Doublet Group distance statistics: 51365

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.012, 0.022, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.019, 0.036, 0.054, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.036 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.027 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.006, 0.036, 0.065, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.036 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.040, 0.074, 0.109, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.074 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.037, 0.125, 0.214, 0.263 max_d=0.263 avg_d=0.125 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.040, 0.149, 0.259, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.149 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.108, 0.231, 0.354, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.231 std_dev=0.123
C3'	A	0, 0.078, 0.236, 0.394, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.236 std_dev=0.158
O2'	A	0, 0.036, 0.204, 0.373, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.204 std_dev=0.168
O3'	A	0, 0.075, 0.309, 0.543, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.309 std_dev=0.234
C5'	A	0, 0.231, 0.488, 0.746, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.488 std_dev=0.258
OP1	B	0, 0.330, 0.630, 0.930, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.630 std_dev=0.300
P	B	0, 0.359, 0.678, 0.997, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.678 std_dev=0.319
O5'	B	0, 0.478, 0.890, 1.303, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.890 std_dev=0.412
OP2	B	0, 0.311, 0.776, 1.240, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.776 std_dev=0.464
O5'	A	0, 0.251, 0.767, 1.282, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.767 std_dev=0.515
C5'	B	0, 0.526, 1.083, 1.640, 1.771 max_d=1.771 avg_d=1.083 std_dev=0.557
P	A	0, 0.513, 1.211, 1.908, 2.407 max_d=2.407 avg_d=1.211 std_dev=0.698
OP1	A	0, 0.450, 1.237, 2.024, 2.863 max_d=2.863 avg_d=1.237 std_dev=0.787
C4'	B	0, 0.724, 1.523, 2.322, 2.486 max_d=2.486 avg_d=1.523 std_dev=0.799
OP2	A	0, 0.695, 1.509, 2.324, 2.477 max_d=2.477 avg_d=1.509 std_dev=0.815
C3'	B	0, 0.876, 1.823, 2.771, 2.875 max_d=2.875 avg_d=1.823 std_dev=0.947
O3'	B	0, 0.854, 1.849, 2.844, 2.986 max_d=2.986 avg_d=1.849 std_dev=0.995
O4'	B	0, 0.954, 1.994, 3.033, 3.231 max_d=3.231 avg_d=1.994 std_dev=1.040
C2'	B	0, 1.206, 2.419, 3.632, 3.536 max_d=3.536 avg_d=2.419 std_dev=1.213
O2'	B	0, 1.249, 2.531, 3.813, 3.800 max_d=3.800 avg_d=2.531 std_dev=1.282
C1'	B	0, 1.182, 2.489, 3.796, 4.255 max_d=4.255 avg_d=2.489 std_dev=1.307
N9	B	0, 1.317, 2.796, 4.275, 5.253 max_d=5.253 avg_d=2.796 std_dev=1.479
C8	B	0, 0.927, 2.455, 3.983, 6.084 max_d=6.084 avg_d=2.455 std_dev=1.528
