Doublet Group distance statistics: 51336

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.016, 0.038, 0.060, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.015, 0.040, 0.064, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.040 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.007, 0.042, 0.077, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.042 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.003, 0.043, 0.084, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.043 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.004, 0.051, 0.097, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.051 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.053, 0.302, 0.551, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.302 std_dev=0.249
C2'	A	0, 0.080, 0.356, 0.631, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.356 std_dev=0.276
P	B	0, 0.116, 0.406, 0.695, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.406 std_dev=0.290
O2'	A	0, 0.134, 0.446, 0.759, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.446 std_dev=0.313
C4'	A	0, 0.088, 0.488, 0.887, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.488 std_dev=0.399
OP1	B	0, 0.205, 0.619, 1.034, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.619 std_dev=0.414
C3'	A	0, 0.106, 0.543, 0.980, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.543 std_dev=0.437
OP2	B	0, 0.272, 0.813, 1.353, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.813 std_dev=0.541
O5'	B	0, 0.188, 0.761, 1.335, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.761 std_dev=0.573
OP2	A	0, 0.171, 0.779, 1.388, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.779 std_dev=0.608
O5'	A	0, 0.166, 0.790, 1.414, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.790 std_dev=0.624
C5'	A	0, 0.167, 0.810, 1.452, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.810 std_dev=0.643
O3'	A	0, 0.186, 0.831, 1.475, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.831 std_dev=0.644
P	A	0, 0.152, 0.912, 1.672, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.912 std_dev=0.760
OP1	A	0, 0.150, 1.195, 2.241, 2.443 max_d=2.443 avg_d=1.195 std_dev=1.046
C4'	B	0, 0.766, 2.071, 3.375, 3.487 max_d=3.487 avg_d=2.071 std_dev=1.305
C5'	B	0, 0.544, 1.911, 3.278, 3.501 max_d=3.501 avg_d=1.911 std_dev=1.367
O4'	B	0, 0.899, 2.399, 3.899, 4.158 max_d=4.158 avg_d=2.399 std_dev=1.500
O3'	B	0, 0.988, 2.583, 4.178, 4.128 max_d=4.128 avg_d=2.583 std_dev=1.595
C3'	B	0, 0.844, 2.527, 4.210, 4.426 max_d=4.426 avg_d=2.527 std_dev=1.683
C1'	B	0, 1.171, 3.031, 4.892, 5.100 max_d=5.100 avg_d=3.031 std_dev=1.860
C2'	B	0, 1.307, 3.176, 5.045, 4.955 max_d=4.955 avg_d=3.176 std_dev=1.869
O2'	B	0, 1.343, 3.455, 5.566, 6.085 max_d=6.085 avg_d=3.455 std_dev=2.111
N9	B	0, 1.125, 3.382, 5.640, 6.103 max_d=6.103 avg_d=3.382 std_dev=2.257
C8	B	0, 1.167, 3.473, 5.778, 6.120 max_d=6.120 avg_d=3.473 std_dev=2.306
C4	B	0, 1.207, 3.907, 6.606, 7.246 max_d=7.246 avg_d=3.907 std_dev=2.700
N7	B	0, 1.087, 3.825, 6.563, 7.139 max_d=7.139 avg_d=3.825 std_dev=2.738
N3	B	0, 1.415, 4.328, 7.241, 7.758 max_d=7.758 avg_d=4.328 std_dev=2.913
C5	B	0, 1.118, 4.108, 7.098, 7.836 max_d=7.836 avg_d=4.108 std_dev=2.990
C2	B	0, 1.535, 4.983, 8.431, 8.906 max_d=8.906 avg_d=4.983 std_dev=3.448
C6	B	0, 1.300, 4.772, 8.244, 9.042 max_d=9.042 avg_d=4.772 std_dev=3.472
N1	B	0, 1.536, 5.228, 8.919, 9.548 max_d=9.548 avg_d=5.228 std_dev=3.691
N6	B	0, 1.273, 5.071, 8.870, 9.752 max_d=9.752 avg_d=5.071 std_dev=3.798

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.05
C2	0.03	0.00	0.20	0.19	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.27	0.04	0.11	0.01	0.13	0.14	0.09
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.07	0.16	0.23	0.19	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.08	0.04	0.03
