Doublet Group distance statistics: 51361

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.000, 0.308, 0.616, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.308 std_dev=0.308
O4'	A	0, 0.000, 0.311, 0.621, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.311 std_dev=0.311
O2'	A	0, 0.000, 0.332, 0.663, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.332 std_dev=0.332
OP2	B	0, 0.000, 0.389, 0.778, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.389 std_dev=0.389
C3'	A	0, 0.000, 0.503, 1.005, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.503 std_dev=0.503
C4'	A	0, 0.000, 0.504, 1.007, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.504 std_dev=0.504
OP1	A	0, 0.000, 0.556, 1.113, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.556 std_dev=0.556
P	A	0, 0.000, 0.598, 1.197, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.598 std_dev=0.598
OP2	A	0, 0.000, 0.605, 1.210, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.605 std_dev=0.605
P	B	0, 0.000, 0.630, 1.260, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.630 std_dev=0.630
OP1	B	0, 0.000, 0.751, 1.501, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.751 std_dev=0.751
O3'	A	0, 0.000, 0.770, 1.541, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.770 std_dev=0.770
O5'	A	0, 0.000, 0.772, 1.544, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.772 std_dev=0.772
C5'	A	0, 0.000, 0.789, 1.579, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.789 std_dev=0.789
O5'	B	0, 0.000, 1.026, 2.052, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.026 std_dev=1.026
C5'	B	0, 0.000, 1.269, 2.537, 2.537 max_d=2.537 avg_d=1.269 std_dev=1.269
C5	B	0, 0.000, 1.626, 3.251, 3.251 max_d=3.251 avg_d=1.626 std_dev=1.626
C4'	B	0, 0.000, 1.629, 3.258, 3.258 max_d=3.258 avg_d=1.629 std_dev=1.629
C6	B	0, 0.000, 1.659, 3.317, 3.317 max_d=3.317 avg_d=1.659 std_dev=1.659
C3'	B	0, 0.000, 1.711, 3.421, 3.421 max_d=3.421 avg_d=1.711 std_dev=1.711
O4'	B	0, 0.000, 1.716, 3.431, 3.431 max_d=3.431 avg_d=1.716 std_dev=1.716
C4	B	0, 0.000, 1.756, 3.512, 3.512 max_d=3.512 avg_d=1.756 std_dev=1.756
N4	B	0, 0.000, 1.792, 3.584, 3.584 max_d=3.584 avg_d=1.792 std_dev=1.792
N1	B	0, 0.000, 1.819, 3.639, 3.639 max_d=3.639 avg_d=1.819 std_dev=1.819
N3	B	0, 0.000, 1.878, 3.756, 3.756 max_d=3.756 avg_d=1.878 std_dev=1.878
O3'	B	0, 0.000, 1.885, 3.769, 3.769 max_d=3.769 avg_d=1.885 std_dev=1.885
C1'	B	0, 0.000, 1.914, 3.828, 3.828 max_d=3.828 avg_d=1.914 std_dev=1.914
C2	B	0, 0.000, 1.919, 3.839, 3.839 max_d=3.839 avg_d=1.919 std_dev=1.919
C2'	B	0, 0.000, 1.970, 3.941, 3.941 max_d=3.941 avg_d=1.970 std_dev=1.970
O2	B	0, 0.000, 2.066, 4.133, 4.133 max_d=4.133 avg_d=2.066 std_dev=2.066
O2'	B	0, 0.000, 2.271, 4.542, 4.542 max_d=4.542 avg_d=2.271 std_dev=2.271

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.05
C2	0.01	0.00	0.14	0.13	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.18	0.10	0.05	0.01	0.06	0.03	0.01
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.12	0.16	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.07	0.04
C3'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.08	0.04	0.11	0.14	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.22	0.07	0.07
C4	0.00	0.01	0.08	0.08	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.06	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.02	0.00
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03
C5'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00
C6	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.14	0.07	0.05	0.00	0.05	0.03	0.01
C8	0.00	0.01	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06
N1	0.01	0.00	0.12	0.11	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.09	0.06	0.01	0.06	0.04	0.01
N2	0.01	0.00	0.16	0.14	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.20	0.11	0.06	0.02	0.07	0.03	0.01
N3	0.01	0.00	0.13	0.11	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.09	0.04	0.00	0.06	0.02	0.02
N7	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.06	0.11	0.16	0.12	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.05	0.18	0.06	0.04
O3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.14	0.03	0.17	0.20	0.15	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.03	0.13	0.30	0.08	0.12
O4'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.03	0.09	0.11	0.09	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.10
O5'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.13	0.07	0.06	0.00	0.05	0.05	0.01
OP1	0.06	0.06	0.18	0.22	0.05	0.09	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.06	0.03	0.05	0.18	0.30	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00
