Doublet Group distance statistics: 51341

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C5	A	0, -0.002, 0.015, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.004, 0.019, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.023
N1	A	0, -0.005, 0.021, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N3	A	0, -0.004, 0.023, 0.051, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.027
C4	A	0, -0.003, 0.025, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.028
N9	A	0, -0.003, 0.027, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.030
N7	A	0, -0.007, 0.024, 0.056, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.024 std_dev=0.031
C1'	A	0, -0.003, 0.030, 0.063, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.030 std_dev=0.033
N2	A	0, -0.005, 0.034, 0.073, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.034 std_dev=0.039
C8	A	0, -0.008, 0.036, 0.079, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.036 std_dev=0.044
C2'	A	0, 0.023, 0.165, 0.307, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.165 std_dev=0.142
O2'	A	0, 0.000, 0.209, 0.418, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.209 std_dev=0.209
O4'	A	0, 0.008, 0.245, 0.482, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.245 std_dev=0.237
P	B	0, 0.000, 0.284, 0.568, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.284 std_dev=0.284
C3'	A	0, 0.000, 0.421, 0.843, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.421 std_dev=0.421
O3'	A	0, 0.019, 0.528, 1.036, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.528 std_dev=0.508
O5'	B	0, 0.126, 0.677, 1.228, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.677 std_dev=0.551
C4'	A	0, -0.038, 0.537, 1.112, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.537 std_dev=0.575
OP1	B	0, 0.111, 0.746, 1.381, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.746 std_dev=0.635
OP2	B	0, 0.071, 0.957, 1.843, 2.135 max_d=2.135 avg_d=0.957 std_dev=0.886
C8	B	0, 0.168, 1.083, 1.999, 2.239 max_d=2.239 avg_d=1.083 std_dev=0.915
C5'	A	0, -0.109, 1.058, 2.224, 2.683 max_d=2.683 avg_d=1.058 std_dev=1.166
C5'	B	0, -0.082, 1.250, 2.582, 3.096 max_d=3.096 avg_d=1.250 std_dev=1.332
N9	B	0, 0.042, 1.401, 2.759, 3.240 max_d=3.240 avg_d=1.401 std_dev=1.358
N7	B	0, 0.034, 1.470, 2.907, 3.419 max_d=3.419 avg_d=1.470 std_dev=1.436
O5'	A	0, -0.161, 1.279, 2.720, 3.292 max_d=3.292 avg_d=1.279 std_dev=1.441
O4'	B	0, -0.029, 1.525, 3.079, 3.658 max_d=3.658 avg_d=1.525 std_dev=1.554
C5	B	0, -0.083, 1.676, 3.435, 4.106 max_d=4.106 avg_d=1.676 std_dev=1.759
C4	B	0, -0.097, 1.697, 3.491, 4.179 max_d=4.179 avg_d=1.697 std_dev=1.794
C1'	B	0, -0.099, 1.762, 3.623, 4.336 max_d=4.336 avg_d=1.762 std_dev=1.861
C4'	B	0, -0.200, 1.731, 3.662, 4.426 max_d=4.426 avg_d=1.731 std_dev=1.931
P	A	0, -0.205, 1.912, 4.029, 4.864 max_d=4.864 avg_d=1.912 std_dev=2.117
