Doublet Group distance statistics: 51275

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N7	B	0, -0.346, 1.014, 2.374, 3.700 max_d=3.700 avg_d=1.014 std_dev=1.360
N7	A	0, -0.672, 0.722, 2.117, 3.511 max_d=3.511 avg_d=0.722 std_dev=1.394
N6	B	0, -0.499, 1.382, 3.262, 5.107 max_d=5.107 avg_d=1.382 std_dev=1.881
C5	B	0, -0.561, 1.364, 3.290, 5.185 max_d=5.185 avg_d=1.364 std_dev=1.925
C5	A	0, -0.952, 0.974, 2.899, 4.825 max_d=4.825 avg_d=0.974 std_dev=1.925
N6	A	0, -0.975, 1.016, 3.007, 4.998 max_d=4.998 avg_d=1.016 std_dev=1.991
C6	B	0, -0.629, 1.548, 3.725, 5.864 max_d=5.864 avg_d=1.548 std_dev=2.177
C6	A	0, -1.100, 1.113, 3.326, 5.538 max_d=5.538 avg_d=1.113 std_dev=2.213
C8	B	0, -0.674, 1.575, 3.825, 6.048 max_d=6.048 avg_d=1.575 std_dev=2.249
C8	A	0, -1.128, 1.191, 3.510, 5.829 max_d=5.829 avg_d=1.191 std_dev=2.319
C4	B	0, -0.911, 1.975, 4.862, 7.708 max_d=7.708 avg_d=1.975 std_dev=2.887
C4	A	0, -1.443, 1.476, 4.394, 7.313 max_d=7.313 avg_d=1.476 std_dev=2.919
N9	B	0, -0.960, 2.059, 5.077, 8.066 max_d=8.066 avg_d=2.059 std_dev=3.019
N9	A	0, -1.527, 1.563, 4.653, 7.743 max_d=7.743 avg_d=1.563 std_dev=3.090
N1	B	0, -0.974, 2.221, 5.415, 8.553 max_d=8.553 avg_d=2.221 std_dev=3.194
N1	A	0, -1.621, 1.644, 4.908, 8.172 max_d=8.172 avg_d=1.644 std_dev=3.264
N3	B	0, -1.196, 2.555, 6.305, 9.992 max_d=9.992 avg_d=2.555 std_dev=3.751
C2	B	0, -1.186, 2.594, 6.375, 10.085 max_d=10.085 avg_d=2.594 std_dev=3.780
N3	A	0, -1.898, 1.924, 5.745, 9.566 max_d=9.566 avg_d=1.924 std_dev=3.821
C2	A	0, -1.920, 1.939, 5.797, 9.656 max_d=9.656 avg_d=1.939 std_dev=3.859
C1'	B	0, -1.269, 2.757, 6.783, 10.764 max_d=10.764 avg_d=2.757 std_dev=4.026
O4'	A	0, -1.467, 2.697, 6.861, 10.824 max_d=10.824 avg_d=2.697 std_dev=4.164
C1'	A	0, -2.080, 2.106, 6.292, 10.478 max_d=10.478 avg_d=2.106 std_dev=4.186
O5'	A	0, -0.527, 3.842, 8.211, 10.726 max_d=10.726 avg_d=3.842 std_dev=4.369
O4'	B	0, -1.532, 2.923, 7.378, 11.803 max_d=11.803 avg_d=2.923 std_dev=4.455
OP2	B	0, -1.050, 3.435, 7.921, 12.245 max_d=12.245 avg_d=3.435 std_dev=4.486
P	A	0, -0.379, 4.193, 8.766, 10.138 max_d=10.138 avg_d=4.193 std_dev=4.573
C2'	B	0, -1.384, 3.223, 7.830, 12.368 max_d=12.368 avg_d=3.223 std_dev=4.607
OP2	A	0, -0.481, 4.214, 8.908, 11.115 max_d=11.115 avg_d=4.214 std_dev=4.694
C5'	A	0, -1.009, 3.817, 8.644, 12.465 max_d=12.465 avg_d=3.817 std_dev=4.827
C2'	A	0, -1.841, 3.049, 7.939, 12.675 max_d=12.675 avg_d=3.049 std_dev=4.890
C4'	A	0, -1.715, 3.239, 8.192, 12.918 max_d=12.918 avg_d=3.239 std_dev=4.954
C3'	B	0, -1.765, 3.370, 8.505, 13.603 max_d=13.603 avg_d=3.370 std_dev=5.135
O5'	B	0, -1.648, 3.497, 8.642, 13.735 max_d=13.735 avg_d=3.497 std_dev=5.145
P	B	0, -1.508, 3.649, 8.806, 13.860 max_d=13.860 avg_d=3.649 std_dev=5.157
C3'	A	0, -1.807, 3.360, 8.526, 13.475 max_d=13.475 avg_d=3.360 std_dev=5.167
