Doublet Group distance statistics: 51284

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 7, 6, 9, 5, 7, 5, 3, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.002, 0.025, 0.047, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.025 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.001, 0.027, 0.052, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.027 std_dev=0.025
N1	A	0, 0.001, 0.028, 0.055, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.028 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.002, 0.029, 0.056, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.029 std_dev=0.027
C4	A	0, 0.002, 0.033, 0.065, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.033 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.007, 0.050, 0.094, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.050 std_dev=0.044
N7	A	0, 0.003, 0.055, 0.108, 0.192 max_d=0.192 avg_d=0.055 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.012, 0.070, 0.127, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.070 std_dev=0.058
C8	A	0, 0.002, 0.065, 0.128, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.065 std_dev=0.063
C2'	A	0, 0.020, 0.113, 0.205, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.113 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.028, 0.169, 0.310, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.169 std_dev=0.141
N1	B	0, 0.184, 0.343, 0.501, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.343 std_dev=0.158
O2'	A	0, 0.006, 0.169, 0.333, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.169 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.028, 0.192, 0.356, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.192 std_dev=0.164
N6	B	0, 0.147, 0.337, 0.527, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.337 std_dev=0.190
C2	B	0, 0.237, 0.427, 0.617, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.427 std_dev=0.190
C6	B	0, 0.157, 0.350, 0.543, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.350 std_dev=0.193
C5'	A	0, 0.048, 0.249, 0.450, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.249 std_dev=0.201
N3	B	0, 0.270, 0.498, 0.725, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.498 std_dev=0.227
O3'	A	0, 0.045, 0.275, 0.504, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.275 std_dev=0.229
C4	B	0, 0.239, 0.488, 0.736, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.488 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.189, 0.441, 0.694, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.441 std_dev=0.252
N9	B	0, 0.256, 0.577, 0.899, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.577 std_dev=0.322
N7	B	0, 0.203, 0.537, 0.871, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.537 std_dev=0.334
C2'	B	0, 0.307, 0.656, 1.005, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.656 std_dev=0.349
C1'	B	0, 0.306, 0.668, 1.030, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.668 std_dev=0.362
C8	B	0, 0.227, 0.597, 0.967, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.597 std_dev=0.370
O5'	A	0, -0.047, 0.333, 0.712, 2.437 max_d=2.437 avg_d=0.333 std_dev=0.380
O2'	B	0, 0.373, 0.759, 1.145, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.759 std_dev=0.386
C3'	B	0, 0.296, 0.689, 1.082, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.689 std_dev=0.393
OP1	A	0, -0.009, 0.409, 0.828, 2.555 max_d=2.555 avg_d=0.409 std_dev=0.418
O4'	B	0, 0.320, 0.743, 1.167, 2.121 max_d=2.121 avg_d=0.743 std_dev=0.423
C4'	B	0, 0.335, 0.776, 1.217, 2.167 max_d=2.167 avg_d=0.776 std_dev=0.441
O3'	B	0, 0.313, 0.756, 1.199, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.756 std_dev=0.443
P	A	0, -0.062, 0.413, 0.887, 3.160 max_d=3.160 avg_d=0.413 std_dev=0.474
