Doublet Group distance statistics: 51345

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 24, 13, 8, 2, 8, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.013, 0.024, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.021, 0.034, 0.046, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.034 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.034 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.009, 0.035, 0.061, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.035 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.009, 0.039, 0.069, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.039 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.014, 0.049, 0.084, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.049 std_dev=0.035
P	B	0, 0.109, 0.266, 0.423, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.266 std_dev=0.157
OP1	B	0, 0.111, 0.311, 0.510, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.311 std_dev=0.200
C2'	A	0, -0.049, 0.194, 0.437, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.194 std_dev=0.243
O4'	A	0, -0.096, 0.151, 0.399, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.151 std_dev=0.248
OP2	B	0, 0.052, 0.315, 0.579, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.315 std_dev=0.264
O5'	B	0, 0.069, 0.359, 0.649, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.359 std_dev=0.290
O2'	A	0, 0.011, 0.361, 0.712, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.361 std_dev=0.350
O5'	A	0, -0.017, 0.409, 0.836, 2.102 max_d=2.102 avg_d=0.409 std_dev=0.426
C6	B	0, -0.001, 0.440, 0.882, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.440 std_dev=0.441
P	A	0, -0.001, 0.456, 0.912, 2.092 max_d=2.092 avg_d=0.456 std_dev=0.457
OP1	A	0, 0.020, 0.483, 0.946, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.483 std_dev=0.463
OP2	A	0, 0.021, 0.499, 0.977, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.499 std_dev=0.478
C4'	A	0, -0.189, 0.297, 0.782, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.297 std_dev=0.486
O4'	B	0, -0.010, 0.488, 0.985, 2.214 max_d=2.214 avg_d=0.488 std_dev=0.497
C5'	B	0, -0.014, 0.499, 1.013, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.499 std_dev=0.514
C5	B	0, -0.062, 0.463, 0.988, 2.283 max_d=2.283 avg_d=0.463 std_dev=0.525
C5'	A	0, -0.159, 0.371, 0.901, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.371 std_dev=0.530
N1	B	0, -0.066, 0.517, 1.100, 2.399 max_d=2.399 avg_d=0.517 std_dev=0.583
C3'	A	0, -0.257, 0.336, 0.929, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.336 std_dev=0.593
C4'	B	0, -0.067, 0.551, 1.169, 2.329 max_d=2.329 avg_d=0.551 std_dev=0.618
C1'	B	0, -0.061, 0.563, 1.186, 2.249 max_d=2.249 avg_d=0.563 std_dev=0.624
C3'	B	0, -0.117, 0.609, 1.335, 2.523 max_d=2.523 avg_d=0.609 std_dev=0.726
C4	B	0, -0.207, 0.569, 1.345, 3.272 max_d=3.272 avg_d=0.569 std_dev=0.776
C2	B	0, -0.176, 0.610, 1.396, 3.302 max_d=3.302 avg_d=0.610 std_dev=0.786
C2'	B	0, -0.152, 0.672, 1.495, 2.898 max_d=2.898 avg_d=0.672 std_dev=0.823
N3	B	0, -0.252, 0.637, 1.526, 3.731 max_d=3.731 avg_d=0.637 std_dev=0.889
O2	B	0, -0.215, 0.698, 1.611, 3.764 max_d=3.764 avg_d=0.698 std_dev=0.913
O3'	B	0, -0.200, 0.725, 1.650, 3.246 max_d=3.246 avg_d=0.725 std_dev=0.925
N4	B	0, -0.304, 0.651, 1.606, 3.856 max_d=3.856 avg_d=0.651 std_dev=0.955
O3'	A	0, -0.434, 0.552, 1.538, 3.222 max_d=3.222 avg_d=0.552 std_dev=0.986
O2'	B	0, -0.202, 0.796, 1.794, 3.446 max_d=3.446 avg_d=0.796 std_dev=0.998

