Doublet Group distance statistics: 51292

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 5, 9, 7, 4, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.011, 0.030, 0.048, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.017, 0.036, 0.056, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.036 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.020, 0.045, 0.070, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.045 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.007, 0.036, 0.065, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.036 std_dev=0.029
N3	B	0, 0.286, 0.436, 0.586, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.436 std_dev=0.150
C2	B	0, 0.307, 0.475, 0.644, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.475 std_dev=0.168
C4	B	0, 0.383, 0.586, 0.788, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.586 std_dev=0.203
O4'	A	0, 0.020, 0.256, 0.492, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.256 std_dev=0.236
N1	B	0, 0.370, 0.616, 0.863, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.616 std_dev=0.246
C2'	A	0, 0.039, 0.286, 0.532, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.286 std_dev=0.246
N2	B	0, 0.186, 0.462, 0.738, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.462 std_dev=0.276
C5	B	0, 0.435, 0.725, 1.015, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.725 std_dev=0.290
O2'	A	0, 0.076, 0.374, 0.672, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.374 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.388, 0.725, 1.062, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.725 std_dev=0.337
C4'	A	0, 0.087, 0.425, 0.764, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.425 std_dev=0.338
N9	B	0, 0.329, 0.672, 1.015, 2.222 max_d=2.222 avg_d=0.672 std_dev=0.343
C3'	A	0, 0.118, 0.491, 0.864, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.491 std_dev=0.373
N7	B	0, 0.482, 0.894, 1.306, 2.087 max_d=2.087 avg_d=0.894 std_dev=0.412
C1'	B	0, 0.176, 0.619, 1.063, 2.789 max_d=2.789 avg_d=0.619 std_dev=0.443
C8	B	0, 0.407, 0.853, 1.299, 2.769 max_d=2.769 avg_d=0.853 std_dev=0.446
O6	B	0, 0.420, 0.874, 1.327, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.874 std_dev=0.454
C2'	B	0, 0.180, 0.662, 1.144, 3.001 max_d=3.001 avg_d=0.662 std_dev=0.482
O2'	B	0, 0.161, 0.655, 1.150, 2.945 max_d=2.945 avg_d=0.655 std_dev=0.495
O3'	A	0, 0.248, 0.804, 1.360, 2.733 max_d=2.733 avg_d=0.804 std_dev=0.556
C5'	A	0, 0.113, 0.699, 1.285, 2.895 max_d=2.895 avg_d=0.699 std_dev=0.586
O4'	B	0, 0.102, 0.710, 1.318, 3.869 max_d=3.869 avg_d=0.710 std_dev=0.608
C3'	B	0, 0.148, 0.792, 1.437, 4.173 max_d=4.173 avg_d=0.792 std_dev=0.645
C4'	B	0, 0.071, 0.797, 1.523, 4.634 max_d=4.634 avg_d=0.797 std_dev=0.726
O5'	A	0, 0.096, 0.831, 1.566, 3.101 max_d=3.101 avg_d=0.831 std_dev=0.735
O3'	B	0, 0.138, 0.917, 1.697, 4.997 max_d=4.997 avg_d=0.917 std_dev=0.779
C5'	B	0, 0.092, 0.959, 1.825, 5.568 max_d=5.568 avg_d=0.959 std_dev=0.867
O5'	B	0, 0.234, 1.146, 2.058, 5.426 max_d=5.426 avg_d=1.146 std_dev=0.912
P	A	0, 0.049, 1.106, 2.163, 4.419 max_d=4.419 avg_d=1.106 std_dev=1.057
P	B	0, 0.259, 1.391, 2.524, 6.515 max_d=6.515 avg_d=1.391 std_dev=1.133
OP2	B	0, 0.402, 1.609, 2.816, 6.349 max_d=6.349 avg_d=1.609 std_dev=1.207
OP1	B	0, 0.244, 1.500, 2.755, 7.368 max_d=7.368 avg_d=1.500 std_dev=1.255
OP1	A	0, -0.008, 1.259, 2.526, 5.412 max_d=5.412 avg_d=1.259 std_dev=1.267
OP2	A	0, -0.085, 1.331, 2.747, 5.929 max_d=5.929 avg_d=1.331 std_dev=1.416

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.17	0.14	0.19	0.15
C2	0.04	0.00	0.20	0.21	0.01	0.06	0.02	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.28	0.10	0.35	0.21	0.64	0.38
C2'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.02	0.08	0.02	0.11	0.09	0.17	0.19	0.10	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.22	0.22	0.20	0.15
