Doublet Group distance statistics: 51285

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.001, 0.020, 0.039, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.019
N3	A	0, -0.001, 0.024, 0.049, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.024 std_dev=0.025
N1	A	0, -0.007, 0.022, 0.051, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.022 std_dev=0.029
C5	A	0, -0.001, 0.028, 0.058, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.028 std_dev=0.030
C4	A	0, -0.008, 0.034, 0.076, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.034 std_dev=0.042
N9	A	0, -0.009, 0.042, 0.093, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.042 std_dev=0.051
N6	A	0, -0.003, 0.055, 0.112, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.055 std_dev=0.058
N7	A	0, -0.016, 0.055, 0.127, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.055 std_dev=0.071
C8	A	0, -0.018, 0.076, 0.170, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.076 std_dev=0.094
O4'	A	0, 0.065, 0.180, 0.294, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.180 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.087, 0.258, 0.429, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.258 std_dev=0.171
C4'	A	0, 0.081, 0.257, 0.433, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.257 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.131, 0.340, 0.549, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.340 std_dev=0.209
O2'	A	0, 0.085, 0.330, 0.576, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.330 std_dev=0.245
C5'	A	0, 0.157, 0.455, 0.753, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.455 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.196, 0.543, 0.889, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.543 std_dev=0.347
O3'	A	0, 0.175, 0.535, 0.896, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.535 std_dev=0.361
C2	B	0, 0.213, 0.627, 1.040, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.627 std_dev=0.413
C6	B	0, 0.157, 0.583, 1.008, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.583 std_dev=0.426
N6	B	0, 0.117, 0.568, 1.020, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.568 std_dev=0.451
N3	B	0, 0.224, 0.714, 1.205, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.714 std_dev=0.490
C2'	B	0, 0.349, 0.874, 1.399, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.874 std_dev=0.525
O3'	B	0, 0.409, 0.937, 1.465, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.937 std_dev=0.528
C4	B	0, 0.202, 0.735, 1.267, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.735 std_dev=0.533
C5	B	0, 0.152, 0.691, 1.231, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.691 std_dev=0.540
C3'	B	0, 0.367, 0.921, 1.475, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.921 std_dev=0.554
OP1	A	0, 0.167, 0.801, 1.434, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.801 std_dev=0.633
N9	B	0, 0.210, 0.858, 1.507, 2.269 max_d=2.269 avg_d=0.858 std_dev=0.649
O2'	B	0, 0.376, 1.032, 1.689, 2.031 max_d=2.031 avg_d=1.032 std_dev=0.656
N7	B	0, 0.101, 0.804, 1.507, 2.471 max_d=2.471 avg_d=0.804 std_dev=0.703
C1'	B	0, 0.266, 0.981, 1.697, 2.458 max_d=2.458 avg_d=0.981 std_dev=0.715
C8	B	0, 0.143, 0.887, 1.631, 2.621 max_d=2.621 avg_d=0.887 std_dev=0.744
O5'	A	0, -0.025, 0.783, 1.590, 2.778 max_d=2.778 avg_d=0.783 std_dev=0.807
C4'	B	0, 0.302, 1.117, 1.932, 2.809 max_d=2.809 avg_d=1.117 std_dev=0.815
O4'	B	0, 0.245, 1.139, 2.033, 3.107 max_d=3.107 avg_d=1.139 std_dev=0.894
C5'	B	0, 0.188, 1.208, 2.227, 3.560 max_d=3.560 avg_d=1.208 std_dev=1.020
O5'	B	0, 0.069, 1.123, 2.177, 3.675 max_d=3.675 avg_d=1.123 std_dev=1.054