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.11	0.11	0.17	0.23	0.17	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.10	0.11	0.08	0.07
C4	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.13	0.02	0.10	0.01	0.12	0.12	0.09
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.06	0.08	0.06	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.09	0.02	0.13	0.01	0.15	0.15	0.12
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.10	0.07	0.06	0.05	0.11	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.11	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.15	0.03	0.14	0.00	0.17	0.18	0.14
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.13	0.01	0.12	0.11	0.10
N1	0.03	0.00	0.16	0.17	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.23	0.04	0.13	0.01	0.16	0.16	0.12
N2	0.03	0.00	0.23	0.23	0.01	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.33	0.05	0.10	0.01	0.13	0.14	0.09
N3	0.03	0.00	0.19	0.17	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.23	0.04	0.09	0.01	0.11	0.12	0.08
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.15	0.01	0.15	0.15	0.14
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.08	0.01	0.09	0.10	0.07
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.10	0.04	0.07	0.04	0.11	0.06	0.17	0.25	0.18	0.04	0.03	0.00	0.05	0.05	0.04	0.10	0.12	0.04	0.04
O3'	0.02	0.27	0.02	0.01	0.13	0.03	0.09	0.04	0.15	0.13	0.23	0.33	0.23	0.09	0.04	0.05	0.00	0.02	0.10	0.13	0.19	0.17	0.14
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.12	0.08
O5'	0.03	0.11	0.03	0.06	0.10	0.00	0.13	0.01	0.14	0.13	0.13	0.10	0.09	0.15	0.08	0.04	0.10	0.05	0.00	0.16	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.04	0.16	0.00	0.19	0.20	0.17
OP1	0.05	0.13	0.08	0.11	0.12	0.06	0.15	0.05	0.17	0.12	0.16	0.13	0.11	0.15	0.09	0.12	0.19	0.05	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.14	0.04	0.08	0.12	0.02	0.15	0.01	0.18	0.11	0.16	0.14	0.12	0.15	0.10	0.04	0.17	0.12	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.03	0.07	0.09	0.01	0.12	0.01	0.14	0.10	0.12	0.09	0.08	0.14	0.07	0.04	0.14	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.11	2.78	0.87	0.69	1.96	0.60	2.07	0.79	2.68	1.03	2.99	2.32	2.86	1.44	1.36	1.06	0.79	0.87	0.47	0.19	0.38	0.11
C2	1.10	2.69	0.78	0.52	1.98	0.51	2.00	0.68	2.35	1.17	2.68	2.35	2.28	1.55	1.40	0.83	0.69	0.94	0.43	0.18	0.41	0.10
C2'	0.78	2.12	0.71	0.98	1.37	0.80	1.37	1.10	1.89	0.55	2.23	1.73	1.97	0.78	0.89	0.78	1.06	0.70	0.68	0.37	0.27	0.24
C3'	0.74	2.10	0.70	0.93	1.35	0.79	1.36	1.08	1.88	0.55	2.23	1.71	2.00	0.80	0.86	0.81	1.01	0.65	0.67	0.39	0.14	0.25
C4	1.19	2.97	0.96	0.57	2.13	0.54	2.24	0.66	2.77	1.29	3.11	2.50	2.84	1.74	1.51	1.08	0.68	0.93	0.39	0.18	0.35	0.07
C4'	0.99	2.55	0.82	0.71	1.75	0.62	1.83	0.86	2.41	0.89	2.75	2.11	2.61	1.25	1.20	1.06	0.80	0.76	0.52	0.24	0.25	0.13
C5	1.27	3.10	1.13	0.55	2.20	0.53	2.33	0.55	2.82	1.54	3.21	2.60	2.89	1.97	1.62	1.21	0.60	0.96	0.30	0.17	0.31	0.05
C5'	1.06	2.69	0.92	0.60	1.86	0.56	1.97	0.76	2.56	1.03	2.90	2.22	2.78	1.42	1.30	1.20	0.70	0.77	0.47	0.21	0.20	0.10
C6	1.29	3.03	1.17	0.53	2.15	0.52	2.25	0.48	2.64	1.66	3.04	2.56	2.65	2.01	1.64	1.18	0.53	0.99	0.24	0.18	0.32	0.05
C8	1.26	3.12	1.12	0.60	2.20	0.55	2.35	0.60	2.94	1.42	3.31	2.59	3.11	1.88	1.59	1.28	0.66	0.93	0.34	0.17	0.31	0.05
N1	1.21	2.82	1.00	0.46	2.04	0.50	2.08	0.53	2.41	1.50	2.77	2.44	2.36	1.82	1.54	0.98	0.56	0.98	0.31	0.17	0.33	0.06
N2	0.96	2.31	0.52	0.59	1.73	0.50	1.65	0.77	1.93	0.85	2.23	2.09	1.80	1.16	1.19	0.57	0.78	0.90	0.50	0.19	0.50	0.13
N3	1.09	2.76	0.78	0.60	2.00	0.54	2.07	0.74	2.54	1.06	2.85	2.36	2.54	1.49	1.38	0.89	0.74	0.90	0.45	0.18	0.42	0.10
N7	1.30	3.18	1.21	0.59	2.25	0.54	2.39	0.53	2.93	1.58	3.33	2.64	3.06	2.02	1.66	1.33	0.60	0.96	0.27	0.17	0.30	0.05
