Doublet Group distance statistics: 51334

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 3, 4, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.016, 0.029, 0.041, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.016
P	B	0, 0.217, 0.470, 0.723, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.470 std_dev=0.253
OP1	B	0, 0.402, 0.655, 0.909, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.655 std_dev=0.253
OP2	B	0, 0.057, 0.372, 0.686, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.372 std_dev=0.315
O4'	A	0, -0.217, 0.218, 0.653, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.218 std_dev=0.435
C2'	A	0, -0.235, 0.236, 0.707, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.236 std_dev=0.471
O5'	B	0, 0.185, 0.709, 1.233, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.709 std_dev=0.524
C3'	A	0, -0.339, 0.318, 0.975, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.318 std_dev=0.657
C4'	A	0, -0.332, 0.331, 0.995, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.331 std_dev=0.663
OP2	A	0, -0.033, 0.648, 1.328, 2.659 max_d=2.659 avg_d=0.648 std_dev=0.681
O5'	A	0, -0.319, 0.422, 1.162, 2.408 max_d=2.408 avg_d=0.422 std_dev=0.740
O2'	A	0, -0.365, 0.400, 1.165, 2.251 max_d=2.251 avg_d=0.400 std_dev=0.765
P	A	0, -0.253, 0.581, 1.415, 2.962 max_d=2.962 avg_d=0.581 std_dev=0.834
C5'	A	0, -0.406, 0.463, 1.332, 2.840 max_d=2.840 avg_d=0.463 std_dev=0.869
O3'	A	0, -0.433, 0.441, 1.316, 2.834 max_d=2.834 avg_d=0.441 std_dev=0.874
OP1	A	0, -0.325, 0.781, 1.888, 4.050 max_d=4.050 avg_d=0.781 std_dev=1.106
C5'	B	0, -0.237, 1.064, 2.365, 4.493 max_d=4.493 avg_d=1.064 std_dev=1.301
O3'	B	0, -0.232, 1.208, 2.649, 4.606 max_d=4.606 avg_d=1.208 std_dev=1.440
C4'	B	0, -0.365, 1.155, 2.675, 4.834 max_d=4.834 avg_d=1.155 std_dev=1.520
C3'	B	0, -0.454, 1.313, 3.080, 5.517 max_d=5.517 avg_d=1.313 std_dev=1.767
O4'	B	0, -0.652, 1.248, 3.148, 6.023 max_d=6.023 avg_d=1.248 std_dev=1.900
C1'	B	0, -0.865, 1.457, 3.778, 7.182 max_d=7.182 avg_d=1.457 std_dev=2.321
C8	B	0, -0.950, 1.372, 3.693, 7.386 max_d=7.386 avg_d=1.372 std_dev=2.322
N9	B	0, -0.932, 1.412, 3.756, 7.322 max_d=7.322 avg_d=1.412 std_dev=2.344
C2'	B	0, -0.801, 1.547, 3.895, 7.112 max_d=7.112 avg_d=1.547 std_dev=2.348
N7	B	0, -1.015, 1.365, 3.745, 7.572 max_d=7.572 avg_d=1.365 std_dev=2.380
C4	B	0, -0.983, 1.423, 3.829, 7.446 max_d=7.446 avg_d=1.423 std_dev=2.406
C5	B	0, -1.039, 1.399, 3.837, 7.625 max_d=7.625 avg_d=1.399 std_dev=2.438
N3	B	0, -0.981, 1.465, 3.911, 7.433 max_d=7.433 avg_d=1.465 std_dev=2.446
C2	B	0, -1.035, 1.488, 4.011, 7.631 max_d=7.631 avg_d=1.488 std_dev=2.523
C6	B	0, -1.105, 1.424, 3.952, 7.847 max_d=7.847 avg_d=1.424 std_dev=2.528
N1	B	0, -1.096, 1.471, 4.038, 7.834 max_d=7.834 avg_d=1.471 std_dev=2.567
N6	B	0, -1.170, 1.414, 3.999, 8.084 max_d=8.084 avg_d=1.414 std_dev=2.585