C3'	B	0, -0.309, 2.039, 4.387, 5.328 max_d=5.328 avg_d=2.039 std_dev=2.348
C6	B	0, -0.293, 2.095, 4.482, 5.435 max_d=5.435 avg_d=2.095 std_dev=2.387
N3	B	0, -0.316, 2.158, 4.632, 5.622 max_d=5.622 avg_d=2.158 std_dev=2.474
OP2	A	0, -0.288, 2.236, 4.761, 5.765 max_d=5.765 avg_d=2.236 std_dev=2.525
OP1	A	0, -0.259, 2.427, 5.113, 6.171 max_d=6.171 avg_d=2.427 std_dev=2.686
C2'	B	0, -0.344, 2.348, 5.040, 6.117 max_d=6.117 avg_d=2.348 std_dev=2.692
N1	B	0, -0.426, 2.313, 5.052, 6.160 max_d=6.160 avg_d=2.313 std_dev=2.739
C2	B	0, -0.435, 2.338, 5.111, 6.234 max_d=6.234 avg_d=2.338 std_dev=2.773
N6	B	0, -0.430, 2.465, 5.361, 6.530 max_d=6.530 avg_d=2.465 std_dev=2.896
O3'	B	0, -0.551, 2.537, 5.626, 6.885 max_d=6.885 avg_d=2.537 std_dev=3.089
O2'	B	0, -0.544, 2.916, 6.376, 7.777 max_d=7.777 avg_d=2.916 std_dev=3.460

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.19	0.03	0.06	0.29	0.19
C2	0.06	0.00	0.09	0.12	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.16	0.40	0.00	0.21	0.94	0.50
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.07	0.10	0.10	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.14	0.03	0.08	0.09	0.12
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.15	0.00	0.20	0.05	0.21	0.19	0.17	0.09	0.10	0.22	0.13	0.00	0.00	0.04	0.09	0.23	0.11	0.08	0.06
C4	0.03	0.01	0.07	0.15	0.00	0.01	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.12	0.07	0.52	0.01	0.41	0.97	0.63
C4'	0.04	0.12	0.03	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.10	0.29	0.02	0.21	0.14	0.28	0.09	0.05	0.01	0.01	0.00	0.16	0.14	0.08	0.02
C5	0.02	0.00	0.03	0.20	0.00	0.14	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.19	0.01	0.78	0.01	0.79	1.40	0.99
C5'	0.04	0.02	0.02	0.05	0.19	0.00	0.41	0.00	0.37	0.62	0.17	0.16	0.06	0.64	0.28	0.07	0.02	0.00	0.00	0.49	0.20	0.05	0.02
C6	0.04	0.00	0.04	0.21	0.01	0.10	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.19	0.04	0.78	0.00	0.81	1.52	1.03
C8	0.01	0.00	0.04	0.19	0.00	0.29	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.17	0.11	0.89	0.00	0.91	1.26	1.04
N1	0.05	0.00	0.07	0.17	0.01	0.02	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.15	0.11	0.60	0.00	0.52	1.28	0.78
N2	0.07	0.00	0.10	0.09	0.01	0.21	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.06	0.20	0.27	0.00	0.09	0.80	0.34
N3	0.05	0.01	0.10	0.10	0.00	0.14	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.16	0.31	0.01	0.12	0.74	0.38
N7	0.01	0.00	0.02	0.22	0.00	0.28	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.22	0.08	0.99	0.00	1.10	1.62	1.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.09	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.53	0.01	0.43	0.81	0.60
O2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.05	0.10	0.07	0.13	0.07	0.12	0.10	0.07	0.10	0.05	0.00	0.06	0.06	0.03	0.14	0.16	0.11	0.04
O3'	0.02	0.09	0.04	0.00	0.12	0.01	0.19	0.02	0.19	0.17	0.15	0.06	0.07	0.22	0.10	0.06	0.00	0.01	0.05	0.23	0.09	0.32	0.04
