Doublet Group distance statistics: 51288

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 5, 10, 19, 14, 11, 4, 0, 3, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.012, 0.030, 0.047, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.030 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.010, 0.031, 0.051, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.031 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.012, 0.039, 0.065, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.039 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.028, 0.062, 0.096, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.062 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.033, 0.071, 0.110, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.071 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.029, 0.076, 0.122, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.076 std_dev=0.047
N3	B	0, 0.173, 0.347, 0.521, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.347 std_dev=0.174
C2'	B	0, 0.210, 0.408, 0.605, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.408 std_dev=0.197
C2	B	0, 0.158, 0.357, 0.556, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.357 std_dev=0.199
N2	B	0, 0.140, 0.347, 0.555, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.347 std_dev=0.208
O2'	B	0, 0.172, 0.382, 0.593, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.382 std_dev=0.211
O2'	A	0, 0.102, 0.324, 0.546, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.324 std_dev=0.222
C2'	A	0, 0.026, 0.254, 0.481, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.254 std_dev=0.227
C1'	B	0, 0.223, 0.451, 0.680, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.451 std_dev=0.228
C4	B	0, 0.180, 0.419, 0.657, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.419 std_dev=0.238
O4'	A	0, 0.001, 0.245, 0.488, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.245 std_dev=0.243
N1	B	0, 0.165, 0.429, 0.692, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.429 std_dev=0.264
N9	B	0, 0.192, 0.464, 0.736, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.464 std_dev=0.272
C3'	B	0, 0.225, 0.501, 0.776, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.501 std_dev=0.276
O3'	B	0, 0.241, 0.535, 0.828, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.535 std_dev=0.293
O4'	B	0, 0.240, 0.547, 0.854, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.547 std_dev=0.307
C5	B	0, 0.177, 0.498, 0.819, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.498 std_dev=0.321
C6	B	0, 0.176, 0.503, 0.830, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.503 std_dev=0.327
C4'	B	0, 0.224, 0.552, 0.880, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.552 std_dev=0.328
C4'	A	0, 0.024, 0.395, 0.767, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.395 std_dev=0.372
C8	B	0, 0.183, 0.565, 0.947, 1.711 max_d=1.711 avg_d=0.565 std_dev=0.382
C3'	A	0, -0.004, 0.388, 0.779, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.388 std_dev=0.391
O6	B	0, 0.175, 0.582, 0.989, 2.423 max_d=2.423 avg_d=0.582 std_dev=0.407
N7	B	0, 0.177, 0.589, 1.002, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.589 std_dev=0.412
C5'	B	0, 0.257, 0.697, 1.137, 1.967 max_d=1.967 avg_d=0.697 std_dev=0.440
O3'	A	0, 0.035, 0.568, 1.101, 2.035 max_d=2.035 avg_d=0.568 std_dev=0.533
C5'	A	0, 0.101, 0.699, 1.297, 2.277 max_d=2.277 avg_d=0.699 std_dev=0.598
O5'	A	0, 0.074, 0.858, 1.641, 3.146 max_d=3.146 avg_d=0.858 std_dev=0.784
O5'	B	0, 0.192, 1.000, 1.807, 3.267 max_d=3.267 avg_d=1.000 std_dev=0.807
P	B	0, 0.248, 1.265, 2.283, 4.005 max_d=4.005 avg_d=1.265 std_dev=1.017
OP2	B	0, 0.309, 1.472, 2.636, 4.870 max_d=4.870 avg_d=1.472 std_dev=1.164
OP2	A	0, 0.133, 1.347, 2.561, 5.358 max_d=5.358 avg_d=1.347 std_dev=1.214
OP1	B	0, 0.176, 1.405, 2.634, 4.825 max_d=4.825 avg_d=1.405 std_dev=1.229
P	A	0, 0.026, 1.256, 2.487, 4.499 max_d=4.499 avg_d=1.256 std_dev=1.230
