Doublet Group distance statistics: 51294

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 3, 3, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.002, 0.012, 0.026, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.012 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.012, 0.030, 0.047, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.017, 0.036, 0.054, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.036 std_dev=0.018
O2'	B	0, 0.270, 0.458, 0.646, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.458 std_dev=0.188
C2'	B	0, 0.320, 0.509, 0.698, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.509 std_dev=0.189
N3	B	0, 0.322, 0.524, 0.725, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.524 std_dev=0.202
O3'	B	0, 0.433, 0.658, 0.882, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.658 std_dev=0.225
C2'	A	0, 0.562, 0.802, 1.041, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.802 std_dev=0.240
O4'	A	0, 0.564, 0.804, 1.043, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.804 std_dev=0.240
O2'	A	0, 0.570, 0.814, 1.057, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.814 std_dev=0.244
N2	B	0, 0.392, 0.640, 0.889, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.640 std_dev=0.249
C2	B	0, 0.366, 0.616, 0.865, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.616 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.398, 0.666, 0.934, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.666 std_dev=0.268
C4	B	0, 0.384, 0.666, 0.947, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.666 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.451, 0.751, 1.050, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.751 std_dev=0.299
N9	B	0, 0.438, 0.741, 1.045, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.741 std_dev=0.304
N1	B	0, 0.438, 0.801, 1.163, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.801 std_dev=0.362
C5	B	0, 0.491, 0.865, 1.238, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.865 std_dev=0.374
C4'	A	0, 0.864, 1.241, 1.617, 1.458 max_d=1.458 avg_d=1.241 std_dev=0.377
C3'	A	0, 0.909, 1.299, 1.689, 1.528 max_d=1.528 avg_d=1.299 std_dev=0.390
C8	B	0, 0.588, 0.978, 1.369, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.978 std_dev=0.390
O4'	B	0, 0.558, 0.956, 1.354, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.956 std_dev=0.398
P	A	0, 0.738, 1.146, 1.554, 1.502 max_d=1.502 avg_d=1.146 std_dev=0.408
C6	B	0, 0.502, 0.921, 1.340, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.921 std_dev=0.419
N7	B	0, 0.615, 1.044, 1.473, 1.521 max_d=1.521 avg_d=1.044 std_dev=0.429
C4'	B	0, 0.617, 1.062, 1.508, 1.458 max_d=1.458 avg_d=1.062 std_dev=0.445
O6	B	0, 0.618, 1.120, 1.622, 1.623 max_d=1.623 avg_d=1.120 std_dev=0.502
OP2	A	0, 0.989, 1.541, 2.093, 2.723 max_d=2.723 avg_d=1.541 std_dev=0.552
O3'	A	0, 1.310, 1.873, 2.436, 2.200 max_d=2.200 avg_d=1.873 std_dev=0.563
C5'	A	0, 1.422, 2.028, 2.634, 2.389 max_d=2.389 avg_d=2.028 std_dev=0.606
C5'	B	0, 0.920, 1.537, 2.154, 2.076 max_d=2.076 avg_d=1.537 std_dev=0.617
O5'	A	0, 1.390, 2.016, 2.642, 2.443 max_d=2.443 avg_d=2.016 std_dev=0.626
O5'	B	0, 1.222, 2.037, 2.853, 2.699 max_d=2.699 avg_d=2.037 std_dev=0.816
OP1	A	0, -0.080, 0.790, 1.660, 3.278 max_d=3.278 avg_d=0.790 std_dev=0.870
P	B	0, 1.611, 2.931, 4.251, 5.106 max_d=5.106 avg_d=2.931 std_dev=1.320
OP2	B	0, 1.203, 2.788, 4.373, 6.527 max_d=6.527 avg_d=2.788 std_dev=1.585
OP1	B	0, 2.672, 4.499, 6.326, 6.564 max_d=6.564 avg_d=4.499 std_dev=1.827

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.15	0.18	0.12