N7	B	0, 1.175, 2.994, 4.813, 7.237 max_d=7.237 avg_d=2.994 std_dev=1.819
C4	B	0, 1.790, 3.631, 5.471, 6.154 max_d=6.154 avg_d=3.631 std_dev=1.841
C5	B	0, 1.763, 3.732, 5.701, 7.226 max_d=7.226 avg_d=3.732 std_dev=1.969
N3	B	0, 2.162, 4.302, 6.442, 6.437 max_d=6.437 avg_d=4.302 std_dev=2.140
C6	B	0, 2.236, 4.602, 6.967, 8.475 max_d=8.475 avg_d=4.602 std_dev=2.366
C2	B	0, 2.598, 5.126, 7.654, 7.713 max_d=7.713 avg_d=5.126 std_dev=2.528
O6	B	0, 2.278, 4.864, 7.450, 9.680 max_d=9.680 avg_d=4.864 std_dev=2.586
N1	B	0, 2.651, 5.258, 7.865, 8.558 max_d=8.558 avg_d=5.258 std_dev=2.607
N2	B	0, 3.013, 5.936, 8.859, 8.575 max_d=8.575 avg_d=5.936 std_dev=2.923

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.14	0.02	0.15	0.19	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.29	0.01	0.23	0.20	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.09	0.07	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.21	0.05	0.30	0.12	0.15
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.06	0.10	0.05	0.08	0.06	0.10	0.04	0.01	0.01	0.01	0.26	0.08	0.38	0.10	0.22
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.31	0.01	0.22	0.17	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.15	0.22	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.39	0.01	0.26	0.20	0.25
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.09	0.09	0.07	0.05	0.04	0.10	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.11	0.15	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.41	0.00	0.28	0.24	0.28
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.39	0.03	0.24	0.17	0.23
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.36	0.01	0.26	0.22	0.23
N2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.11	0.02	0.26	0.02	0.22	0.20	0.15
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.02	0.25	0.01	0.20	0.18	0.13
N7	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.13	0.03	0.44	0.03	0.28	0.21	0.29
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.28	0.02	0.19	0.16	0.13
O2'	0.03	0.07	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.10	0.07	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.10	0.05	0.26	0.12	0.08
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.07	0.12	0.04	0.11	0.07	0.13	0.04	0.04	0.00	0.02	0.21	0.10	0.45	0.13	0.25
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.32	0.13
O5'	0.14	0.29	0.21	0.26	0.31	0.01	0.39	0.01	0.41	0.39	0.36	0.26	0.25	0.44	0.28	0.10	0.21	0.04	0.00	0.45	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.10	0.04	0.45	0.00	0.32	0.29	0.34
OP1	0.15	0.23	0.30	0.38	0.22	0.15	0.26	0.15	0.28	0.24	0.26	0.22	0.20	0.28	0.19	0.26	0.45	0.06	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.20	0.12	0.10	0.17	0.22	0.20	0.26	0.24	0.17	0.22	0.20	0.18	0.21	0.16	0.12	0.13	0.32	0.02	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.17	0.15	0.22	0.16	0.02	0.25	0.01	0.28	0.23	0.23	0.15	0.13	0.29	0.13	0.08	0.25	0.13	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.49	0.65	0.75	0.67	0.61	0.35	0.97	0.31	0.93	1.15	0.59	1.06	0.56	1.38	0.70	0.63	0.70	0.30	0.24	1.27	0.21	0.26	0.22