O2'	B	0, -1.000, 1.856, 4.712, 8.578 max_d=8.578 avg_d=1.856 std_dev=2.856

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.00	0.15	0.01	0.16	0.16	0.14
C2	0.01	0.00	0.26	0.15	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.20	0.23	0.18	0.01	0.19	0.21	0.17
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.14	0.00	0.07	0.18	0.12	0.13	0.20	0.31	0.26	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.38	0.09	0.42	0.51	0.43
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.18	0.00	0.26	0.01	0.26	0.26	0.21	0.10	0.11	0.30	0.17	0.01	0.00	0.02	0.02	0.29	0.12	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.14	0.18	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.12	0.17	0.01	0.18	0.18	0.16
C4'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.05	0.20	0.06	0.17	0.11	0.17	0.07	0.21	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.07	0.26	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.08	0.05	0.21	0.01	0.24	0.28	0.22
C5'	0.07	0.18	0.18	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.13	0.19	0.15	0.23	0.17	0.18	0.08	0.03	0.16	0.01	0.01	0.14	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.26	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.10	0.22	0.00	0.26	0.33	0.24
C8	0.00	0.01	0.13	0.26	0.00	0.20	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.37	0.13	0.14	0.23	0.01	0.23	0.20	0.20
N1	0.01	0.00	0.20	0.21	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.18	0.19	0.00	0.22	0.28	0.20
N2	0.02	0.00	0.31	0.10	0.01	0.17	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.27	0.28	0.19	0.01	0.20	0.19	0.18
N3	0.01	0.00	0.26	0.11	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.23	0.23	0.17	0.01	0.18	0.16	0.16
N7	0.00	0.00	0.06	0.30	0.00	0.17	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.16	0.08	0.26	0.01	0.30	0.32	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.17	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.07	0.01	0.15	0.01	0.15	0.14	0.13
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.05	0.21	0.19	0.03	0.14	0.37	0.06	0.31	0.20	0.35	0.15	0.00	0.01	0.14	0.32	0.21	0.36	0.62	0.40
O3'	0.24	0.20	0.01	0.00	0.11	0.02	0.08	0.16	0.08	0.13	0.12	0.27	0.23	0.16	0.07	0.01	0.00	0.17	0.18	0.12	0.24	0.18	0.20
O4'	0.00	0.23	0.01	0.02	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.14	0.18	0.28	0.23	0.08	0.01	0.14	0.17	0.00	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04
O5'	0.15	0.18	0.38	0.02	0.17	0.01	0.21	0.01	0.22	0.23	0.19	0.19	0.17	0.26	0.15	0.32	0.18	0.04	0.00	0.25	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.29	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.12	0.06	0.25	0.00	0.31	0.40	0.28
