Doublet Group distance statistics: 51276

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N7	B	0, 0.000, 1.781, 3.563, 3.563 max_d=3.563 avg_d=1.781 std_dev=1.781
N7	A	0, 0.000, 2.015, 4.030, 4.030 max_d=4.030 avg_d=2.015 std_dev=2.015
N6	A	0, 0.000, 2.275, 4.550, 4.550 max_d=4.550 avg_d=2.275 std_dev=2.275
N6	B	0, 0.000, 2.493, 4.986, 4.986 max_d=4.986 avg_d=2.493 std_dev=2.493
C5	A	0, 0.000, 2.567, 5.134, 5.134 max_d=5.134 avg_d=2.567 std_dev=2.567
C5	B	0, 0.000, 2.568, 5.135, 5.135 max_d=5.135 avg_d=2.568 std_dev=2.568
C6	A	0, 0.000, 2.768, 5.536, 5.536 max_d=5.536 avg_d=2.768 std_dev=2.768
C6	B	0, 0.000, 2.906, 5.812, 5.812 max_d=5.812 avg_d=2.906 std_dev=2.906
C8	B	0, 0.000, 2.909, 5.819, 5.819 max_d=5.819 avg_d=2.909 std_dev=2.909
C8	A	0, 0.000, 3.141, 6.281, 6.281 max_d=6.281 avg_d=3.141 std_dev=3.141
C4	A	0, 0.000, 3.786, 7.571, 7.571 max_d=7.571 avg_d=3.786 std_dev=3.786
C4	B	0, 0.000, 3.821, 7.642, 7.642 max_d=7.642 avg_d=3.821 std_dev=3.821
N9	B	0, 0.000, 3.960, 7.921, 7.921 max_d=7.921 avg_d=3.960 std_dev=3.960
N9	A	0, 0.000, 4.023, 8.045, 8.045 max_d=8.045 avg_d=4.023 std_dev=4.023
N1	A	0, 0.000, 4.067, 8.135, 8.135 max_d=8.135 avg_d=4.067 std_dev=4.067
N1	B	0, 0.000, 4.246, 8.493, 8.493 max_d=8.493 avg_d=4.246 std_dev=4.246
N3	A	0, 0.000, 4.849, 9.698, 9.698 max_d=9.698 avg_d=4.849 std_dev=4.849
C2	A	0, 0.000, 4.856, 9.713, 9.713 max_d=9.713 avg_d=4.856 std_dev=4.856
N3	B	0, 0.000, 4.974, 9.947, 9.947 max_d=9.947 avg_d=4.974 std_dev=4.974
C2	B	0, 0.000, 5.030, 10.060, 10.060 max_d=10.060 avg_d=5.030 std_dev=5.030
OP1	A	0, 0.000, 5.173, 10.347, 10.347 max_d=10.347 avg_d=5.173 std_dev=5.173
C1'	B	0, 0.000, 5.299, 10.598, 10.598 max_d=10.598 avg_d=5.299 std_dev=5.299
O4'	A	0, 0.000, 5.313, 10.625, 10.625 max_d=10.625 avg_d=5.313 std_dev=5.313
C1'	A	0, 0.000, 5.313, 10.626, 10.626 max_d=10.626 avg_d=5.313 std_dev=5.313
O4'	B	0, 0.000, 5.403, 10.806, 10.806 max_d=10.806 avg_d=5.403 std_dev=5.403
P	B	0, 0.000, 5.594, 11.188, 11.188 max_d=11.188 avg_d=5.594 std_dev=5.594
O5'	B	0, 0.000, 5.678, 11.356, 11.356 max_d=11.356 avg_d=5.678 std_dev=5.678
O5'	A	0, 0.000, 5.764, 11.529, 11.529 max_d=11.529 avg_d=5.764 std_dev=5.764
P	A	0, 0.000, 5.927, 11.854, 11.854 max_d=11.854 avg_d=5.927 std_dev=5.927
OP1	B	0, 0.000, 5.938, 11.876, 11.876 max_d=11.876 avg_d=5.938 std_dev=5.938
OP2	B	0, 0.000, 6.104, 12.207, 12.207 max_d=12.207 avg_d=6.104 std_dev=6.104
C2'	B	0, 0.000, 6.336, 12.673, 12.673 max_d=12.673 avg_d=6.336 std_dev=6.336
C2'	A	0, 0.000, 6.434, 12.868, 12.868 max_d=12.868 avg_d=6.434 std_dev=6.434
C5'	A	0, 0.000, 6.466, 12.932, 12.932 max_d=12.932 avg_d=6.466 std_dev=6.466
C4'	B	0, 0.000, 6.477, 12.954, 12.954 max_d=12.954 avg_d=6.477 std_dev=6.477
C5'	B	0, 0.000, 6.493, 12.987, 12.987 max_d=12.987 avg_d=6.493 std_dev=6.493
C4'	A	0, 0.000, 6.512, 13.025, 13.025 max_d=13.025 avg_d=6.512 std_dev=6.512
C3'	B	0, 0.000, 6.543, 13.087, 13.087 max_d=13.087 avg_d=6.543 std_dev=6.543
C3'	A	0, 0.000, 7.053, 14.106, 14.106 max_d=14.106 avg_d=7.053 std_dev=7.053
OP2	A	0, 0.000, 7.337, 14.674, 14.674 max_d=14.674 avg_d=7.337 std_dev=7.337
O2'	A	0, 0.000, 7.425, 14.850, 14.850 max_d=14.850 avg_d=7.425 std_dev=7.425
O2'	B	0, 0.000, 7.608, 15.215, 15.215 max_d=15.215 avg_d=7.608 std_dev=7.608
O3'	B	0, 0.000, 7.857, 15.715, 15.715 max_d=15.715 avg_d=7.857 std_dev=7.857
O3'	A	0, 0.000, 8.168, 16.337, 16.337 max_d=16.337 avg_d=8.168 std_dev=8.168

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.11	0.16	0.07	0.14
