Doublet Group distance statistics: 51358

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.022, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.007, 0.026, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.009, 0.037, 0.066, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.029
C5	A	0, 0.006, 0.037, 0.067, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.037 std_dev=0.031
N1	A	0, 0.006, 0.036, 0.067, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.036 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.007, 0.038, 0.070, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.038 std_dev=0.031
C4	A	0, 0.009, 0.054, 0.098, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.054 std_dev=0.045
N9	A	0, 0.008, 0.060, 0.112, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.060 std_dev=0.052
O6	A	0, 0.013, 0.069, 0.124, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.069 std_dev=0.055
N7	A	0, 0.011, 0.075, 0.140, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.075 std_dev=0.064
C8	A	0, 0.012, 0.101, 0.190, 0.197 max_d=0.197 avg_d=0.101 std_dev=0.089
OP2	B	0, 0.063, 0.291, 0.519, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.291 std_dev=0.228
C5'	B	0, 0.123, 0.391, 0.659, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.391 std_dev=0.268
O5'	B	0, 0.086, 0.358, 0.629, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.358 std_dev=0.271
O4'	A	0, 0.021, 0.298, 0.575, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.298 std_dev=0.277
C4'	B	0, 0.182, 0.489, 0.795, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.489 std_dev=0.306
P	B	0, 0.115, 0.425, 0.734, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.425 std_dev=0.310
O4'	B	0, 0.076, 0.415, 0.754, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.415 std_dev=0.339
O5'	A	0, 0.033, 0.379, 0.725, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.379 std_dev=0.346
C1'	B	0, 0.136, 0.524, 0.911, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.524 std_dev=0.387
C2'	A	0, 0.006, 0.412, 0.818, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.412 std_dev=0.406
P	A	0, 0.061, 0.512, 0.964, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.512 std_dev=0.452
C3'	B	0, 0.207, 0.660, 1.113, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.660 std_dev=0.453
OP1	B	0, 0.167, 0.626, 1.084, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.626 std_dev=0.459
C4'	A	0, 0.016, 0.490, 0.964, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.490 std_dev=0.474
C2'	B	0, 0.221, 0.707, 1.193, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.707 std_dev=0.486
C6	B	0, 0.114, 0.616, 1.117, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.616 std_dev=0.502
N1	B	0, 0.157, 0.684, 1.211, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.684 std_dev=0.527
C3'	A	0, 0.006, 0.559, 1.113, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.559 std_dev=0.554
C5'	A	0, 0.010, 0.565, 1.120, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.565 std_dev=0.555
OP2	A	0, 0.084, 0.641, 1.198, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.641 std_dev=0.557
C5	B	0, 0.175, 0.764, 1.353, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.764 std_dev=0.589
O2'	B	0, 0.217, 0.823, 1.428, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.823 std_dev=0.605
O3'	B	0, 0.171, 0.852, 1.533, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.852 std_dev=0.681
OP1	A	0, 0.045, 0.741, 1.436, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.741 std_dev=0.695
C2	B	0, 0.226, 0.967, 1.708, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.967 std_dev=0.741
C4	B	0, 0.260, 1.026, 1.793, 1.982 max_d=1.982 avg_d=1.026 std_dev=0.766
O2	B	0, 0.224, 1.079, 1.934, 2.108 max_d=2.108 avg_d=1.079 std_dev=0.855
N3	B	0, 0.259, 1.128, 1.997, 2.128 max_d=2.128 avg_d=1.128 std_dev=0.869