OP1	A	0, -0.115, 1.634, 3.383, 5.947 max_d=5.947 avg_d=1.634 std_dev=1.749

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.18	0.19	0.20	0.13
C2	0.02	0.00	0.22	0.22	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.29	0.11	0.36	0.50	0.55	0.36
C2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.12	0.01	0.08	0.02	0.12	0.10	0.18	0.22	0.10	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.20	0.34	0.18	0.16
C3'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.14	0.01	0.12	0.03	0.16	0.10	0.21	0.20	0.15	0.09	0.06	0.02	0.01	0.02	0.24	0.44	0.13	0.20
C4	0.01	0.01	0.12	0.14	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.16	0.06	0.40	0.47	0.53	0.37
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.04	0.10	0.11	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.14	0.16	0.05
C5	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.04	0.53	0.63	0.72	0.52
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.13	0.01	0.19	0.00	0.19	0.21	0.16	0.09	0.23	0.23	0.12	0.05	0.05	0.01	0.01	0.25	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.16	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.20	0.06	0.54	0.68	0.78	0.55
C8	0.01	0.01	0.10	0.10	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.11	0.07	0.55	0.57	0.62	0.49
N1	0.02	0.00	0.18	0.21	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.27	0.09	0.46	0.61	0.69	0.47
N3	0.02	0.01	0.22	0.20	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.25	0.11	0.31	0.42	0.45	0.29
N6	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.19	0.05	0.61	0.79	0.90	0.65
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.04	0.61	0.70	0.80	0.61
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.38	0.39	0.43	0.32
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.10	0.05	0.08	0.05	0.12	0.08	0.16	0.18	0.11	0.07	0.03	0.00	0.06	0.05	0.05	0.25	0.10	0.07
O3'	0.03	0.29	0.03	0.01	0.16	0.03	0.14	0.05	0.20	0.11	0.27	0.25	0.19	0.10	0.06	0.06	0.00	0.03	0.16	0.51	0.19	0.21
O4'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.09	0.11	0.05	0.04	0.01	0.05	0.03	0.00	0.07	0.10	0.13	0.12
O5'	0.18	0.36	0.20	0.24	0.40	0.02	0.53	0.01	0.54	0.55	0.46	0.31	0.61	0.61	0.38	0.05	0.16	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.19	0.50	0.34	0.44	0.47	0.14	0.63	0.25	0.68	0.57	0.61	0.42	0.79	0.70	0.39	0.25	0.51	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.55	0.18	0.13	0.53	0.16	0.72	0.27	0.78	0.62	0.69	0.45	0.90	0.80	0.43	0.10	0.19	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.36	0.16	0.20	0.37	0.05	0.52	0.02	0.55	0.49	0.47	0.29	0.65	0.61	0.32	0.07	0.21	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.15	0.11	0.14	0.13	0.10	0.14	0.12	0.16	0.13	0.17	0.16	0.13	0.14	0.12	0.11	0.17	0.13	0.21	0.17	0.27	0.31	0.20
C2	0.10	0.13	0.12	0.13	0.10	0.10	0.11	0.11	0.12	0.10	0.13	0.14	0.12	0.10	0.10	0.11	0.15	0.11	0.16	0.12	0.21	0.26	0.14
C2'	0.26	0.29	0.27	0.30	0.28	0.27	0.29	0.28	0.30	0.28	0.30	0.30	0.28	0.29	0.27	0.25	0.32	0.26	0.40	0.31	0.44	0.49	0.40
C3'	0.27	0.29	0.32	0.37	0.28	0.30	0.30	0.32	0.32	0.29	0.31	0.28	0.27	0.31	0.28	0.30	0.41	0.26	0.42	0.34	0.47	0.52	0.42
C4	0.11	0.12	0.12	0.14	0.10	0.11	0.10	0.11	0.11	0.10	0.12	0.14	0.11	0.10	0.10	0.11	0.16	0.12	0.14	0.12	0.24	0.28	0.15
C4'	0.12	0.17	0.14	0.18	0.15	0.12	0.17	0.14	0.20	0.15	0.20	0.17	0.14	0.17	0.14	0.14	0.24	0.14	0.23	0.23	0.28	0.34	0.22
C5	0.12	0.12	0.13	0.14	0.10	0.13	0.10	0.14	0.11	0.10	0.12	0.14	0.11	0.10	0.10	0.13	0.17	0.13	0.15	0.11	0.31	0.34	0.20
C5'	0.15	0.16	0.18	0.22	0.15	0.17	0.17	0.17	0.20	0.16	0.19	0.16	0.14	0.17	0.15	0.20	0.31	0.17	0.21	0.22	0.28	0.30	0.19
C6	0.14	0.13	0.14	0.15	0.12	0.15	0.11	0.16	0.12	0.12	0.12	0.14	0.12	0.12	0.12	0.14	0.17	0.15	0.19	0.12	0.35	0.40	0.25
C8	0.11	0.13	0.12	0.15	0.10	0.12	0.11	0.13	0.13	0.10	0.14	0.15	0.11	0.10	0.10	0.12	0.19	0.13	0.14	0.14	0.29	0.31	0.17
N1	0.13	0.14	0.14	0.14	0.12	0.13	0.12	0.13	0.13	0.12	0.13	0.14	0.13	0.12	0.12	0.12	0.15	0.14	0.15	0.13	0.27	0.34	0.19
