Doublet Group distance statistics: 51295

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.006, 0.026, 0.045, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C2	B	0, 0.196, 0.399, 0.603, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.399 std_dev=0.203
C6	B	0, 0.263, 0.481, 0.699, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.481 std_dev=0.218
N1	B	0, 0.242, 0.462, 0.682, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.462 std_dev=0.220
N2	B	0, 0.254, 0.483, 0.711, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.483 std_dev=0.229
C5	B	0, 0.245, 0.532, 0.819, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.532 std_dev=0.287
O6	B	0, 0.303, 0.612, 0.920, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.612 std_dev=0.309
N3	B	0, 0.191, 0.504, 0.817, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.504 std_dev=0.313
C4	B	0, 0.188, 0.575, 0.962, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.575 std_dev=0.387
N7	B	0, 0.290, 0.713, 1.136, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.713 std_dev=0.423
OP2	A	0, 0.078, 0.696, 1.315, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.696 std_dev=0.619
C8	B	0, 0.227, 0.865, 1.502, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.865 std_dev=0.637
N9	B	0, 0.154, 0.799, 1.445, 2.011 max_d=2.011 avg_d=0.799 std_dev=0.645
O4'	A	0, -0.016, 0.634, 1.285, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.634 std_dev=0.650
C2'	A	0, -0.013, 0.657, 1.326, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.657 std_dev=0.670
O5'	A	0, 0.117, 1.012, 1.906, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.012 std_dev=0.895
C1'	B	0, 0.081, 0.982, 1.883, 2.745 max_d=2.745 avg_d=0.982 std_dev=0.901
O2'	A	0, 0.015, 0.946, 1.876, 2.317 max_d=2.317 avg_d=0.946 std_dev=0.930
C3'	A	0, -0.029, 0.917, 1.863, 2.614 max_d=2.614 avg_d=0.917 std_dev=0.946
O2'	B	0, 0.060, 1.010, 1.960, 2.834 max_d=2.834 avg_d=1.010 std_dev=0.950
C4'	A	0, -0.031, 0.935, 1.901, 2.675 max_d=2.675 avg_d=0.935 std_dev=0.966
C2'	B	0, 0.081, 1.067, 2.054, 3.048 max_d=3.048 avg_d=1.067 std_dev=0.987
P	A	0, 0.026, 1.107, 2.187, 2.865 max_d=2.865 avg_d=1.107 std_dev=1.080
O3'	A	0, -0.116, 1.104, 2.325, 3.347 max_d=3.347 avg_d=1.104 std_dev=1.221
C5'	A	0, -0.017, 1.337, 2.690, 3.661 max_d=3.661 avg_d=1.337 std_dev=1.354
O4'	B	0, 0.061, 1.424, 2.786, 4.024 max_d=4.024 avg_d=1.424 std_dev=1.362
C3'	B	0, 0.062, 1.535, 3.008, 4.407 max_d=4.407 avg_d=1.535 std_dev=1.473
OP2	B	0, 0.118, 1.756, 3.394, 4.586 max_d=4.586 avg_d=1.756 std_dev=1.638
C4'	B	0, 0.033, 1.697, 3.360, 4.869 max_d=4.869 avg_d=1.697 std_dev=1.664
O5'	B	0, 0.120, 1.801, 3.483, 4.472 max_d=4.472 avg_d=1.801 std_dev=1.682
O3'	B	0, 0.065, 1.835, 3.606, 5.018 max_d=5.018 avg_d=1.835 std_dev=1.771
