Doublet Group distance statistics: 51356

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.033 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.016, 0.046, 0.076, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.046 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.018, 0.051, 0.084, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.051 std_dev=0.033
OP2	B	0, 0.087, 0.213, 0.339, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.213 std_dev=0.126
OP1	B	0, 0.164, 0.379, 0.593, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.379 std_dev=0.215
O4'	A	0, 0.386, 0.702, 1.017, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.702 std_dev=0.316
C2'	A	0, 0.398, 0.723, 1.048, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.723 std_dev=0.325
P	B	0, 0.420, 0.797, 1.174, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.797 std_dev=0.377
O2'	A	0, 0.665, 1.215, 1.765, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.215 std_dev=0.550
O5'	A	0, 0.779, 1.420, 2.061, 1.838 max_d=1.838 avg_d=1.420 std_dev=0.641
C4'	A	0, 0.794, 1.447, 2.100, 1.850 max_d=1.850 avg_d=1.447 std_dev=0.653
C3'	A	0, 0.889, 1.613, 2.337, 2.008 max_d=2.008 avg_d=1.613 std_dev=0.724
C5'	A	0, 0.954, 1.747, 2.540, 2.267 max_d=2.267 avg_d=1.747 std_dev=0.793
OP2	A	0, 0.979, 1.789, 2.598, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.789 std_dev=0.810
P	A	0, 0.989, 1.809, 2.629, 2.349 max_d=2.349 avg_d=1.809 std_dev=0.820
OP1	A	0, 1.373, 2.491, 3.610, 3.147 max_d=3.147 avg_d=2.491 std_dev=1.118
O3'	A	0, 1.451, 2.631, 3.811, 3.268 max_d=3.268 avg_d=2.631 std_dev=1.180
O5'	B	0, 1.515, 2.745, 3.976, 3.468 max_d=3.468 avg_d=2.745 std_dev=1.231
C5'	B	0, 2.352, 4.261, 6.170, 5.314 max_d=5.314 avg_d=4.261 std_dev=1.909
C5	B	0, 3.209, 5.811, 8.412, 7.197 max_d=7.197 avg_d=5.811 std_dev=2.602
C6	B	0, 3.342, 6.051, 8.760, 7.476 max_d=7.476 avg_d=6.051 std_dev=2.709
N4	B	0, 3.433, 6.217, 9.000, 7.643 max_d=7.643 avg_d=6.217 std_dev=2.784
C4'	B	0, 3.518, 6.366, 9.215, 7.757 max_d=7.757 avg_d=6.366 std_dev=2.848
C4	B	0, 3.553, 6.432, 9.311, 7.905 max_d=7.905 avg_d=6.432 std_dev=2.879
C3'	B	0, 3.714, 6.721, 9.729, 8.282 max_d=8.282 avg_d=6.721 std_dev=3.008
N1	B	0, 4.040, 7.312, 10.584, 8.940 max_d=8.940 avg_d=7.312 std_dev=3.272
O4'	B	0, 4.049, 7.327, 10.606, 8.956 max_d=8.956 avg_d=7.327 std_dev=3.279
N3	B	0, 4.236, 7.668, 11.100, 9.394 max_d=9.394 avg_d=7.668 std_dev=3.432
C2'	B	0, 4.262, 7.712, 11.163, 9.455 max_d=9.455 avg_d=7.712 std_dev=3.451
C1'	B	0, 4.447, 8.049, 11.650, 9.825 max_d=9.825 avg_d=8.049 std_dev=3.601
O3'	B	0, 4.451, 8.054, 11.656, 9.836 max_d=9.836 avg_d=8.054 std_dev=3.603
C2	B	0, 4.586, 8.301, 12.016, 10.162 max_d=10.162 avg_d=8.301 std_dev=3.715
O2'	B	0, 5.367, 9.711, 14.056, 11.902 max_d=11.902 avg_d=9.711 std_dev=4.345
O2	B	0, 5.471, 9.902, 14.332, 12.117 max_d=12.117 avg_d=9.902 std_dev=4.431

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.07	0.01	0.27	0.10	0.10
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.05	0.11	0.02	0.22	0.14	0.09
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.06	0.06	0.04	0.08	0.11	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.06	0.44	0.23	0.27
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.11	0.00	0.15	0.02	0.16	0.14	0.13	0.07	0.07	0.17	0.10	0.04	0.01	0.02	0.16	0.18	0.27	0.05	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.03	0.11	0.02	0.20	0.13	0.09