OP1	0.16	0.19	0.42	0.12	0.18	0.06	0.24	0.04	0.26	0.23	0.22	0.20	0.18	0.30	0.15	0.36	0.24	0.04	0.02	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.21	0.51	0.06	0.18	0.02	0.28	0.01	0.33	0.20	0.28	0.19	0.16	0.32	0.14	0.62	0.18	0.05	0.01	0.40	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.17	0.43	0.05	0.16	0.01	0.22	0.01	0.24	0.20	0.20	0.18	0.16	0.27	0.13	0.40	0.20	0.04	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.23	0.20	0.56	0.24	0.10	0.26	0.23	0.29	0.28	0.28	0.22	0.37	0.28	0.26	0.19	0.51	0.36	0.34	0.27	0.13	0.05
C2	0.36	0.22	0.12	0.50	0.31	0.07	0.27	0.16	0.20	0.38	0.17	0.28	0.21	0.34	0.36	0.17	0.51	0.52	0.30	0.21	0.17	0.06
C2'	0.54	0.82	0.71	1.04	0.69	0.58	0.75	0.63	0.90	0.55	0.91	0.73	1.03	0.64	0.59	0.49	0.95	0.35	0.68	0.14	0.15	0.28
C3'	0.32	0.40	0.43	0.77	0.37	0.38	0.43	0.49	0.49	0.37	0.46	0.36	0.59	0.42	0.35	0.23	0.65	0.25	0.58	0.14	0.12	0.25
C4	0.33	0.19	0.12	0.44	0.28	0.06	0.27	0.18	0.23	0.37	0.19	0.24	0.27	0.34	0.33	0.27	0.45	0.45	0.29	0.29	0.12	0.05
C4'	0.44	0.37	0.21	0.28	0.43	0.14	0.43	0.17	0.40	0.46	0.36	0.40	0.40	0.46	0.45	0.50	0.19	0.54	0.25	0.31	0.20	0.09
C5	0.40	0.21	0.23	0.31	0.32	0.10	0.29	0.18	0.21	0.42	0.18	0.28	0.21	0.36	0.38	0.41	0.39	0.48	0.25	0.36	0.12	0.08
C5'	0.63	0.56	0.44	0.10	0.63	0.29	0.65	0.19	0.62	0.68	0.56	0.59	0.63	0.68	0.65	0.79	0.05	0.68	0.19	0.40	0.25	0.16
C6	0.45	0.25	0.31	0.25	0.36	0.16	0.30	0.19	0.20	0.46	0.19	0.33	0.17	0.37	0.44	0.45	0.37	0.53	0.22	0.37	0.12	0.09
C8	0.34	0.19	0.18	0.35	0.27	0.07	0.27	0.20	0.22	0.37	0.20	0.23	0.26	0.33	0.33	0.39	0.39	0.42	0.27	0.36	0.12	0.08
N1	0.44	0.26	0.21	0.34	0.35	0.13	0.29	0.16	0.20	0.44	0.19	0.33	0.17	0.36	0.43	0.32	0.43	0.56	0.24	0.29	0.12	0.07
N2	0.33	0.22	0.24	0.62	0.29	0.09	0.25	0.18	0.18	0.35	0.17	0.28	0.19	0.31	0.33	0.14	0.59	0.54	0.33	0.13	0.25	0.10
N3	0.31	0.19	0.17	0.54	0.28	0.07	0.28	0.19	0.24	0.35	0.19	0.24	0.29	0.34	0.32	0.17	0.52	0.46	0.32	0.23	0.16	0.05
N7	0.39	0.20	0.28	0.27	0.31	0.11	0.28	0.20	0.21	0.41	0.18	0.27	0.22	0.36	0.38	0.48	0.35	0.45	0.24	0.39	0.13	0.10
N9	0.30	0.20	0.12	0.46	0.26	0.06	0.26	0.20	0.25	0.34	0.22	0.22	0.31	0.32	0.30	0.27	0.45	0.41	0.31	0.31	0.12	0.06
O2'	0.73	1.28	0.97	1.20	0.99	0.65	1.06	0.64	1.32	0.71	1.42	1.10	1.48	0.84	0.80	0.80	1.11	0.40	0.59	0.21	0.09	0.11
O3'	0.25	0.30	0.30	0.55	0.28	0.16	0.34	0.28	0.41	0.29	0.37	0.27	0.55	0.34	0.27	0.21	0.37	0.30	0.31	0.26	0.23	0.07
O4'	0.66	0.57	0.38	0.12	0.65	0.33	0.67	0.27	0.63	0.70	0.57	0.61	0.62	0.71	0.68	0.68	0.08	0.76	0.17	0.45	0.33	0.24
O5'	0.54	0.44	0.39	0.24	0.52	0.20	0.53	0.10	0.48	0.58	0.43	0.48	0.48	0.57	0.55	0.69	0.18	0.58	0.29	0.35	0.17	0.15
O6	0.51	0.28	0.46	0.15	0.39	0.23	0.31	0.24	0.21	0.49	0.21	0.36	0.16	0.38	0.47	0.56	0.32	0.55	0.18	0.44	0.18	0.13
OP1	0.62	0.55	0.51	0.19	0.61	0.26	0.63	0.10	0.60	0.67	0.56	0.58	0.61	0.67	0.64	0.85	0.13	0.63	0.30	0.36	0.18	0.20
OP2	0.52	0.41	0.43	0.33	0.49	0.22	0.49	0.17	0.45	0.56	0.40	0.45	0.44	0.55	0.52	0.69	0.32	0.52	0.40	0.34	0.23	0.29