OP1	A	0, -0.088, 1.736, 3.559, 5.328 max_d=5.328 avg_d=1.736 std_dev=1.824
P	B	0, 0.103, 1.952, 3.800, 4.971 max_d=4.971 avg_d=1.952 std_dev=1.848
C5'	B	0, 0.012, 2.067, 4.123, 6.026 max_d=6.026 avg_d=2.067 std_dev=2.055
OP1	B	0, 0.077, 2.204, 4.331, 5.633 max_d=5.633 avg_d=2.204 std_dev=2.127

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.26	0.00	0.32	0.32	0.27	0.25
C2	0.01	0.00	0.25	0.15	0.01	0.29	0.01	0.52	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.23	0.38	0.59	0.76	0.39	0.64
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.02	0.07	0.23	0.11	0.18	0.20	0.25	0.08	0.11	0.03	0.00	0.05	0.01	0.66	0.67	0.52	0.57
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.17	0.00	0.24	0.01	0.24	0.27	0.20	0.12	0.28	0.29	0.17	0.02	0.01	0.02	0.31	0.37	0.23	0.16
C4	0.01	0.01	0.13	0.17	0.00	0.14	0.00	0.36	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.13	0.20	0.53	0.62	0.39	0.55
C4'	0.01	0.29	0.02	0.00	0.14	0.00	0.09	0.00	0.14	0.21	0.23	0.28	0.12	0.15	0.06	0.26	0.02	0.00	0.01	0.20	0.33	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.24	0.00	0.09	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.12	0.08	0.53	0.69	0.45	0.60
C5'	0.13	0.52	0.23	0.01	0.36	0.00	0.32	0.00	0.39	0.25	0.48	0.47	0.37	0.26	0.22	0.07	0.22	0.01	0.01	0.29	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.24	0.00	0.14	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.13	0.16	0.56	0.77	0.45	0.66
C8	0.01	0.01	0.18	0.27	0.00	0.21	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.39	0.19	0.22	0.41	0.53	0.45	0.45
N1	0.02	0.00	0.20	0.20	0.01	0.23	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.15	0.29	0.59	0.80	0.42	0.67
N3	0.01	0.00	0.25	0.12	0.00	0.28	0.00	0.47	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.26	0.39	0.56	0.67	0.36	0.56
N6	0.01	0.01	0.08	0.28	0.00	0.12	0.00	0.37	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.17	0.10	0.53	0.79	0.47	0.67
N7	0.01	0.01	0.11	0.29	0.00	0.15	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.36	0.22	0.12	0.45	0.65	0.49	0.56
N9	0.00	0.01	0.03	0.17	0.00	0.06	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.09	0.01	0.45	0.48	0.36	0.42
O2'	0.02	0.34	0.00	0.02	0.17	0.26	0.22	0.07	0.22	0.39	0.27	0.33	0.25	0.36	0.16	0.00	0.09	0.19	0.45	0.52	0.60	0.46
O3'	0.26	0.23	0.05	0.01	0.13	0.02	0.12	0.22	0.13	0.19	0.15	0.26	0.17	0.22	0.09	0.09	0.00	0.25	0.17	0.31	0.36	0.15
O4'	0.00	0.38	0.01	0.02	0.20	0.00	0.08	0.01	0.16	0.22	0.29	0.39	0.10	0.12	0.01	0.19	0.25	0.00	0.11	0.11	0.46	0.21