O2'	B	0, -1.258, 3.920, 9.099, 14.068 max_d=14.068 avg_d=3.920 std_dev=5.179
C4'	B	0, -1.861, 3.321, 8.503, 13.652 max_d=13.652 avg_d=3.321 std_dev=5.182
OP1	A	0, -0.388, 4.805, 9.997, 11.546 max_d=11.546 avg_d=4.805 std_dev=5.193
C5'	B	0, -1.864, 3.335, 8.533, 13.697 max_d=13.697 avg_d=3.335 std_dev=5.198
O2'	A	0, -1.923, 3.701, 9.325, 14.636 max_d=14.636 avg_d=3.701 std_dev=5.624
O3'	B	0, -1.967, 3.746, 9.460, 15.128 max_d=15.128 avg_d=3.746 std_dev=5.714
OP1	B	0, -1.766, 4.355, 10.477, 16.494 max_d=16.494 avg_d=4.355 std_dev=6.122
O3'	A	0, -2.258, 3.939, 10.136, 16.168 max_d=16.168 avg_d=3.939 std_dev=6.197

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.00	0.24	0.56	0.32	0.27
C2	0.03	0.00	0.51	0.70	0.00	0.48	0.00	0.84	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.49	0.36	0.44	0.43	0.51	1.35	0.76
C2'	0.00	0.51	0.00	0.00	0.26	0.01	0.11	0.18	0.22	0.29	0.39	0.51	0.14	0.17	0.04	0.00	0.02	0.02	0.59	0.93	0.78	0.73
C3'	0.02	0.70	0.00	0.00	0.38	0.00	0.29	0.01	0.41	0.27	0.58	0.67	0.36	0.23	0.15	0.01	0.00	0.01	0.37	0.78	0.26	0.45
C4	0.02	0.00	0.26	0.38	0.00	0.20	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.07	0.23	0.12	0.37	0.41	0.17
C4'	0.00	0.48	0.01	0.00	0.20	0.00	0.08	0.00	0.18	0.29	0.35	0.47	0.11	0.21	0.06	0.21	0.02	0.00	0.01	0.33	0.24	0.05
C5	0.01	0.00	0.11	0.29	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.10	0.10	0.39	0.71	0.12	0.44
C5'	0.07	0.84	0.18	0.01	0.30	0.00	0.08	0.00	0.28	0.51	0.62	0.77	0.15	0.38	0.10	0.03	0.19	0.01	0.01	0.27	0.39	0.01
C6	0.02	0.00	0.22	0.41	0.00	0.18	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.14	0.20	0.21	0.50	0.37	0.30
C8	0.01	0.01	0.29	0.27	0.00	0.29	0.00	0.51	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.51	0.33	0.24	0.89	1.37	0.92	1.08
N1	0.03	0.00	0.39	0.58	0.01	0.35	0.00	0.62	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.33	0.27	0.34	0.20	0.37	1.00	0.51
N3	0.03	0.00	0.51	0.67	0.00	0.47	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.30	0.43	0.38	0.35	1.14	0.61
N6	0.01	0.00	0.14	0.36	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.14	0.13	0.36	0.69	0.13	0.44
N7	0.01	0.01	0.17	0.23	0.00	0.21	0.00	0.38	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.44	0.25	0.13	0.81	1.28	0.78	1.00
N9	0.00	0.01	0.04	0.15	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.16	0.01	0.42	0.76	0.30	0.46
O2'	0.01	0.49	0.00	0.01	0.18	0.21	0.19	0.03	0.19	0.51	0.33	0.49	0.21	0.44	0.17	0.00	0.04	0.14	0.37	0.79	0.87	0.63
O3'	0.26	0.36	0.02	0.00	0.07	0.02	0.10	0.19	0.14	0.33	0.27	0.30	0.14	0.25	0.16	0.04	0.00	0.17	0.22	0.48	0.07	0.19
O4'	0.00	0.44	0.02	0.01	0.23	0.00	0.10	0.01	0.20	0.24	0.34	0.43	0.13	0.13	0.01	0.14	0.17	0.00	0.06	0.45	0.28	0.15
