Doublet Group distance statistics: 51338

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.013, 0.041, 0.068, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.041 std_dev=0.028
C5	A	0, 0.011, 0.043, 0.076, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.043 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.013, 0.049, 0.084, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.049 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.012, 0.049, 0.087, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.049 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.010, 0.052, 0.094, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.052 std_dev=0.042
C4	A	0, 0.017, 0.060, 0.103, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.060 std_dev=0.043
C2	A	0, 0.017, 0.061, 0.104, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.061 std_dev=0.043
N3	A	0, 0.022, 0.074, 0.127, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.074 std_dev=0.052
C1'	A	0, 0.021, 0.080, 0.138, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.080 std_dev=0.058
O6	A	0, 0.021, 0.082, 0.143, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.082 std_dev=0.061
N2	A	0, 0.050, 0.152, 0.253, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.152 std_dev=0.102
C2'	A	0, 0.236, 0.566, 0.895, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.566 std_dev=0.330
O4'	A	0, 0.285, 0.684, 1.084, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.684 std_dev=0.400
P	B	0, 0.271, 0.675, 1.078, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.675 std_dev=0.403
O5'	B	0, 0.321, 0.823, 1.325, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.823 std_dev=0.502
OP1	B	0, 0.141, 0.695, 1.250, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.695 std_dev=0.554
C4'	A	0, 0.433, 1.042, 1.651, 1.475 max_d=1.475 avg_d=1.042 std_dev=0.609
OP2	B	0, 0.415, 1.036, 1.656, 1.649 max_d=1.649 avg_d=1.036 std_dev=0.620
C5'	A	0, 0.443, 1.076, 1.710, 1.558 max_d=1.558 avg_d=1.076 std_dev=0.634
C2'	B	0, 0.421, 1.080, 1.740, 1.746 max_d=1.746 avg_d=1.080 std_dev=0.659
C3'	A	0, 0.500, 1.192, 1.885, 1.666 max_d=1.666 avg_d=1.192 std_dev=0.693
O2'	A	0, 0.523, 1.238, 1.954, 1.668 max_d=1.668 avg_d=1.238 std_dev=0.715
C3'	B	0, 0.474, 1.291, 2.109, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.291 std_dev=0.818
C5'	B	0, 0.546, 1.378, 2.209, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.378 std_dev=0.832
O2'	B	0, 0.460, 1.365, 2.271, 2.532 max_d=2.532 avg_d=1.365 std_dev=0.905
O3'	A	0, 0.877, 2.088, 3.299, 2.905 max_d=2.905 avg_d=2.088 std_dev=1.211
C4'	B	0, 0.850, 2.091, 3.331, 3.237 max_d=3.237 avg_d=2.091 std_dev=1.240
O5'	A	0, 1.094, 2.659, 4.224, 3.864 max_d=3.864 avg_d=2.659 std_dev=1.565
OP1	A	0, 1.168, 2.890, 4.613, 4.318 max_d=4.318 avg_d=2.890 std_dev=1.723
O3'	B	0, 1.226, 2.999, 4.771, 4.617 max_d=4.617 avg_d=2.999 std_dev=1.772
C1'	B	0, 1.286, 3.071, 4.856, 4.396 max_d=4.396 avg_d=3.071 std_dev=1.785
O4'	B	0, 1.280, 3.077, 4.875, 4.497 max_d=4.497 avg_d=3.077 std_dev=1.797
