Doublet Group distance statistics: 51314

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.014, 0.031, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.018, 0.036, 0.055, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.036 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.015, 0.034, 0.053, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.034 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.016, 0.040, 0.064, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.040 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.021, 0.046, 0.072, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.046 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.014, 0.044, 0.074, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.044 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.010, 0.051, 0.093, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.051 std_dev=0.042
O6	A	0, 0.040, 0.085, 0.130, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.085 std_dev=0.045
N2	A	0, 0.037, 0.087, 0.137, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.087 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.069, 0.154, 0.240, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.154 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.114, 0.244, 0.374, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.244 std_dev=0.130
C2'	A	0, 0.060, 0.192, 0.323, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.192 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.112, 0.277, 0.442, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.277 std_dev=0.165
O2'	A	0, 0.099, 0.302, 0.505, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.302 std_dev=0.203
C5'	A	0, 0.187, 0.427, 0.667, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.427 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.154, 0.416, 0.679, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.416 std_dev=0.262
OP2	B	0, 0.193, 0.471, 0.749, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.471 std_dev=0.278
O5'	A	0, 0.148, 0.439, 0.729, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.439 std_dev=0.290
P	B	0, 0.249, 0.594, 0.940, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.594 std_dev=0.345
P	A	0, 0.355, 0.727, 1.099, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.727 std_dev=0.372
C5'	B	0, 0.364, 0.811, 1.259, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.811 std_dev=0.447
O5'	B	0, 0.432, 0.891, 1.349, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.891 std_dev=0.459
OP1	A	0, 0.463, 0.958, 1.452, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.958 std_dev=0.495
C4'	B	0, 0.376, 0.901, 1.427, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.901 std_dev=0.526
OP1	B	0, 0.242, 0.807, 1.372, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.807 std_dev=0.565
OP2	A	0, 0.400, 0.995, 1.590, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.995 std_dev=0.595
C3'	B	0, 0.598, 1.252, 1.906, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.252 std_dev=0.654
O3'	B	0, 0.632, 1.344, 2.055, 1.956 max_d=1.956 avg_d=1.344 std_dev=0.711
O4'	B	0, 0.574, 1.374, 2.174, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.374 std_dev=0.800
O2'	B	0, 0.843, 1.808, 2.773, 2.798 max_d=2.798 avg_d=1.808 std_dev=0.965
C2'	B	0, 0.725, 1.711, 2.696, 2.862 max_d=2.862 avg_d=1.711 std_dev=0.986
C1'	B	0, 0.684, 1.781, 2.877, 3.234 max_d=3.234 avg_d=1.781 std_dev=1.096
C2	B	0, 0.890, 2.226, 3.561, 4.009 max_d=4.009 avg_d=2.226 std_dev=1.336
O2	B	0, 1.383, 2.858, 4.332, 3.977 max_d=3.977 avg_d=2.858 std_dev=1.474
N1	B	0, 0.630, 2.270, 3.910, 4.498 max_d=4.498 avg_d=2.270 std_dev=1.640