O5'	0.24	0.43	0.59	0.37	0.12	0.01	0.39	0.01	0.21	0.89	0.20	0.38	0.36	0.81	0.42	0.37	0.22	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.56	0.51	0.93	0.78	0.37	0.33	0.71	0.27	0.50	1.37	0.37	0.35	0.69	1.28	0.76	0.79	0.48	0.45	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.32	1.35	0.78	0.26	0.41	0.24	0.12	0.39	0.37	0.92	1.00	1.14	0.13	0.78	0.30	0.87	0.07	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.27	0.76	0.73	0.45	0.17	0.05	0.44	0.01	0.30	1.08	0.51	0.61	0.44	1.00	0.46	0.63	0.19	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.16	0.38	0.41	0.22	0.24	0.23	0.23	0.20	0.31	0.17	0.19	0.21	0.28	0.27	0.82	0.22	0.47	0.86	1.13	1.51	1.16
C2	0.47	0.16	0.61	0.54	0.28	0.24	0.22	0.56	0.13	0.39	0.12	0.25	0.14	0.29	0.38	1.10	0.20	0.38	1.58	2.16	2.55	2.15
C2'	0.55	0.53	0.58	0.34	0.50	0.33	0.46	0.22	0.48	0.48	0.52	0.52	0.46	0.44	0.50	1.11	0.27	0.61	0.83	1.19	1.62	1.22
C3'	0.61	0.54	0.30	0.25	0.52	0.62	0.47	0.62	0.46	0.48	0.51	0.56	0.41	0.43	0.54	0.85	0.27	0.88	0.66	1.03	1.52	1.04
C4	0.39	0.15	0.45	0.43	0.25	0.16	0.22	0.21	0.15	0.35	0.13	0.21	0.14	0.29	0.33	0.92	0.18	0.43	1.17	1.56	1.94	1.59
C4'	0.49	0.59	0.12	0.42	0.50	0.60	0.47	0.66	0.52	0.38	0.58	0.55	0.51	0.38	0.45	0.55	0.40	0.83	0.61	0.83	1.31	0.85
C5	0.40	0.15	0.42	0.39	0.26	0.16	0.21	0.23	0.12	0.36	0.11	0.22	0.11	0.28	0.34	0.88	0.15	0.43	1.19	1.56	1.91	1.60
C5'	0.71	1.04	0.26	0.55	0.79	0.88	0.73	0.97	0.88	0.50	1.04	0.94	0.88	0.52	0.66	0.46	0.62	1.11	0.57	0.69	1.17	0.68
C6	0.47	0.17	0.52	0.43	0.28	0.18	0.21	0.48	0.11	0.40	0.11	0.26	0.13	0.28	0.39	0.98	0.14	0.38	1.48	1.96	2.33	1.99
C8	0.30	0.16	0.28	0.35	0.23	0.30	0.22	0.31	0.17	0.30	0.15	0.20	0.16	0.27	0.27	0.69	0.18	0.49	0.78	0.99	1.32	1.03
N1	0.50	0.17	0.62	0.52	0.29	0.26	0.21	0.65	0.12	0.41	0.11	0.27	0.13	0.28	0.40	1.09	0.17	0.36	1.67	2.26	2.65	2.26
N3	0.42	0.15	0.55	0.49	0.26	0.17	0.23	0.36	0.15	0.37	0.13	0.23	0.15	0.29	0.35	1.03	0.21	0.41	1.36	1.84	2.24	1.85
N6	0.50	0.19	0.52	0.39	0.30	0.20	0.20	0.58	0.11	0.42	0.12	0.28	0.17	0.26	0.42	0.96	0.16	0.35	1.58	2.06	2.40	2.10
N7	0.34	0.15	0.28	0.33	0.24	0.25	0.21	0.21	0.13	0.31	0.12	0.21	0.10	0.27	0.30	0.71	0.16	0.47	0.91	1.16	1.47	1.20
N9	0.33	0.16	0.37	0.39	0.23	0.22	0.23	0.19	0.18	0.32	0.15	0.20	0.17	0.29	0.29	0.81	0.19	0.47	0.93	1.22	1.58	1.25
O2'	0.90	0.98	1.08	0.82	0.89	0.64	0.82	0.48	0.85	0.78	0.94	0.95	0.77	0.74	0.85	1.61	0.84	0.77	1.04	1.29	1.65	1.33
O3'	0.73	0.62	0.62	0.18	0.62	0.62	0.55	0.56	0.53	0.58	0.57	0.65	0.45	0.52	0.64	1.23	0.32	0.93	0.46	0.86	1.40	0.90
O4'	0.34	0.53	0.19	0.51	0.40	0.44	0.40	0.48	0.49	0.29	0.55	0.46	0.51	0.32	0.34	0.49	0.45	0.63	0.71	0.90	1.33	0.93
O5'	1.04	1.35	0.51	0.62	1.13	1.20	1.10	1.31	1.25	0.85	1.37	1.26	1.28	0.90	1.00	0.64	0.71	1.49	0.58	0.49	0.75	0.44
OP1	1.70	2.43	1.26	1.38	1.95	1.97	1.88	2.24	2.19	1.42	2.47	2.20	2.20	1.50	1.69	1.13	1.34	2.19	1.56	1.52	1.30	1.46
OP2	1.29	2.10	0.72	0.81	1.55	1.50	1.45	1.66	1.80	0.92	2.12	1.85	1.85	1.02	1.25	0.79	0.83	1.80	1.02	0.99	1.09	0.90