C2	0.26	1.14	0.44	0.48	0.39	0.28	0.11	0.29	0.31	0.59	0.86	1.53	0.92	0.60	0.18	0.37	0.57	0.38	0.20	0.19	0.18	0.31	0.19
C2'	0.79	0.93	1.00	0.82	1.06	0.46	1.46	0.34	1.53	1.47	1.14	1.01	0.85	1.76	1.07	0.86	0.79	0.45	0.29	1.92	0.22	0.24	0.21
C3'	0.83	1.01	1.00	0.83	1.07	0.50	1.44	0.37	1.51	1.46	1.19	1.12	0.91	1.72	1.08	0.88	0.79	0.52	0.32	1.89	0.25	0.22	0.24
C4	0.33	1.04	0.54	0.54	0.36	0.32	0.38	0.30	0.31	0.79	0.76	1.53	0.80	0.88	0.37	0.46	0.59	0.33	0.24	0.37	0.21	0.24	0.22
C4'	0.64	0.78	0.86	0.74	0.83	0.41	1.19	0.33	1.23	1.28	0.89	1.03	0.69	1.52	0.87	0.74	0.74	0.38	0.27	1.61	0.24	0.23	0.24
C5	0.34	1.37	0.41	0.43	0.57	0.31	0.37	0.29	0.65	0.54	1.21	1.80	1.04	0.53	0.31	0.38	0.50	0.36	0.25	0.49	0.22	0.18	0.24
C5'	0.61	0.81	0.81	0.71	0.74	0.44	1.04	0.37	1.05	1.19	0.81	1.13	0.70	1.38	0.80	0.71	0.72	0.41	0.32	1.37	0.28	0.20	0.28
C6	0.40	1.63	0.32	0.33	0.82	0.29	0.66	0.27	1.06	0.28	1.58	1.95	1.27	0.24	0.40	0.33	0.41	0.41	0.25	0.94	0.21	0.16	0.23
C8	0.39	1.09	0.55	0.53	0.47	0.34	0.50	0.31	0.51	0.80	0.88	1.58	0.83	0.88	0.44	0.48	0.57	0.35	0.27	0.55	0.24	0.18	0.24
N1	0.38	1.55	0.31	0.35	0.79	0.29	0.57	0.28	0.92	0.25	1.42	1.83	1.25	0.16	0.36	0.32	0.44	0.44	0.24	0.74	0.19	0.24	0.21
N2	0.24	0.96	0.45	0.51	0.34	0.27	0.25	0.30	0.33	0.62	0.67	1.28	0.84	0.67	0.18	0.37	0.61	0.43	0.14	0.37	0.17	0.38	0.17
N3	0.30	0.85	0.58	0.58	0.25	0.30	0.44	0.29	0.24	0.88	0.51	1.34	0.67	0.99	0.39	0.47	0.64	0.30	0.21	0.46	0.19	0.30	0.21
N7	0.37	1.34	0.44	0.44	0.57	0.32	0.43	0.30	0.67	0.59	1.19	1.79	1.01	0.60	0.36	0.40	0.49	0.36	0.27	0.55	0.24	0.15	0.25
N9	0.40	0.89	0.62	0.59	0.43	0.34	0.62	0.31	0.52	0.94	0.63	1.38	0.69	1.08	0.51	0.53	0.63	0.32	0.25	0.73	0.22	0.23	0.23
O2'	0.88	1.15	1.10	0.87	1.28	0.44	1.73	0.33	1.92	1.59	1.51	1.05	1.03	1.93	1.22	0.95	0.84	0.44	0.26	2.37	0.18	0.26	0.18
O3'	1.03	1.34	1.16	0.92	1.37	0.57	1.75	0.39	1.92	1.64	1.62	1.34	1.20	1.93	1.31	1.05	0.86	0.65	0.34	2.33	0.25	0.23	0.23
O4'	0.44	0.67	0.70	0.64	0.54	0.34	0.89	0.31	0.85	1.08	0.55	1.11	0.56	1.29	0.64	0.58	0.67	0.30	0.24	1.20	0.22	0.25	0.23
O5'	0.76	0.86	0.95	0.92	0.84	0.60	1.15	0.50	1.10	1.39	0.84	1.23	0.75	1.57	0.95	0.82	0.92	0.56	0.56	1.40	0.70	0.51	0.66
O6	0.49	1.81	0.31	0.25	1.06	0.28	1.01	0.25	1.48	0.28	1.89	2.07	1.43	0.44	0.58	0.33	0.31	0.44	0.25	1.46	0.21	0.14	0.23
OP1	0.84	1.03	0.99	0.93	0.93	0.68	1.18	0.58	1.17	1.37	1.02	1.36	0.90	1.52	1.00	0.89	0.93	0.68	0.58	1.42	0.70	0.40	0.65
OP2	0.76	1.28	0.82	0.80	0.83	0.68	0.90	0.62	0.92	1.10	1.13	1.75	1.06	1.18	0.82	0.77	0.79	0.69	0.59	0.99	0.67	0.34	0.63
P	0.69	1.05	0.83	0.81	0.76	0.60	0.95	0.53	0.91	1.18	0.91	1.49	0.87	1.31	0.82	0.74	0.82	0.58	0.53	1.12	0.65	0.38	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.15	0.01	0.34	0.27	0.19