C2	0.03	0.00	0.09	0.14	0.01	0.07	0.02	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.17	0.02	0.16	0.51	0.34	0.20
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.07	0.09	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.10	0.11	0.10
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.09	0.06	0.13	0.13	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.11	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.15	0.44	0.26	0.18
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.17	0.23	0.06
C5	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.18	0.60	0.34	0.18
C5'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.12	0.11	0.11	0.09	0.14	0.13	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.28	0.24	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.18	0.68	0.42	0.20
C8	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.04	0.18	0.45	0.17	0.13
N1	0.03	0.00	0.07	0.13	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.18	0.62	0.41	0.21
N3	0.03	0.01	0.09	0.13	0.01	0.07	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.15	0.02	0.15	0.41	0.26	0.18
N6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.03	0.20	0.79	0.47	0.21
N7	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.20	0.63	0.31	0.16
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.12	0.32	0.16	0.15
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.08	0.09	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.03	0.10	0.17	0.10
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.12	0.06	0.16	0.15	0.11	0.06	0.03	0.04	0.00	0.01	0.09	0.19	0.12	0.09
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.16	0.32	0.13
O5'	0.07	0.16	0.04	0.06	0.15	0.01	0.18	0.01	0.18	0.18	0.18	0.15	0.20	0.20	0.12	0.03	0.09	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.15	0.51	0.10	0.11	0.44	0.17	0.60	0.28	0.68	0.45	0.62	0.41	0.79	0.63	0.32	0.10	0.19	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.34	0.11	0.11	0.26	0.23	0.34	0.24	0.42	0.17	0.41	0.26	0.47	0.31	0.16	0.17	0.12	0.32	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.20	0.10	0.10	0.18	0.06	0.18	0.01	0.20	0.13	0.21	0.18	0.21	0.16	0.15	0.10	0.09	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.16	0.09	0.09	0.14	0.09	0.17	0.10	0.20	0.14	0.21	0.17	0.13	0.16	0.13	0.11	0.10	0.12	0.13	0.23	0.41	0.35	0.28
C2	0.13	0.10	0.11	0.11	0.12	0.12	0.11	0.12	0.10	0.13	0.10	0.12	0.11	0.12	0.13	0.13	0.12	0.13	0.11	0.10	0.46	0.27	0.28
C2'	0.16	0.16	0.14	0.14	0.15	0.15	0.16	0.14	0.18	0.15	0.19	0.17	0.15	0.15	0.15	0.18	0.16	0.16	0.14	0.20	0.42	0.36	0.27
C3'	0.19	0.16	0.20	0.20	0.15	0.21	0.16	0.19	0.19	0.15	0.19	0.17	0.15	0.15	0.16	0.26	0.23	0.20	0.18	0.21	0.50	0.28	0.33
C4	0.13	0.12	0.09	0.09	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.14	0.10	0.11	0.13	0.11	0.10	0.15	0.13	0.13	0.51	0.26	0.36
C4'	0.12	0.16	0.12	0.12	0.14	0.13	0.18	0.12	0.23	0.14	0.23	0.16	0.13	0.17	0.13	0.17	0.16	0.13	0.13	0.27	0.46	0.31	0.30
C5	0.18	0.09	0.12	0.12	0.12	0.18	0.11	0.18	0.10	0.16	0.11	0.13	0.10	0.13	0.16	0.12	0.10	0.21	0.21	0.10	0.67	0.31	0.50
C5'	0.14	0.17	0.15	0.16	0.15	0.16	0.19	0.15	0.24	0.16	0.23	0.17	0.14	0.19	0.14	0.20	0.20	0.15	0.15	0.28	0.53	0.23	0.33
C6	0.22	0.09	0.16	0.16	0.15	0.22	0.13	0.22	0.10	0.20	0.09	0.11	0.11	0.17	0.20	0.15	0.12	0.25	0.26	0.10	0.72	0.35	0.55
C8	0.15	0.12	0.10	0.10	0.11	0.16	0.12	0.16	0.14	0.14	0.15	0.15	0.10	0.12	0.14	0.12	0.10	0.19	0.20	0.16	0.64	0.31	0.47
N1	0.20	0.10	0.15	0.14	0.15	0.18	0.14	0.18	0.11	0.18	0.10	0.11	0.12	0.16	0.19	0.14	0.11	0.20	0.19	0.11	0.61	0.25	0.44
N3	0.11	0.12	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.12	0.11	0.13	0.14	0.11	0.11	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.13	0.40	0.31	0.25