O5'	0.32	0.59	0.66	0.31	0.53	0.01	0.53	0.01	0.56	0.41	0.59	0.56	0.53	0.45	0.45	0.45	0.17	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.76	0.67	0.37	0.62	0.20	0.69	0.29	0.77	0.53	0.80	0.67	0.79	0.65	0.48	0.52	0.31	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.39	0.52	0.23	0.39	0.33	0.45	0.36	0.45	0.45	0.42	0.36	0.47	0.49	0.36	0.60	0.36	0.46	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.64	0.57	0.16	0.55	0.05	0.60	0.01	0.66	0.45	0.67	0.56	0.67	0.56	0.42	0.46	0.15	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.19	0.20	0.25	0.18	0.15	0.19	0.17	0.20	0.18	0.21	0.20	0.18	0.18	0.18	0.17	0.38	0.25	0.14	0.21	0.16	0.11	0.13
C2	0.18	0.08	0.16	0.16	0.10	0.17	0.09	0.18	0.07	0.14	0.08	0.13	0.08	0.11	0.14	0.15	0.17	0.20	0.21	0.07	0.28	0.19	0.20
C2'	0.25	0.43	0.54	0.63	0.37	0.36	0.44	0.38	0.50	0.36	0.50	0.43	0.35	0.42	0.32	0.41	0.77	0.18	0.40	0.53	0.37	0.47	0.42
C3'	0.16	0.17	0.39	0.49	0.13	0.23	0.17	0.23	0.23	0.13	0.24	0.19	0.12	0.16	0.13	0.33	0.70	0.24	0.28	0.27	0.29	0.31	0.28
C4	0.11	0.11	0.17	0.21	0.09	0.12	0.09	0.12	0.10	0.09	0.11	0.12	0.10	0.09	0.10	0.16	0.30	0.14	0.10	0.10	0.14	0.11	0.10
C4'	0.59	0.36	0.26	0.25	0.45	0.54	0.41	0.56	0.36	0.50	0.33	0.32	0.43	0.44	0.51	0.33	0.25	0.74	0.53	0.34	0.53	0.45	0.52
C5	0.11	0.09	0.20	0.26	0.06	0.20	0.06	0.21	0.08	0.07	0.09	0.12	0.08	0.06	0.08	0.21	0.34	0.13	0.15	0.09	0.13	0.14	0.15
C5'	0.81	0.45	0.48	0.47	0.60	0.80	0.53	0.82	0.43	0.67	0.39	0.38	0.57	0.58	0.70	0.58	0.39	0.98	0.75	0.39	0.78	0.66	0.75
C6	0.16	0.09	0.17	0.20	0.10	0.22	0.09	0.22	0.08	0.11	0.08	0.10	0.11	0.10	0.12	0.20	0.23	0.19	0.17	0.10	0.13	0.15	0.16
C8	0.10	0.12	0.25	0.34	0.07	0.21	0.08	0.23	0.12	0.06	0.14	0.16	0.09	0.06	0.07	0.24	0.48	0.12	0.16	0.13	0.14	0.15	0.15
N1	0.12	0.10	0.12	0.12	0.10	0.11	0.10	0.11	0.09	0.11	0.09	0.12	0.11	0.10	0.11	0.08	0.13	0.12	0.12	0.09	0.18	0.14	0.12
N3	0.20	0.11	0.15	0.16	0.14	0.17	0.12	0.18	0.11	0.16	0.11	0.12	0.13	0.14	0.17	0.14	0.20	0.24	0.20	0.10	0.25	0.17	0.19
N6	0.27	0.10	0.23	0.27	0.14	0.37	0.13	0.38	0.11	0.18	0.10	0.10	0.14	0.15	0.19	0.30	0.27	0.35	0.30	0.13	0.20	0.23	0.27
N7	0.14	0.10	0.26	0.35	0.06	0.27	0.05	0.29	0.09	0.08	0.11	0.14	0.08	0.05	0.09	0.28	0.47	0.17	0.22	0.11	0.19	0.19	0.21
N9	0.12	0.14	0.21	0.27	0.12	0.13	0.12	0.15	0.14	0.11	0.15	0.16	0.12	0.11	0.11	0.19	0.39	0.15	0.09	0.14	0.12	0.09	0.09
O2'	0.46	0.62	0.69	0.81	0.58	0.57	0.67	0.63	0.72	0.60	0.71	0.59	0.53	0.66	0.54	0.56	0.91	0.41	0.56	0.77	0.54	0.64	0.59
O3'	0.37	0.39	0.20	0.30	0.36	0.23	0.36	0.24	0.39	0.34	0.40	0.42	0.37	0.35	0.35	0.20	0.54	0.48	0.28	0.41	0.26	0.25	0.27
O4'	0.70	0.54	0.40	0.39	0.63	0.64	0.60	0.66	0.55	0.67	0.51	0.48	0.61	0.63	0.67	0.42	0.28	0.82	0.66	0.52	0.67	0.62	0.65
O5'	0.79	0.55	0.54	0.52	0.65	0.75	0.60	0.76	0.54	0.70	0.51	0.50	0.63	0.64	0.71	0.62	0.45	0.90	0.72	0.52	0.77	0.67	0.72
OP1	1.03	0.63	0.78	0.78	0.79	1.07	0.74	1.09	0.66	0.89	0.61	0.56	0.75	0.80	0.91	0.88	0.71	1.19	1.03	0.64	1.09	0.95	1.03
OP2	0.39	0.31	0.31	0.34	0.33	0.36	0.32	0.35	0.31	0.35	0.31	0.31	0.33	0.33	0.36	0.35	0.43	0.43	0.38	0.31	0.42	0.39	0.38
P	0.83	0.48	0.62	0.61	0.62	0.85	0.56	0.85	0.47	0.71	0.43	0.41	0.59	0.62	0.73	0.72	0.56	0.96	0.81	0.44	0.88	0.75	0.81

