Doublet Group distance statistics: 51366

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 5, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C6	A	0, -0.002, 0.009, 0.021, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.009 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.001, 0.014, 0.029, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.014 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.024 std_dev=0.019
O6	A	0, -0.005, 0.020, 0.044, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.020 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.003, 0.028, 0.053, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.028 std_dev=0.025
C1'	A	0, -0.006, 0.020, 0.047, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.020 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.003, 0.100, 0.197, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.100 std_dev=0.097
C2'	A	0, 0.014, 0.118, 0.222, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.118 std_dev=0.104
OP2	B	0, 0.018, 0.170, 0.321, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.170 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.030, 0.203, 0.377, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.203 std_dev=0.173
P	B	0, 0.107, 0.293, 0.479, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.293 std_dev=0.186
O2'	A	0, -0.021, 0.190, 0.401, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.190 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.015, 0.246, 0.477, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.246 std_dev=0.231
O5'	B	0, 0.152, 0.385, 0.618, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.385 std_dev=0.233
C5'	A	0, 0.069, 0.328, 0.587, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.328 std_dev=0.259
C3'	B	0, 0.180, 0.496, 0.811, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.496 std_dev=0.316
C4'	B	0, 0.264, 0.587, 0.909, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.587 std_dev=0.322
O3'	B	0, 0.202, 0.525, 0.848, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.525 std_dev=0.323
O5'	A	0, 0.088, 0.417, 0.745, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.417 std_dev=0.329
OP1	B	0, 0.168, 0.501, 0.834, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.501 std_dev=0.333
OP2	A	0, 0.228, 0.578, 0.927, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.578 std_dev=0.350
P	A	0, 0.185, 0.536, 0.887, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.536 std_dev=0.351
C5'	B	0, 0.274, 0.628, 0.982, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.628 std_dev=0.354
OP1	A	0, 0.245, 0.628, 1.011, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.628 std_dev=0.383
O3'	A	0, 0.002, 0.400, 0.799, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.400 std_dev=0.399
O4'	B	0, 0.296, 0.739, 1.182, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.739 std_dev=0.443
C2'	B	0, 0.180, 0.636, 1.093, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.636 std_dev=0.456
O2'	B	0, 0.263, 0.743, 1.223, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.743 std_dev=0.480
C1'	B	0, 0.210, 0.746, 1.283, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.746 std_dev=0.536
N9	B	0, 0.207, 0.848, 1.488, 2.014 max_d=2.014 avg_d=0.848 std_dev=0.640
C8	B	0, 0.341, 1.003, 1.665, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.003 std_dev=0.662
C4	B	0, 0.156, 0.923, 1.690, 2.623 max_d=2.623 avg_d=0.923 std_dev=0.767
N7	B	0, 0.385, 1.153, 1.921, 2.437 max_d=2.437 avg_d=1.153 std_dev=0.768
C5	B	0, 0.266, 1.095, 1.923, 2.827 max_d=2.827 avg_d=1.095 std_dev=0.829
N3	B	0, 0.070, 0.908, 1.747, 3.009 max_d=3.009 avg_d=0.908 std_dev=0.838
C6	B	0, 0.241, 1.220, 2.199, 3.450 max_d=3.450 avg_d=1.220 std_dev=0.979
C2	B	0, 0.052, 1.038, 2.024, 3.596 max_d=3.596 avg_d=1.038 std_dev=0.986
N1	B	0, 0.112, 1.164, 2.215, 3.787 max_d=3.787 avg_d=1.164 std_dev=1.051
O6	B	0, 0.319, 1.394, 2.468, 3.761 max_d=3.761 avg_d=1.394 std_dev=1.074
N2	B	0, 0.021, 1.119, 2.218, 4.111 max_d=4.111 avg_d=1.119 std_dev=1.099