C5'	B	0, 0.330, 0.814, 1.298, 2.495 max_d=2.495 avg_d=0.814 std_dev=0.484
O5'	B	0, 0.189, 0.788, 1.387, 3.631 max_d=3.631 avg_d=0.788 std_dev=0.599
OP2	B	0, 0.184, 0.789, 1.393, 3.545 max_d=3.545 avg_d=0.789 std_dev=0.605
P	B	0, 0.246, 0.875, 1.503, 3.518 max_d=3.518 avg_d=0.875 std_dev=0.629
OP1	B	0, 0.317, 1.056, 1.795, 3.466 max_d=3.466 avg_d=1.056 std_dev=0.739
OP2	A	0, -0.305, 0.533, 1.371, 5.989 max_d=5.989 avg_d=0.533 std_dev=0.838

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.07	0.20	0.13
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.22	0.15	0.42	0.25
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.07	0.05	0.09	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.08	0.15	0.09
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.12	0.08	0.11	0.07	0.15	0.11	0.05	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.14	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.23	0.15	0.43	0.26
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.03	0.09	0.08	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.30	0.21	0.56	0.34
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.09	0.05	0.14	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.02	0.30	0.22	0.59	0.35
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03	0.31	0.19	0.53	0.34
N1	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.03	0.27	0.20	0.52	0.31
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.19	0.13	0.36	0.22
N6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.18	0.02	0.33	0.25	0.67	0.40
N7	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.33	0.23	0.63	0.39
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.23	0.13	0.38	0.24
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.06	0.04	0.07	0.04	0.01	0.00	0.05	0.03	0.08	0.08	0.09	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.14	0.09	0.14	0.09	0.18	0.12	0.06	0.05	0.00	0.01	0.12	0.14	0.11	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.10	0.08	0.16	0.10
O5'	0.12	0.22	0.10	0.12	0.23	0.01	0.30	0.01	0.30	0.31	0.27	0.19	0.33	0.33	0.23	0.08	0.12	0.10	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.07	0.15	0.08	0.10	0.15	0.05	0.21	0.06	0.22	0.19	0.20	0.13	0.25	0.23	0.13	0.08	0.14	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.42	0.15	0.14	0.43	0.05	0.56	0.02	0.59	0.53	0.52	0.36	0.67	0.63	0.38	0.09	0.11	0.16	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.25	0.09	0.10	0.26	0.02	0.34	0.01	0.35	0.34	0.31	0.22	0.40	0.39	0.24	0.07	0.11	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.13	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.09	0.09	0.13	0.11	0.09	0.09	0.08	0.10	0.08	0.08	0.20	0.20	0.23	0.21
C2	0.11	0.15	0.11	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.09	0.12	0.14	0.14	0.10	0.10	0.13	0.10	0.10	0.17	0.16	0.19	0.18
C2'	0.09	0.15	0.10	0.09	0.10	0.08	0.09	0.10	0.10	0.11	0.14	0.13	0.11	0.12	0.09	0.11	0.09	0.09	0.21	0.21	0.24	0.22
C3'	0.09	0.15	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.10	0.10	0.12	0.14	0.13	0.11	0.12	0.09	0.12	0.09	0.10	0.21	0.20	0.23	0.22
C4	0.08	0.15	0.09	0.07	0.09	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.13	0.13	0.07	0.08	0.07	0.11	0.08	0.07	0.18	0.17	0.21	0.19
C4'	0.11	0.13	0.10	0.08	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.13	0.13	0.11	0.11	0.13	0.11	0.11	0.09	0.12	0.21	0.22	0.23	0.23
C5	0.10	0.15	0.10	0.08	0.10	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.12	0.14	0.09	0.09	0.09	0.13	0.09	0.09	0.16	0.16	0.19	0.17
C5'	0.11	0.13	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.11	0.10	0.14	0.13	0.11	0.11	0.13	0.11	0.11	0.09	0.13	0.21	0.23	0.23	0.24
C6	0.13	0.15	0.13	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.12	0.15	0.12	0.11	0.12	0.15	0.11	0.12	0.16	0.15	0.18	0.17