N9	1.18	2.98	0.97	0.61	2.11	0.56	2.24	0.69	2.83	1.23	3.17	2.48	2.99	1.69	1.49	1.14	0.71	0.91	0.40	0.18	0.34	0.08
O2'	0.84	1.92	0.78	1.10	1.27	0.88	1.23	1.15	1.67	0.68	2.01	1.59	1.70	0.76	0.90	0.82	1.14	0.79	0.71	0.36	0.42	0.29
O3'	0.73	1.70	0.79	1.16	1.06	0.99	1.02	1.29	1.43	0.60	1.77	1.38	1.49	0.64	0.75	0.80	1.20	0.74	0.80	0.48	0.16	0.35
O4'	1.25	2.98	1.01	0.60	2.14	0.57	2.28	0.68	2.91	1.24	3.22	2.49	3.16	1.68	1.53	1.28	0.68	0.95	0.40	0.13	0.37	0.09
O5'	1.07	2.78	1.00	0.58	1.92	0.54	2.05	0.72	2.64	1.14	2.99	2.28	2.87	1.55	1.35	1.26	0.68	0.75	0.45	0.24	0.19	0.14
O6	1.32	3.02	1.31	0.60	2.13	0.54	2.23	0.42	2.60	1.79	3.00	2.55	2.62	2.07	1.68	1.26	0.48	1.00	0.15	0.20	0.37	0.08
OP1	1.06	2.71	1.05	0.59	1.86	0.56	1.98	0.75	2.56	1.14	2.91	2.22	2.78	1.52	1.32	1.35	0.68	0.72	0.47	0.28	0.21	0.19
OP2	1.20	2.99	1.24	0.61	2.08	0.56	2.24	0.63	2.82	1.42	3.19	2.45	3.05	1.83	1.52	1.49	0.66	0.81	0.39	0.29	0.30	0.19
P	1.21	2.96	1.19	0.58	2.08	0.54	2.23	0.63	2.83	1.36	3.18	2.44	3.07	1.77	1.52	1.48	0.64	0.83	0.38	0.22	0.24	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.35	0.01	0.29	1.14	0.42	0.57
C2	0.04	0.00	0.31	0.68	0.00	0.65	0.00	1.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.66	0.41	1.13	2.09	1.36	1.51
C2'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.16	0.01	0.09	0.21	0.16	0.16	0.25	0.30	0.12	0.08	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.96	0.37	0.40
C3'	0.02	0.68	0.00	0.00	0.39	0.00	0.36	0.03	0.44	0.41	0.58	0.66	0.44	0.39	0.21	0.01	0.01	0.01	0.31	0.32	0.35	0.14
C4	0.03	0.00	0.16	0.39	0.00	0.30	0.00	0.48	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.30	0.22	0.60	1.55	0.86	0.98
C4'	0.01	0.65	0.01	0.00	0.30	0.00	0.17	0.01	0.29	0.37	0.50	0.64	0.22	0.26	0.09	0.27	0.03	0.00	0.02	0.45	0.31	0.10
C5	0.02	0.00	0.09	0.36	0.00	0.17	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.13	0.10	0.44	1.56	0.91	0.96
C5'	0.06	1.09	0.21	0.03	0.48	0.01	0.27	0.00	0.50	0.50	0.86	1.00	0.38	0.35	0.08	0.06	0.20	0.01	0.01	0.29	0.43	0.02
C6	0.02	0.00	0.16	0.44	0.00	0.29	0.00	0.50	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.25	0.18	0.61	1.70	1.08	1.12
C8	0.01	0.01	0.16	0.41	0.01	0.37	0.00	0.50	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.39	0.30	0.23	0.52	1.55	0.85	0.97
N1	0.03	0.00	0.25	0.58	0.01	0.50	0.00	0.86	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.48	0.32	0.94	1.97	1.30	1.39
N3	0.04	0.00	0.30	0.66	0.00	0.64	0.01	1.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.64	0.41	1.02	1.86	1.14	1.32
N6	0.02	0.01	0.12	0.44	0.01	0.22	0.01	0.38	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.18	0.12	0.50	1.64	1.09	1.09
N7	0.02	0.01	0.08	0.39	0.01	0.26	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.39	0.23	0.12	0.42	1.56	0.92	0.98
N9	0.01	0.01	0.02	0.21	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.16	0.02	0.34	1.37	0.63	0.76
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.18	0.27	0.28	0.06	0.25	0.39	0.20	0.20	0.29	0.39	0.21	0.00	0.03	0.19	0.28	0.70	0.35	0.14
O3'	0.35	0.66	0.04	0.01	0.30	0.03	0.13	0.20	0.25	0.30	0.48	0.64	0.18	0.23	0.16	0.03	0.00	0.23	0.66	0.25	0.58	0.54
O4'	0.01	0.41	0.03	0.01	0.22	0.00	0.10	0.01	0.18	0.23	0.32	0.41	0.12	0.12	0.02	0.19	0.23	0.00	0.43	1.03	0.37	0.57
O5'	0.29	1.13	0.10	0.31	0.60	0.02	0.44	0.01	0.61	0.52	0.94	1.02	0.50	0.42	0.34	0.28	0.66	0.43	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	1.14	2.09	0.96	0.32	1.55	0.45	1.56	0.29	1.70	1.55	1.97	1.86	1.64	1.56	1.37	0.70	0.25	1.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	1.36	0.37	0.35	0.86	0.31	0.91	0.43	1.08	0.85	1.30	1.14	1.09	0.92	0.63	0.35	0.58	0.37	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.57	1.51	0.40	0.14	0.98	0.10	0.96	0.02	1.12	0.97	1.39	1.32	1.09	0.98	0.76	0.14	0.54	0.57	0.00	0.01	0.00	0.00