N6	0.27	0.09	0.21	0.22	0.18	0.29	0.17	0.31	0.12	0.25	0.10	0.11	0.12	0.21	0.24	0.19	0.18	0.32	0.37	0.12	0.89	0.54	0.71
N7	0.18	0.10	0.12	0.13	0.12	0.19	0.11	0.21	0.11	0.17	0.12	0.14	0.09	0.14	0.16	0.12	0.11	0.23	0.25	0.12	0.74	0.38	0.56
N9	0.12	0.14	0.09	0.09	0.12	0.11	0.13	0.11	0.16	0.12	0.17	0.16	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.14	0.14	0.18	0.51	0.28	0.36
O2'	0.12	0.17	0.09	0.10	0.15	0.10	0.18	0.11	0.21	0.15	0.21	0.16	0.15	0.18	0.14	0.12	0.11	0.13	0.14	0.24	0.33	0.50	0.23
O3'	0.22	0.17	0.24	0.25	0.17	0.25	0.17	0.23	0.20	0.18	0.20	0.17	0.17	0.17	0.18	0.30	0.29	0.22	0.21	0.23	0.50	0.31	0.31
O4'	0.10	0.19	0.09	0.09	0.16	0.09	0.21	0.10	0.26	0.17	0.25	0.18	0.14	0.21	0.14	0.10	0.10	0.12	0.14	0.30	0.43	0.34	0.30
O5'	0.18	0.19	0.21	0.22	0.17	0.22	0.19	0.21	0.23	0.18	0.23	0.19	0.16	0.19	0.18	0.26	0.26	0.19	0.21	0.27	0.63	0.21	0.41
OP1	0.46	0.37	0.54	0.57	0.39	0.55	0.38	0.54	0.38	0.40	0.37	0.35	0.39	0.39	0.41	0.60	0.63	0.47	0.51	0.38	0.63	0.34	0.47
OP2	0.36	0.19	0.40	0.44	0.16	0.50	0.18	0.50	0.28	0.20	0.30	0.22	0.14	0.17	0.23	0.51	0.50	0.43	0.53	0.37	1.05	0.58	0.82
P	0.24	0.09	0.25	0.27	0.12	0.31	0.08	0.30	0.10	0.14	0.12	0.10	0.13	0.09	0.18	0.32	0.30	0.28	0.32	0.15	0.78	0.36	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.04	0.24	0.41	0.18
C2	0.04	0.00	0.08	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.03	0.13	0.02	0.20	0.70	0.26
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.09	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.42	0.33	0.16
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.05	0.08	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.48	0.36	0.11
C4	0.03	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.15	0.02	0.19	0.75	0.30
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.41	0.22	0.18
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.02	0.21	0.02	0.33	0.95	0.43
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.06	0.05	0.13	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.12	0.30	0.33	0.01
C6	0.04	0.01	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.05	0.03	0.22	0.01	0.36	0.99	0.45
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.22	0.02	0.33	0.95	0.45
N1	0.04	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.07	0.03	0.18	0.01	0.26	0.86	0.35
N2	0.05	0.00	0.09	0.08	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.04	0.11	0.02	0.22	0.61	0.21
N3	0.04	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.04	0.11	0.02	0.20	0.61	0.22
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.25	0.02	0.44	1.08	0.53
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.03	0.17	0.70	0.28
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.02	0.09	0.13	0.10	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.07	0.59	0.13	0.31
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.12	0.09	0.07	0.02	0.03	0.00	0.01	0.06	0.06	0.70	0.21	0.23
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.03	0.21	0.35	0.21
O5'	0.07	0.13	0.02	0.01	0.15	0.01	0.21	0.01	0.22	0.22	0.18	0.11	0.11	0.25	0.14	0.05	0.06	0.06	0.00	0.25	0.02	0.01	0.00
O6	0.04	0.02	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.03	0.25	0.00	0.46	1.10	0.54
OP1	0.24	0.20	0.42	0.48	0.19	0.41	0.33	0.30	0.36	0.33	0.26	0.22	0.20	0.44	0.17	0.59	0.70	0.21	0.02	0.46	0.00	0.01	0.00
OP2	0.41	0.70	0.33	0.36	0.75	0.22	0.95	0.33	0.99	0.95	0.86	0.61	0.61	1.08	0.70	0.13	0.21	0.35	0.01	1.10	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.26	0.16	0.11	0.30	0.18	0.43	0.01	0.45	0.45	0.35	0.21	0.22	0.53	0.28	0.31	0.23	0.21	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00