P	A	0, -0.090, 0.983, 2.056, 3.664 max_d=3.664 avg_d=0.983 std_dev=1.073
OP2	B	0, -0.196, 1.223, 2.642, 4.835 max_d=4.835 avg_d=1.223 std_dev=1.419
P	B	0, -0.167, 1.288, 2.742, 4.971 max_d=4.971 avg_d=1.288 std_dev=1.455
OP1	B	0, -0.177, 1.369, 2.916, 5.258 max_d=5.258 avg_d=1.369 std_dev=1.546
OP2	A	0, -0.596, 1.385, 3.366, 6.528 max_d=6.528 avg_d=1.385 std_dev=1.981

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.19	0.04	0.32	0.21
C2	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.03	0.36	0.11	0.76	0.44
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.09	0.07	0.09	0.07	0.11	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.20	0.11	0.32	0.17
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.14	0.08	0.13	0.09	0.16	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.27	0.17	0.36	0.20
C4	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.40	0.12	0.79	0.47
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.05	0.04	0.02	0.06	0.05	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.15	0.02	0.51	0.17	1.08	0.62
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.03	0.10	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.19	0.03	0.52	0.19	1.14	0.65
C8	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.02	0.55	0.17	1.03	0.62
N1	0.01	0.00	0.09	0.13	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.45	0.15	0.98	0.56
N3	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.03	0.31	0.08	0.63	0.37
N6	0.01	0.01	0.11	0.16	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.23	0.03	0.59	0.23	1.33	0.75
N7	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.16	0.02	0.60	0.21	1.24	0.72
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.38	0.10	0.70	0.43
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.04	0.07	0.04	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.07	0.03	0.00	0.05	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05
O3'	0.02	0.14	0.02	0.00	0.10	0.01	0.15	0.02	0.19	0.11	0.17	0.11	0.23	0.16	0.05	0.05	0.00	0.01	0.16	0.20	0.19	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.07	0.15	0.12
O5'	0.19	0.36	0.20	0.27	0.40	0.01	0.51	0.01	0.52	0.55	0.45	0.31	0.59	0.60	0.38	0.03	0.16	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.11	0.11	0.17	0.12	0.04	0.17	0.05	0.19	0.17	0.15	0.08	0.23	0.21	0.10	0.04	0.20	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.76	0.32	0.36	0.79	0.03	1.08	0.02	1.14	1.03	0.98	0.63	1.33	1.24	0.70	0.06	0.19	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.44	0.17	0.20	0.47	0.02	0.62	0.01	0.65	0.62	0.56	0.37	0.75	0.72	0.43	0.05	0.11	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.21	0.11	0.10	0.19	0.16	0.18	0.17	0.19	0.17	0.21	0.21	0.17	0.17	0.19	0.11	0.09	0.20	0.14	0.85	0.67	0.17
C2	0.12	0.09	0.12	0.10	0.12	0.11	0.15	0.10	0.15	0.15	0.11	0.09	0.20	0.16	0.13	0.13	0.10	0.13	0.12	0.59	0.65	0.13
C2'	0.34	0.27	0.22	0.24	0.34	0.35	0.37	0.41	0.35	0.40	0.29	0.30	0.40	0.41	0.36	0.20	0.19	0.40	0.41	1.14	0.39	0.48
C3'	0.36	0.26	0.23	0.27	0.35	0.39	0.38	0.47	0.34	0.42	0.27	0.29	0.38	0.43	0.38	0.21	0.21	0.43	0.47	1.23	0.32	0.57
C4	0.08	0.10	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09	0.08	0.09	0.07	0.07	0.10	0.72	0.66	0.12
C4'	0.30	0.26	0.17	0.17	0.29	0.29	0.29	0.33	0.27	0.31	0.26	0.28	0.27	0.30	0.30	0.17	0.12	0.35	0.29	1.05	0.54	0.34
C5	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.10	0.07	0.10	0.10	0.08	0.08	0.13	0.11	0.09	0.11	0.08	0.09	0.10	0.70	0.65	0.12
C5'	0.28	0.24	0.15	0.15	0.26	0.27	0.25	0.31	0.24	0.27	0.23	0.25	0.23	0.26	0.27	0.16	0.11	0.32	0.27	1.03	0.55	0.32
C6	0.15	0.12	0.13	0.10	0.14	0.12	0.15	0.10	0.15	0.15	0.13	0.12	0.18	0.16	0.14	0.16	0.10	0.15	0.11	0.63	0.64	0.13