P	A	0, 1.446, 3.471, 5.497, 4.903 max_d=4.903 avg_d=3.471 std_dev=2.026
N9	B	0, 1.860, 4.405, 6.950, 5.989 max_d=5.989 avg_d=4.405 std_dev=2.545
C8	B	0, 2.150, 5.093, 8.035, 6.953 max_d=6.953 avg_d=5.093 std_dev=2.942
OP2	A	0, 2.272, 5.389, 8.506, 7.358 max_d=7.358 avg_d=5.389 std_dev=3.117
C4	B	0, 2.505, 5.931, 9.356, 8.045 max_d=8.045 avg_d=5.931 std_dev=3.425
N3	B	0, 2.699, 6.393, 10.086, 8.721 max_d=8.721 avg_d=6.393 std_dev=3.693
N7	B	0, 2.913, 6.893, 10.873, 9.237 max_d=9.237 avg_d=6.893 std_dev=3.980
C5	B	0, 3.077, 7.282, 11.487, 9.838 max_d=9.838 avg_d=7.282 std_dev=4.205
C2	B	0, 3.374, 7.994, 12.615, 10.923 max_d=10.923 avg_d=7.994 std_dev=4.620
C6	B	0, 3.800, 8.997, 14.194, 12.206 max_d=12.206 avg_d=8.997 std_dev=5.197
N1	B	0, 3.891, 9.220, 14.549, 12.575 max_d=12.575 avg_d=9.220 std_dev=5.329
N6	B	0, 4.471, 10.584, 16.696, 14.329 max_d=14.329 avg_d=10.584 std_dev=6.113

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.09	0.07	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.12	0.02	0.12	0.20	0.10
C2	0.07	0.00	0.09	0.04	0.00	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.25	0.13	0.10	0.02	0.06	0.29	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.12	0.04	0.05	0.07	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.03	0.08	0.19	0.05
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.11	0.17	0.06	0.09	0.05	0.17	0.08	0.03	0.01	0.01	0.22	0.14	0.15	0.21	0.12
C4	0.04	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.06	0.14	0.02	0.06	0.40	0.20
C4'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.10	0.05	0.16	0.10	0.09	0.02	0.14	0.02	0.00	0.01	0.06	0.15	0.07	0.04
C5	0.02	0.01	0.02	0.12	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.02	0.21	0.01	0.13	0.61	0.35
C5'	0.05	0.12	0.12	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.08	0.09	0.09	0.16	0.12	0.10	0.05	0.05	0.12	0.01	0.00	0.11	0.17	0.04	0.00
C6	0.03	0.01	0.04	0.11	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.15	0.08	0.05	0.19	0.01	0.15	0.63	0.35
C8	0.02	0.01	0.05	0.17	0.01	0.10	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.09	0.08	0.32	0.03	0.17	0.68	0.42
N1	0.05	0.00	0.07	0.06	0.00	0.05	0.02	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.17	0.09	0.12	0.02	0.07	0.46	0.23
N2	0.09	0.00	0.11	0.09	0.01	0.16	0.02	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.34	0.18	0.12	0.01	0.12	0.19	0.03
N3	0.07	0.01	0.09	0.05	0.00	0.10	0.00	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.26	0.13	0.11	0.02	0.10	0.23	0.08
N7	0.01	0.02	0.02	0.17	0.01	0.09	0.01	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.09	0.05	0.31	0.04	0.21	0.78	0.47
N9	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.09	0.07	0.00	0.18	0.01	0.09	0.41	0.23
O2'	0.02	0.13	0.00	0.03	0.09	0.14	0.14	0.05	0.15	0.17	0.13	0.17	0.11	0.18	0.09	0.00	0.03	0.10	0.17	0.16	0.10	0.21	0.11
O3'	0.15	0.25	0.01	0.01	0.13	0.02	0.05	0.12	0.08	0.09	0.17	0.34	0.26	0.09	0.07	0.03	0.00	0.12	0.29	0.06	0.30	0.19	0.17