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04
C2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.15	0.04	0.13	0.01	0.16	0.21	0.15
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.14	0.11	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.10	0.07	0.06
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.02	0.14	0.15	0.13	0.16	0.12	0.15	0.09	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.13	0.14	0.11
C4	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.10	0.03	0.13	0.01	0.14	0.17	0.13
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.09	0.05	0.07	0.01	0.00	0.02	0.07	0.07	0.04	0.03
C5	0.03	0.01	0.03	0.13	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.14	0.03	0.17	0.01	0.19	0.23	0.18
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.13	0.13	0.11	0.08	0.07	0.15	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.14	0.06	0.03	0.02
C6	0.04	0.01	0.05	0.14	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.15	0.04	0.18	0.00	0.21	0.26	0.21
C8	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.02	0.18	0.02	0.17	0.17	0.15
N1	0.04	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.14	0.04	0.16	0.01	0.19	0.25	0.19
N2	0.05	0.00	0.14	0.16	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.19	0.05	0.13	0.02	0.15	0.21	0.15
N3	0.04	0.00	0.11	0.12	0.00	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.13	0.04	0.11	0.01	0.13	0.17	0.12
N7	0.02	0.01	0.04	0.15	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.19	0.02	0.20	0.02	0.21	0.24	0.20
N9	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.11	0.03	0.12	0.11	0.10
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.10	0.07	0.08	0.07	0.11	0.04	0.15	0.22	0.16	0.04	0.04	0.00	0.04	0.05	0.08	0.10	0.15	0.10	0.10
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.10	0.01	0.14	0.04	0.15	0.17	0.14	0.19	0.13	0.19	0.08	0.04	0.00	0.01	0.16	0.17	0.24	0.24	0.20
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.04	0.06	0.05	0.04
O5'	0.05	0.13	0.04	0.09	0.13	0.02	0.17	0.01	0.18	0.18	0.16	0.13	0.11	0.20	0.11	0.08	0.16	0.06	0.00	0.19	0.01	0.02	0.00
O6	0.04	0.01	0.04	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.17	0.04	0.19	0.00	0.23	0.28	0.22
OP1	0.07	0.16	0.10	0.13	0.14	0.07	0.19	0.06	0.21	0.17	0.19	0.15	0.13	0.21	0.12	0.15	0.24	0.06	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.21	0.07	0.14	0.17	0.04	0.23	0.03	0.26	0.17	0.25	0.21	0.17	0.24	0.11	0.10	0.24	0.05	0.02	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.15	0.06	0.11	0.13	0.03	0.18	0.02	0.21	0.15	0.19	0.15	0.12	0.20	0.10	0.10	0.20	0.04	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.29	0.08	0.13	0.13	0.17	0.16	0.20	0.25	0.24	0.32	0.37	0.20	0.24	0.13	0.08	0.16	0.22	0.10	0.29	0.16	0.13	0.14
C2	0.08	0.23	0.05	0.09	0.13	0.11	0.17	0.11	0.24	0.18	0.25	0.26	0.17	0.21	0.08	0.05	0.16	0.16	0.06	0.28	0.10	0.17	0.10
C2'	0.17	0.34	0.12	0.15	0.16	0.22	0.18	0.23	0.29	0.27	0.38	0.42	0.23	0.27	0.17	0.12	0.14	0.27	0.07	0.35	0.15	0.17	0.10
C3'	0.17	0.34	0.12	0.12	0.18	0.19	0.20	0.19	0.30	0.24	0.38	0.42	0.24	0.23	0.17	0.14	0.11	0.26	0.10	0.36	0.12	0.24	0.08
C4	0.08	0.29	0.07	0.12	0.15	0.14	0.19	0.16	0.31	0.15	0.34	0.33	0.20	0.17	0.08	0.06	0.18	0.17	0.09	0.38	0.16	0.15	0.14
C4'	0.16	0.31	0.10	0.13	0.16	0.18	0.18	0.19	0.26	0.24	0.34	0.40	0.22	0.24	0.16	0.11	0.13	0.24	0.08	0.30	0.14	0.16	0.09
C5	0.08	0.33	0.08	0.13	0.20	0.14	0.27	0.16	0.39	0.13	0.39	0.36	0.24	0.21	0.11	0.08	0.20	0.14	0.10	0.47	0.19	0.14	0.16
C5'	0.14	0.33	0.09	0.11	0.17	0.15	0.18	0.17	0.28	0.19	0.36	0.42	0.23	0.19	0.14	0.10	0.13	0.22	0.11	0.33	0.15	0.19	0.11
C6	0.07	0.31	0.07	0.13	0.21	0.12	0.29	0.13	0.38	0.14	0.37	0.32	0.23	0.26	0.12	0.08	0.20	0.11	0.09	0.46	0.16	0.13	0.14
C8	0.11	0.37	0.10	0.15	0.21	0.17	0.25	0.20	0.40	0.15	0.44	0.43	0.27	0.18	0.13	0.09	0.19	0.18	0.13	0.49	0.22	0.14	0.18
N1	0.05	0.25	0.05	0.10	0.17	0.09	0.23	0.09	0.31	0.14	0.30	0.27	0.19	0.23	0.08	0.06	0.19	0.11	0.06	0.37	0.11	0.14	0.10
N2	0.17	0.24	0.09	0.08	0.19	0.13	0.21	0.13	0.21	0.30	0.23	0.26	0.21	0.29	0.18	0.07	0.13	0.22	0.10	0.22	0.11	0.18	0.09
