Doublet Group distance statistics: 51353

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.015, 0.029, 0.042, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.020, 0.039, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.018, 0.037, 0.056, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.037 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.022, 0.043, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.043 std_dev=0.021
O4'	A	0, 0.035, 0.069, 0.103, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.069 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.040, 0.075, 0.111, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.075 std_dev=0.036
O6	A	0, 0.046, 0.085, 0.125, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.085 std_dev=0.040
N2	A	0, 0.028, 0.068, 0.108, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.068 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.050, 0.093, 0.135, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.093 std_dev=0.042
C2'	A	0, 0.040, 0.086, 0.132, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.086 std_dev=0.046
C3'	A	0, 0.089, 0.167, 0.245, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.167 std_dev=0.078
O3'	A	0, 0.117, 0.222, 0.327, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.222 std_dev=0.105
O2'	A	0, 0.097, 0.218, 0.340, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.218 std_dev=0.122
C4'	A	0, 0.074, 0.198, 0.321, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.198 std_dev=0.124
C5'	A	0, 0.168, 0.380, 0.593, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.380 std_dev=0.212
O5'	A	0, 0.312, 0.587, 0.862, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.587 std_dev=0.275
P	A	0, 0.360, 0.730, 1.099, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.730 std_dev=0.369
OP1	B	0, 0.463, 0.876, 1.289, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.876 std_dev=0.413
OP2	A	0, 0.428, 0.852, 1.275, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.852 std_dev=0.424
C5	B	0, 0.497, 0.931, 1.366, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.931 std_dev=0.435
C2'	B	0, 0.517, 0.966, 1.415, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.966 std_dev=0.449
C6	B	0, 0.534, 0.985, 1.436, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.985 std_dev=0.451
P	B	0, 0.551, 1.008, 1.465, 1.328 max_d=1.328 avg_d=1.008 std_dev=0.457
O5'	B	0, 0.564, 1.028, 1.493, 1.356 max_d=1.356 avg_d=1.028 std_dev=0.465
OP1	A	0, 0.486, 0.956, 1.426, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.956 std_dev=0.470
C4	B	0, 0.491, 0.967, 1.442, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.967 std_dev=0.476
OP2	B	0, 0.581, 1.060, 1.538, 1.382 max_d=1.382 avg_d=1.060 std_dev=0.478
N4	B	0, 0.451, 0.936, 1.420, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.936 std_dev=0.485
C3'	B	0, 0.595, 1.105, 1.615, 1.470 max_d=1.470 avg_d=1.105 std_dev=0.510
N1	B	0, 0.601, 1.128, 1.655, 1.569 max_d=1.569 avg_d=1.128 std_dev=0.527
N3	B	0, 0.516, 1.054, 1.593, 1.643 max_d=1.643 avg_d=1.054 std_dev=0.539
C5'	B	0, 0.661, 1.201, 1.741, 1.512 max_d=1.512 avg_d=1.201 std_dev=0.540
C4'	B	0, 0.689, 1.258, 1.826, 1.616 max_d=1.616 avg_d=1.258 std_dev=0.569
C2	B	0, 0.581, 1.159, 1.737, 1.758 max_d=1.758 avg_d=1.159 std_dev=0.578
C1'	B	0, 0.712, 1.321, 1.929, 1.765 max_d=1.765 avg_d=1.321 std_dev=0.609
O2	B	0, 0.636, 1.318, 2.000, 2.061 max_d=2.061 avg_d=1.318 std_dev=0.682
