Doublet Group distance statistics: 51289

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 8, 6, 7, 10, 11, 5, 6, 5, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.007, 0.035, 0.063, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.035 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.006, 0.035, 0.063, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.035 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.008, 0.040, 0.072, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.040 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.300, 0.479, 0.658, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.479 std_dev=0.179
O4'	A	0, 0.293, 0.474, 0.654, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.474 std_dev=0.181
O2'	A	0, 0.317, 0.530, 0.744, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.530 std_dev=0.213
O2'	B	0, 0.487, 0.740, 0.992, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.740 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.431, 0.690, 0.948, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.690 std_dev=0.259
C4'	A	0, 0.442, 0.705, 0.968, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.705 std_dev=0.263
C3'	A	0, 0.490, 0.770, 1.049, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.770 std_dev=0.280
N2	B	0, 0.503, 0.790, 1.077, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.790 std_dev=0.287
C4	B	0, 0.399, 0.690, 0.982, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.690 std_dev=0.292
N9	B	0, 0.434, 0.728, 1.023, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.728 std_dev=0.294
C1'	B	0, 0.358, 0.661, 0.965, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.661 std_dev=0.304
N3	B	0, 0.316, 0.627, 0.937, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.627 std_dev=0.310
O3'	B	0, 0.633, 0.950, 1.266, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.950 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.541, 0.859, 1.177, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.859 std_dev=0.318
C2	B	0, 0.299, 0.645, 0.990, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.645 std_dev=0.345
N1	B	0, 0.391, 0.744, 1.098, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.744 std_dev=0.353
C5	B	0, 0.522, 0.879, 1.236, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.879 std_dev=0.357
O4'	B	0, 0.442, 0.813, 1.183, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.813 std_dev=0.371
C6	B	0, 0.537, 0.922, 1.308, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.922 std_dev=0.386
C8	B	0, 0.549, 0.941, 1.333, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.941 std_dev=0.392
C4'	B	0, 0.497, 0.896, 1.296, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.896 std_dev=0.400
O3'	A	0, 0.703, 1.115, 1.527, 2.178 max_d=2.178 avg_d=1.115 std_dev=0.412
O5'	A	0, 0.949, 1.367, 1.784, 2.247 max_d=2.247 avg_d=1.367 std_dev=0.418
C5'	A	0, 0.789, 1.228, 1.666, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.228 std_dev=0.439
N7	B	0, 0.603, 1.057, 1.512, 2.085 max_d=2.085 avg_d=1.057 std_dev=0.454
C5'	B	0, 0.628, 1.119, 1.610, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.119 std_dev=0.491
P	A	0, 0.806, 1.307, 1.808, 3.441 max_d=3.441 avg_d=1.307 std_dev=0.501
O6	B	0, 0.636, 1.137, 1.639, 2.227 max_d=2.227 avg_d=1.137 std_dev=0.502
OP1	A	0, 0.728, 1.359, 1.990, 3.361 max_d=3.361 avg_d=1.359 std_dev=0.631
OP2	A	0, 0.740, 1.504, 2.268, 5.985 max_d=5.985 avg_d=1.504 std_dev=0.764
O5'	B	0, 0.862, 1.712, 2.561, 3.677 max_d=3.677 avg_d=1.712 std_dev=0.850
OP1	B	0, 2.482, 3.634, 4.786, 6.052 max_d=6.052 avg_d=3.634 std_dev=1.152
P	B	0, 2.434, 3.587, 4.741, 6.038 max_d=6.038 avg_d=3.587 std_dev=1.154
