.10	0.15	0.34	0.27	0.31	0.52	0.38	0.15	0.47	0.53	0.45	0.21	0.22	0.20	0.14	0.20	0.27	0.36	0.30	0.17	0.11
C4'	0.54	0.56	0.55	0.77	0.67	0.75	0.81	1.14	0.81	0.88	0.68	0.50	0.52	0.93	0.70	0.29	0.67	0.64	0.51	0.92	1.16	0.73	0.75
C5	0.14	0.52	0.09	0.15	0.34	0.29	0.31	0.53	0.39	0.12	0.50	0.58	0.46	0.19	0.19	0.22	0.17	0.18	0.26	0.37	0.33	0.15	0.11
C5'	0.82	0.75	0.89	1.18	0.93	1.09	1.11	1.51	1.09	1.23	0.91	0.63	0.72	1.28	0.99	0.58	1.13	0.90	0.95	1.22	1.72	1.19	1.22
C6	0.08	0.54	0.09	0.17	0.33	0.32	0.32	0.51	0.42	0.10	0.53	0.60	0.46	0.18	0.17	0.19	0.23	0.16	0.25	0.41	0.28	0.16	0.12
C8	0.21	0.50	0.16	0.14	0.35	0.25	0.32	0.53	0.38	0.18	0.47	0.55	0.46	0.23	0.23	0.30	0.10	0.21	0.31	0.36	0.43	0.23	0.09
N1	0.05	0.53	0.08	0.19	0.32	0.32	0.32	0.47	0.42	0.11	0.52	0.58	0.44	0.20	0.16	0.16	0.25	0.16	0.24	0.41	0.20	0.22	0.12
N2	0.03	0.52	0.07	0.21	0.33	0.33	0.31	0.39	0.40	0.12	0.49	0.55	0.46	0.20	0.15	0.12	0.25	0.20	0.23	0.39	0.13	0.33	0.12
N3	0.17	0.49	0.08	0.16	0.35	0.28	0.32	0.48	0.38	0.15	0.46	0.51	0.44	0.21	0.22	0.13	0.16	0.19	0.25	0.36	0.19	0.20	0.12
N7	0.17	0.53	0.13	0.13	0.34	0.26	0.31	0.54	0.39	0.14	0.50	0.59	0.47	0.20	0.21	0.27	0.13	0.18	0.28	0.37	0.40	0.18	0.10
N9	0.22	0.47	0.16	0.16	0.34	0.24	0.32	0.52	0.38	0.20	0.45	0.51	0.44	0.25	0.24	0.27	0.10	0.23	0.32	0.36	0.38	0.21	0.10
O2'	0.57	0.64	0.56	0.51	0.60	0.52	0.58	0.46	0.61	0.52	0.64	0.64	0.63	0.53	0.56	0.58	0.51	0.55	0.94	0.59	0.74	0.88	0.82
O3'	0.28	0.50	0.29	0.50	0.48	0.45	0.60	0.79	0.64	0.57	0.58	0.49	0.43	0.66	0.43	0.04	0.45	0.35	0.17	0.74	0.77	0.54	0.37
O4'	0.39	0.40	0.36	0.56	0.48	0.60	0.58	0.95	0.58	0.65	0.48	0.36	0.37	0.68	0.50	0.15	0.45	0.51	0.29	0.65	0.84	0.41	0.44
O5'	0.54	0.41	0.63	1.00	0.59	0.92	0.75	1.36	0.72	0.90	0.54	0.32	0.40	0.93	0.67	0.32	1.02	0.66	0.66	0.83	1.49	1.01	0.97
O6	0.10	0.59	0.14	0.16	0.36	0.30	0.36	0.50	0.48	0.13	0.59	0.66	0.49	0.22	0.19	0.23	0.24	0.14	0.25	0.48	0.29	0.17	0.12
OP1	1.06	0.92	1.22	1.62	1.16	1.42	1.38	1.85	1.35	1.53	1.11	0.75	0.90	1.60	1.25	0.83	1.69	1.14	1.22	1.50	1.96	1.76	1.54
OP2	0.88	0.80	0.92	1.30	0.89	1.26	0.98	1.68	0.94	1.12	0.84	0.77	0.81	1.13	0.95	0.65	1.36	1.02	1.02	1.00	1.28	1.64	1.22
P	0.76	0.59	0.88	1.28	0.80	1.16	0.97	1.59	0.92	1.13	0.73	0.47	0.59	1.17	0.90	0.53	1.35	0.89	0.86	1.04	1.53	1.39	1.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.02	0.36	0.20	0.14
C2	0.05	0.00	0.22	0.24	0.01	0.09	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.17	0.28	0.06	0.38	0.02	0.72	0.32	0.36
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.08	0.17	0.25	0.22	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.07	0.38	0.11	0.23
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.14	0.00	0.10	0.01	0.14	0.07	0.20	0.27	0.23	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.34	0.12	0.38	0.05	0.27
C4	0.03	0.01	0.11	0.14	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.03	0.43	0.01	0.71	0.31	0.36
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.08	0.08	0.09	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.14	0.28	0.01
C5	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.55	0.01	0.88	0.43	0.47
C5'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.04	0.09	0.08	0.09	0.04	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.05	0.25	0.37	0.01
C6	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.07	0.16	0.02	0.56	0.00	0.93	0.48	0.51
C8	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.04	0.56	0.02	0.79	0.36	0.43
N1	0.05	0.01	0.17	0.20	0.02	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.13	0.24	0.05	0.47	0.02	0.85	0.41	0.44
N2	0.03	0.00	0.25	0.27	0.01	0.08	0.01	0.08	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.19	0.33	0.06	0.34	0.05	0.67	0.30	0.33
N3	0.05	0.00	0.22	0.23	0.00	0.09	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.17	0.26	0.06	0.33	0.01	0.63	0.26	0.30
N7	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.03	0.62	0.03	0.94	0.48	0.53
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.41	0.01	0.62	0.26	0.31
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.07	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.13	0.19	0.17	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.05	0.17	0.16	0.05
O3'	0.01	0.28	0.01	0.00	0.15	0.02	0.11	0.03	0.16	0.08	0.24	0.33	0.26	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.21	0.14	0.33	0.04	0.19
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.06	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.19	0.31	0.04
O5'	0.21	0.38	0.29	0.34	0.43	0.01	0.55	0.01	0.56	0.56	0.47	0.34	0.33	0.62	0.41	0.07	0.21	0.06	0.00	0.63	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.14	0.01	0.63	0.00	1.02	0.59	0.59
OP1	0.36	0.72	0.38	0.38	0.71	0.14	0.88	0.25	0.93	0.79	0.85	0.67	0.63	0.94	0.62	0.17	0.33	0.19	0.02	1.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.32	0.11	0.05	0.31	0.28	0.43	0.37	0.48	0.36	0.41	0.30	0.26	0.48	0.26	0.16	0.04	0.31	0.01	0.59	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.36	0.23	0.27	0.36	0.01	0.47	0.01	0.51	0.43	0.44	0.33	0.30	0.53	0.31	0.05	0.19	0.04	0.01	0.59	0.01	0.01	0.00