Doublet Group distance statistics: 51304

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 13, 14, 4, 2, 1, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.001, 0.018, 0.034, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.003, 0.025, 0.047, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.025 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.001, 0.023, 0.046, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.011, 0.038, 0.064, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.038 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.005, 0.036, 0.068, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.036 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.003, 0.041, 0.079, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.041 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.004, 0.111, 0.217, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.111 std_dev=0.106
O4'	A	0, 0.003, 0.113, 0.223, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.113 std_dev=0.110
OP2	B	0, 0.043, 0.202, 0.361, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.202 std_dev=0.159
P	B	0, 0.078, 0.241, 0.404, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.241 std_dev=0.163
O5'	B	0, 0.078, 0.267, 0.456, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.267 std_dev=0.189
O4'	B	0, 0.128, 0.329, 0.529, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.329 std_dev=0.200
C5'	A	0, -0.016, 0.200, 0.416, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.200 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.098, 0.314, 0.530, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.314 std_dev=0.216
O5'	A	0, 0.053, 0.278, 0.504, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.278 std_dev=0.225
C4'	B	0, 0.110, 0.341, 0.572, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.341 std_dev=0.231
OP1	B	0, 0.089, 0.329, 0.568, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.329 std_dev=0.239
C5'	B	0, 0.100, 0.344, 0.589, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.344 std_dev=0.245
C3'	B	0, 0.083, 0.328, 0.573, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.328 std_dev=0.245
C4'	A	0, -0.103, 0.153, 0.410, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.153 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.068, 0.328, 0.589, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.328 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.063, 0.326, 0.588, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.326 std_dev=0.263
C2'	B	0, 0.056, 0.341, 0.626, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.341 std_dev=0.285
O3'	B	0, 0.100, 0.397, 0.695, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.397 std_dev=0.297
P	A	0, -0.036, 0.295, 0.627, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.295 std_dev=0.331
O2'	B	0, 0.050, 0.398, 0.747, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.398 std_dev=0.349
C5	B	0, -0.005, 0.362, 0.730, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.362 std_dev=0.367
O2'	A	0, -0.099, 0.277, 0.653, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.277 std_dev=0.376
C3'	A	0, -0.217, 0.193, 0.602, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.193 std_dev=0.409
OP2	A	0, -0.091, 0.324, 0.739, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.324 std_dev=0.415
C2	B	0, -0.038, 0.390, 0.817, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.390 std_dev=0.427
OP1	A	0, -0.058, 0.374, 0.807, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.374 std_dev=0.432
O2	B	0, -0.048, 0.436, 0.920, 2.407 max_d=2.407 avg_d=0.436 std_dev=0.484