C2	0.02	0.00	0.26	0.28	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.14	0.15	0.14	0.16	0.10
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.13	0.00	0.03	0.16	0.09	0.16	0.18	0.27	0.04	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.34	0.40	0.26	0.39
C3'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.24	0.00	0.26	0.01	0.29	0.15	0.30	0.25	0.29	0.22	0.16	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03
C4	0.00	0.01	0.13	0.24	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.14	0.03	0.07	0.12	0.14	0.10	0.05
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.13	0.06	0.03	0.09	0.13	0.08	0.23	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.26	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.25	0.04	0.04	0.18	0.12	0.14	0.11
C5'	0.04	0.05	0.16	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.10	0.11	0.08	0.03	0.12	0.14	0.05	0.04	0.13	0.01	0.01	0.07	0.02	0.00
C6	0.02	0.00	0.09	0.29	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.24	0.05	0.08	0.21	0.12	0.19	0.15
C8	0.00	0.02	0.16	0.15	0.00	0.13	0.01	0.11	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.29	0.01	0.09	0.09	0.14	0.02	0.01
N1	0.03	0.00	0.18	0.30	0.02	0.06	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.16	0.02	0.12	0.20	0.13	0.19	0.14
N3	0.01	0.01	0.27	0.25	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.11	0.15	0.11	0.05
N6	0.02	0.00	0.04	0.29	0.02	0.09	0.02	0.12	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.30	0.08	0.06	0.24	0.11	0.21	0.19
N7	0.00	0.01	0.10	0.22	0.00	0.13	0.00	0.14	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.31	0.07	0.04	0.18	0.11	0.11	0.10
N9	0.00	0.02	0.01	0.16	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.17	0.06	0.00	0.04	0.15	0.02	0.03
O2'	0.00	0.05	0.00	0.03	0.14	0.23	0.25	0.04	0.24	0.29	0.16	0.01	0.30	0.31	0.17	0.00	0.04	0.18	0.27	0.34	0.15	0.35
O3'	0.23	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.13	0.05	0.01	0.02	0.07	0.08	0.07	0.06	0.04	0.00	0.17	0.11	0.11	0.34	0.16
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.09	0.12	0.13	0.06	0.04	0.00	0.18	0.17	0.00	0.04	0.03	0.02	0.05
O5'	0.11	0.15	0.34	0.02	0.12	0.03	0.18	0.01	0.21	0.09	0.20	0.11	0.24	0.18	0.04	0.27	0.11	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.16	0.14	0.40	0.02	0.14	0.02	0.12	0.07	0.12	0.14	0.13	0.15	0.11	0.11	0.15	0.34	0.11	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.16	0.26	0.06	0.10	0.02	0.14	0.02	0.19	0.02	0.19	0.11	0.21	0.11	0.02	0.15	0.34	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.10	0.39	0.03	0.05	0.02	0.11	0.00	0.15	0.01	0.14	0.05	0.19	0.10	0.03	0.35	0.16	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.10	0.02	0.04	0.05	0.02	0.06	0.05	0.11	0.02	0.12	0.07	0.14	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.50	0.78	0.13
C2	0.26	0.14	0.23	0.20	0.19	0.23	0.15	0.19	0.09	0.24	0.09	0.18	0.03	0.19	0.23	0.24	0.19	0.28	0.21	0.20	0.90	0.28
C2'	0.02	0.02	0.00	0.06	0.02	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.09	0.61	0.67	0.00
C3'	0.22	0.37	0.29	0.33	0.30	0.24	0.33	0.27	0.41	0.22	0.41	0.32	0.47	0.27	0.25	0.25	0.35	0.17	0.29	0.69	0.51	0.14
C4	0.07	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.03	0.05	0.05	0.06	0.07	0.02	0.08	0.02	0.48	0.80	0.12
C4'	0.04	0.26	0.10	0.12	0.15	0.03	0.19	0.05	0.29	0.04	0.32	0.18	0.37	0.10	0.08	0.06	0.14	0.03	0.06	0.48	0.73	0.11
C5	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.62	0.72	0.00
C5'	0.11	0.33	0.19	0.21	0.22	0.11	0.25	0.13	0.36	0.10	0.39	0.25	0.44	0.16	0.14	0.14	0.23	0.04	0.15	0.56	0.65	0.02