O4'	B	0, 0.817, 1.508, 2.199, 2.019 max_d=2.019 avg_d=1.508 std_dev=0.691
O3'	B	0, 1.039, 1.882, 2.725, 2.323 max_d=2.323 avg_d=1.882 std_dev=0.843
O2'	B	0, 1.372, 2.493, 3.614, 3.234 max_d=3.234 avg_d=2.493 std_dev=1.121

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.09	0.08
C2	0.04	0.00	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.10	0.05
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.05	0.09	0.02	0.06	0.03	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.10	0.05
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.02	0.05	0.03	0.08	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.12	0.08
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.05	0.03	0.02	0.12	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.10	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.04	0.02	0.08	0.00	0.08	0.14	0.09
C8	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.07	0.02	0.05	0.10	0.06
N1	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.11	0.03	0.02	0.05	0.02	0.06	0.12	0.07
N2	0.05	0.01	0.09	0.06	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.16	0.08	0.04	0.03	0.03	0.04	0.09	0.05
N3	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.09	0.06
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.11	0.02	0.09	0.12	0.10
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.06
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.11	0.16	0.12	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.05	0.04
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.04	0.09	0.03	0.08	0.05	0.09	0.05	0.03	0.00	0.02	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.03	0.08	0.11	0.10
O5'	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.07	0.01	0.08	0.07	0.05	0.03	0.03	0.11	0.02	0.03	0.05	0.08	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.04	0.03	0.10	0.00	0.11	0.16	0.12
OP1	0.06	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.08	0.05	0.06	0.04	0.04	0.09	0.03	0.03	0.07	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.10	0.05	0.05	0.10	0.03	0.12	0.01	0.14	0.10	0.12	0.09	0.09	0.12	0.10	0.05	0.07	0.11	0.02	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.05	0.04	0.02	0.05	0.04	0.08	0.01	0.09	0.06	0.07	0.05	0.06	0.10	0.06	0.04	0.04	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.15	0.15	0.10	0.09	0.12	0.05	0.14	0.05	0.10	0.14	0.07	0.20	0.27	0.16	0.10	0.04	0.12	0.10	0.07
C2	0.10	0.12	0.12	0.07	0.10	0.09	0.10	0.09	0.11	0.11	0.12	0.09	0.14	0.16	0.24	0.08	0.06	0.13	0.16	0.10
C2'	0.10	0.09	0.15	0.14	0.04	0.15	0.03	0.17	0.04	0.06	0.09	0.04	0.14	0.31	0.20	0.11	0.03	0.12	0.11	0.08
C3'	0.12	0.06	0.17	0.16	0.03	0.16	0.07	0.17	0.08	0.07	0.05	0.04	0.10	0.34	0.22	0.12	0.04	0.08	0.07	0.05
C4	0.10	0.13	0.13	0.07	0.10	0.11	0.08	0.12	0.08	0.11	0.13	0.08	0.16	0.20	0.22	0.09	0.08	0.10	0.10	0.06
C4'	0.11	0.08	0.15	0.14	0.03	0.15	0.06	0.16	0.07	0.06	0.07	0.03	0.13	0.31	0.20	0.11	0.04	0.09	0.08	0.05
C5	0.08	0.11	0.11	0.07	0.09	0.10	0.09	0.12	0.09	0.10	0.11	0.07	0.13	0.17	0.25	0.09	0.10	0.11	0.09	0.06
C5'	0.11	0.06	0.16	0.14	0.04	0.14	0.08	0.16	0.09	0.06	0.05	0.06	0.11	0.32	0.20	0.12	0.05	0.08	0.07	0.05
C6	0.08	0.10	0.09	0.07	0.08	0.11	0.09	0.12	0.10	0.09	0.10	0.07	0.11	0.13	0.29	0.10	0.12	0.12	0.12	0.09
C8	0.10	0.13	0.13	0.08	0.09	0.11	0.07	0.13	0.07	0.10	0.12	0.07	0.16	0.23	0.22	0.09	0.10	0.10	0.06	0.05
N1	0.08	0.09	0.09	0.07	0.08	0.09	0.10	0.09	0.11	0.09	0.09	0.07	0.10	0.14	0.29	0.08	0.08	0.11	0.16	0.09