C8	0.09	0.11	0.07	0.08	0.09	0.09	0.09	0.11	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.10	0.09	0.08	0.07	0.10	0.12	0.80	0.65	0.15
N1	0.18	0.14	0.15	0.12	0.17	0.14	0.18	0.12	0.19	0.18	0.17	0.14	0.21	0.19	0.17	0.18	0.11	0.18	0.13	0.58	0.64	0.14
N3	0.07	0.11	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.09	0.09	0.10	0.12	0.10	0.07	0.09	0.08	0.07	0.09	0.67	0.67	0.12
N6	0.19	0.16	0.16	0.12	0.18	0.15	0.18	0.12	0.18	0.18	0.17	0.16	0.19	0.18	0.18	0.21	0.12	0.19	0.12	0.62	0.63	0.13
N7	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.08	0.09	0.09	0.08	0.07	0.11	0.10	0.08	0.10	0.08	0.08	0.10	0.75	0.65	0.13
N9	0.11	0.14	0.08	0.08	0.12	0.10	0.11	0.12	0.11	0.11	0.13	0.14	0.11	0.10	0.11	0.08	0.08	0.12	0.11	0.79	0.66	0.14
O2'	0.46	0.37	0.28	0.29	0.46	0.45	0.50	0.51	0.47	0.53	0.39	0.40	0.53	0.55	0.48	0.26	0.21	0.53	0.49	1.22	0.36	0.56
O3'	0.53	0.34	0.37	0.43	0.49	0.60	0.55	0.72	0.48	0.64	0.36	0.40	0.53	0.66	0.56	0.33	0.35	0.64	0.73	1.52	0.22	0.88
O4'	0.19	0.22	0.10	0.09	0.19	0.14	0.16	0.15	0.17	0.15	0.20	0.21	0.14	0.13	0.18	0.11	0.08	0.20	0.10	0.82	0.74	0.12
O5'	0.18	0.35	0.11	0.06	0.23	0.10	0.19	0.08	0.26	0.12	0.34	0.30	0.24	0.12	0.17	0.13	0.07	0.15	0.07	0.66	0.90	0.15
OP1	0.18	0.22	0.11	0.10	0.19	0.16	0.18	0.18	0.19	0.16	0.22	0.21	0.19	0.16	0.18	0.12	0.08	0.19	0.16	0.86	0.68	0.21
OP2	0.12	0.49	0.09	0.11	0.21	0.15	0.16	0.24	0.29	0.16	0.48	0.37	0.25	0.15	0.12	0.12	0.13	0.14	0.29	0.24	1.28	0.45
P	0.17	0.39	0.10	0.06	0.23	0.08	0.20	0.06	0.27	0.11	0.38	0.32	0.24	0.11	0.17	0.13	0.08	0.14	0.09	0.58	0.98	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.27	0.18	0.06
C2	0.03	0.00	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.14	0.57	0.40	0.16
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.12	0.12	0.04
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.07	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03
C4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.12	0.54	0.39	0.13
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.05	0.02	0.07	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.15	0.66	0.50	0.17
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.10	0.10	0.06	0.14	0.12	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.14	0.27	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.17	0.71	0.53	0.20
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.11	0.57	0.45	0.13
N1	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.17	0.66	0.48	0.19
N3	0.03	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.11	0.49	0.35	0.12
N6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.18	0.79	0.59	0.23
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.03	0.15	0.71	0.55	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.09	0.45	0.34	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.06	0.07	0.04	0.03	0.00	0.06	0.02	0.03	0.07	0.03	0.03
O3'	0.03	0.08	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.07	0.07	0.05	0.03	0.06	0.00	0.03	0.05	0.18	0.13	0.05
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.20	0.08	0.07
O5'	0.03	0.14	0.03	0.03	0.12	0.01	0.15	0.01	0.17	0.11	0.17	0.11	0.18	0.15	0.09	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.27	0.57	0.12	0.02	0.54	0.04	0.66	0.14	0.71	0.57	0.66	0.49	0.79	0.71	0.45	0.07	0.18	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.40	0.12	0.04	0.39	0.12	0.50	0.27	0.53	0.45	0.48	0.35	0.59	0.55	0.34	0.03	0.13	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.16	0.04	0.03	0.13	0.02	0.17	0.01	0.20	0.13	0.19	0.12	0.23	0.17	0.10	0.03	0.05	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00