OP2	0.00	0.03	0.07	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.06	0.08	0.05	0.00	0.05	0.04	0.00	0.00
P	0.05	0.01	0.04	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.12	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.87	0.89	0.80	0.75	0.92	0.78	0.91	0.67	0.89	0.89	0.89	0.91	0.87	0.79	0.72	0.88	0.59	0.27	0.27	0.38
C2	0.58	0.36	0.57	0.65	0.10	0.69	0.24	0.65	0.46	0.48	0.19	0.13	0.38	0.56	0.65	0.69	0.56	0.34	0.21	0.38
C2'	0.82	0.86	0.76	0.69	0.90	0.72	0.87	0.59	0.84	0.85	0.87	0.93	0.84	0.77	0.67	0.82	0.50	0.20	0.16	0.29
C3'	0.79	0.81	0.73	0.66	0.84	0.68	0.83	0.55	0.81	0.81	0.82	0.85	0.80	0.74	0.64	0.78	0.49	0.19	0.18	0.29
C4	0.76	0.68	0.69	0.67	0.61	0.73	0.72	0.64	0.77	0.75	0.61	0.46	0.67	0.68	0.63	0.82	0.58	0.28	0.26	0.38
C4'	0.85	0.87	0.79	0.74	0.89	0.76	0.89	0.66	0.87	0.87	0.87	0.91	0.85	0.78	0.72	0.86	0.59	0.29	0.32	0.41
C5	0.71	0.60	0.61	0.58	0.48	0.67	0.61	0.59	0.71	0.68	0.50	0.32	0.59	0.62	0.53	0.78	0.56	0.25	0.26	0.37
C5'	0.85	0.85	0.78	0.74	0.87	0.77	0.88	0.67	0.87	0.86	0.85	0.87	0.84	0.78	0.72	0.87	0.63	0.34	0.40	0.46
C6	0.57	0.38	0.48	0.49	0.16	0.60	0.30	0.55	0.49	0.49	0.23	0.03	0.40	0.51	0.45	0.68	0.54	0.27	0.25	0.38
C8	0.84	0.82	0.72	0.65	0.80	0.72	0.87	0.61	0.87	0.85	0.78	0.73	0.80	0.73	0.58	0.87	0.57	0.22	0.27	0.37
N1	0.51	0.25	0.46	0.53	0.04	0.62	0.08	0.61	0.35	0.38	0.07	0.24	0.29	0.48	0.52	0.64	0.57	0.34	0.22	0.40
N2	0.44	0.14	0.50	0.66	0.21	0.66	0.10	0.65	0.18	0.27	0.07	0.40	0.20	0.49	0.72	0.57	0.49	0.36	0.14	0.34
N3	0.71	0.59	0.67	0.70	0.46	0.73	0.57	0.66	0.67	0.67	0.49	0.27	0.59	0.66	0.69	0.77	0.57	0.31	0.23	0.38
N7	0.77	0.70	0.64	0.57	0.62	0.67	0.72	0.56	0.78	0.76	0.63	0.51	0.69	0.66	0.51	0.81	0.55	0.20	0.26	0.35
N9	0.84	0.82	0.75	0.70	0.81	0.75	0.87	0.65	0.87	0.85	0.79	0.75	0.80	0.75	0.66	0.87	0.59	0.26	0.27	0.38
O2'	0.83	0.89	0.79	0.73	0.92	0.73	0.85	0.60	0.82	0.85	0.92	0.97	0.88	0.80	0.72	0.81	0.49	0.21	0.15	0.29
O3'	0.75	0.78	0.71	0.63	0.79	0.63	0.77	0.50	0.75	0.77	0.78	0.81	0.77	0.72	0.62	0.72	0.43	0.15	0.11	0.23
O4'	0.88	0.90	0.81	0.78	0.92	0.81	0.92	0.71	0.90	0.90	0.90	0.91	0.88	0.80	0.75	0.90	0.64	0.33	0.37	0.45
O5'	0.82	0.81	0.74	0.69	0.81	0.73	0.85	0.63	0.85	0.83	0.79	0.79	0.79	0.74	0.66	0.84	0.60	0.31	0.39	0.44
O6	0.47	0.26	0.37	0.36	0.03	0.49	0.13	0.45	0.34	0.37	0.11	0.14	0.30	0.42	0.33	0.58	0.46	0.23	0.20	0.34
OP1	0.91	0.95	0.80	0.70	0.96	0.75	0.95	0.61	0.94	0.94	0.96	0.98	0.94	0.81	0.64	0.90	0.59	0.23	0.34	0.39
OP2	0.79	0.78	0.67	0.59	0.76	0.66	0.80	0.54	0.81	0.80	0.76	0.73	0.77	0.69	0.52	0.81	0.54	0.22	0.34	0.37
P	0.77	0.79	0.66	0.58	0.79	0.64	0.81	0.53	0.80	0.79	0.78	0.79	0.78	0.67	0.52	0.79	0.52	0.19	0.30	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.10	0.04
C2	0.01	0.00	0.10	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.02	0.08	0.10	0.21	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.09	0.05	0.16	0.00	0.01	0.00	0.09	0.11	0.15	0.10
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.09	0.00	0.07	0.02	0.14	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.14	0.12
C4	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.18	0.24	0.34	0.25
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.00	0.05	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.20	0.27	0.35	0.27
C5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.13	0.00	0.17	0.00	0.15	0.06	0.07	0.14	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00
C6	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.17	0.21	0.26	0.20
N1	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.18	0.11
N3	0.00	0.00	0.09	0.07	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.03	0.13	0.17	0.28	0.18
N4	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.05	0.19	0.27	0.38	0.28
O2	0.03	0.00	0.16	0.14	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.18	0.00	0.04	0.04	0.16	0.07
O2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.08	0.05	0.14	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.10	0.05
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.04	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.11	0.06	0.18	0.01	0.00	0.02	0.12	0.16	0.12	0.13
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04
O5'	0.03	0.08	0.09	0.12	0.18	0.02	0.20	0.00	0.17	0.09	0.13	0.19	0.04	0.05	0.12	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.10	0.11	0.14	0.24	0.00	0.27	0.05	0.21	0.11	0.17	0.27	0.04	0.05	0.16	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.21	0.15	0.14	0.34	0.03	0.35	0.00	0.26	0.18	0.28	0.38	0.16	0.10	0.12	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.12	0.10	0.12	0.25	0.01	0.27	0.00	0.20	0.11	0.18	0.28	0.07	0.05	0.13	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00