N3	0.08	0.24	0.05	0.10	0.11	0.12	0.15	0.14	0.23	0.20	0.26	0.28	0.17	0.21	0.08	0.04	0.15	0.18	0.07	0.28	0.12	0.17	0.12
N7	0.11	0.38	0.10	0.15	0.24	0.16	0.30	0.19	0.43	0.15	0.45	0.42	0.28	0.23	0.14	0.10	0.20	0.17	0.13	0.53	0.23	0.13	0.18
N9	0.10	0.32	0.08	0.14	0.15	0.17	0.19	0.19	0.32	0.17	0.36	0.37	0.22	0.17	0.10	0.08	0.18	0.19	0.11	0.39	0.19	0.14	0.16
O2'	0.29	0.25	0.22	0.27	0.24	0.33	0.31	0.34	0.26	0.43	0.27	0.33	0.20	0.46	0.31	0.19	0.24	0.39	0.16	0.31	0.21	0.16	0.18
O3'	0.22	0.33	0.17	0.16	0.21	0.23	0.22	0.21	0.28	0.28	0.36	0.41	0.25	0.27	0.22	0.18	0.14	0.30	0.12	0.31	0.12	0.27	0.10
O4'	0.13	0.29	0.09	0.14	0.14	0.18	0.16	0.20	0.24	0.23	0.31	0.37	0.19	0.23	0.14	0.08	0.17	0.22	0.11	0.29	0.18	0.12	0.15
O5'	0.12	0.40	0.10	0.10	0.21	0.13	0.23	0.16	0.37	0.14	0.44	0.47	0.28	0.16	0.13	0.11	0.14	0.18	0.17	0.43	0.19	0.22	0.15
O6	0.09	0.33	0.08	0.12	0.24	0.12	0.33	0.13	0.42	0.18	0.40	0.34	0.25	0.31	0.16	0.09	0.21	0.11	0.10	0.51	0.19	0.11	0.15
OP1	0.12	0.48	0.13	0.12	0.26	0.13	0.27	0.18	0.43	0.11	0.52	0.57	0.35	0.15	0.14	0.14	0.14	0.15	0.23	0.49	0.24	0.28	0.21
OP2	0.16	0.51	0.17	0.14	0.32	0.14	0.36	0.18	0.52	0.17	0.58	0.58	0.39	0.25	0.20	0.17	0.16	0.14	0.26	0.60	0.26	0.31	0.24
P	0.12	0.44	0.12	0.11	0.25	0.12	0.27	0.16	0.42	0.12	0.49	0.52	0.33	0.17	0.14	0.13	0.14	0.15	0.20	0.49	0.22	0.25	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.02	0.15	0.17	0.14
C2	0.05	0.00	0.19	0.15	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.24	0.20	0.05	0.30	0.01	0.34	0.37	0.33
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.09	0.01	0.04	0.02	0.08	0.08	0.14	0.23	0.19	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.05	0.11	0.07
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.15	0.10	0.19	0.14	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.04	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.09	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03	0.31	0.01	0.32	0.33	0.32
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.08	0.07	0.10	0.05	0.05	0.01	0.00	0.03	0.09	0.05	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.38	0.01	0.42	0.39	0.40
C5'	0.04	0.12	0.02	0.01	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.16	0.11	0.11	0.21	0.12	0.06	0.02	0.02	0.01	0.22	0.06	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.06	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.07	0.03	0.39	0.01	0.46	0.43	0.43
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.10	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.17	0.03	0.38	0.02	0.37	0.33	0.35
N1	0.04	0.00	0.14	0.10	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.14	0.05	0.35	0.01	0.41	0.41	0.39
N2	0.06	0.00	0.23	0.19	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.30	0.27	0.06	0.28	0.02	0.30	0.36	0.31
N3	0.05	0.00	0.19	0.14	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.22	0.18	0.05	0.27	0.01	0.29	0.33	0.29
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.10	0.00	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.02	0.42	0.03	0.45	0.40	0.43
N9	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.29	0.01	0.28	0.28	0.27
O2'	0.02	0.24	0.00	0.01	0.11	0.05	0.07	0.06	0.12	0.05	0.19	0.30	0.22	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.07	0.10	0.07	0.10	0.08
O3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.07	0.17	0.14	0.27	0.18	0.14	0.05	0.03	0.00	0.02	0.21	0.07	0.15	0.22	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.14	0.04	0.13	0.13	0.11
O5'	0.16	0.30	0.05	0.08	0.31	0.03	0.38	0.01	0.39	0.38	0.35	0.28	0.27	0.42	0.29	0.07	0.21	0.14	0.00	0.42	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.09	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.07	0.04	0.42	0.00	0.52	0.47	0.48
OP1	0.15	0.34	0.05	0.04	0.32	0.05	0.42	0.06	0.46	0.37	0.41	0.30	0.29	0.45	0.28	0.07	0.15	0.13	0.01	0.52	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.37	0.11	0.10	0.33	0.07	0.39	0.07	0.43	0.33	0.41	0.36	0.33	0.40	0.28	0.10	0.22	0.13	0.01	0.47	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.33	0.07	0.07	0.32	0.03	0.40	0.02	0.43	0.35	0.39	0.31	0.29	0.43	0.27	0.08	0.18	0.11	0.01	0.48	0.00	0.00	0.00