Doublet Group distance statistics: 51355

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.013, 0.031, 0.048, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.035 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.015, 0.039, 0.063, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.039 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.022, 0.047, 0.072, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.047 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.016, 0.042, 0.069, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.042 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.018, 0.045, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.045 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.019, 0.055, 0.090, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.055 std_dev=0.036
N2	A	0, 0.032, 0.072, 0.113, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.072 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.057, 0.180, 0.302, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.180 std_dev=0.123
C2'	A	0, 0.039, 0.170, 0.301, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.170 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.091, 0.271, 0.451, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.271 std_dev=0.180
OP2	B	0, 0.127, 0.371, 0.614, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.371 std_dev=0.244
O2'	A	0, 0.086, 0.341, 0.595, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.341 std_dev=0.255
P	B	0, 0.108, 0.374, 0.641, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.374 std_dev=0.267
O3'	A	0, 0.007, 0.294, 0.580, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.294 std_dev=0.287
C4'	A	0, 0.159, 0.489, 0.820, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.489 std_dev=0.331
OP1	B	0, 0.170, 0.535, 0.900, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.535 std_dev=0.365
O5'	B	0, 0.160, 0.539, 0.917, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.539 std_dev=0.379
C4'	B	0, 0.151, 0.644, 1.138, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.644 std_dev=0.493
O4'	B	0, 0.037, 0.557, 1.077, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.557 std_dev=0.520
O3'	B	0, 0.135, 0.675, 1.216, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.675 std_dev=0.541
C3'	B	0, 0.225, 0.805, 1.385, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.805 std_dev=0.580
OP1	A	0, 0.086, 0.666, 1.247, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.666 std_dev=0.581
C1'	B	0, 0.118, 0.701, 1.283, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.701 std_dev=0.583
C5'	B	0, 0.214, 0.825, 1.436, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.825 std_dev=0.611
C5'	A	0, 0.310, 0.994, 1.677, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.994 std_dev=0.684
P	A	0, -0.009, 0.684, 1.377, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.684 std_dev=0.693
N1	B	0, 0.051, 0.761, 1.472, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.761 std_dev=0.710
C2	B	0, -0.032, 0.734, 1.500, 2.303 max_d=2.303 avg_d=0.734 std_dev=0.766
OP2	A	0, 0.058, 0.828, 1.599, 2.324 max_d=2.324 avg_d=0.828 std_dev=0.771
O5'	A	0, 0.073, 0.855, 1.636, 2.369 max_d=2.369 avg_d=0.855 std_dev=0.782
N3	B	0, 0.015, 0.807, 1.599, 2.192 max_d=2.192 avg_d=0.807 std_dev=0.792
C2'	B	0, 0.225, 1.122, 2.020, 2.306 max_d=2.306 avg_d=1.122 std_dev=0.897
C4	B	0, -0.170, 0.956, 2.081, 3.289 max_d=3.289 avg_d=0.956 std_dev=1.125
O2	B	0, -0.202, 0.952, 2.105, 3.394 max_d=3.394 avg_d=0.952 std_dev=1.154
C6	B	0, -0.255, 1.053, 2.362, 3.819 max_d=3.819 avg_d=1.053 std_dev=1.308
N4	B	0, -0.277, 1.070, 2.418, 3.923 max_d=3.923 avg_d=1.070 std_dev=1.348
O2'	B	0, 0.257, 1.617, 2.977, 3.586 max_d=3.586 avg_d=1.617 std_dev=1.360
C5	B	0, -0.368, 1.190, 2.748, 4.504 max_d=4.504 avg_d=1.190 std_dev=1.558

