Doublet Group distance statistics: 51265

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.009, 0.017, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.034 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.026, 0.052, 0.077, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.052 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.025, 0.051, 0.076, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.051 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.031, 0.057, 0.084, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.057 std_dev=0.026
OP1	B	0, 0.192, 0.371, 0.551, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.371 std_dev=0.179
P	B	0, 0.195, 0.377, 0.559, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.377 std_dev=0.182
N3	B	0, 0.226, 0.464, 0.702, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.464 std_dev=0.238
O4'	A	0, 0.194, 0.444, 0.693, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.444 std_dev=0.249
C2	B	0, 0.235, 0.485, 0.734, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.485 std_dev=0.250
O2	B	0, 0.334, 0.610, 0.886, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.610 std_dev=0.276
C2'	A	0, 0.302, 0.596, 0.890, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.596 std_dev=0.294
C4	B	0, 0.096, 0.415, 0.733, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.415 std_dev=0.318
O4'	B	0, 0.171, 0.511, 0.850, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.511 std_dev=0.339
C4'	B	0, 0.190, 0.541, 0.892, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.541 std_dev=0.351
OP2	B	0, 0.234, 0.587, 0.941, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.587 std_dev=0.354
N1	B	0, 0.094, 0.450, 0.805, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.450 std_dev=0.356
C3'	A	0, 0.314, 0.674, 1.034, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.674 std_dev=0.360
N4	B	0, 0.076, 0.438, 0.800, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.438 std_dev=0.362
C5	B	0, 0.106, 0.506, 0.906, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.506 std_dev=0.400
C4'	A	0, 0.352, 0.758, 1.165, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.758 std_dev=0.406
C6	B	0, 0.083, 0.507, 0.931, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.507 std_dev=0.424
O5'	B	0, 0.271, 0.696, 1.121, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.696 std_dev=0.425
C1'	B	0, 0.065, 0.527, 0.989, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.527 std_dev=0.462
OP2	A	0, 0.211, 0.681, 1.150, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.681 std_dev=0.469
O2'	A	0, 0.533, 1.056, 1.579, 1.488 max_d=1.488 avg_d=1.056 std_dev=0.523
P	A	0, 0.334, 0.858, 1.383, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.858 std_dev=0.524
C5'	B	0, 0.308, 0.848, 1.389, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.848 std_dev=0.540
O5'	A	0, 0.326, 0.898, 1.471, 1.821 max_d=1.821 avg_d=0.898 std_dev=0.573
C2'	B	0, 0.176, 0.751, 1.326, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.751 std_dev=0.575
C3'	B	0, 0.037, 0.647, 1.257, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.647 std_dev=0.610
OP1	A	0, 0.312, 0.983, 1.653, 1.992 max_d=1.992 avg_d=0.983 std_dev=0.670
C5'	A	0, 0.484, 1.176, 1.869, 2.026 max_d=2.026 avg_d=1.176 std_dev=0.692
O3'	A	0, 0.311, 1.017, 1.722, 2.372 max_d=2.372 avg_d=1.017 std_dev=0.705
O2'	B	0, 0.462, 1.349, 2.235, 3.016 max_d=3.016 avg_d=1.349 std_dev=0.887
O3'	B	0, 0.178, 1.077, 1.975, 2.753 max_d=2.753 avg_d=1.077 std_dev=0.899