N2	0.11	0.13	0.14	0.10	0.12	0.09	0.12	0.08	0.13	0.12	0.13	0.11	0.14	0.19	0.22	0.09	0.06	0.17	0.19	0.14
N3	0.12	0.15	0.15	0.09	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.12	0.14	0.10	0.18	0.20	0.20	0.10	0.06	0.11	0.14	0.08
N7	0.08	0.11	0.11	0.07	0.09	0.11	0.08	0.13	0.08	0.09	0.11	0.07	0.14	0.19	0.25	0.10	0.12	0.12	0.07	0.07
N9	0.12	0.15	0.15	0.09	0.11	0.12	0.08	0.13	0.08	0.12	0.15	0.09	0.19	0.25	0.19	0.10	0.08	0.10	0.08	0.05
O2'	0.10	0.09	0.13	0.18	0.05	0.18	0.04	0.19	0.05	0.05	0.10	0.06	0.14	0.30	0.24	0.12	0.08	0.19	0.13	0.13
O3'	0.16	0.05	0.22	0.21	0.07	0.20	0.13	0.20	0.15	0.11	0.04	0.09	0.07	0.41	0.26	0.17	0.03	0.08	0.08	0.06
O4'	0.11	0.13	0.14	0.10	0.06	0.12	0.03	0.14	0.04	0.08	0.12	0.05	0.18	0.28	0.16	0.10	0.05	0.11	0.09	0.06
O5'	0.11	0.08	0.17	0.12	0.02	0.13	0.05	0.15	0.06	0.07	0.06	0.03	0.12	0.32	0.19	0.10	0.08	0.08	0.07	0.05
O6	0.09	0.10	0.08	0.10	0.09	0.13	0.11	0.14	0.12	0.11	0.10	0.08	0.11	0.12	0.31	0.13	0.15	0.15	0.14	0.12
OP1	0.09	0.05	0.15	0.12	0.03	0.13	0.06	0.14	0.06	0.05	0.04	0.05	0.10	0.31	0.21	0.10	0.07	0.07	0.06	0.05
OP2	0.12	0.11	0.19	0.09	0.06	0.10	0.05	0.12	0.06	0.09	0.10	0.04	0.14	0.33	0.15	0.08	0.11	0.09	0.10	0.09
P	0.11	0.07	0.17	0.12	0.02	0.12	0.04	0.14	0.06	0.06	0.05	0.03	0.11	0.32	0.19	0.10	0.07	0.07	0.07	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.13	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.15	0.03	0.03	0.05	0.06	0.06
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.08	0.09	0.02	0.04	0.05	0.12	0.01	0.03	0.02	0.10	0.08	0.17	0.12
C3'	0.03	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.06	0.05	0.08	0.02	0.01	0.02	0.08	0.03	0.10	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.03	0.08	0.13	0.14	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.03	0.03	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.06	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.21	0.04	0.05	0.14	0.18	0.19	0.20
C5'	0.02	0.04	0.08	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.06	0.06	0.08	0.03	0.02	0.09	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.06	0.02	0.06	0.01	0.12	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.20	0.04	0.06	0.14	0.16	0.18	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.10	0.03	0.06	0.08	0.09	0.09
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.05	0.08	0.10	0.09
N4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.14	0.08	0.03	0.08	0.13	0.14	0.15
O2	0.05	0.00	0.12	0.08	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.18	0.22	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03
O2'	0.03	0.06	0.01	0.02	0.12	0.08	0.21	0.02	0.20	0.07	0.04	0.14	0.18	0.00	0.04	0.06	0.12	0.08	0.17	0.11
O3'	0.13	0.15	0.03	0.01	0.08	0.02	0.04	0.09	0.04	0.10	0.13	0.08	0.22	0.04	0.00	0.09	0.19	0.23	0.20	0.20
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.03	0.03	0.04	0.06	0.09	0.00	0.03	0.04	0.05	0.02
O5'	0.03	0.03	0.10	0.08	0.08	0.02	0.14	0.01	0.14	0.06	0.05	0.08	0.04	0.12	0.19	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.03	0.05	0.08	0.03	0.13	0.03	0.18	0.03	0.16	0.08	0.08	0.13	0.03	0.08	0.23	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.06	0.17	0.10	0.14	0.07	0.19	0.07	0.18	0.09	0.10	0.14	0.03	0.17	0.20	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.06	0.12	0.06	0.14	0.03	0.20	0.01	0.19	0.09	0.09	0.15	0.03	0.11	0.20	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00