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.04	0.03	0.01	0.10	0.06	0.10	0.01	0.00	0.02	0.09	0.16	0.03	0.04
C5	0.00	0.01	0.05	0.15	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.11	0.08	0.01	0.15	0.01	0.17	0.18	0.14
C5'	0.02	0.05	0.06	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.08	0.03	0.03	0.14	0.07	0.05	0.08	0.01	0.00	0.14	0.14	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.09	0.02	0.17	0.01	0.18	0.22	0.17
C8	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01	0.09	0.01	0.12	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.08	0.04	0.16	0.03	0.16	0.14	0.12
N1	0.02	0.00	0.08	0.13	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.04	0.13	0.01	0.19	0.18	0.13
N2	0.03	0.00	0.11	0.07	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.15	0.06	0.09	0.03	0.24	0.13	0.08
N3	0.02	0.01	0.09	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.05	0.08	0.02	0.23	0.11	0.07
N7	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.10	0.00	0.14	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02	0.18	0.03	0.16	0.21	0.17
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.05	0.01	0.11	0.01	0.21	0.10	0.07
O2'	0.08	0.06	0.00	0.04	0.09	0.10	0.11	0.05	0.11	0.12	0.08	0.06	0.07	0.13	0.09	0.00	0.04	0.09	0.11	0.12	0.45	0.26	0.26
O3'	0.12	0.12	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.08	0.09	0.08	0.09	0.15	0.13	0.11	0.05	0.04	0.00	0.08	0.21	0.11	0.15	0.10	0.11
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.09	0.08	0.00	0.10	0.02	0.17	0.07	0.05
O5'	0.07	0.11	0.13	0.16	0.11	0.02	0.15	0.00	0.17	0.16	0.13	0.09	0.08	0.18	0.11	0.11	0.21	0.10	0.00	0.19	0.03	0.01	0.00
O6	0.01	0.02	0.06	0.18	0.02	0.09	0.01	0.14	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.12	0.11	0.02	0.19	0.00	0.18	0.26	0.21
OP1	0.27	0.22	0.44	0.27	0.20	0.16	0.17	0.14	0.18	0.16	0.19	0.24	0.23	0.16	0.21	0.45	0.15	0.17	0.03	0.18	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.14	0.23	0.05	0.13	0.03	0.18	0.06	0.22	0.14	0.18	0.13	0.11	0.21	0.10	0.26	0.10	0.07	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.09	0.27	0.14	0.09	0.04	0.14	0.01	0.17	0.12	0.13	0.08	0.07	0.17	0.07	0.26	0.11	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.49	0.56	0.48	0.23	0.45	0.30	0.36	0.22	0.39	0.48	0.55	0.39	0.60	0.70	0.23	0.41	0.16	0.09	0.06	0.08
C2	0.25	0.21	0.32	0.12	0.13	0.14	0.13	0.12	0.15	0.21	0.16	0.19	0.26	0.44	0.11	0.20	0.10	0.09	0.10	0.08
C2'	0.26	0.30	0.28	0.14	0.18	0.13	0.13	0.08	0.16	0.24	0.27	0.16	0.36	0.51	0.15	0.19	0.06	0.14	0.11	0.06
C3'	0.33	0.39	0.34	0.19	0.31	0.20	0.24	0.13	0.26	0.33	0.39	0.29	0.45	0.56	0.20	0.27	0.11	0.16	0.15	0.08
C4	0.51	0.56	0.58	0.30	0.33	0.32	0.25	0.22	0.34	0.49	0.49	0.21	0.63	0.78	0.29	0.40	0.17	0.09	0.05	0.06
C4'	0.57	0.66	0.54	0.30	0.57	0.38	0.47	0.28	0.49	0.57	0.67	0.56	0.71	0.77	0.33	0.50	0.21	0.09	0.06	0.08
C5	0.64	0.68	0.77	0.46	0.33	0.42	0.22	0.27	0.35	0.58	0.56	0.20	0.82	1.01	0.47	0.48	0.20	0.08	0.02	0.05
C5'	0.67	0.78	0.64	0.39	0.63	0.44	0.50	0.31	0.53	0.66	0.78	0.60	0.87	0.90	0.44	0.57	0.22	0.12	0.10	0.08
C6	0.60	0.56	0.78	0.48	0.20	0.40	0.14	0.25	0.25	0.49	0.41	0.15	0.71	0.99	0.47	0.42	0.19	0.07	0.02	0.04
C8	0.71	0.82	0.78	0.49	0.49	0.46	0.34	0.30	0.45	0.66	0.75	0.35	0.97	1.07	0.52	0.54	0.21	0.08	0.03	0.05
N1	0.39	0.33	0.53	0.27	0.13	0.25	0.15	0.17	0.16	0.30	0.22	0.19	0.42	0.67	0.23	0.28	0.14	0.08	0.05	0.05