C4	B	0, -0.133, 0.414, 0.961, 2.472 max_d=2.472 avg_d=0.414 std_dev=0.547
N3	B	0, -0.143, 0.430, 1.004, 2.631 max_d=2.631 avg_d=0.430 std_dev=0.573
O4	B	0, -0.255, 0.456, 1.166, 3.152 max_d=3.152 avg_d=0.456 std_dev=0.711
O3'	A	0, -0.402, 0.380, 1.162, 3.523 max_d=3.523 avg_d=0.380 std_dev=0.782

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.14	0.01	0.14	0.23	0.14
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.28	0.05	0.08	0.01	0.11	0.19	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.14	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.28	0.04	0.32	0.38	0.31
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.12	0.00	0.20	0.02	0.19	0.27	0.12	0.04	0.03	0.28	0.14	0.02	0.01	0.01	0.03	0.23	0.09	0.05	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.14	0.03	0.08	0.01	0.12	0.20	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.13	0.04	0.05	0.03	0.13	0.06	0.18	0.02	0.00	0.01	0.09	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.20	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.05	0.03	0.10	0.01	0.13	0.19	0.12
C5'	0.06	0.05	0.14	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.08	0.09	0.06	0.06	0.05	0.11	0.04	0.05	0.13	0.01	0.01	0.10	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.19	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.06	0.03	0.11	0.00	0.14	0.19	0.13
C8	0.01	0.01	0.04	0.27	0.00	0.13	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.17	0.05	0.10	0.01	0.13	0.21	0.13
N1	0.01	0.00	0.05	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.16	0.04	0.09	0.01	0.12	0.18	0.11
N2	0.02	0.00	0.08	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.37	0.06	0.09	0.01	0.11	0.18	0.10
N3	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.30	0.05	0.09	0.01	0.11	0.19	0.10
N7	0.01	0.01	0.03	0.28	0.00	0.13	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.17	0.04	0.12	0.01	0.15	0.20	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.14	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.06	0.01	0.09	0.01	0.12	0.21	0.12
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.18	0.18	0.22	0.05	0.24	0.17	0.22	0.17	0.16	0.22	0.14	0.00	0.05	0.12	0.21	0.26	0.25	0.42	0.26
O3'	0.20	0.28	0.03	0.01	0.14	0.02	0.05	0.13	0.06	0.17	0.16	0.37	0.30	0.17	0.06	0.05	0.00	0.15	0.14	0.08	0.24	0.18	0.17
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.01	0.12	0.15	0.00	0.06	0.04	0.07	0.12	0.07
O5'	0.14	0.08	0.28	0.03	0.08	0.01	0.10	0.01	0.11	0.10	0.09	0.09	0.09	0.12	0.09	0.21	0.14	0.06	0.00	0.13	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.23	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.08	0.04	0.13	0.00	0.16	0.19	0.14
OP1	0.14	0.11	0.32	0.09	0.12	0.07	0.13	0.08	0.14	0.13	0.12	0.11	0.11	0.15	0.12	0.25	0.24	0.07	0.02	0.16	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.19	0.38	0.05	0.20	0.04	0.19	0.02	0.19	0.21	0.18	0.18	0.19	0.20	0.21	0.42	0.18	0.12	0.02	0.19	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.10	0.31	0.03	0.11	0.02	0.12	0.01	0.13	0.13	0.11	0.10	0.10	0.13	0.12	0.26	0.17	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.14	0.30	0.21	0.15	0.11	0.13	0.07	0.11	0.14	0.12	0.19	0.34	0.24	0.26	0.10	0.06	0.09	0.10	0.08
C2	0.21	0.14	0.30	0.23	0.10	0.15	0.13	0.10	0.18	0.18	0.10	0.15	0.31	0.23	0.13	0.12	0.08	0.10	0.12	0.08
C2'	0.10	0.12	0.19	0.10	0.20	0.07	0.20	0.10	0.13	0.10	0.13	0.16	0.24	0.13	0.31	0.13	0.11	0.10	0.13	0.14
C3'	0.16	0.17	0.32	0.20	0.18	0.07	0.22	0.09	0.13	0.12	0.13	0.27	0.39	0.27	0.31	0.11	0.11	0.13	0.20	0.19
C4	0.19	0.18	0.29	0.21	0.13	0.12	0.14	0.07	0.16	0.18	0.15	0.19	0.31	0.22	0.14	0.10	0.07	0.11	0.10	0.09