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.08	0.09	0.18	0.13	0.05	0.00	0.10	0.12	0.00	0.13	0.04	0.16	0.08	0.06
O5'	0.12	0.10	0.10	0.22	0.14	0.01	0.21	0.00	0.19	0.32	0.12	0.12	0.11	0.31	0.18	0.17	0.29	0.13	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.03	0.14	0.02	0.06	0.01	0.11	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.16	0.06	0.04	0.24	0.00	0.24	0.76	0.45
OP1	0.12	0.06	0.08	0.15	0.06	0.15	0.13	0.17	0.15	0.17	0.07	0.12	0.10	0.21	0.09	0.10	0.30	0.16	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.29	0.19	0.21	0.40	0.07	0.61	0.04	0.63	0.68	0.46	0.19	0.23	0.78	0.41	0.21	0.19	0.08	0.01	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.11	0.05	0.12	0.20	0.04	0.35	0.00	0.35	0.42	0.23	0.03	0.08	0.47	0.23	0.11	0.17	0.06	0.00	0.45	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.82	0.11	0.35	0.82	0.53	1.36	0.40	1.62	1.06	1.31	0.53	2.10	1.52	0.63	0.18	0.77	0.23	0.12	0.06	0.21	0.08
C2	0.09	0.30	0.07	0.23	0.43	0.52	0.84	0.38	0.89	0.83	0.61	0.16	1.17	1.10	0.39	0.14	0.50	0.33	0.17	0.26	0.29	0.23
C2'	0.33	1.26	0.22	0.21	1.18	0.33	1.75	0.24	2.07	1.34	1.79	0.92	2.60	1.84	0.93	0.08	0.64	0.10	0.06	0.14	0.35	0.18
C3'	0.16	1.06	0.09	0.36	0.99	0.45	1.57	0.32	1.90	1.18	1.61	0.71	2.45	1.69	0.75	0.18	0.84	0.11	0.03	0.15	0.36	0.17
C4	0.06	0.56	0.07	0.25	0.67	0.48	1.16	0.36	1.29	1.02	0.97	0.35	1.68	1.40	0.56	0.12	0.58	0.22	0.11	0.09	0.23	0.11
C4'	0.08	0.77	0.12	0.41	0.76	0.57	1.32	0.42	1.61	1.00	1.31	0.46	2.15	1.47	0.56	0.26	0.87	0.28	0.14	0.06	0.24	0.08
C5	0.07	0.46	0.05	0.20	0.60	0.44	1.06	0.32	1.17	0.99	0.85	0.28	1.54	1.33	0.53	0.10	0.48	0.19	0.12	0.03	0.20	0.05
C5'	0.09	0.71	0.13	0.42	0.71	0.60	1.28	0.45	1.56	0.98	1.24	0.40	2.10	1.44	0.53	0.27	0.86	0.31	0.18	0.06	0.21	0.08
C6	0.14	0.28	0.14	0.20	0.44	0.43	0.84	0.32	0.89	0.86	0.59	0.18	1.20	1.12	0.43	0.16	0.39	0.24	0.18	0.07	0.17	0.05
C8	0.10	0.70	0.05	0.25	0.77	0.45	1.29	0.33	1.48	1.10	1.15	0.45	1.94	1.52	0.64	0.09	0.60	0.15	0.10	0.03	0.22	0.05
N1	0.13	0.22	0.13	0.19	0.36	0.46	0.72	0.34	0.75	0.77	0.48	0.15	1.01	1.00	0.35	0.15	0.38	0.30	0.15	0.13	0.23	0.13
N2	0.19	0.21	0.10	0.24	0.29	0.57	0.63	0.42	0.66	0.67	0.44	0.14	0.88	0.87	0.26	0.17	0.49	0.44	0.27	0.42	0.37	0.37
N3	0.09	0.50	0.10	0.28	0.61	0.53	1.08	0.39	1.19	0.96	0.88	0.30	1.53	1.32	0.51	0.15	0.61	0.29	0.16	0.20	0.27	0.20
N7	0.10	0.56	0.05	0.21	0.68	0.42	1.17	0.31	1.31	1.05	0.98	0.36	1.72	1.42	0.59	0.08	0.51	0.15	0.12	0.07	0.20	0.06
N9	0.10	0.72	0.09	0.28	0.78	0.48	1.31	0.36	1.50	1.08	1.18	0.47	1.95	1.51	0.63	0.13	0.65	0.20	0.10	0.06	0.23	0.09
O2'	0.31	1.44	0.17	0.27	1.24	0.40	1.78	0.37	2.17	1.26	1.96	1.05	2.68	1.78	0.92	0.03	0.70	0.05	0.06	0.06	0.14	0.03
O3'	0.13	0.92	0.26	0.64	0.78	0.70	1.36	0.57	1.74	0.91	1.49	0.54	2.30	1.43	0.51	0.46	1.16	0.33	0.24	0.06	0.16	0.04
O4'	0.15	0.58	0.16	0.44	0.61	0.64	1.16	0.48	1.40	0.90	1.08	0.30	1.90	1.34	0.45	0.30	0.87	0.38	0.21	0.06	0.17	0.08
O5'	0.08	0.63	0.08	0.30	0.71	0.46	1.28	0.27	1.52	1.07	1.16	0.37	2.05	1.51	0.58	0.19	0.75	0.21	0.05	0.20	0.44	0.21
O6	0.22	0.21	0.22	0.25	0.38	0.43	0.72	0.34	0.74	0.79	0.47	0.19	1.03	1.00	0.40	0.22	0.36	0.28	0.28	0.23	0.12	0.16