C6	0.09	0.10	0.09	0.03	0.10	0.02	0.10	0.06	0.09	0.11	0.10	0.11	0.07	0.10	0.10	0.09	0.03	0.08	0.02	0.56	0.74	0.01
C8	0.15	0.14	0.13	0.16	0.14	0.18	0.14	0.22	0.14	0.12	0.13	0.14	0.12	0.12	0.14	0.12	0.16	0.15	0.17	0.70	0.66	0.05
N1	0.23	0.16	0.21	0.17	0.19	0.18	0.16	0.12	0.12	0.23	0.13	0.19	0.08	0.19	0.22	0.21	0.16	0.24	0.15	0.30	0.87	0.19
N3	0.18	0.07	0.16	0.13	0.12	0.16	0.09	0.12	0.03	0.18	0.03	0.11	0.03	0.13	0.16	0.17	0.12	0.21	0.15	0.30	0.87	0.24
N6	0.04	0.14	0.05	0.03	0.10	0.07	0.11	0.17	0.14	0.05	0.15	0.11	0.15	0.08	0.07	0.04	0.03	0.01	0.15	0.69	0.61	0.16
N7	0.16	0.09	0.14	0.18	0.13	0.21	0.12	0.26	0.09	0.14	0.07	0.12	0.05	0.13	0.15	0.13	0.17	0.18	0.21	0.75	0.61	0.11
N9	0.02	0.08	0.03	0.06	0.05	0.05	0.06	0.09	0.09	0.00	0.09	0.06	0.11	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.56	0.76	0.07
O2'	0.16	0.12	0.19	0.18	0.16	0.15	0.16	0.11	0.13	0.20	0.12	0.14	0.13	0.20	0.17	0.19	0.19	0.16	0.18	0.34	0.98	0.27
O3'	0.03	0.34	0.11	0.12	0.18	0.01	0.22	0.01	0.36	0.02	0.40	0.23	0.44	0.10	0.07	0.08	0.14	0.08	0.01	0.33	0.81	0.17
O4'	0.06	0.14	0.02	0.02	0.04	0.08	0.07	0.06	0.16	0.07	0.19	0.08	0.22	0.02	0.03	0.05	0.01	0.11	0.08	0.37	0.87	0.25
O5'	0.32	0.46	0.39	0.42	0.39	0.34	0.41	0.37	0.49	0.30	0.51	0.41	0.55	0.34	0.34	0.35	0.45	0.27	0.38	0.78	0.45	0.21
OP1	0.19	0.34	0.23	0.24	0.23	0.18	0.21	0.19	0.29	0.11	0.36	0.29	0.28	0.11	0.18	0.21	0.25	0.14	0.17	0.60	0.64	0.00
OP2	0.24	0.42	0.35	0.40	0.32	0.28	0.34	0.31	0.44	0.23	0.47	0.35	0.49	0.26	0.26	0.29	0.44	0.18	0.36	0.74	0.43	0.19
P	0.37	0.52	0.44	0.48	0.43	0.39	0.43	0.41	0.52	0.32	0.56	0.46	0.55	0.34	0.37	0.40	0.50	0.31	0.42	0.81	0.41	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.20	0.10
C2	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.39	0.45	0.06
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.14	0.09	0.03
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.05	0.03
C4	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.05	0.40	0.43	0.06
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03
C5	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.07	0.48	0.53	0.04
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.06	0.10	0.04	0.03	0.07	0.11	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.25	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.50	0.57	0.03
C8	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.10	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.07	0.45	0.46	0.06
N1	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.45	0.53	0.04
N3	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.35	0.39	0.06
N6	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.08	0.54	0.63	0.02
N7	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.09	0.53	0.56	0.03
N9	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.35	0.36	0.08
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02
O3'	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.00	0.02	0.04	0.04	0.21	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.14	0.11	0.14
O5'	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.05	0.03	0.08	0.09	0.03	0.02	0.04	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.21	0.39	0.14	0.06	0.40	0.03	0.48	0.05	0.50	0.45	0.45	0.35	0.54	0.53	0.35	0.08	0.04	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.45	0.09	0.05	0.43	0.11	0.53	0.25	0.57	0.46	0.53	0.39	0.63	0.56	0.36	0.03	0.21	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.06	0.03	0.03	0.06	0.03	0.04	0.01	0.03	0.06	0.04	0.06	0.02	0.03	0.08	0.02	0.07	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00