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.13	0.01	0.11	0.02	0.15	0.11	0.19	0.19	0.15	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.28	0.34	0.20	0.19
C4	0.02	0.01	0.11	0.13	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.15	0.05	0.39	0.25	0.63	0.40
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.06	0.05	0.08	0.07	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.19	0.19	0.10
C5	0.02	0.02	0.08	0.11	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.14	0.03	0.50	0.40	0.85	0.55
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.14	0.13	0.13	0.08	0.17	0.15	0.08	0.07	0.05	0.01	0.01	0.25	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.15	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.20	0.05	0.50	0.41	0.91	0.58
C8	0.02	0.02	0.09	0.11	0.01	0.07	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.07	0.13	0.07	0.54	0.45	0.76	0.55
N1	0.03	0.01	0.17	0.19	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.25	0.08	0.43	0.31	0.81	0.49
N3	0.04	0.01	0.19	0.19	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.24	0.10	0.30	0.17	0.53	0.32
N6	0.03	0.01	0.10	0.15	0.02	0.08	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.10	0.20	0.05	0.56	0.52	1.05	0.67
N7	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.59	0.54	0.96	0.66
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.37	0.25	0.52	0.35
O2'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.09	0.07	0.07	0.07	0.11	0.07	0.15	0.16	0.10	0.06	0.02	0.00	0.07	0.05	0.07	0.30	0.13	0.18
O3'	0.03	0.28	0.03	0.01	0.15	0.02	0.14	0.05	0.20	0.13	0.25	0.24	0.20	0.13	0.06	0.07	0.00	0.02	0.23	0.42	0.22	0.18
O4'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.08	0.10	0.05	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.21	0.13	0.17
O5'	0.17	0.35	0.22	0.28	0.39	0.02	0.50	0.01	0.50	0.54	0.43	0.30	0.56	0.59	0.37	0.07	0.23	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.21	0.22	0.34	0.25	0.19	0.40	0.25	0.41	0.45	0.31	0.17	0.52	0.54	0.25	0.30	0.42	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.64	0.20	0.20	0.63	0.19	0.85	0.25	0.91	0.76	0.81	0.53	1.05	0.96	0.52	0.13	0.22	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.38	0.15	0.19	0.40	0.10	0.55	0.02	0.58	0.55	0.49	0.32	0.67	0.66	0.35	0.18	0.18	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.19	0.14	0.15	0.19	0.18	0.19	0.19	0.19	0.21	0.20	0.23	0.18	0.20	0.21	0.14	0.19	0.25	0.27	0.20	0.25	0.27	0.25
C2	0.22	0.18	0.15	0.16	0.21	0.16	0.21	0.16	0.20	0.22	0.19	0.17	0.20	0.22	0.22	0.17	0.20	0.23	0.20	0.20	0.21	0.26	0.17
C2'	0.36	0.31	0.27	0.28	0.35	0.31	0.34	0.33	0.32	0.37	0.30	0.29	0.34	0.36	0.37	0.25	0.27	0.38	0.39	0.31	0.35	0.41	0.38
C3'	0.31	0.29	0.25	0.26	0.32	0.28	0.31	0.29	0.30	0.33	0.29	0.27	0.31	0.32	0.33	0.22	0.26	0.34	0.36	0.30	0.34	0.39	0.35
C4	0.20	0.16	0.14	0.15	0.19	0.15	0.19	0.15	0.17	0.21	0.16	0.15	0.18	0.20	0.21	0.12	0.20	0.23	0.19	0.17	0.22	0.27	0.18
C4'	0.19	0.17	0.12	0.14	0.18	0.16	0.19	0.17	0.20	0.20	0.20	0.19	0.17	0.20	0.19	0.12	0.18	0.24	0.27	0.21	0.25	0.26	0.24
C5	0.23	0.17	0.17	0.18	0.21	0.17	0.20	0.17	0.18	0.23	0.17	0.15	0.19	0.21	0.22	0.14	0.23	0.25	0.21	0.18	0.28	0.35	0.23
C5'	0.21	0.18	0.15	0.15	0.19	0.19	0.20	0.19	0.20	0.21	0.20	0.19	0.18	0.20	0.20	0.16	0.19	0.25	0.27	0.22	0.26	0.24	0.23
C6	0.26	0.18	0.21	0.20	0.22	0.21	0.22	0.20	0.20	0.25	0.18	0.16	0.20	0.24	0.24	0.18	0.25	0.28	0.25	0.20	0.34	0.42	0.28
C8	0.23	0.16	0.16	0.17	0.20	0.19	0.19	0.19	0.17	0.22	0.17	0.17	0.18	0.21	0.22	0.14	0.22	0.26	0.21	0.17	0.27	0.31	0.22
N1	0.27	0.19	0.21	0.20	0.23	0.22	0.23	0.21	0.22	0.25	0.20	0.18	0.20	0.24	0.25	0.20	0.23	0.29	0.23	0.22	0.29	0.37	0.25
N3	0.19	0.16	0.13	0.15	0.19	0.13	0.19	0.14	0.18	0.20	0.17	0.15	0.18	0.19	0.20	0.14	0.19	0.21	0.21	0.18	0.21	0.23	0.17