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.00	0.27	0.02	0.26	0.20	0.23
C2	0.01	0.00	0.19	0.21	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.07	0.36	0.01	0.34	0.33	0.33
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.11	0.01	0.08	0.14	0.12	0.06	0.17	0.22	0.18	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.50	0.12	0.53	0.39	0.47
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.23	0.00	0.31	0.02	0.33	0.27	0.28	0.17	0.16	0.32	0.19	0.02	0.01	0.01	0.26	0.38	0.27	0.08	0.19
C4	0.01	0.00	0.11	0.23	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.06	0.04	0.37	0.02	0.35	0.31	0.34
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.12	0.14	0.09	0.04	0.03	0.15	0.08	0.22	0.02	0.00	0.01	0.15	0.08	0.21	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.31	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.11	0.02	0.40	0.02	0.38	0.37	0.39
C5'	0.05	0.07	0.14	0.02	0.09	0.00	0.15	0.00	0.16	0.15	0.12	0.05	0.05	0.18	0.08	0.08	0.16	0.01	0.01	0.19	0.11	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.33	0.01	0.12	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.13	0.03	0.40	0.01	0.39	0.38	0.40
C8	0.01	0.01	0.06	0.27	0.01	0.14	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.14	0.05	0.41	0.02	0.37	0.33	0.38
N1	0.01	0.00	0.17	0.28	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.08	0.05	0.39	0.01	0.37	0.36	0.37
N2	0.02	0.00	0.22	0.17	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.09	0.34	0.02	0.33	0.31	0.32
N3	0.01	0.00	0.18	0.16	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.17	0.07	0.34	0.01	0.32	0.29	0.31
N7	0.01	0.01	0.03	0.32	0.00	0.15	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.19	0.03	0.42	0.02	0.40	0.39	0.41
N9	0.00	0.01	0.02	0.19	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.01	0.36	0.02	0.33	0.28	0.32
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.18	0.22	0.22	0.08	0.23	0.20	0.20	0.14	0.14	0.23	0.15	0.00	0.04	0.16	0.23	0.24	0.31	0.31	0.26
O3'	0.23	0.13	0.02	0.01	0.06	0.02	0.11	0.16	0.13	0.14	0.08	0.21	0.17	0.19	0.05	0.04	0.00	0.15	0.10	0.19	0.17	0.21	0.11
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.09	0.07	0.03	0.01	0.16	0.15	0.00	0.07	0.02	0.07	0.20	0.08
O5'	0.27	0.36	0.50	0.26	0.37	0.01	0.40	0.01	0.40	0.41	0.39	0.34	0.34	0.42	0.36	0.23	0.10	0.07	0.00	0.41	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.12	0.38	0.02	0.15	0.02	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.24	0.19	0.02	0.41	0.00	0.40	0.40	0.41
OP1	0.26	0.34	0.53	0.27	0.35	0.08	0.38	0.11	0.39	0.37	0.37	0.33	0.32	0.40	0.33	0.31	0.17	0.07	0.01	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.33	0.39	0.08	0.31	0.21	0.37	0.29	0.38	0.33	0.36	0.31	0.29	0.39	0.28	0.31	0.21	0.20	0.01	0.40	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.33	0.47	0.19	0.34	0.04	0.39	0.02	0.40	0.38	0.37	0.32	0.31	0.41	0.32	0.26	0.11	0.08	0.00	0.41	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.55	0.49	0.72	0.61	0.27	0.47	0.26	0.33	0.37	0.48	0.40	0.19	0.56	0.78	0.67	0.42	0.24	0.10	0.15	0.09
C2	0.39	0.24	0.51	0.48	0.17	0.40	0.20	0.32	0.30	0.32	0.16	0.27	0.27	0.52	0.48	0.35	0.24	0.12	0.20	0.11
C2'	0.36	0.35	0.53	0.41	0.15	0.28	0.14	0.14	0.18	0.30	0.27	0.21	0.44	0.60	0.47	0.24	0.09	0.15	0.28	0.18
C3'	0.31	0.30	0.57	0.44	0.19	0.23	0.24	0.10	0.15	0.23	0.22	0.35	0.44	0.67	0.56	0.17	0.12	0.23	0.41	0.30
C4	0.48	0.44	0.61	0.52	0.31	0.41	0.31	0.29	0.39	0.45	0.37	0.23	0.47	0.62	0.53	0.38	0.23	0.10	0.14	0.10