C8	0.08	0.15	0.09	0.07	0.09	0.07	0.07	0.08	0.08	0.07	0.13	0.13	0.07	0.07	0.07	0.11	0.08	0.07	0.18	0.18	0.22	0.19
N1	0.13	0.16	0.13	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.16	0.14	0.12	0.12	0.16	0.12	0.13	0.16	0.16	0.18	0.17
N3	0.08	0.15	0.09	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.12	0.13	0.09	0.08	0.07	0.11	0.08	0.07	0.19	0.17	0.21	0.19
N6	0.15	0.16	0.15	0.12	0.14	0.14	0.12	0.13	0.12	0.13	0.13	0.16	0.13	0.13	0.14	0.18	0.12	0.15	0.15	0.16	0.17	0.16
N7	0.09	0.15	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.12	0.13	0.08	0.08	0.08	0.13	0.08	0.08	0.17	0.16	0.20	0.17
N9	0.07	0.14	0.08	0.07	0.08	0.06	0.07	0.07	0.08	0.07	0.13	0.12	0.07	0.08	0.07	0.10	0.08	0.07	0.19	0.18	0.22	0.20
O2'	0.11	0.14	0.10	0.09	0.11	0.10	0.12	0.12	0.12	0.14	0.14	0.12	0.14	0.16	0.11	0.11	0.09	0.12	0.21	0.21	0.24	0.23
O3'	0.11	0.17	0.13	0.12	0.12	0.11	0.11	0.13	0.12	0.13	0.16	0.15	0.12	0.14	0.11	0.15	0.13	0.12	0.21	0.21	0.23	0.21
O4'	0.10	0.13	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.10	0.11	0.13	0.11	0.10	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.20	0.20	0.23	0.22
O5'	0.11	0.19	0.11	0.11	0.10	0.13	0.10	0.15	0.13	0.14	0.19	0.14	0.13	0.13	0.11	0.11	0.11	0.14	0.30	0.36	0.35	0.36
OP1	0.12	0.18	0.12	0.12	0.12	0.13	0.12	0.14	0.14	0.15	0.19	0.15	0.14	0.14	0.12	0.13	0.12	0.15	0.29	0.34	0.33	0.34
OP2	0.11	0.29	0.12	0.14	0.14	0.16	0.13	0.23	0.20	0.15	0.29	0.22	0.20	0.14	0.11	0.12	0.14	0.15	0.40	0.52	0.50	0.50
P	0.11	0.21	0.10	0.10	0.11	0.12	0.10	0.15	0.15	0.13	0.21	0.16	0.15	0.12	0.11	0.11	0.11	0.13	0.31	0.38	0.37	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.13	0.06	0.10
C2	0.06	0.00	0.11	0.10	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.12	0.05	0.13	0.13	0.15	0.14
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.09	0.11	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.08	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.08	0.09	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.08	0.09	0.08
C4	0.02	0.02	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.13	0.13	0.13	0.13
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.04	0.05	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.06	0.05
C5	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.16	0.13	0.17	0.15
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.07	0.07	0.09	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.16	0.14	0.19	0.16
C8	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.15	0.14	0.12	0.14
N1	0.04	0.01	0.09	0.08	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.11	0.10	0.03	0.15	0.13	0.18	0.15
N3	0.05	0.01	0.11	0.09	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.12	0.05	0.12	0.14	0.12	0.13
N6	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.06	0.03	0.19	0.16	0.23	0.18
N7	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.17	0.14	0.17	0.16
N9	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.11	0.13	0.09	0.12
O2'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.11	0.12	0.07	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.03	0.07	0.07	0.06
O3'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.10	0.12	0.06	0.07	0.03	0.04	0.00	0.02	0.12	0.15	0.11	0.10
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.18	0.09	0.13
O5'	0.05	0.13	0.08	0.12	0.13	0.01	0.16	0.01	0.16	0.15	0.15	0.12	0.19	0.17	0.11	0.03	0.12	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.13	0.13	0.06	0.08	0.13	0.07	0.13	0.05	0.14	0.14	0.13	0.14	0.16	0.14	0.13	0.07	0.15	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.15	0.08	0.09	0.13	0.06	0.17	0.09	0.19	0.12	0.18	0.12	0.23	0.17	0.09	0.07	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.07	0.08	0.13	0.05	0.15	0.02	0.16	0.14	0.15	0.13	0.18	0.16	0.12	0.06	0.10	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00