Doublet Group distance statistics: 51302

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 24, 43, 34, 17, 17, 7, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.020, 0.028, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.015, 0.028, 0.041, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.018, 0.032, 0.047, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.032 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.019, 0.034, 0.049, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.034 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.027, 0.046, 0.065, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.046 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.025, 0.046, 0.067, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.046 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.032 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.038, 0.070, 0.102, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.070 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.026, 0.115, 0.203, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.115 std_dev=0.089
O2'	A	0, 0.093, 0.196, 0.299, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.196 std_dev=0.103
C2'	A	0, 0.030, 0.134, 0.237, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.134 std_dev=0.103
P	B	0, 0.218, 0.356, 0.495, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.356 std_dev=0.139
C4'	A	0, 0.049, 0.190, 0.332, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.190 std_dev=0.141
OP2	B	0, 0.189, 0.334, 0.478, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.334 std_dev=0.144
C3'	A	0, 0.043, 0.202, 0.361, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.202 std_dev=0.159
O5'	B	0, 0.252, 0.442, 0.631, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.442 std_dev=0.189
O5'	A	0, 0.138, 0.339, 0.539, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.339 std_dev=0.200
O3'	A	0, 0.087, 0.312, 0.537, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.312 std_dev=0.225
C4	B	0, 0.605, 0.839, 1.073, 2.135 max_d=2.135 avg_d=0.839 std_dev=0.234
C5'	A	0, 0.059, 0.304, 0.549, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.304 std_dev=0.245
O4	B	0, 0.551, 0.801, 1.050, 2.514 max_d=2.514 avg_d=0.801 std_dev=0.249
N1	B	0, 0.454, 0.727, 0.999, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.727 std_dev=0.273
OP1	B	0, 0.290, 0.569, 0.847, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.569 std_dev=0.278
O3'	B	0, 0.372, 0.661, 0.951, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.661 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.288, 0.592, 0.897, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.592 std_dev=0.305
C1'	B	0, 0.393, 0.703, 1.012, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.703 std_dev=0.309
P	A	0, 0.256, 0.574, 0.892, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.574 std_dev=0.318
C4'	B	0, 0.318, 0.637, 0.956, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.637 std_dev=0.319
C2'	B	0, 0.319, 0.646, 0.972, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.646 std_dev=0.327
C5'	B	0, 0.371, 0.701, 1.031, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.701 std_dev=0.330
O4'	B	0, 0.372, 0.704, 1.035, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.704 std_dev=0.331
O2'	B	0, 0.395, 0.752, 1.109, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.752 std_dev=0.357
OP1	A	0, 0.367, 0.755, 1.142, 2.455 max_d=2.455 avg_d=0.755 std_dev=0.388
OP2	A	0, 0.377, 0.791, 1.206, 2.039 max_d=2.039 avg_d=0.791 std_dev=0.415
C2	B	0, 1.636, 2.099, 2.563, 3.609 max_d=3.609 avg_d=2.099 std_dev=0.463
