Doublet Group distance statistics: 51367

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.021 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.019, 0.043, 0.066, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.043 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.040 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.003, 0.036, 0.069, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.036 std_dev=0.033
N2	A	0, 0.019, 0.057, 0.096, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.057 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.070, 0.231, 0.393, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.231 std_dev=0.162
O4'	A	0, 0.047, 0.211, 0.374, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.211 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.118, 0.312, 0.507, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.312 std_dev=0.194
C4'	A	0, 0.077, 0.307, 0.536, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.307 std_dev=0.230
C3'	A	0, 0.057, 0.328, 0.600, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.328 std_dev=0.272
P	B	0, 0.125, 0.404, 0.683, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.404 std_dev=0.279
OP1	B	0, 0.052, 0.395, 0.738, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.395 std_dev=0.343
OP2	A	0, 0.240, 0.598, 0.957, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.598 std_dev=0.359
O5'	A	0, 0.226, 0.599, 0.972, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.599 std_dev=0.373
O3'	A	0, 0.052, 0.447, 0.842, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.447 std_dev=0.395
C5'	A	0, 0.156, 0.556, 0.956, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.556 std_dev=0.400
P	A	0, 0.290, 0.708, 1.126, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.708 std_dev=0.418
OP2	B	0, 0.035, 0.502, 0.969, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.502 std_dev=0.467
O5'	B	0, 0.126, 0.621, 1.115, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.621 std_dev=0.494
OP1	A	0, 0.332, 0.853, 1.375, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.853 std_dev=0.522
C5'	B	0, -0.054, 0.643, 1.339, 2.379 max_d=2.379 avg_d=0.643 std_dev=0.697
C8	B	0, -0.127, 0.908, 1.944, 3.633 max_d=3.633 avg_d=0.908 std_dev=1.035
C4'	B	0, -0.210, 0.839, 1.887, 3.598 max_d=3.598 avg_d=0.839 std_dev=1.048
O4'	B	0, -0.186, 0.922, 2.030, 3.874 max_d=3.874 avg_d=0.922 std_dev=1.108
C2'	B	0, -0.213, 0.939, 2.091, 3.914 max_d=3.914 avg_d=0.939 std_dev=1.152
O2'	B	0, -0.175, 0.982, 2.140, 3.805 max_d=3.805 avg_d=0.982 std_dev=1.158
C3'	B	0, -0.298, 0.893, 2.084, 4.028 max_d=4.028 avg_d=0.893 std_dev=1.191
C1'	B	0, -0.234, 1.010, 2.254, 4.335 max_d=4.335 avg_d=1.010 std_dev=1.244
N9	B	0, -0.218, 1.032, 2.282, 4.389 max_d=4.389 avg_d=1.032 std_dev=1.250
O3'	B	0, -0.323, 0.945, 2.213, 4.243 max_d=4.243 avg_d=0.945 std_dev=1.268
N7	B	0, -0.193, 1.075, 2.344, 4.432 max_d=4.432 avg_d=1.075 std_dev=1.269
C4	B	0, -0.319, 1.261, 2.842, 5.539 max_d=5.539 avg_d=1.261 std_dev=1.581
C5	B	0, -0.300, 1.283, 2.867, 5.543 max_d=5.543 avg_d=1.283 std_dev=1.584
N3	B	0, -0.424, 1.465, 3.354, 6.603 max_d=6.603 avg_d=1.465 std_dev=1.889
C6	B	0, -0.388, 1.541, 3.470, 6.743 max_d=6.743 avg_d=1.541 std_dev=1.929
O6	B	0, -0.398, 1.655, 3.709, 7.160 max_d=7.160 avg_d=1.655 std_dev=2.053
C2	B	0, -0.481, 1.681, 3.844, 7.571 max_d=7.571 avg_d=1.681 std_dev=2.162
N1	B	0, -0.471, 1.714, 3.899, 7.649 max_d=7.649 avg_d=1.714 std_dev=2.185
N2	B	0, -0.569, 1.916, 4.401, 8.699 max_d=8.699 avg_d=1.916 std_dev=2.485

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.08	0.07
C2	0.04	0.00	0.12	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.04	0.07	0.03	0.08	0.14	0.10