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.34	0.01	0.16	0.17	0.19	0.15
C2	0.04	0.00	0.33	0.17	0.01	0.11	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.28	0.24	0.15	0.13	0.16	0.15
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.16	0.03	0.06	0.26	0.12	0.24	0.25	0.33	0.07	0.16	0.04	0.00	0.01	0.03	0.55	0.59	0.61	0.58
C3'	0.03	0.17	0.01	0.00	0.19	0.00	0.25	0.02	0.26	0.24	0.22	0.14	0.29	0.28	0.17	0.02	0.01	0.02	0.17	0.15	0.07	0.13
C4	0.02	0.01	0.16	0.19	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.23	0.14	0.12	0.12	0.15	0.12
C4'	0.01	0.11	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.13	0.08	0.10	0.08	0.11	0.04	0.24	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.25	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.21	0.09	0.10	0.11	0.15	0.12
C5'	0.09	0.23	0.26	0.02	0.17	0.01	0.18	0.00	0.21	0.15	0.22	0.20	0.22	0.18	0.12	0.09	0.23	0.03	0.01	0.13	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.26	0.00	0.07	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.21	0.14	0.11	0.11	0.15	0.13
C8	0.03	0.01	0.24	0.24	0.00	0.13	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.48	0.21	0.10	0.08	0.10	0.14	0.10
N1	0.03	0.00	0.25	0.22	0.00	0.08	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.23	0.20	0.12	0.12	0.15	0.14
N3	0.04	0.00	0.33	0.14	0.00	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.35	0.31	0.23	0.15	0.14	0.16	0.14
N6	0.01	0.01	0.07	0.29	0.00	0.08	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.23	0.23	0.11	0.11	0.14	0.17	0.14
N7	0.02	0.01	0.16	0.28	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.44	0.24	0.04	0.10	0.12	0.15	0.12
N9	0.01	0.01	0.04	0.17	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.21	0.02	0.11	0.12	0.16	0.12
O2'	0.02	0.34	0.00	0.02	0.10	0.24	0.22	0.09	0.16	0.48	0.20	0.35	0.23	0.44	0.19	0.00	0.04	0.17	0.49	0.60	0.77	0.60
O3'	0.34	0.28	0.01	0.01	0.23	0.02	0.21	0.23	0.21	0.21	0.23	0.31	0.23	0.24	0.21	0.04	0.00	0.23	0.22	0.25	0.22	0.22
O4'	0.01	0.24	0.03	0.02	0.14	0.00	0.09	0.03	0.14	0.10	0.20	0.23	0.11	0.04	0.02	0.17	0.23	0.00	0.17	0.20	0.17	0.16
O5'	0.16	0.15	0.55	0.17	0.12	0.01	0.10	0.01	0.11	0.08	0.12	0.15	0.11	0.10	0.11	0.49	0.22	0.17	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.17	0.13	0.59	0.15	0.12	0.07	0.11	0.13	0.11	0.10	0.12	0.14	0.14	0.12	0.12	0.60	0.25	0.20	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.16	0.61	0.07	0.15	0.10	0.15	0.13	0.15	0.14	0.15	0.16	0.17	0.15	0.16	0.77	0.22	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.15	0.58	0.13	0.12	0.01	0.12	0.02	0.13	0.10	0.14	0.14	0.14	0.12	0.12	0.60	0.22	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.16	0.12	0.14	0.14	0.10	0.13	0.06	0.14	0.10	0.20	0.20	0.21	0.23	0.28	0.10	0.13	0.16	0.22	0.19
C2	0.04	0.15	0.17	0.05	0.21	0.05	0.07	0.04	0.03	0.05	0.23	0.31	0.17	0.15	0.39	0.07	0.16	0.16	0.26	0.19
C2'	0.11	0.07	0.06	0.10	0.08	0.12	0.12	0.19	0.13	0.10	0.09	0.09	0.07	0.16	0.28	0.12	0.33	0.43	0.52	0.45
C3'	0.39	0.43	0.36	0.38	0.42	0.39	0.37	0.33	0.36	0.39	0.45	0.45	0.46	0.39	0.42	0.40	0.21	0.20	0.20	0.19
C4	0.09	0.17	0.13	0.10	0.18	0.08	0.08	0.04	0.09	0.08	0.23	0.28	0.20	0.14	0.31	0.07	0.13	0.15	0.23	0.17
C4'	0.17	0.23	0.17	0.16	0.23	0.17	0.23	0.14	0.21	0.18	0.27	0.29	0.27	0.39	0.33	0.18	0.04	0.11	0.16	0.11
C5	0.09	0.17	0.14	0.11	0.19	0.08	0.08	0.04	0.09	0.08	0.24	0.30	0.20	0.14	0.29	0.07	0.13	0.15	0.23	0.17
C5'	0.18	0.18	0.26	0.15	0.20	0.15	0.27	0.18	0.26	0.19	0.20	0.23	0.22	0.57	0.39	0.16	0.15	0.22	0.26	0.22
C6	0.05	0.16	0.18	0.08	0.21	0.05	0.05	0.03	0.04	0.06	0.23	0.31	0.17	0.17	0.33	0.06	0.15	0.16	0.25	0.19