N6	0.29	0.18	0.26	0.26	0.23	0.27	0.23	0.26	0.21	0.27	0.19	0.17	0.20	0.26	0.27	0.25	0.31	0.32	0.35	0.21	0.47	0.54	0.40
N7	0.24	0.16	0.19	0.19	0.20	0.19	0.20	0.19	0.18	0.23	0.16	0.15	0.19	0.21	0.23	0.16	0.24	0.26	0.23	0.17	0.32	0.37	0.25
N9	0.21	0.17	0.14	0.15	0.19	0.17	0.19	0.17	0.17	0.21	0.17	0.18	0.18	0.20	0.21	0.13	0.20	0.25	0.22	0.17	0.23	0.27	0.20
O2'	0.37	0.32	0.30	0.32	0.35	0.34	0.35	0.37	0.32	0.38	0.31	0.31	0.34	0.37	0.37	0.28	0.33	0.40	0.42	0.32	0.38	0.43	0.41
O3'	0.38	0.38	0.33	0.35	0.40	0.35	0.40	0.37	0.40	0.41	0.39	0.37	0.39	0.41	0.40	0.29	0.36	0.39	0.44	0.41	0.41	0.48	0.43
O4'	0.20	0.24	0.17	0.18	0.20	0.18	0.22	0.19	0.24	0.21	0.26	0.28	0.20	0.22	0.20	0.19	0.22	0.24	0.27	0.26	0.26	0.25	0.24
O5'	0.32	0.23	0.34	0.35	0.23	0.36	0.22	0.36	0.23	0.25	0.24	0.25	0.23	0.22	0.26	0.42	0.42	0.36	0.40	0.25	0.40	0.32	0.36
OP1	0.25	0.30	0.24	0.25	0.29	0.27	0.35	0.27	0.40	0.32	0.37	0.28	0.26	0.36	0.28	0.31	0.34	0.29	0.29	0.45	0.34	0.31	0.29
OP2	0.61	0.35	0.67	0.70	0.42	0.72	0.35	0.71	0.30	0.46	0.30	0.35	0.42	0.38	0.49	0.80	0.80	0.67	0.64	0.28	0.69	0.51	0.61
P	0.37	0.27	0.40	0.42	0.29	0.43	0.28	0.43	0.29	0.31	0.28	0.28	0.28	0.29	0.32	0.49	0.50	0.42	0.41	0.31	0.46	0.35	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.23	0.02	0.23	0.23	0.19
C2	0.04	0.00	0.14	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.19	0.04	0.40	0.02	0.37	0.37	0.36
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.08	0.06	0.11	0.16	0.13	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.07	0.24	0.17	0.13
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.11	0.11	0.14	0.19	0.14	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.26	0.12	0.31	0.23	0.18
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.44	0.01	0.41	0.41	0.40
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.03	0.07	0.02	0.00	0.02	0.08	0.14	0.29	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.55	0.01	0.54	0.57	0.53
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.10	0.01	0.12	0.00	0.14	0.12	0.13	0.12	0.10	0.14	0.08	0.07	0.04	0.02	0.01	0.15	0.23	0.31	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.03	0.55	0.01	0.55	0.60	0.55
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.05	0.57	0.02	0.55	0.56	0.54
N1	0.04	0.01	0.11	0.14	0.02	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.17	0.03	0.48	0.02	0.47	0.49	0.46
N2	0.05	0.01	0.16	0.19	0.02	0.09	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.24	0.05	0.34	0.03	0.31	0.32	0.31
N3	0.04	0.01	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.04	0.35	0.02	0.32	0.32	0.31
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.62	0.02	0.62	0.68	0.62
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.42	0.02	0.39	0.37	0.38
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.07	0.06	0.07	0.08	0.04	0.12	0.18	0.13	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.11	0.08	0.20	0.32	0.15
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.04	0.14	0.12	0.17	0.24	0.16	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.22	0.15	0.32	0.51	0.29
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.18	0.03	0.20	0.29	0.19
O5'	0.23	0.40	0.20	0.26	0.44	0.02	0.55	0.01	0.55	0.57	0.48	0.34	0.35	0.62	0.42	0.11	0.22	0.18	0.00	0.60	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.15	0.03	0.60	0.00	0.63	0.70	0.62
OP1	0.23	0.37	0.24	0.31	0.41	0.14	0.54	0.23	0.55	0.55	0.47	0.31	0.32	0.62	0.39	0.20	0.32	0.20	0.02	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.37	0.17	0.23	0.41	0.29	0.57	0.31	0.60	0.56	0.49	0.32	0.32	0.68	0.37	0.32	0.51	0.29	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.36	0.13	0.18	0.40	0.04	0.53	0.02	0.55	0.54	0.46	0.31	0.31	0.62	0.38	0.15	0.29	0.19	0.01	0.62	0.01	0.01	0.00