C6	B	0, 2.235, 2.710, 3.186, 3.472 max_d=3.472 avg_d=2.710 std_dev=0.475
N3	B	0, 1.396, 1.876, 2.355, 3.789 max_d=3.789 avg_d=1.876 std_dev=0.480
C5	B	0, 2.333, 2.849, 3.366, 3.590 max_d=3.590 avg_d=2.849 std_dev=0.517
O2	B	0, 3.557, 4.194, 4.831, 5.516 max_d=5.516 avg_d=4.194 std_dev=0.637

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.09	0.07
C2	0.04	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.14	0.04	0.11	0.01	0.13	0.18	0.13
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.07	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.06	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.09	0.08	0.11	0.13	0.10	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.15	0.15	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.10	0.01	0.11	0.16	0.12
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.08	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.12	0.01	0.14	0.19	0.14
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.09	0.08	0.08	0.06	0.11	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.12	0.08	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.13	0.02	0.13	0.00	0.16	0.21	0.16
C8	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.11	0.02	0.12	0.15	0.12
N1	0.03	0.01	0.07	0.11	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.03	0.12	0.01	0.15	0.20	0.15
N2	0.05	0.01	0.11	0.13	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.11	0.17	0.06	0.11	0.03	0.13	0.18	0.12
N3	0.04	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.12	0.04	0.09	0.01	0.11	0.15	0.11
N7	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.13	0.02	0.15	0.19	0.15
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.13	0.10
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.06	0.03	0.07	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.06	0.11	0.10	0.05
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.13	0.10	0.14	0.17	0.12	0.11	0.06	0.04	0.00	0.02	0.13	0.14	0.23	0.23	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.03	0.09	0.12	0.11
O5'	0.05	0.11	0.06	0.09	0.10	0.02	0.12	0.01	0.13	0.11	0.12	0.11	0.09	0.13	0.08	0.05	0.13	0.07	0.00	0.14	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.14	0.03	0.14	0.00	0.19	0.23	0.18
OP1	0.07	0.13	0.11	0.15	0.11	0.08	0.14	0.08	0.16	0.12	0.15	0.13	0.11	0.15	0.09	0.11	0.23	0.09	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.18	0.12	0.15	0.16	0.05	0.19	0.06	0.21	0.15	0.20	0.18	0.15	0.19	0.13	0.10	0.23	0.12	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.07	0.10	0.12	0.03	0.14	0.02	0.16	0.12	0.15	0.12	0.11	0.15	0.10	0.05	0.16	0.11	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.35	0.27	0.22	0.33	0.17	0.25	0.12	0.23	0.27	0.39	0.41	0.29	0.26	0.39	0.21	0.11	0.13	0.14	0.11
C2	0.22	0.33	0.22	0.20	0.33	0.16	0.33	0.12	0.27	0.25	0.36	0.39	0.22	0.23	0.36	0.20	0.12	0.13	0.15	0.11
C2'	0.25	0.33	0.27	0.23	0.28	0.18	0.20	0.15	0.20	0.25	0.36	0.39	0.29	0.26	0.32	0.20	0.16	0.14	0.17	0.12
C3'	0.25	0.32	0.27	0.23	0.28	0.19	0.21	0.19	0.21	0.25	0.34	0.38	0.29	0.26	0.31	0.20	0.19	0.16	0.19	0.14
C4	0.24	0.36	0.23	0.20	0.38	0.16	0.34	0.12	0.28	0.27	0.41	0.41	0.24	0.23	0.45	0.21	0.11	0.13	0.13	0.11
C4'	0.24	0.33	0.27	0.22	0.28	0.17	0.21	0.13	0.20	0.25	0.35	0.39	0.29	0.26	0.32	0.19	0.13	0.14	0.14	0.11
C5	0.25	0.38	0.22	0.19	0.42	0.16	0.41	0.12	0.34	0.30	0.43	0.45	0.22	0.21	0.49	0.23	0.12	0.14	0.12	0.11
C5'	0.23	0.33	0.25	0.22	0.29	0.17	0.23	0.14	0.21	0.25	0.35	0.39	0.28	0.25	0.34	0.19	0.14	0.16	0.15	0.12
C6	0.26	0.39	0.21	0.18	0.42	0.16	0.46	0.12	0.39	0.30	0.43	0.48	0.20	0.20	0.47	0.25	0.13	0.14	0.13	0.12