C4'	0.17	0.14	0.33	0.24	0.18	0.11	0.17	0.06	0.10	0.12	0.12	0.19	0.39	0.30	0.32	0.09	0.06	0.09	0.12	0.10
C5	0.20	0.22	0.28	0.20	0.22	0.12	0.21	0.09	0.20	0.21	0.22	0.23	0.28	0.20	0.22	0.11	0.09	0.13	0.11	0.10
C5'	0.20	0.19	0.34	0.24	0.11	0.12	0.11	0.06	0.11	0.16	0.14	0.25	0.40	0.29	0.17	0.10	0.06	0.10	0.10	0.09
C6	0.21	0.23	0.28	0.21	0.25	0.14	0.26	0.11	0.24	0.23	0.24	0.23	0.26	0.19	0.26	0.13	0.11	0.15	0.12	0.11
C8	0.19	0.22	0.28	0.19	0.19	0.11	0.16	0.08	0.16	0.19	0.22	0.25	0.29	0.20	0.20	0.11	0.08	0.12	0.11	0.10
N1	0.22	0.19	0.29	0.23	0.18	0.15	0.23	0.11	0.24	0.22	0.18	0.19	0.28	0.20	0.17	0.14	0.11	0.13	0.11	0.10
N2	0.22	0.12	0.31	0.26	0.14	0.18	0.12	0.13	0.17	0.16	0.12	0.13	0.32	0.25	0.20	0.14	0.10	0.10	0.15	0.08
N3	0.20	0.13	0.31	0.22	0.12	0.13	0.11	0.08	0.14	0.15	0.10	0.15	0.33	0.24	0.20	0.10	0.06	0.10	0.11	0.08
N7	0.19	0.25	0.27	0.19	0.25	0.11	0.21	0.09	0.19	0.21	0.26	0.26	0.27	0.19	0.27	0.11	0.09	0.14	0.12	0.11
N9	0.18	0.18	0.29	0.20	0.13	0.11	0.12	0.07	0.14	0.17	0.16	0.21	0.32	0.22	0.16	0.10	0.07	0.10	0.10	0.09
O2'	0.31	0.29	0.40	0.32	0.13	0.26	0.16	0.21	0.22	0.28	0.22	0.33	0.44	0.34	0.12	0.23	0.21	0.22	0.22	0.19
O3'	0.40	0.36	0.64	0.53	0.12	0.34	0.12	0.22	0.18	0.31	0.23	0.48	0.72	0.64	0.27	0.23	0.20	0.20	0.13	0.12
O4'	0.20	0.14	0.34	0.26	0.16	0.15	0.13	0.10	0.12	0.15	0.12	0.18	0.39	0.31	0.28	0.11	0.08	0.12	0.09	0.08
O5'	0.26	0.31	0.38	0.27	0.21	0.15	0.15	0.08	0.18	0.25	0.29	0.37	0.43	0.30	0.20	0.14	0.08	0.10	0.09	0.08
O6	0.22	0.27	0.27	0.21	0.32	0.15	0.32	0.14	0.28	0.26	0.30	0.26	0.25	0.19	0.35	0.15	0.14	0.18	0.15	0.14
OP1	0.34	0.42	0.43	0.31	0.33	0.21	0.25	0.13	0.26	0.34	0.42	0.48	0.47	0.32	0.34	0.21	0.13	0.14	0.12	0.11
OP2	0.41	0.52	0.48	0.37	0.49	0.27	0.38	0.19	0.37	0.43	0.54	0.56	0.50	0.36	0.52	0.27	0.19	0.20	0.18	0.15
P	0.30	0.38	0.40	0.28	0.31	0.18	0.24	0.11	0.24	0.31	0.38	0.43	0.43	0.29	0.32	0.18	0.11	0.14	0.11	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.10	0.06
C2	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.01	0.04	0.06	0.06	0.13	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.13	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.09	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.09	0.13	0.02	0.01	0.08	0.01	0.04	0.10	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.09	0.12	0.20	0.14
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.11	0.15	0.23	0.16
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06	0.04	0.04	0.03	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.10	0.12	0.20	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.06	0.06	0.14	0.09
N3	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.03	0.07	0.08	0.16	0.11
O2	0.02	0.00	0.13	0.13	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.16	0.01	0.06	0.04	0.07	0.11	0.06
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.10	0.00	0.04	0.03	0.03	0.04	0.11	0.06	0.04
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.03	0.07	0.04	0.12	0.16	0.04	0.00	0.10	0.01	0.05	0.16	0.09	0.08
O4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.03	0.10	0.14	0.22	0.15
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.06	0.09	0.07
O5'	0.05	0.06	0.05	0.04	0.09	0.01	0.11	0.01	0.10	0.06	0.07	0.04	0.04	0.05	0.10	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.06	0.09	0.10	0.12	0.07	0.15	0.06	0.12	0.06	0.08	0.07	0.11	0.16	0.14	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.13	0.09	0.06	0.20	0.03	0.23	0.01	0.20	0.14	0.16	0.11	0.06	0.09	0.22	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.05	0.05	0.14	0.01	0.16	0.01	0.14	0.09	0.11	0.06	0.04	0.08	0.15	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00