P	1.43	2.01	0.96	1.14	1.61	1.69	1.53	1.88	1.78	1.13	2.03	1.83	1.78	1.18	1.39	0.85	1.18	1.93	1.23	1.15	1.10	1.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.34	0.00	0.30	0.29	0.19	0.17
C2	0.02	0.00	0.32	0.41	0.00	0.61	0.00	1.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.48	0.35	0.82	1.00	1.40	1.13
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.15	0.01	0.03	0.21	0.09	0.22	0.22	0.34	0.03	0.16	0.02	0.00	0.03	0.02	0.30	0.21	0.63	0.33
C3'	0.01	0.41	0.00	0.00	0.16	0.00	0.24	0.01	0.20	0.56	0.26	0.41	0.26	0.50	0.22	0.02	0.00	0.01	0.13	0.07	0.41	0.10
C4	0.01	0.00	0.15	0.16	0.00	0.26	0.01	0.53	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.26	0.19	0.36	0.35	0.57	0.40
C4'	0.00	0.61	0.01	0.00	0.26	0.00	0.13	0.00	0.24	0.40	0.46	0.59	0.18	0.29	0.09	0.27	0.01	0.00	0.01	0.17	0.34	0.05
C5	0.01	0.00	0.03	0.24	0.01	0.13	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.07	0.10	0.66	0.66	0.68	0.67
C5'	0.07	1.19	0.21	0.01	0.53	0.00	0.29	0.00	0.53	0.53	0.93	1.11	0.39	0.37	0.09	0.06	0.22	0.01	0.00	0.36	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.20	0.01	0.24	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.31	0.14	0.18	0.53	0.55	0.72	0.60
C8	0.01	0.00	0.22	0.56	0.00	0.40	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.22	0.16	1.30	1.31	1.16	1.31
N1	0.01	0.00	0.22	0.26	0.01	0.46	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.33	0.28	0.58	0.71	1.03	0.81
N3	0.01	0.00	0.34	0.41	0.00	0.59	0.01	1.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.51	0.35	0.71	0.82	1.28	0.97
N6	0.01	0.01	0.03	0.26	0.01	0.18	0.01	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.37	0.05	0.14	0.68	0.74	0.88	0.78
N7	0.01	0.00	0.16	0.50	0.01	0.29	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.40	0.19	0.07	1.21	1.28	1.25	1.29
N9	0.00	0.00	0.02	0.22	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.12	0.01	0.62	0.59	0.36	0.53
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.20	0.27	0.32	0.06	0.31	0.35	0.21	0.09	0.37	0.40	0.20	0.00	0.05	0.21	0.28	0.13	0.79	0.33
O3'	0.34	0.48	0.03	0.00	0.26	0.01	0.07	0.22	0.14	0.22	0.33	0.51	0.05	0.19	0.12	0.05	0.00	0.23	0.16	0.28	0.34	0.16
O4'	0.00	0.35	0.02	0.01	0.19	0.00	0.10	0.01	0.18	0.16	0.28	0.35	0.14	0.07	0.01	0.21	0.23	0.00	0.28	0.41	0.17	0.26
O5'	0.30	0.82	0.30	0.13	0.36	0.01	0.66	0.00	0.53	1.30	0.58	0.71	0.68	1.21	0.62	0.28	0.16	0.28	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.29	1.00	0.21	0.07	0.35	0.17	0.66	0.36	0.55	1.31	0.71	0.82	0.74	1.28	0.59	0.13	0.28	0.41	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	1.40	0.63	0.41	0.57	0.34	0.68	0.29	0.72	1.16	1.03	1.28	0.88	1.25	0.36	0.79	0.34	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	1.13	0.33	0.10	0.40	0.05	0.67	0.01	0.60	1.31	0.81	0.97	0.78	1.29	0.53	0.33	0.16	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00