N2	0.11	0.18	0.10	0.24	0.24	0.10	0.21	0.07	0.15	0.15	0.22	0.27	0.18	0.14	0.30	0.08	0.07	0.11	0.14	0.11
N3	0.33	0.32	0.36	0.15	0.20	0.19	0.18	0.15	0.24	0.31	0.26	0.15	0.35	0.51	0.12	0.27	0.13	0.10	0.08	0.08
N7	0.76	0.84	0.88	0.57	0.43	0.50	0.28	0.31	0.42	0.68	0.71	0.28	1.03	1.18	0.61	0.56	0.22	0.08	0.04	0.05
N9	0.57	0.66	0.61	0.33	0.44	0.36	0.33	0.24	0.40	0.56	0.62	0.33	0.75	0.85	0.34	0.45	0.18	0.09	0.04	0.06
O2'	0.19	0.18	0.22	0.09	0.13	0.10	0.10	0.09	0.13	0.17	0.16	0.18	0.22	0.43	0.08	0.15	0.09	0.07	0.10	0.10
O3'	0.37	0.38	0.37	0.22	0.33	0.28	0.32	0.25	0.34	0.37	0.36	0.31	0.40	0.56	0.23	0.34	0.22	0.12	0.09	0.15
O4'	0.68	0.79	0.64	0.37	0.69	0.46	0.56	0.35	0.59	0.69	0.81	0.66	0.84	0.87	0.39	0.60	0.27	0.09	0.05	0.13
O5'	0.68	0.81	0.69	0.43	0.57	0.43	0.41	0.28	0.47	0.65	0.79	0.50	0.95	0.98	0.51	0.54	0.20	0.21	0.16	0.11
O6	0.66	0.60	0.91	0.62	0.18	0.47	0.14	0.28	0.23	0.51	0.42	0.15	0.79	1.15	0.63	0.46	0.21	0.07	0.07	0.05
OP1	0.76	0.86	0.80	0.56	0.65	0.54	0.51	0.40	0.57	0.73	0.83	0.59	1.00	1.09	0.61	0.62	0.34	0.21	0.18	0.21
OP2	0.68	0.82	0.75	0.50	0.50	0.43	0.32	0.25	0.40	0.63	0.76	0.41	1.02	1.09	0.59	0.50	0.21	0.28	0.25	0.20
P	0.69	0.82	0.72	0.46	0.56	0.43	0.39	0.27	0.45	0.65	0.79	0.49	0.98	1.04	0.53	0.53	0.20	0.22	0.17	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.11	0.01	0.04	0.09	0.14	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.19	0.08	0.02	0.05	0.03	0.09	0.05
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.06	0.03	0.05	0.04	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.13	0.20	0.34	0.21
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.17	0.01	0.18	0.02	0.15	0.09	0.13	0.18	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.12	0.16	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.16	0.10	0.02	0.12	0.17	0.24	0.17
C4'	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.09	0.09	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.18	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.12	0.02	0.15	0.21	0.31	0.22
C5'	0.02	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.03	0.05	0.08	0.01	0.15	0.09	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.02	0.12	0.14	0.20	0.16
N1	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.04	0.03	0.05	0.03	0.09	0.06
N3	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.19	0.08	0.02	0.08	0.09	0.13	0.10
N4	0.02	0.00	0.06	0.18	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.17	0.12	0.03	0.14	0.22	0.31	0.21
O2	0.02	0.02	0.05	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.24	0.14	0.02	0.04	0.07	0.15	0.07
O2'	0.03	0.19	0.01	0.02	0.16	0.18	0.10	0.15	0.07	0.12	0.19	0.17	0.24	0.00	0.06	0.10	0.10	0.19	0.38	0.20
O3'	0.11	0.08	0.04	0.00	0.10	0.01	0.12	0.09	0.08	0.04	0.08	0.12	0.14	0.06	0.00	0.07	0.11	0.08	0.08	0.04
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.10	0.07	0.00	0.03	0.04	0.07	0.04
O5'	0.04	0.05	0.13	0.04	0.12	0.02	0.15	0.01	0.12	0.05	0.08	0.14	0.04	0.10	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.03	0.20	0.12	0.17	0.09	0.21	0.06	0.14	0.03	0.09	0.22	0.07	0.19	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.14	0.09	0.34	0.16	0.24	0.09	0.31	0.03	0.20	0.09	0.13	0.31	0.15	0.38	0.08	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.07	0.05	0.21	0.08	0.17	0.03	0.22	0.01	0.16	0.06	0.10	0.21	0.07	0.20	0.04	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00