C4'	0.41	0.36	0.65	0.56	0.15	0.36	0.14	0.21	0.19	0.32	0.26	0.23	0.46	0.73	0.67	0.27	0.13	0.08	0.21	0.13
C5	0.44	0.46	0.53	0.44	0.40	0.33	0.39	0.22	0.41	0.44	0.43	0.37	0.47	0.53	0.42	0.33	0.19	0.09	0.11	0.09
C5'	0.41	0.42	0.64	0.52	0.22	0.33	0.16	0.18	0.22	0.35	0.36	0.18	0.52	0.71	0.62	0.26	0.12	0.11	0.22	0.16
C6	0.35	0.36	0.42	0.34	0.33	0.26	0.35	0.17	0.36	0.37	0.34	0.31	0.37	0.40	0.31	0.27	0.17	0.09	0.10	0.09
C8	0.51	0.57	0.63	0.51	0.49	0.38	0.42	0.24	0.44	0.52	0.56	0.47	0.61	0.65	0.51	0.38	0.21	0.09	0.11	0.09
N1	0.33	0.26	0.40	0.36	0.19	0.30	0.24	0.22	0.30	0.30	0.20	0.18	0.27	0.40	0.33	0.28	0.19	0.09	0.15	0.09
N2	0.36	0.17	0.48	0.50	0.32	0.44	0.26	0.38	0.25	0.24	0.25	0.46	0.18	0.50	0.52	0.35	0.27	0.16	0.26	0.14
N3	0.47	0.34	0.61	0.55	0.18	0.45	0.22	0.34	0.33	0.39	0.22	0.25	0.38	0.64	0.58	0.39	0.25	0.12	0.19	0.11
N7	0.47	0.54	0.55	0.44	0.51	0.33	0.45	0.20	0.44	0.49	0.55	0.52	0.56	0.56	0.42	0.34	0.19	0.10	0.10	0.10
N9	0.53	0.52	0.66	0.56	0.37	0.43	0.34	0.29	0.41	0.50	0.46	0.29	0.56	0.69	0.58	0.40	0.23	0.10	0.13	0.09
O2'	0.81	0.74	0.94	0.81	0.47	0.72	0.46	0.58	0.60	0.73	0.63	0.28	0.81	1.01	0.85	0.70	0.47	0.29	0.17	0.29
O3'	0.48	0.37	0.81	0.73	0.25	0.48	0.25	0.32	0.20	0.34	0.23	0.51	0.52	0.93	0.92	0.33	0.21	0.11	0.19	0.10
O4'	0.54	0.47	0.74	0.65	0.25	0.49	0.24	0.35	0.35	0.46	0.37	0.17	0.54	0.80	0.73	0.41	0.27	0.14	0.12	0.11
O5'	0.90	0.92	1.05	0.92	0.77	0.79	0.69	0.64	0.75	0.86	0.88	0.70	0.99	1.10	0.96	0.76	0.58	0.42	0.34	0.40
O6	0.30	0.35	0.33	0.25	0.37	0.19	0.37	0.12	0.34	0.33	0.36	0.37	0.35	0.31	0.21	0.22	0.14	0.12	0.12	0.11
OP1	0.94	1.02	1.07	0.92	0.90	0.78	0.78	0.62	0.81	0.93	1.02	0.89	1.10	1.12	0.94	0.78	0.57	0.41	0.37	0.39
OP2	0.90	1.00	1.00	0.86	0.93	0.74	0.83	0.59	0.83	0.92	1.01	0.94	1.04	1.04	0.85	0.76	0.56	0.39	0.38	0.39
P	0.90	0.97	1.03	0.89	0.86	0.77	0.76	0.61	0.79	0.89	0.95	0.83	1.02	1.08	0.91	0.76	0.57	0.40	0.36	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.03	0.08	0.10	0.09	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.11	0.00	0.02	0.01	0.03	0.13	0.07	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.10	0.08	0.12	0.02	0.00	0.01	0.04	0.17	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.12	0.13	0.13	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.12	0.13	0.14	0.13
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.07	0.09	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.11	0.12	0.13	0.12
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.07	0.07	0.08
N3	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.11	0.13	0.12	0.11
N4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.13	0.15	0.16	0.14
O2	0.04	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.14	0.06	0.07	0.11	0.09	0.08
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.07	0.06	0.11	0.00	0.06	0.04	0.03	0.14	0.07	0.04
O3'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.08	0.03	0.11	0.09	0.14	0.06	0.00	0.01	0.08	0.28	0.20	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.04	0.01	0.00	0.05	0.05	0.08	0.09
O5'	0.04	0.08	0.03	0.04	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.06	0.11	0.13	0.07	0.03	0.08	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.13	0.17	0.13	0.07	0.13	0.04	0.12	0.07	0.13	0.15	0.11	0.14	0.28	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.09	0.07	0.11	0.13	0.02	0.14	0.01	0.13	0.07	0.12	0.16	0.09	0.07	0.20	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.04	0.08	0.12	0.02	0.13	0.02	0.12	0.08	0.11	0.14	0.08	0.04	0.16	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00