C8	0.26	0.38	0.24	0.20	0.41	0.16	0.36	0.12	0.31	0.29	0.43	0.44	0.24	0.23	0.49	0.22	0.12	0.14	0.12	0.11
N1	0.24	0.36	0.20	0.18	0.38	0.16	0.43	0.12	0.36	0.28	0.39	0.45	0.20	0.21	0.41	0.23	0.12	0.12	0.13	0.11
N2	0.21	0.29	0.22	0.21	0.26	0.18	0.26	0.14	0.23	0.22	0.30	0.35	0.23	0.24	0.28	0.19	0.13	0.16	0.19	0.13
N3	0.23	0.33	0.24	0.21	0.33	0.17	0.28	0.12	0.24	0.25	0.37	0.38	0.25	0.24	0.38	0.20	0.12	0.13	0.15	0.11
N7	0.26	0.40	0.22	0.19	0.44	0.16	0.42	0.12	0.35	0.31	0.45	0.47	0.23	0.21	0.52	0.24	0.12	0.15	0.13	0.12
N9	0.24	0.36	0.24	0.21	0.38	0.16	0.31	0.12	0.27	0.27	0.41	0.41	0.25	0.24	0.45	0.21	0.11	0.13	0.13	0.11
O2'	0.28	0.36	0.30	0.25	0.28	0.21	0.22	0.16	0.23	0.28	0.37	0.43	0.33	0.28	0.28	0.23	0.15	0.14	0.17	0.13
O3'	0.28	0.33	0.29	0.26	0.28	0.24	0.24	0.25	0.24	0.28	0.34	0.38	0.32	0.28	0.28	0.25	0.25	0.20	0.23	0.18
O4'	0.25	0.35	0.27	0.23	0.32	0.18	0.25	0.12	0.23	0.26	0.38	0.41	0.29	0.27	0.37	0.20	0.11	0.14	0.13	0.12
O5'	0.24	0.34	0.24	0.22	0.33	0.18	0.28	0.16	0.25	0.26	0.38	0.39	0.26	0.25	0.39	0.21	0.18	0.16	0.17	0.14
O6	0.28	0.40	0.21	0.18	0.43	0.17	0.50	0.14	0.43	0.32	0.44	0.52	0.20	0.20	0.47	0.27	0.15	0.17	0.15	0.14
OP1	0.27	0.36	0.26	0.23	0.35	0.21	0.31	0.21	0.28	0.29	0.39	0.41	0.27	0.26	0.40	0.24	0.23	0.19	0.20	0.17
OP2	0.32	0.42	0.28	0.26	0.44	0.25	0.40	0.25	0.36	0.35	0.46	0.47	0.28	0.28	0.50	0.30	0.27	0.23	0.25	0.22
P	0.26	0.36	0.25	0.23	0.37	0.20	0.32	0.19	0.29	0.29	0.40	0.42	0.26	0.26	0.43	0.24	0.21	0.19	0.19	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.11	0.14	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.12	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.11	0.21	0.25	0.29	0.29
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.06	0.14	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.13	0.11	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.09	0.04	0.08	0.14	0.02	0.01	0.08	0.01	0.06	0.19	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.04	0.16	0.22	0.26	0.25
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.13	0.03	0.09	0.22	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.09	0.05	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.01	0.10	0.26	0.35	0.35	0.36
C5'	0.02	0.19	0.02	0.02	0.11	0.01	0.19	0.00	0.20	0.06	0.16	0.36	0.05	0.03	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.13	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.09	0.02	0.12	0.27	0.34	0.32	0.35
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.11	0.15	0.18	0.19
N3	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.09	0.02	0.08	0.19	0.25	0.30	0.29
O2	0.04	0.01	0.14	0.14	0.02	0.22	0.02	0.36	0.02	0.02	0.02	0.00	0.19	0.14	0.03	0.20	0.37	0.46	0.45	0.48
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.04	0.05	0.08	0.05	0.09	0.03	0.08	0.19	0.00	0.05	0.05	0.04	0.04	0.15	0.09	0.06
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.09	0.04	0.09	0.14	0.05	0.00	0.10	0.02	0.10	0.30	0.14	0.12
O4	0.03	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.10	0.00	0.05	0.16	0.24	0.28	0.26
O4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.12	0.02	0.08	0.20	0.04	0.02	0.05	0.00	0.08	0.17	0.15	0.18
O5'	0.07	0.21	0.05	0.06	0.16	0.02	0.26	0.01	0.27	0.11	0.19	0.37	0.04	0.10	0.16	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.25	0.13	0.19	0.22	0.09	0.35	0.07	0.34	0.15	0.25	0.46	0.15	0.30	0.24	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.29	0.11	0.10	0.26	0.05	0.35	0.02	0.32	0.18	0.30	0.45	0.09	0.14	0.28	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.29	0.07	0.06	0.25	0.05	0.36	0.02	0.35	0.19	0.29	0.48	0.06	0.12	0.26	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00