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.03	0.12	0.08	0.08
C2	0.02	0.00	0.19	0.21	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.27	0.04	0.25	0.01	0.24	0.24	0.24
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.11	0.01	0.09	0.01	0.13	0.08	0.16	0.21	0.18	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.18	0.13	0.25	0.12	0.17
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.13	0.00	0.14	0.01	0.18	0.13	0.20	0.24	0.19	0.14	0.07	0.01	0.01	0.02	0.25	0.19	0.32	0.14	0.23
C4	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.16	0.02	0.26	0.01	0.25	0.22	0.24
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.08	0.05	0.08	0.08	0.07	0.06	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.09	0.08	0.14	0.01
C5	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.19	0.01	0.33	0.02	0.33	0.31	0.32
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.22	0.01
C6	0.02	0.00	0.13	0.18	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.24	0.02	0.35	0.00	0.35	0.35	0.35
C8	0.00	0.00	0.08	0.13	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.15	0.04	0.33	0.02	0.31	0.24	0.30
N1	0.02	0.00	0.16	0.20	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.27	0.03	0.30	0.01	0.31	0.31	0.30
N2	0.02	0.00	0.21	0.24	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.32	0.05	0.22	0.01	0.22	0.22	0.22
N3	0.02	0.00	0.18	0.19	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.23	0.04	0.21	0.00	0.21	0.19	0.20
N7	0.01	0.00	0.07	0.14	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.02	0.37	0.03	0.37	0.34	0.36
N9	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.23	0.03	0.22	0.16	0.20
O2'	0.02	0.14	0.00	0.01	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.12	0.17	0.13	0.04	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.09	0.18	0.07	0.08
O3'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.16	0.01	0.19	0.02	0.24	0.15	0.27	0.32	0.23	0.17	0.08	0.03	0.00	0.01	0.21	0.27	0.36	0.16	0.25
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.03	0.03	0.17	0.09
O5'	0.09	0.25	0.18	0.25	0.26	0.01	0.33	0.01	0.35	0.33	0.30	0.22	0.21	0.37	0.23	0.07	0.21	0.06	0.00	0.38	0.02	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.13	0.19	0.01	0.09	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.09	0.27	0.03	0.38	0.00	0.40	0.41	0.39
OP1	0.12	0.24	0.25	0.32	0.25	0.08	0.33	0.05	0.35	0.31	0.31	0.22	0.21	0.37	0.22	0.18	0.36	0.03	0.02	0.40	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.24	0.12	0.14	0.22	0.14	0.31	0.22	0.35	0.24	0.31	0.22	0.19	0.34	0.16	0.07	0.16	0.17	0.01	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.24	0.17	0.23	0.24	0.01	0.32	0.01	0.35	0.30	0.30	0.22	0.20	0.36	0.20	0.08	0.25	0.09	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00