P	0.64	0.54	0.52	0.17	0.62	0.26	0.64	0.10	0.60	0.69	0.54	0.58	0.60	0.69	0.65	0.85	0.13	0.64	0.26	0.37	0.16	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.25	0.00	0.09	0.20	0.70	0.25
C2	0.03	0.00	0.28	0.29	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.17	0.21	0.17	0.53	0.14
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.15	0.01	0.07	0.18	0.12	0.14	0.22	0.29	0.08	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.21	0.51	0.17
C3'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.28	0.00	0.35	0.02	0.38	0.27	0.35	0.24	0.41	0.35	0.22	0.02	0.01	0.01	0.33	0.21	0.17	0.23
C4	0.02	0.00	0.15	0.28	0.00	0.12	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.08	0.09	0.24	0.17	0.57	0.12
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.12	0.00	0.20	0.00	0.19	0.26	0.13	0.06	0.23	0.28	0.14	0.22	0.02	0.00	0.02	0.08	0.37	0.08
C5	0.01	0.00	0.07	0.35	0.00	0.20	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.10	0.03	0.40	0.13	0.41	0.10
C5'	0.06	0.22	0.18	0.02	0.24	0.00	0.36	0.00	0.37	0.39	0.30	0.17	0.44	0.45	0.22	0.04	0.14	0.01	0.01	0.09	0.23	0.01
C6	0.02	0.00	0.12	0.38	0.00	0.19	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.11	0.07	0.42	0.13	0.33	0.12
C8	0.01	0.00	0.14	0.27	0.00	0.26	0.00	0.39	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.11	0.12	0.41	0.14	0.50	0.13
N1	0.02	0.00	0.22	0.35	0.00	0.13	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.08	0.13	0.33	0.14	0.42	0.08
N3	0.03	0.00	0.29	0.24	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.17	0.18	0.15	0.19	0.62	0.19
N6	0.02	0.01	0.08	0.41	0.01	0.23	0.01	0.44	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.16	0.04	0.52	0.13	0.19	0.21
N7	0.00	0.00	0.08	0.35	0.00	0.28	0.00	0.45	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.37	0.17	0.08	0.50	0.12	0.33	0.19
N9	0.00	0.01	0.02	0.22	0.00	0.14	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.07	0.01	0.21	0.18	0.63	0.14
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.16	0.22	0.29	0.04	0.28	0.34	0.19	0.09	0.35	0.37	0.19	0.00	0.05	0.20	0.22	0.12	0.45	0.08
O3'	0.25	0.13	0.01	0.01	0.08	0.02	0.10	0.14	0.11	0.11	0.08	0.17	0.16	0.17	0.07	0.05	0.00	0.16	0.45	0.56	0.30	0.42
O4'	0.00	0.17	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.12	0.13	0.18	0.04	0.08	0.01	0.20	0.16	0.00	0.22	0.19	0.81	0.35
O5'	0.09	0.21	0.09	0.33	0.24	0.02	0.40	0.01	0.42	0.41	0.33	0.15	0.52	0.50	0.21	0.22	0.45	0.22	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.20	0.17	0.21	0.21	0.17	0.08	0.13	0.09	0.13	0.14	0.14	0.19	0.13	0.12	0.18	0.12	0.56	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.70	0.53	0.51	0.17	0.57	0.37	0.41	0.23	0.33	0.50	0.42	0.62	0.19	0.33	0.63	0.45	0.30	0.81	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.14	0.17	0.23	0.12	0.08	0.10	0.01	0.12	0.13	0.08	0.19	0.21	0.19	0.14	0.08	0.42	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00