N3	0.11	0.12	0.12	0.14	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.10	0.12	0.14	0.11	0.10	0.10	0.11	0.15	0.12	0.19	0.12	0.23	0.27	0.17
N6	0.17	0.13	0.17	0.18	0.13	0.20	0.13	0.22	0.13	0.15	0.13	0.14	0.13	0.14	0.15	0.17	0.20	0.19	0.29	0.13	0.48	0.54	0.38
N7	0.12	0.12	0.13	0.15	0.10	0.15	0.10	0.15	0.11	0.10	0.12	0.14	0.11	0.10	0.10	0.13	0.19	0.14	0.16	0.12	0.35	0.37	0.23
N9	0.11	0.13	0.12	0.14	0.11	0.11	0.12	0.12	0.13	0.10	0.14	0.15	0.11	0.11	0.10	0.11	0.17	0.12	0.15	0.14	0.25	0.28	0.15
O2'	0.24	0.29	0.22	0.25	0.27	0.23	0.28	0.26	0.30	0.26	0.30	0.30	0.26	0.28	0.25	0.21	0.26	0.24	0.42	0.31	0.46	0.52	0.43
O3'	0.36	0.39	0.42	0.47	0.39	0.41	0.43	0.44	0.45	0.41	0.43	0.37	0.36	0.43	0.38	0.38	0.52	0.36	0.55	0.48	0.61	0.68	0.57
O4'	0.18	0.21	0.14	0.15	0.21	0.15	0.22	0.16	0.23	0.21	0.23	0.20	0.20	0.22	0.20	0.13	0.16	0.20	0.20	0.24	0.26	0.29	0.19
O5'	0.28	0.20	0.34	0.37	0.22	0.34	0.21	0.33	0.22	0.23	0.22	0.20	0.22	0.22	0.24	0.41	0.46	0.31	0.38	0.25	0.39	0.34	0.34
OP1	0.46	0.45	0.61	0.69	0.47	0.56	0.51	0.57	0.54	0.50	0.51	0.42	0.44	0.53	0.47	0.60	0.82	0.45	0.64	0.59	0.77	0.70	0.64
OP2	0.51	0.29	0.56	0.60	0.36	0.61	0.31	0.60	0.27	0.40	0.26	0.27	0.35	0.34	0.42	0.66	0.70	0.55	0.59	0.27	0.58	0.47	0.54
P	0.31	0.23	0.37	0.41	0.25	0.37	0.26	0.36	0.27	0.27	0.27	0.23	0.24	0.26	0.27	0.43	0.52	0.34	0.37	0.31	0.45	0.35	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.23	0.03	0.21	0.20	0.20
C2	0.04	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.14	0.04	0.45	0.02	0.48	0.53	0.45
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.07	0.10	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.23	0.07	0.24	0.20	0.18
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.03	0.12	0.09	0.13	0.14	0.11	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.31	0.12	0.33	0.25	0.24
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.47	0.02	0.49	0.54	0.48
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.07	0.05	0.08	0.05	0.06	0.03	0.01	0.02	0.09	0.12	0.29	0.06
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.59	0.02	0.66	0.75	0.63
C5'	0.04	0.14	0.03	0.03	0.14	0.01	0.18	0.00	0.20	0.17	0.17	0.13	0.12	0.20	0.12	0.06	0.05	0.02	0.01	0.22	0.24	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.02	0.60	0.01	0.70	0.80	0.67
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.59	0.02	0.61	0.70	0.62
N1	0.03	0.01	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.15	0.03	0.54	0.02	0.61	0.68	0.57
N2	0.04	0.01	0.10	0.14	0.02	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.16	0.05	0.40	0.03	0.42	0.47	0.40
N3	0.03	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.03	0.39	0.02	0.40	0.43	0.39
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.65	0.02	0.74	0.87	0.73
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.44	0.02	0.43	0.46	0.43
O2'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.09	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.09	0.08	0.23	0.33	0.16
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.03	0.11	0.05	0.14	0.10	0.15	0.16	0.12	0.12	0.06	0.06	0.00	0.03	0.22	0.15	0.31	0.51	0.28
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.15	0.03	0.16	0.20	0.15
O5'	0.23	0.45	0.23	0.31	0.47	0.02	0.59	0.01	0.60	0.59	0.54	0.40	0.39	0.65	0.44	0.09	0.22	0.15	0.00	0.65	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.07	0.12	0.02	0.09	0.02	0.22	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.15	0.03	0.65	0.00	0.81	0.92	0.75
OP1	0.21	0.48	0.24	0.33	0.49	0.12	0.66	0.24	0.70	0.61	0.61	0.42	0.40	0.74	0.43	0.23	0.31	0.16	0.02	0.81	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.53	0.20	0.25	0.54	0.29	0.75	0.37	0.80	0.70	0.68	0.47	0.43	0.87	0.46	0.33	0.51	0.20	0.02	0.92	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.45	0.18	0.24	0.48	0.06	0.63	0.02	0.67	0.62	0.57	0.40	0.39	0.73	0.43	0.16	0.28	0.15	0.01	0.75	0.01	0.01	0.00