O4'	0.00	0.16	0.00	0.04	0.07	0.01	0.01	0.00	0.04	0.11	0.11	0.20	0.16	0.08	0.00	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.14	0.09	0.03
O5'	0.19	0.40	0.14	0.09	0.52	0.00	0.78	0.00	0.78	0.89	0.60	0.27	0.31	0.99	0.53	0.03	0.05	0.03	0.00	0.91	0.02	0.01	0.00
O6	0.03	0.00	0.03	0.23	0.01	0.16	0.01	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.23	0.01	0.91	0.00	1.04	1.78	1.24
OP1	0.06	0.21	0.08	0.11	0.41	0.14	0.79	0.20	0.81	0.91	0.52	0.09	0.12	1.10	0.43	0.16	0.09	0.14	0.02	1.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.29	0.94	0.09	0.08	0.97	0.08	1.40	0.05	1.52	1.26	1.28	0.80	0.74	1.62	0.81	0.11	0.32	0.09	0.01	1.78	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.50	0.12	0.06	0.63	0.02	0.99	0.02	1.03	1.04	0.78	0.34	0.38	1.25	0.60	0.04	0.04	0.03	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.19	0.23	0.24	0.04	0.43	0.06	0.52	0.22	0.22	0.27	0.06	0.32	0.05	0.20	0.29	0.13	0.49	0.37	0.41	0.11	0.22
C2	0.21	0.27	0.09	0.09	0.09	0.28	0.14	0.39	0.28	0.13	0.33	0.16	0.35	0.02	0.10	0.11	0.13	0.37	0.28	0.36	0.06	0.17
C2'	0.36	0.19	0.33	0.33	0.02	0.47	0.17	0.49	0.33	0.09	0.33	0.03	0.48	0.11	0.15	0.45	0.33	0.47	0.27	0.35	0.12	0.08
C3'	0.17	0.28	0.12	0.12	0.12	0.23	0.21	0.27	0.35	0.01	0.37	0.15	0.44	0.14	0.03	0.19	0.08	0.26	0.13	0.18	0.12	0.06
C4	0.22	0.17	0.12	0.12	0.01	0.25	0.03	0.34	0.14	0.20	0.20	0.08	0.19	0.10	0.14	0.12	0.04	0.33	0.28	0.27	0.14	0.14
C4'	0.28	0.19	0.14	0.14	0.03	0.33	0.01	0.44	0.16	0.24	0.23	0.07	0.22	0.12	0.19	0.16	0.03	0.43	0.34	0.37	0.19	0.24
C5	0.15	0.06	0.08	0.08	0.08	0.11	0.13	0.18	0.09	0.26	0.06	0.01	0.14	0.24	0.16	0.03	0.06	0.19	0.22	0.12	0.26	0.09
C5'	0.03	0.39	0.23	0.22	0.18	0.03	0.14	0.11	0.26	0.08	0.37	0.31	0.25	0.04	0.04	0.27	0.43	0.11	0.11	0.12	0.11	0.06
C6	0.11	0.04	0.04	0.03	0.10	0.04	0.18	0.09	0.15	0.28	0.08	0.01	0.21	0.29	0.16	0.07	0.14	0.12	0.19	0.03	0.32	0.06
C8	0.19	0.06	0.13	0.14	0.08	0.16	0.12	0.23	0.08	0.26	0.07	0.00	0.11	0.22	0.18	0.08	0.02	0.23	0.24	0.16	0.22	0.10
N1	0.14	0.14	0.06	0.06	0.01	0.12	0.05	0.21	0.09	0.21	0.14	0.08	0.12	0.16	0.12	0.06	0.17	0.23	0.22	0.16	0.21	0.11
N2	0.24	0.39	0.11	0.11	0.18	0.35	0.29	0.48	0.47	0.07	0.50	0.24	0.58	0.17	0.09	0.15	0.17	0.46	0.29	0.47	0.17	0.22
N3	0.25	0.28	0.12	0.12	0.08	0.33	0.15	0.43	0.31	0.13	0.36	0.15	0.39	0.03	0.11	0.16	0.07	0.41	0.30	0.38	0.06	0.18
N7	0.14	0.04	0.10	0.10	0.13	0.06	0.20	0.12	0.17	0.29	0.09	0.03	0.23	0.31	0.19	0.00	0.03	0.14	0.21	0.07	0.30	0.07
N9	0.25	0.15	0.16	0.16	0.03	0.28	0.02	0.36	0.13	0.21	0.19	0.06	0.19	0.11	0.17	0.16	0.05	0.35	0.29	0.28	0.14	0.15
O2'	0.68	0.02	0.63	0.62	0.18	0.85	0.03	0.87	0.25	0.29	0.22	0.19	0.46	0.02	0.40	0.81	0.63	0.84	0.55	0.66	0.08	0.33
O3'	0.27	0.20	0.27	0.26	0.06	0.36	0.20	0.36	0.34	0.03	0.33	0.06	0.48	0.16	0.09	0.38	0.26	0.36	0.17	0.25	0.14	0.04
O4'	0.29	0.20	0.13	0.14	0.05	0.34	0.02	0.47	0.14	0.29	0.23	0.09	0.18	0.17	0.21	0.13	0.07	0.45	0.39	0.41	0.25	0.30