N4	B	0, 0.297, 1.191, 2.084, 2.189 max_d=2.189 avg_d=1.191 std_dev=0.893
O2'	A	0, 0.009, 0.935, 1.862, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.935 std_dev=0.926
O3'	A	0, 0.019, 1.045, 2.071, 2.232 max_d=2.232 avg_d=1.045 std_dev=1.026

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.28	0.00	0.09	0.01	0.13	0.10	0.08
C2	0.01	0.00	0.17	0.18	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.22	0.08	0.04	0.02	0.07	0.08	0.06
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.16	0.01	0.13	0.09	0.23	0.19	0.12	0.02	0.00	0.04	0.01	0.38	0.04	0.50	0.51	0.44
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.21	0.00	0.26	0.01	0.26	0.25	0.22	0.15	0.15	0.28	0.19	0.02	0.01	0.02	0.05	0.28	0.22	0.08	0.11
C4	0.01	0.00	0.08	0.21	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.12	0.04	0.04	0.01	0.06	0.07	0.07
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.12	0.05	0.02	0.01	0.12	0.06	0.28	0.02	0.00	0.01	0.11	0.05	0.01	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.06	0.01	0.10	0.00	0.14	0.15	0.13
C5'	0.05	0.03	0.16	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.03	0.04	0.04	0.09	0.02	0.11	0.19	0.01	0.01	0.09	0.03	0.00	0.00
C6	0.01	0.01	0.01	0.26	0.01	0.08	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.40	0.07	0.01	0.11	0.01	0.16	0.18	0.15
C8	0.01	0.00	0.13	0.25	0.00	0.12	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.10	0.06	0.10	0.02	0.11	0.11	0.12
N1	0.01	0.01	0.09	0.22	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.14	0.05	0.07	0.02	0.11	0.13	0.11
N2	0.01	0.00	0.23	0.15	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.30	0.09	0.03	0.04	0.08	0.06	0.04
N3	0.01	0.00	0.19	0.15	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.25	0.09	0.03	0.02	0.06	0.04	0.04
N7	0.01	0.00	0.12	0.28	0.01	0.12	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.38	0.13	0.05	0.14	0.02	0.18	0.19	0.17
N9	0.01	0.00	0.02	0.19	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05
O2'	0.03	0.19	0.00	0.02	0.22	0.28	0.36	0.11	0.40	0.29	0.32	0.11	0.11	0.38	0.19	0.00	0.08	0.20	0.25	0.46	0.42	0.54	0.34
O3'	0.28	0.22	0.04	0.01	0.12	0.02	0.06	0.19	0.07	0.10	0.14	0.30	0.25	0.13	0.08	0.08	0.00	0.19	0.15	0.09	0.20	0.15	0.17
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.09	0.09	0.05	0.01	0.20	0.19	0.00	0.06	0.01	0.08	0.12	0.13
O5'	0.09	0.04	0.38	0.05	0.04	0.01	0.10	0.01	0.11	0.10	0.07	0.03	0.03	0.14	0.03	0.25	0.15	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.02	0.04	0.28	0.01	0.11	0.00	0.09	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.46	0.09	0.01	0.15	0.00	0.22	0.23	0.20
OP1	0.13	0.07	0.50	0.22	0.06	0.05	0.14	0.03	0.16	0.11	0.11	0.08	0.06	0.18	0.03	0.42	0.20	0.08	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.08	0.51	0.08	0.07	0.01	0.15	0.00	0.18	0.11	0.13	0.06	0.04	0.19	0.04	0.54	0.15	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.06	0.44	0.11	0.07	0.01	0.13	0.00	0.15	0.12	0.11	0.04	0.04	0.17	0.05	0.34	0.17	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.36	0.20	0.25	0.43	0.25	0.39	0.24	0.33	0.31	0.42	0.49	0.36	0.29	0.39	0.21	0.23	0.28	0.18	0.25
C2	0.22	0.34	0.16	0.19	0.40	0.23	0.36	0.23	0.31	0.29	0.40	0.44	0.36	0.27	0.28	0.22	0.24	0.28	0.22	0.28
C2'	0.34	0.53	0.38	0.39	0.55	0.33	0.46	0.30	0.40	0.42	0.59	0.60	0.59	0.40	0.47	0.30	0.23	0.16	0.14	0.17
C3'	0.29	0.43	0.28	0.32	0.49	0.31	0.42	0.29	0.36	0.36	0.50	0.56	0.46	0.34	0.42	0.27	0.26	0.19	0.23	0.23
C4	0.22	0.34	0.16	0.20	0.41	0.23	0.36	0.22	0.30	0.29	0.41	0.46	0.36	0.29	0.31	0.21	0.21	0.25	0.19	0.24
C4'	0.23	0.36	0.19	0.25	0.45	0.25	0.40	0.23	0.34	0.31	0.44	0.52	0.35	0.27	0.39	0.21	0.21	0.19	0.16	0.21
C5	0.19	0.32	0.15	0.16	0.38	0.20	0.32	0.19	0.27	0.26	0.38	0.43	0.34	0.30	0.26	0.19	0.18	0.24	0.20	0.23
C5'	0.25	0.37	0.20	0.25	0.46	0.25	0.41	0.24	0.35	0.32	0.45	0.53	0.36	0.30	0.39	0.23	0.23	0.22	0.18	0.23