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.09	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.22	0.02	0.16	0.39	0.14
C2	0.04	0.00	0.12	0.13	0.01	0.06	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.15	0.04	0.33	0.01	0.23	0.28	0.20
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.09	0.14	0.12	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.30	0.05	0.29	0.27	0.19
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.08	0.11	0.11	0.16	0.12	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.39	0.08	0.39	0.19	0.27
C4	0.03	0.01	0.06	0.07	0.00	0.08	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02	0.34	0.01	0.22	0.30	0.20
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.14	0.17	0.09	0.06	0.05	0.18	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.33	0.05
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.14	0.00	0.39	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02	0.41	0.01	0.23	0.23	0.24
C5'	0.09	0.27	0.04	0.01	0.29	0.01	0.39	0.00	0.41	0.38	0.35	0.24	0.22	0.44	0.26	0.05	0.06	0.01	0.01	0.47	0.24	0.39	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.08	0.01	0.14	0.00	0.41	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.07	0.02	0.42	0.00	0.23	0.21	0.25
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.17	0.01	0.38	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.41	0.03	0.23	0.27	0.23
N1	0.04	0.00	0.09	0.11	0.01	0.09	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.03	0.38	0.02	0.23	0.24	0.22
N2	0.05	0.00	0.14	0.16	0.01	0.06	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.21	0.20	0.05	0.32	0.02	0.23	0.30	0.19
N3	0.05	0.01	0.12	0.12	0.00	0.05	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.14	0.04	0.31	0.01	0.22	0.32	0.19
N7	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.18	0.00	0.44	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.10	0.03	0.45	0.03	0.23	0.21	0.27
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.09	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.32	0.01	0.21	0.33	0.18
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.05	0.11	0.05	0.15	0.21	0.16	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.15	0.10	0.21	0.25	0.07
O3'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.06	0.07	0.12	0.12	0.20	0.14	0.10	0.04	0.04	0.00	0.04	0.38	0.07	0.46	0.11	0.31
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.22	0.03	0.13	0.49	0.19
O5'	0.22	0.33	0.30	0.39	0.34	0.01	0.41	0.01	0.42	0.41	0.38	0.32	0.31	0.45	0.32	0.15	0.38	0.22	0.00	0.44	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.17	0.01	0.47	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.07	0.03	0.44	0.00	0.22	0.18	0.26
OP1	0.16	0.23	0.29	0.39	0.22	0.11	0.23	0.24	0.23	0.23	0.23	0.23	0.22	0.23	0.21	0.21	0.46	0.13	0.02	0.22	0.00	0.02	0.01
OP2	0.39	0.28	0.27	0.19	0.30	0.33	0.23	0.39	0.21	0.27	0.24	0.30	0.32	0.21	0.33	0.25	0.11	0.49	0.02	0.18	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.20	0.19	0.27	0.20	0.05	0.24	0.02	0.25	0.23	0.22	0.19	0.19	0.27	0.18	0.07	0.31	0.19	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.14	0.22	0.17	0.22	0.15	0.49	0.26	0.44	0.13	0.07	0.26	0.43	0.76	0.22	0.18	0.11	0.19	0.12	0.09
C2	0.21	0.24	0.25	0.25	0.30	0.24	0.41	0.27	0.39	0.25	0.26	0.32	0.32	0.55	0.28	0.27	0.22	0.18	0.12	0.12
C2'	0.09	0.18	0.30	0.21	0.13	0.15	0.34	0.24	0.30	0.07	0.12	0.15	0.43	0.80	0.33	0.13	0.15	0.15	0.12	0.11
C3'	0.11	0.17	0.29	0.26	0.20	0.20	0.43	0.31	0.38	0.12	0.11	0.23	0.42	0.77	0.34	0.17	0.20	0.04	0.06	0.11
C4	0.12	0.15	0.22	0.24	0.25	0.20	0.48	0.30	0.45	0.18	0.13	0.28	0.38	0.62	0.27	0.19	0.16	0.15	0.09	0.07
C4'	0.09	0.12	0.22	0.20	0.31	0.20	0.59	0.35	0.53	0.18	0.07	0.35	0.42	0.76	0.21	0.23	0.20	0.06	0.06	0.10
C5	0.12	0.14	0.23	0.27	0.27	0.20	0.53	0.32	0.49	0.18	0.11	0.30	0.38	0.54	0.29	0.16	0.17	0.13	0.09	0.04
C5'	0.30	0.23	0.38	0.45	0.50	0.44	0.79	0.62	0.72	0.38	0.26	0.55	0.41	0.70	0.32	0.40	0.45	0.29	0.33	0.37