OP1	0.06	0.66	0.04	0.30	0.73	0.47	1.30	0.29	1.55	1.08	1.20	0.38	2.10	1.52	0.60	0.18	0.76	0.20	0.06	0.12	0.41	0.16
OP2	0.18	0.48	0.20	0.24	0.69	0.32	1.25	0.19	1.40	1.16	0.99	0.29	1.93	1.55	0.64	0.21	0.65	0.18	0.30	0.56	0.83	0.57
P	0.11	0.58	0.12	0.28	0.70	0.41	1.27	0.21	1.48	1.10	1.11	0.34	2.02	1.52	0.60	0.21	0.73	0.19	0.11	0.32	0.57	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.00	0.08	0.17	0.34	0.17
C2	0.05	0.00	0.19	0.11	0.01	0.08	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.13	0.15	0.11	0.19	0.38	0.11
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.09	0.00	0.04	0.10	0.08	0.11	0.15	0.19	0.05	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.11	0.09
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.13	0.11	0.12	0.09	0.14	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.20	0.15	0.10	0.16
C4	0.02	0.01	0.09	0.09	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.08	0.08	0.33	0.45	0.22
C4'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.10	0.05	0.08	0.04	0.08	0.03	0.14	0.03	0.00	0.01	0.08	0.10	0.03
C5	0.01	0.02	0.04	0.12	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.04	0.04	0.13	0.53	0.55	0.33
C5'	0.03	0.11	0.10	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.08	0.08	0.11	0.05	0.07	0.02	0.04	0.12	0.01	0.00	0.07	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.07	0.09	0.50	0.53	0.29
C8	0.02	0.02	0.11	0.11	0.01	0.10	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.00	0.24	0.06	0.10	0.28	0.67	0.63	0.49
N1	0.03	0.01	0.15	0.12	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.09	0.11	0.07	0.32	0.45	0.18
N3	0.04	0.01	0.19	0.09	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.14	0.15	0.11	0.16	0.35	0.11
N6	0.02	0.02	0.05	0.14	0.01	0.04	0.02	0.05	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.14	0.03	0.06	0.13	0.62	0.59	0.36
N7	0.01	0.02	0.06	0.13	0.01	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.00	0.23	0.06	0.06	0.25	0.74	0.66	0.49
N9	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.10	0.07	0.01	0.14	0.39	0.47	0.29
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.06	0.14	0.12	0.04	0.10	0.24	0.12	0.17	0.14	0.23	0.10	0.00	0.04	0.09	0.15	0.16	0.16	0.15
O3'	0.15	0.13	0.02	0.01	0.08	0.03	0.04	0.12	0.04	0.06	0.09	0.14	0.03	0.06	0.07	0.04	0.00	0.10	0.24	0.13	0.11	0.19
O4'	0.00	0.15	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.10	0.11	0.15	0.06	0.06	0.01	0.09	0.10	0.00	0.06	0.07	0.33	0.13
O5'	0.08	0.11	0.08	0.20	0.08	0.01	0.13	0.00	0.09	0.28	0.07	0.11	0.13	0.25	0.14	0.15	0.24	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.19	0.14	0.15	0.33	0.08	0.53	0.07	0.50	0.67	0.32	0.16	0.62	0.74	0.39	0.16	0.13	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.38	0.11	0.10	0.45	0.10	0.55	0.04	0.53	0.63	0.45	0.35	0.59	0.66	0.47	0.16	0.11	0.33	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.11	0.09	0.16	0.22	0.03	0.33	0.01	0.29	0.49	0.18	0.11	0.36	0.49	0.29	0.15	0.19	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00