C6	0.17	0.30	0.13	0.13	0.34	0.17	0.29	0.16	0.24	0.23	0.35	0.39	0.33	0.30	0.22	0.18	0.17	0.26	0.21	0.24
C8	0.21	0.34	0.17	0.20	0.40	0.22	0.35	0.21	0.29	0.28	0.41	0.46	0.36	0.31	0.31	0.20	0.19	0.22	0.18	0.22
N1	0.19	0.31	0.13	0.14	0.36	0.19	0.31	0.19	0.26	0.25	0.36	0.40	0.34	0.28	0.21	0.20	0.21	0.29	0.25	0.27
N2	0.23	0.35	0.16	0.21	0.40	0.24	0.37	0.24	0.32	0.30	0.40	0.44	0.36	0.26	0.30	0.23	0.27	0.30	0.20	0.29
N3	0.23	0.36	0.18	0.22	0.42	0.24	0.37	0.24	0.32	0.30	0.42	0.47	0.37	0.28	0.34	0.22	0.24	0.27	0.20	0.26
N7	0.19	0.32	0.15	0.17	0.38	0.19	0.32	0.18	0.26	0.25	0.39	0.43	0.34	0.31	0.27	0.19	0.17	0.22	0.18	0.21
N9	0.22	0.35	0.18	0.22	0.42	0.23	0.37	0.23	0.31	0.29	0.42	0.47	0.36	0.29	0.34	0.21	0.21	0.24	0.18	0.24
O2'	0.17	0.30	0.15	0.21	0.38	0.20	0.34	0.23	0.28	0.24	0.38	0.44	0.34	0.19	0.37	0.20	0.39	0.71	0.42	0.52
O3'	0.39	0.47	0.33	0.39	0.60	0.36	0.58	0.36	0.51	0.46	0.55	0.68	0.40	0.38	0.50	0.35	0.34	0.30	0.22	0.32
O4'	0.26	0.37	0.21	0.26	0.46	0.27	0.43	0.26	0.37	0.34	0.44	0.52	0.34	0.29	0.40	0.24	0.25	0.27	0.20	0.27
O5'	0.24	0.38	0.19	0.23	0.46	0.25	0.40	0.24	0.33	0.32	0.45	0.53	0.38	0.31	0.35	0.23	0.22	0.24	0.20	0.24
O6	0.13	0.25	0.12	0.13	0.30	0.13	0.24	0.10	0.20	0.18	0.31	0.35	0.29	0.31	0.22	0.14	0.11	0.25	0.17	0.20
OP1	0.30	0.45	0.23	0.25	0.56	0.29	0.50	0.29	0.42	0.39	0.55	0.65	0.45	0.34	0.33	0.30	0.29	0.36	0.27	0.34
OP2	0.22	0.37	0.18	0.18	0.43	0.22	0.36	0.22	0.29	0.29	0.44	0.50	0.40	0.30	0.24	0.22	0.20	0.26	0.20	0.24
P	0.22	0.37	0.16	0.18	0.45	0.22	0.38	0.22	0.31	0.30	0.45	0.52	0.38	0.28	0.27	0.22	0.21	0.26	0.20	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.06	0.04	0.04
C2	0.01	0.00	0.07	0.11	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.11	0.07	0.24	0.23	0.19	0.21
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.09	0.02	0.09	0.01	0.08	0.04	0.08	0.10	0.10	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.08	0.08	0.12	0.12	0.13	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02
C4	0.00	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.11	0.02	0.20	0.15	0.16	0.16
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.09	0.08	0.16	0.18	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01
C5	0.00	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.21	0.08	0.05	0.15	0.10	0.11	0.10
C5'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.14	0.01	0.11	0.00	0.08	0.07	0.16	0.16	0.22	0.15	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01
C6	0.00	0.01	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.06	0.10	0.06	0.07	0.06
N1	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.04	0.01	0.12	0.09	0.08	0.08
N3	0.01	0.00	0.08	0.12	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.13	0.04	0.25	0.23	0.21	0.22
N4	0.00	0.01	0.10	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.27	0.13	0.03	0.23	0.18	0.19	0.19
O2	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.16	0.02	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.18	0.16	0.36	0.37	0.31	0.35
O2'	0.03	0.14	0.01	0.03	0.23	0.18	0.21	0.15	0.16	0.11	0.20	0.27	0.09	0.00	0.02	0.14	0.21	0.22	0.22	0.18
O3'	0.06	0.11	0.01	0.01	0.11	0.03	0.08	0.05	0.06	0.04	0.13	0.13	0.18	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.13	0.07
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.16	0.14	0.04	0.00	0.06	0.05	0.04	0.04
O5'	0.06	0.24	0.04	0.02	0.20	0.01	0.15	0.01	0.10	0.12	0.25	0.23	0.36	0.21	0.05	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.23	0.03	0.02	0.15	0.01	0.10	0.01	0.06	0.09	0.23	0.18	0.37	0.22	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.19	0.02	0.05	0.16	0.05	0.11	0.03	0.07	0.08	0.21	0.19	0.31	0.22	0.13	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.21	0.02	0.02	0.16	0.01	0.10	0.01	0.06	0.08	0.22	0.19	0.35	0.18	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00