N3	B	0, 0.793, 2.630, 4.466, 5.212 max_d=5.212 avg_d=2.630 std_dev=1.837
C6	B	0, 1.546, 3.943, 6.341, 6.735 max_d=6.735 avg_d=3.943 std_dev=2.397
C4	B	0, 0.356, 3.165, 5.974, 7.026 max_d=7.026 avg_d=3.165 std_dev=2.809
C5	B	0, 1.507, 4.412, 7.317, 7.975 max_d=7.975 avg_d=4.412 std_dev=2.905
O4	B	0, 0.153, 3.443, 6.734, 7.993 max_d=7.993 avg_d=3.443 std_dev=3.291

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.03
C2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.06	0.05	0.01	0.06	0.16	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.09	0.08	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.08	0.10	0.05
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.06	0.09	0.08	0.07	0.03	0.03	0.00	0.00	0.05	0.05	0.09	0.10	0.06
C4	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.05	0.01	0.04	0.13	0.07
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.02	0.07	0.01	0.09	0.16	0.10
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.05	0.05	0.04	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.08	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.08	0.00	0.11	0.18	0.11
C8	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.04	0.06	0.02	0.07	0.12	0.07
N1	0.02	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.05	0.07	0.01	0.09	0.18	0.11
N2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.08	0.05	0.02	0.05	0.16	0.09
N3	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.06	0.05	0.01	0.04	0.14	0.07
N7	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.08	0.02	0.11	0.15	0.10
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.11	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.07	0.06	0.07	0.10	0.08	0.07	0.02	0.00	0.04	0.05	0.03	0.09	0.06	0.08	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.11	0.06	0.13	0.10	0.10	0.03	0.04	0.00	0.02	0.07	0.07	0.10	0.12	0.06
O4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.08	0.04
O5'	0.03	0.05	0.04	0.05	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.06	0.07	0.05	0.05	0.08	0.04	0.03	0.07	0.04	0.00	0.09	0.03	0.03	0.02
O6	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.07	0.03	0.09	0.00	0.14	0.20	0.14
OP1	0.04	0.06	0.08	0.09	0.04	0.07	0.09	0.08	0.11	0.07	0.09	0.05	0.04	0.11	0.03	0.06	0.10	0.06	0.03	0.14	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.16	0.10	0.10	0.13	0.04	0.16	0.03	0.18	0.12	0.18	0.16	0.14	0.15	0.11	0.08	0.12	0.08	0.03	0.20	0.00	0.00	0.01
P	0.03	0.09	0.05	0.06	0.07	0.03	0.10	0.02	0.11	0.07	0.11	0.09	0.07	0.10	0.05	0.04	0.06	0.04	0.02	0.14	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.62	0.08	0.23	1.07	0.08	1.08	0.13	0.85	0.54	0.90	0.64	0.11	0.51	1.29	0.29	0.14	0.09	0.09	0.09
C2	0.26	0.68	0.15	0.22	0.92	0.11	0.93	0.19	0.76	0.49	0.90	0.82	0.16	0.46	1.06	0.22	0.14	0.11	0.10	0.12
C2'	0.10	0.36	0.23	0.38	0.64	0.12	0.71	0.14	0.55	0.25	0.53	0.53	0.26	0.61	0.81	0.16	0.16	0.10	0.08	0.11
C3'	0.08	0.33	0.25	0.38	0.54	0.15	0.63	0.16	0.49	0.20	0.47	0.54	0.28	0.59	0.70	0.09	0.18	0.16	0.08	0.16
C4	0.25	0.63	0.14	0.21	0.91	0.10	0.93	0.17	0.75	0.46	0.85	0.75	0.16	0.45	1.08	0.20	0.13	0.14	0.10	0.13
C4'	0.25	0.51	0.10	0.26	0.93	0.08	0.97	0.13	0.75	0.45	0.75	0.58	0.13	0.52	1.15	0.23	0.13	0.13	0.08	0.12
C5	0.22	0.60	0.18	0.20	0.78	0.14	0.80	0.21	0.66	0.39	0.78	0.80	0.18	0.38	0.92	0.15	0.14	0.21	0.13	0.18
C5'	0.26	0.54	0.09	0.22	0.94	0.08	0.98	0.14	0.76	0.46	0.78	0.61	0.12	0.47	1.15	0.22	0.12	0.16	0.07	0.13
C6	0.21	0.60	0.21	0.20	0.69	0.17	0.72	0.25	0.61	0.36	0.74	0.85	0.20	0.33	0.81	0.14	0.16	0.24	0.15	0.22
C8	0.22	0.58	0.15	0.21	0.84	0.12	0.86	0.18	0.69	0.41	0.79	0.73	0.16	0.42	1.01	0.16	0.13	0.19	0.11	0.16