OP2	B	0, 3.855, 5.370, 6.886, 8.177 max_d=8.177 avg_d=5.370 std_dev=1.516

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.28	0.38	0.27	0.19
C2	0.02	0.00	0.14	0.14	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.06	0.43	0.54	0.47	0.33
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.02	0.08	0.09	0.11	0.14	0.08	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.15	0.23	0.35	0.13
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.12	0.15	0.13	0.13	0.13	0.14	0.07	0.02	0.01	0.02	0.15	0.24	0.39	0.18
C4	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.11	0.03	0.44	0.53	0.45	0.33
C4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.10	0.05	0.04	0.08	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.21	0.31	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.02	0.52	0.59	0.59	0.40
C5'	0.05	0.12	0.02	0.02	0.13	0.01	0.17	0.00	0.17	0.20	0.15	0.10	0.20	0.21	0.13	0.05	0.07	0.02	0.01	0.34	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.03	0.52	0.61	0.63	0.42
C8	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.17	0.04	0.53	0.56	0.52	0.38
N1	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.05	0.48	0.59	0.57	0.38
N3	0.02	0.00	0.14	0.13	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.05	0.39	0.50	0.41	0.29
N6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.19	0.04	0.56	0.64	0.73	0.47
N7	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.18	0.03	0.56	0.62	0.65	0.44
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.42	0.49	0.39	0.30
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.05	0.12	0.14	0.07	0.05	0.02	0.00	0.07	0.05	0.05	0.18	0.35	0.09
O3'	0.02	0.19	0.03	0.01	0.11	0.02	0.14	0.07	0.16	0.17	0.17	0.17	0.19	0.18	0.07	0.07	0.00	0.03	0.27	0.40	0.45	0.30
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.30	0.46	0.21	0.26
O5'	0.28	0.43	0.15	0.15	0.44	0.02	0.52	0.01	0.52	0.53	0.48	0.39	0.56	0.56	0.42	0.05	0.27	0.30	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.38	0.54	0.23	0.24	0.53	0.21	0.59	0.34	0.61	0.56	0.59	0.50	0.64	0.62	0.49	0.18	0.40	0.46	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.47	0.35	0.39	0.45	0.31	0.59	0.34	0.63	0.52	0.57	0.41	0.73	0.65	0.39	0.35	0.45	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.33	0.13	0.18	0.33	0.05	0.40	0.02	0.42	0.38	0.38	0.29	0.47	0.44	0.30	0.09	0.30	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.21	0.20	0.22	0.20	0.20	0.21	0.21	0.21	0.20	0.21	0.22	0.20	0.21	0.20	0.20	0.26	0.22	0.19	0.22	0.31	0.24	0.28
C2	0.15	0.15	0.18	0.21	0.13	0.17	0.13	0.18	0.14	0.13	0.15	0.18	0.14	0.13	0.13	0.18	0.26	0.16	0.15	0.15	0.31	0.19	0.23
C2'	0.23	0.30	0.25	0.28	0.27	0.23	0.29	0.24	0.31	0.27	0.31	0.30	0.27	0.29	0.25	0.21	0.32	0.23	0.23	0.32	0.36	0.29	0.31
C3'	0.20	0.27	0.22	0.25	0.24	0.19	0.26	0.20	0.29	0.23	0.29	0.28	0.24	0.25	0.22	0.18	0.30	0.20	0.19	0.30	0.35	0.27	0.30
C4	0.15	0.12	0.17	0.19	0.12	0.16	0.12	0.17	0.12	0.13	0.12	0.13	0.12	0.13	0.13	0.18	0.25	0.18	0.14	0.12	0.33	0.23	0.28
C4'	0.20	0.23	0.19	0.20	0.21	0.19	0.23	0.20	0.24	0.21	0.25	0.26	0.21	0.22	0.20	0.18	0.25	0.23	0.19	0.26	0.30	0.24	0.27
C5	0.19	0.14	0.17	0.19	0.16	0.19	0.16	0.19	0.15	0.17	0.14	0.14	0.15	0.16	0.17	0.18	0.25	0.22	0.16	0.15	0.39	0.31	0.34
C5'	0.24	0.22	0.18	0.18	0.21	0.23	0.22	0.24	0.23	0.23	0.23	0.24	0.21	0.23	0.22	0.18	0.21	0.29	0.21	0.24	0.32	0.26	0.30
C6	0.23	0.19	0.19	0.20	0.21	0.21	0.21	0.22	0.20	0.22	0.19	0.18	0.20	0.21	0.22	0.19	0.25	0.26	0.20	0.20	0.42	0.34	0.37
C8	0.18	0.14	0.16	0.18	0.15	0.19	0.16	0.20	0.16	0.17	0.15	0.16	0.14	0.17	0.16	0.18	0.24	0.23	0.16	0.17	0.38	0.32	0.35
N1	0.20	0.21	0.18	0.20	0.20	0.17	0.20	0.18	0.20	0.19	0.20	0.20	0.21	0.19	0.20	0.17	0.25	0.20	0.17	0.20	0.36	0.26	0.30