O5'	0.56	0.80	0.71	0.70	0.63	0.60	0.56	0.47	0.63	0.41	0.75	0.75	0.59	0.42	0.53	0.79	0.89	0.48	0.42	0.42	0.31	0.45
O6	0.04	0.12	0.01	0.02	0.18	0.16	0.33	0.13	0.34	0.35	0.24	0.07	0.45	0.44	0.18	0.17	0.19	0.04	0.13	0.18	0.45	0.04
OP1	0.57	0.73	0.76	0.75	0.57	0.64	0.47	0.49	0.52	0.35	0.64	0.71	0.44	0.33	0.49	0.89	0.98	0.48	0.37	0.33	0.18	0.35
OP2	1.54	1.63	1.67	1.65	1.49	1.61	1.35	1.45	1.37	1.25	1.51	1.64	1.25	1.19	1.43	1.83	1.84	1.49	1.30	1.28	1.01	1.27
P	0.90	1.05	1.07	1.06	0.89	0.97	0.76	0.81	0.81	0.64	0.95	1.04	0.71	0.61	0.81	1.21	1.28	0.82	0.68	0.68	0.46	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.01
C2	0.02	0.00	0.12	0.17	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01	0.18	0.40	0.30	0.22
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.00	0.06	0.03	0.10	0.13	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.30	0.12	0.13
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.12	0.04	0.15	0.15	0.11	0.06	0.05	0.00	0.00	0.00	0.04	0.35	0.15	0.19
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.13	0.28	0.18	0.14
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.08	0.09	0.06	0.11	0.10	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.02	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.03	0.18	0.27	0.20	0.16
C5'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.17	0.00	0.18	0.14	0.17	0.11	0.21	0.18	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.02	0.21	0.35	0.29	0.23
C8	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.05	0.10	0.10	0.04	0.05
N1	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.20	0.40	0.32	0.24
N3	0.02	0.00	0.13	0.15	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.13	0.34	0.23	0.17
N6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.11	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.13	0.04	0.24	0.35	0.31	0.25
N7	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.16	0.17	0.10	0.11
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.17	0.06	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.06	0.08	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.29	0.11	0.11
O3'	0.00	0.19	0.02	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.13	0.04	0.17	0.17	0.13	0.06	0.04	0.03	0.00	0.00	0.08	0.52	0.25	0.31
O4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.03	0.11	0.12
O5'	0.01	0.18	0.02	0.04	0.13	0.00	0.18	0.01	0.21	0.10	0.20	0.13	0.24	0.16	0.07	0.01	0.08	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.12	0.40	0.30	0.35	0.28	0.13	0.27	0.03	0.35	0.10	0.40	0.34	0.35	0.17	0.17	0.29	0.52	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.00	0.30	0.12	0.15	0.18	0.02	0.20	0.01	0.29	0.04	0.32	0.23	0.31	0.10	0.06	0.11	0.25	0.11	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.01	0.22	0.13	0.19	0.14	0.04	0.16	0.01	0.23	0.05	0.24	0.17	0.25	0.11	0.05	0.11	0.31	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00