C8	0.13	0.19	0.13	0.17	0.16	0.13	0.16	0.08	0.16	0.12	0.23	0.21	0.23	0.24	0.23	0.12	0.13	0.15	0.20	0.17
N1	0.04	0.15	0.19	0.05	0.22	0.05	0.09	0.05	0.03	0.06	0.23	0.32	0.16	0.21	0.39	0.08	0.16	0.16	0.26	0.20
N3	0.06	0.16	0.14	0.07	0.19	0.07	0.06	0.03	0.06	0.06	0.23	0.30	0.19	0.11	0.35	0.06	0.14	0.15	0.24	0.18
N6	0.06	0.15	0.21	0.09	0.22	0.05	0.08	0.05	0.06	0.06	0.22	0.29	0.16	0.24	0.33	0.07	0.17	0.17	0.26	0.20
N7	0.12	0.18	0.13	0.16	0.16	0.12	0.14	0.07	0.14	0.11	0.23	0.25	0.22	0.19	0.23	0.11	0.13	0.15	0.21	0.17
N9	0.11	0.18	0.12	0.14	0.16	0.11	0.13	0.06	0.13	0.10	0.22	0.24	0.22	0.20	0.27	0.10	0.13	0.15	0.21	0.17
O2'	0.40	0.43	0.33	0.36	0.43	0.46	0.43	0.58	0.42	0.42	0.44	0.44	0.42	0.27	0.48	0.49	0.71	0.81	0.86	0.84
O3'	0.30	0.39	0.29	0.29	0.37	0.32	0.30	0.30	0.29	0.32	0.44	0.43	0.45	0.37	0.43	0.34	0.25	0.30	0.33	0.30
O4'	0.12	0.21	0.12	0.14	0.21	0.13	0.20	0.10	0.19	0.13	0.27	0.29	0.27	0.35	0.30	0.13	0.08	0.07	0.11	0.09
O5'	0.18	0.23	0.25	0.19	0.23	0.17	0.25	0.13	0.23	0.19	0.25	0.25	0.29	0.51	0.32	0.18	0.06	0.10	0.14	0.10
OP1	0.26	0.30	0.39	0.27	0.26	0.24	0.27	0.19	0.26	0.26	0.29	0.26	0.36	0.67	0.37	0.24	0.15	0.17	0.18	0.15
OP2	0.28	0.30	0.41	0.29	0.27	0.24	0.28	0.18	0.27	0.28	0.29	0.26	0.34	0.67	0.38	0.24	0.14	0.18	0.21	0.16
P	0.22	0.26	0.35	0.23	0.22	0.20	0.25	0.16	0.23	0.22	0.26	0.23	0.33	0.64	0.34	0.20	0.10	0.11	0.13	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.29	0.00	0.13	0.11	0.19	0.14
C2	0.02	0.00	0.21	0.06	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.14	0.10	0.26	0.29	0.36	0.32
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.08	0.02	0.07	0.18	0.13	0.04	0.19	0.09	0.34	0.01	0.06	0.04	0.34	0.32	0.43	0.36
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.08	0.05	0.06	0.07	0.09	0.02	0.01	0.01	0.12	0.09	0.05	0.08
C4	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.20	0.05	0.26	0.33	0.43	0.36
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.06	0.13	0.16	0.03	0.00	0.02	0.05	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.26	0.06	0.22	0.25	0.37	0.29
C5'	0.05	0.16	0.18	0.03	0.15	0.01	0.10	0.00	0.07	0.08	0.18	0.17	0.21	0.07	0.21	0.02	0.01	0.04	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.08	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.28	0.07	0.17	0.18	0.30	0.22
N1	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.23	0.02	0.18	0.19	0.28	0.22
N3	0.02	0.00	0.19	0.06	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.14	0.08	0.29	0.36	0.44	0.38
N4	0.01	0.01	0.09	0.07	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.19	0.05	0.29	0.38	0.48	0.41
O2	0.04	0.01	0.34	0.09	0.01	0.13	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.43	0.09	0.17	0.29	0.32	0.35	0.34
O2'	0.03	0.35	0.01	0.02	0.28	0.16	0.15	0.07	0.10	0.15	0.38	0.31	0.43	0.00	0.09	0.10	0.32	0.32	0.56	0.38
O3'	0.29	0.14	0.06	0.01	0.20	0.03	0.26	0.21	0.28	0.23	0.14	0.19	0.09	0.09	0.00	0.16	0.25	0.40	0.25	0.30
O4'	0.00	0.10	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.05	0.17	0.10	0.16	0.00	0.07	0.06	0.10	0.06
O5'	0.13	0.26	0.34	0.12	0.26	0.02	0.22	0.01	0.17	0.18	0.29	0.29	0.29	0.32	0.25	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.11	0.29	0.32	0.09	0.33	0.05	0.25	0.04	0.18	0.19	0.36	0.38	0.32	0.32	0.40	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.36	0.43	0.05	0.43	0.07	0.37	0.11	0.30	0.28	0.44	0.48	0.35	0.56	0.25	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.32	0.36	0.08	0.36	0.02	0.29	0.02	0.22	0.22	0.38	0.41	0.34	0.38	0.30	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00