N3	0.17	0.11	0.20	0.22	0.13	0.19	0.12	0.19	0.11	0.14	0.11	0.12	0.12	0.13	0.15	0.19	0.26	0.18	0.16	0.12	0.30	0.20	0.24
N6	0.33	0.22	0.25	0.26	0.28	0.31	0.27	0.32	0.25	0.31	0.23	0.19	0.25	0.30	0.31	0.25	0.28	0.37	0.30	0.25	0.51	0.46	0.48
N7	0.20	0.14	0.17	0.19	0.17	0.21	0.17	0.22	0.16	0.20	0.15	0.14	0.15	0.19	0.19	0.18	0.25	0.26	0.19	0.17	0.43	0.37	0.39
N9	0.17	0.15	0.18	0.19	0.15	0.17	0.15	0.18	0.15	0.16	0.15	0.16	0.15	0.16	0.16	0.18	0.25	0.20	0.15	0.16	0.33	0.25	0.29
O2'	0.28	0.36	0.30	0.34	0.34	0.29	0.36	0.31	0.39	0.33	0.39	0.36	0.32	0.36	0.32	0.26	0.37	0.28	0.29	0.40	0.39	0.34	0.34
O3'	0.24	0.33	0.28	0.32	0.30	0.24	0.33	0.26	0.36	0.29	0.37	0.34	0.29	0.32	0.27	0.23	0.37	0.23	0.26	0.39	0.40	0.33	0.34
O4'	0.24	0.23	0.22	0.22	0.23	0.24	0.23	0.24	0.23	0.24	0.23	0.25	0.23	0.24	0.23	0.22	0.25	0.28	0.23	0.24	0.32	0.27	0.30
O5'	0.50	0.40	0.52	0.53	0.44	0.52	0.41	0.52	0.38	0.46	0.37	0.40	0.44	0.43	0.47	0.54	0.57	0.52	0.53	0.35	0.63	0.59	0.61
OP1	0.58	0.51	0.61	0.61	0.56	0.59	0.56	0.60	0.54	0.60	0.51	0.49	0.53	0.58	0.58	0.61	0.65	0.59	0.62	0.54	0.74	0.73	0.73
OP2	0.61	0.37	0.57	0.59	0.46	0.69	0.41	0.71	0.34	0.51	0.33	0.35	0.44	0.45	0.53	0.64	0.61	0.69	0.63	0.32	0.80	0.69	0.76
P	0.44	0.34	0.43	0.43	0.38	0.46	0.37	0.47	0.35	0.42	0.33	0.34	0.37	0.40	0.42	0.44	0.46	0.48	0.47	0.34	0.64	0.61	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.14	0.11	0.12
C2	0.04	0.00	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.04	0.18	0.01	0.16	0.30	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.07	0.10	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.07	0.16	0.10	0.09
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.12	0.09	0.12	0.14	0.11	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.18	0.13	0.17	0.17	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.18	0.01	0.15	0.29	0.16
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.10	0.16	0.10	0.13
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.23	0.01	0.23	0.42	0.26
C5'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.13	0.15	0.11	0.10	0.16	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.18	0.07	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.02	0.24	0.00	0.26	0.47	0.29
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.22	0.02	0.21	0.36	0.24
N1	0.03	0.00	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.03	0.22	0.01	0.21	0.40	0.23
N2	0.04	0.00	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.16	0.05	0.17	0.01	0.17	0.27	0.15
N3	0.04	0.01	0.08	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.04	0.16	0.01	0.14	0.23	0.13
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.25	0.02	0.29	0.48	0.32
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.16	0.02	0.12	0.23	0.13
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.09	0.07	0.04	0.02	0.00	0.06	0.03	0.06	0.06	0.26	0.11	0.19
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.04	0.14	0.10	0.14	0.16	0.12	0.12	0.05	0.06	0.00	0.02	0.19	0.15	0.24	0.21	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.03	0.18	0.18	0.19
O5'	0.08	0.18	0.12	0.18	0.18	0.01	0.23	0.01	0.24	0.22	0.22	0.17	0.16	0.25	0.16	0.06	0.19	0.09	0.00	0.26	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.15	0.03	0.26	0.00	0.33	0.55	0.35
OP1	0.14	0.16	0.16	0.17	0.15	0.16	0.23	0.07	0.26	0.21	0.21	0.17	0.14	0.29	0.12	0.26	0.24	0.18	0.02	0.33	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.30	0.10	0.17	0.29	0.10	0.42	0.11	0.47	0.36	0.40	0.27	0.23	0.48	0.23	0.11	0.21	0.18	0.02	0.55	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.09	0.11	0.16	0.13	0.26	0.02	0.29	0.24	0.23	0.15	0.13	0.32	0.13	0.19	0.16	0.19	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00