C2	0.02	0.00	0.31	0.18	0.00	0.26	0.01	0.55	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.40	0.25	0.30	0.79	0.01	0.97	1.25	0.93
C2'	0.00	0.31	0.00	0.01	0.15	0.01	0.07	0.02	0.13	0.17	0.24	0.38	0.30	0.10	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.10	0.40	0.06	0.13
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.14	0.20	0.16	0.22	0.16	0.19	0.09	0.03	0.01	0.01	0.09	0.16	0.34	0.12	0.07
C4	0.01	0.00	0.15	0.11	0.00	0.17	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.12	0.16	0.57	0.01	0.81	0.90	0.67
C4'	0.01	0.26	0.01	0.00	0.17	0.00	0.16	0.01	0.21	0.08	0.25	0.29	0.23	0.10	0.08	0.06	0.01	0.00	0.02	0.20	0.08	0.01	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.16	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.14	0.08	0.54	0.00	0.92	1.00	0.72
C5'	0.04	0.55	0.02	0.01	0.36	0.01	0.34	0.00	0.44	0.09	0.54	0.61	0.47	0.18	0.16	0.06	0.03	0.02	0.01	0.42	0.09	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.13	0.14	0.00	0.21	0.00	0.44	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.14	0.66	0.00	1.05	1.26	0.89
C8	0.01	0.01	0.17	0.20	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.22	0.16	0.14	0.01	0.59	0.39	0.24
N1	0.01	0.00	0.24	0.16	0.00	0.25	0.00	0.54	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.32	0.20	0.24	0.78	0.01	1.06	1.36	0.98
N2	0.03	0.01	0.38	0.22	0.01	0.29	0.01	0.61	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.51	0.33	0.36	0.85	0.02	0.98	1.32	0.99
N3	0.02	0.00	0.30	0.16	0.00	0.23	0.00	0.47	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.38	0.22	0.30	0.69	0.01	0.83	1.03	0.78
N7	0.01	0.00	0.10	0.19	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.21	0.08	0.29	0.01	0.81	0.68	0.46
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.30	0.01	0.59	0.52	0.38
O2'	0.01	0.40	0.00	0.03	0.19	0.06	0.11	0.06	0.19	0.13	0.32	0.51	0.38	0.06	0.03	0.00	0.05	0.06	0.03	0.15	0.30	0.05	0.10
O3'	0.02	0.25	0.03	0.01	0.12	0.01	0.14	0.03	0.16	0.22	0.20	0.33	0.22	0.21	0.08	0.05	0.00	0.02	0.17	0.18	0.26	0.30	0.05
O4'	0.00	0.30	0.01	0.01	0.16	0.00	0.08	0.02	0.14	0.16	0.24	0.36	0.30	0.08	0.01	0.06	0.02	0.00	0.12	0.10	0.10	0.20	0.09
O5'	0.15	0.79	0.03	0.09	0.57	0.02	0.54	0.01	0.66	0.14	0.78	0.85	0.69	0.29	0.30	0.03	0.17	0.12	0.00	0.62	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.20	0.00	0.42	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.10	0.62	0.00	1.10	1.28	0.89
OP1	0.34	0.97	0.40	0.34	0.81	0.08	0.92	0.09	1.05	0.59	1.06	0.98	0.83	0.81	0.59	0.30	0.26	0.10	0.01	1.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	1.25	0.06	0.12	0.90	0.01	1.00	0.03	1.26	0.39	1.36	1.32	1.03	0.68	0.52	0.05	0.30	0.20	0.01	1.28	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.93	0.13	0.07	0.67	0.04	0.72	0.02	0.89	0.24	0.98	0.99	0.78	0.46	0.38	0.10	0.05	0.09	0.01	0.89	0.00	0.00	0.00