C6	0.14	0.16	0.26	0.29	0.28	0.19	0.50	0.29	0.47	0.20	0.17	0.30	0.34	0.44	0.30	0.16	0.17	0.13	0.09	0.04
C8	0.12	0.14	0.23	0.27	0.29	0.22	0.59	0.35	0.54	0.18	0.07	0.33	0.45	0.64	0.28	0.17	0.17	0.12	0.08	0.05
N1	0.18	0.23	0.25	0.28	0.30	0.21	0.43	0.27	0.41	0.24	0.24	0.32	0.32	0.45	0.30	0.21	0.19	0.16	0.09	0.09
N2	0.30	0.32	0.30	0.29	0.37	0.32	0.41	0.30	0.39	0.33	0.34	0.38	0.33	0.57	0.30	0.35	0.30	0.17	0.15	0.17
N3	0.17	0.20	0.24	0.23	0.26	0.22	0.42	0.28	0.40	0.21	0.20	0.28	0.34	0.64	0.26	0.25	0.19	0.17	0.11	0.10
N7	0.13	0.13	0.25	0.29	0.29	0.22	0.60	0.35	0.55	0.19	0.07	0.33	0.43	0.56	0.30	0.16	0.18	0.11	0.10	0.04
N9	0.09	0.14	0.22	0.23	0.25	0.19	0.52	0.31	0.48	0.16	0.08	0.28	0.42	0.67	0.25	0.18	0.15	0.15	0.09	0.06
O2'	0.13	0.24	0.38	0.17	0.07	0.09	0.24	0.16	0.21	0.08	0.18	0.08	0.48	0.93	0.36	0.09	0.15	0.27	0.22	0.21
O3'	0.11	0.18	0.32	0.24	0.15	0.17	0.35	0.28	0.31	0.09	0.12	0.18	0.42	0.81	0.37	0.14	0.20	0.08	0.09	0.13
O4'	0.10	0.12	0.18	0.16	0.32	0.17	0.62	0.29	0.56	0.20	0.07	0.37	0.44	0.74	0.15	0.23	0.13	0.18	0.10	0.07
O5'	0.23	0.30	0.17	0.12	0.42	0.19	0.75	0.25	0.67	0.30	0.26	0.47	0.63	0.77	0.18	0.30	0.31	0.50	0.39	0.35
O6	0.15	0.15	0.30	0.30	0.30	0.19	0.53	0.29	0.50	0.21	0.17	0.33	0.32	0.36	0.31	0.13	0.19	0.13	0.11	0.04
OP1	0.11	0.29	0.19	0.05	0.28	0.05	0.66	0.19	0.58	0.14	0.19	0.34	0.71	0.81	0.21	0.14	0.16	0.35	0.24	0.20
OP2	0.28	0.49	0.36	0.23	0.19	0.19	0.52	0.19	0.42	0.18	0.37	0.24	0.91	0.97	0.45	0.20	0.09	0.28	0.26	0.21
P	0.12	0.31	0.20	0.07	0.29	0.04	0.67	0.20	0.58	0.14	0.20	0.35	0.73	0.83	0.24	0.13	0.17	0.35	0.22	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.02	0.24	0.00	0.06	0.09	0.20	0.09
C2	0.03	0.00	0.19	0.07	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.39	0.30	0.15	0.12	0.12	0.24	0.15
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.06	0.00	0.10	0.16	0.14	0.04	0.16	0.07	0.29	0.00	0.02	0.02	0.17	0.23	0.52	0.31
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.19	0.00	0.29	0.01	0.30	0.10	0.08	0.20	0.18	0.01	0.01	0.02	0.22	0.17	0.31	0.23
C4	0.04	0.01	0.06	0.19	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.25	0.12	0.04	0.22	0.20	0.28	0.20
C4'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.07	0.05	0.09	0.10	0.13	0.21	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.10	0.29	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.10	0.28	0.24	0.23	0.23
C5'	0.05	0.13	0.16	0.01	0.15	0.00	0.15	0.00	0.14	0.10	0.16	0.16	0.16	0.05	0.15	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.30	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.19	0.15	0.26	0.22	0.20	0.21
N1	0.01	0.01	0.04	0.10	0.03	0.05	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.16	0.15	0.01	0.14	0.13	0.20	0.13
N3	0.03	0.01	0.16	0.08	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.39	0.24	0.12	0.17	0.17	0.28	0.19
N4	0.04	0.02	0.07	0.20	0.01	0.10	0.01	0.16	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.28	0.13	0.05	0.24	0.23	0.32	0.22
O2	0.06	0.01	0.29	0.18	0.01	0.13	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.54	0.48	0.25	0.14	0.12	0.23	0.17
O2'	0.02	0.39	0.00	0.01	0.25	0.21	0.13	0.05	0.08	0.16	0.39	0.28	0.54	0.00	0.02	0.14	0.28	0.24	0.49	0.27
O3'	0.24	0.30	0.02	0.01	0.12	0.01	0.19	0.15	0.19	0.15	0.24	0.13	0.48	0.02	0.00	0.16	0.39	0.30	0.22	0.29
O4'	0.00	0.15	0.02	0.02	0.04	0.00	0.10	0.01	0.15	0.01	0.12	0.05	0.25	0.14	0.16	0.00	0.14	0.15	0.04	0.07
O5'	0.06	0.12	0.17	0.22	0.22	0.00	0.28	0.00	0.26	0.14	0.17	0.24	0.14	0.28	0.39	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.12	0.23	0.17	0.20	0.10	0.24	0.05	0.22	0.13	0.17	0.23	0.12	0.24	0.30	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.24	0.52	0.31	0.28	0.07	0.23	0.10	0.20	0.20	0.28	0.32	0.23	0.49	0.22	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.31	0.23	0.20	0.02	0.23	0.01	0.21	0.13	0.19	0.22	0.17	0.27	0.29	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00