N1	0.22	0.63	0.20	0.20	0.74	0.16	0.76	0.24	0.65	0.40	0.79	0.86	0.19	0.37	0.86	0.16	0.15	0.19	0.15	0.19
N2	0.31	0.75	0.13	0.23	1.01	0.10	1.01	0.18	0.84	0.56	0.98	0.84	0.15	0.50	1.13	0.28	0.16	0.08	0.07	0.09
N3	0.28	0.66	0.12	0.23	1.01	0.10	1.02	0.16	0.82	0.52	0.92	0.74	0.15	0.49	1.19	0.25	0.14	0.09	0.08	0.10
N7	0.20	0.58	0.18	0.20	0.75	0.15	0.78	0.21	0.64	0.37	0.75	0.78	0.19	0.37	0.90	0.14	0.14	0.23	0.13	0.19
N9	0.26	0.61	0.12	0.21	0.95	0.09	0.96	0.15	0.77	0.47	0.85	0.70	0.14	0.46	1.14	0.22	0.13	0.13	0.09	0.12
O2'	0.16	0.35	0.26	0.41	0.73	0.15	0.80	0.17	0.60	0.31	0.54	0.49	0.29	0.66	0.93	0.26	0.18	0.13	0.13	0.14
O3'	0.11	0.28	0.36	0.47	0.29	0.19	0.43	0.17	0.35	0.09	0.31	0.53	0.38	0.65	0.41	0.08	0.22	0.16	0.08	0.16
O4'	0.38	0.70	0.11	0.16	1.21	0.09	1.21	0.13	0.96	0.63	1.00	0.67	0.10	0.46	1.45	0.33	0.14	0.10	0.09	0.09
O5'	0.19	0.52	0.09	0.22	0.83	0.11	0.86	0.18	0.68	0.39	0.73	0.64	0.11	0.45	1.02	0.15	0.15	0.21	0.11	0.18
O6	0.20	0.58	0.24	0.21	0.58	0.20	0.63	0.29	0.55	0.31	0.69	0.88	0.23	0.27	0.69	0.16	0.19	0.31	0.18	0.26
OP1	0.20	0.50	0.11	0.19	0.78	0.10	0.82	0.16	0.66	0.37	0.69	0.64	0.13	0.40	0.96	0.15	0.13	0.20	0.08	0.17
OP2	0.27	0.55	0.22	0.13	0.80	0.10	0.87	0.16	0.73	0.44	0.74	0.69	0.20	0.26	0.97	0.18	0.11	0.23	0.10	0.18
P	0.26	0.58	0.16	0.14	0.90	0.08	0.93	0.16	0.75	0.46	0.80	0.68	0.15	0.36	1.09	0.17	0.11	0.22	0.08	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.05	0.04	0.00	0.05	0.12	0.13	0.04
C2	0.05	0.00	0.09	0.18	0.01	0.19	0.01	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.15	0.02	0.18	0.40	0.31	0.54	0.37
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.18	0.04	0.05	0.21	0.00	0.03	0.09	0.01	0.06	0.06	0.18	0.08
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.17	0.05	0.15	0.30	0.01	0.01	0.11	0.02	0.08	0.14	0.21	0.11
C4	0.04	0.01	0.09	0.10	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.11	0.00	0.02	0.20	0.21	0.40	0.15
C4'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.10	0.04	0.15	0.34	0.04	0.03	0.07	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02
C5	0.02	0.01	0.17	0.15	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.01	0.09	0.23	0.41	0.41	0.30
C5'	0.02	0.30	0.01	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.16	0.07	0.26	0.55	0.04	0.03	0.13	0.01	0.01	0.04	0.14	0.02
C6	0.02	0.00	0.18	0.17	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.18	0.01	0.13	0.26	0.42	0.39	0.33
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.01	0.12	0.14	0.23	0.08
N3	0.04	0.00	0.05	0.15	0.00	0.15	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.02	0.12	0.37	0.27	0.58	0.33
O2	0.07	0.00	0.21	0.30	0.01	0.34	0.01	0.55	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.27	0.02	0.33	0.74	0.67	0.88	0.73
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.04	0.16	0.04	0.17	0.03	0.06	0.20	0.00	0.05	0.09	0.04	0.05	0.06	0.19	0.07
O3'	0.05	0.15	0.03	0.01	0.11	0.03	0.17	0.03	0.18	0.06	0.14	0.27	0.05	0.00	0.12	0.03	0.09	0.23	0.30	0.12
O4	0.04	0.02	0.09	0.11	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.02	0.09	0.12	0.00	0.02	0.22	0.23	0.45	0.18
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.12	0.33	0.04	0.03	0.02	0.00	0.08	0.19	0.05	0.08
O5'	0.05	0.40	0.06	0.08	0.20	0.01	0.23	0.01	0.26	0.12	0.37	0.74	0.05	0.09	0.22	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.31	0.06	0.14	0.21	0.05	0.41	0.04	0.42	0.14	0.27	0.67	0.06	0.23	0.23	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.54	0.18	0.21	0.40	0.11	0.41	0.14	0.39	0.23	0.58	0.88	0.19	0.30	0.45	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.37	0.08	0.11	0.15	0.02	0.30	0.02	0.33	0.08	0.33	0.73	0.07	0.12	0.18	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00