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.08	0.07	0.11	0.14	0.12	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.07	0.10	0.07	0.05
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.12	0.10	0.14	0.11	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.09	0.07	0.13	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.02	0.07	0.02	0.08	0.13	0.09
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.10	0.04	0.07	0.05	0.09	0.04	0.06	0.03	0.00	0.03	0.06	0.06	0.05	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.07	0.02	0.12	0.01	0.13	0.18	0.14
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.11	0.16	0.08	0.06	0.05	0.17	0.07	0.07	0.06	0.02	0.01	0.13	0.05	0.03	0.04
C6	0.02	0.02	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.02	0.12	0.01	0.15	0.20	0.16
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.14	0.02	0.12	0.13	0.12
N1	0.03	0.01	0.11	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.12	0.03	0.09	0.02	0.11	0.18	0.13
N2	0.05	0.01	0.14	0.14	0.02	0.07	0.02	0.06	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.16	0.20	0.05	0.06	0.04	0.07	0.14	0.09
N3	0.03	0.01	0.12	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.04	0.05	0.02	0.06	0.12	0.08
N7	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.16	0.02	0.17	0.19	0.17
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.10	0.07
O2'	0.03	0.14	0.01	0.03	0.07	0.06	0.06	0.07	0.09	0.05	0.12	0.16	0.12	0.05	0.03	0.00	0.08	0.06	0.07	0.09	0.12	0.08	0.08
O3'	0.02	0.16	0.03	0.01	0.07	0.03	0.07	0.06	0.08	0.13	0.12	0.20	0.14	0.12	0.04	0.08	0.00	0.03	0.15	0.08	0.21	0.23	0.17
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.08	0.03	0.09	0.15	0.14
O5'	0.03	0.07	0.05	0.09	0.07	0.03	0.12	0.01	0.12	0.14	0.09	0.06	0.05	0.16	0.06	0.07	0.15	0.08	0.00	0.14	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.07	0.07	0.02	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.09	0.08	0.03	0.14	0.00	0.18	0.24	0.19
OP1	0.04	0.08	0.10	0.13	0.08	0.06	0.13	0.05	0.15	0.12	0.11	0.07	0.06	0.17	0.06	0.12	0.21	0.09	0.03	0.18	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.14	0.07	0.14	0.13	0.05	0.18	0.03	0.20	0.13	0.18	0.14	0.12	0.19	0.10	0.08	0.23	0.15	0.02	0.24	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.05	0.10	0.09	0.05	0.14	0.04	0.16	0.12	0.13	0.09	0.08	0.17	0.07	0.08	0.17	0.14	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.86	0.81	1.00	0.99	0.68	0.94	0.49	0.71	0.48	0.42	0.64	0.93	0.85	0.33	0.66	0.90	0.92	0.82	0.37	0.38	0.09	0.23	0.09
C2	0.65	0.59	0.82	0.75	0.52	0.72	0.41	0.62	0.42	0.37	0.51	0.66	0.62	0.32	0.51	0.69	0.59	0.60	0.34	0.39	0.15	0.20	0.12
C2'	1.06	1.10	1.13	1.14	0.93	1.10	0.74	0.84	0.75	0.63	0.94	1.25	1.12	0.56	0.88	0.99	1.07	1.02	0.52	0.63	0.14	0.11	0.16
C3'	1.18	1.22	1.24	1.25	1.03	1.20	0.81	0.88	0.82	0.69	1.03	1.39	1.25	0.60	0.97	1.13	1.22	1.13	0.55	0.67	0.12	0.11	0.15
C4	0.75	0.64	0.93	0.89	0.55	0.83	0.38	0.65	0.37	0.35	0.50	0.74	0.69	0.27	0.56	0.85	0.77	0.70	0.33	0.30	0.10	0.23	0.10
C4'	1.06	1.04	1.17	1.18	0.87	1.11	0.64	0.81	0.63	0.55	0.84	1.21	1.08	0.44	0.84	1.09	1.15	1.01	0.46	0.49	0.10	0.18	0.09
C5	0.72	0.53	0.92	0.86	0.47	0.78	0.28	0.59	0.25	0.28	0.37	0.62	0.60	0.18	0.49	0.90	0.73	0.64	0.30	0.21	0.12	0.27	0.13
C5'	1.09	1.04	1.20	1.21	0.87	1.12	0.61	0.80	0.60	0.54	0.81	1.22	1.09	0.42	0.84	1.16	1.20	1.03	0.44	0.44	0.10	0.21	0.07
C6	0.62	0.41	0.85	0.76	0.37	0.67	0.21	0.53	0.19	0.23	0.28	0.48	0.48	0.13	0.41	0.85	0.59	0.54	0.27	0.19	0.16	0.27	0.16
C8	0.81	0.63	0.99	0.96	0.55	0.87	0.33	0.64	0.30	0.33	0.45	0.75	0.71	0.20	0.57	0.98	0.86	0.74	0.32	0.22	0.11	0.27	0.12
N1	0.59	0.45	0.80	0.70	0.40	0.64	0.28	0.54	0.28	0.27	0.35	0.51	0.49	0.21	0.42	0.73	0.52	0.52	0.28	0.27	0.13	0.22	0.11
N2	0.60	0.64	0.75	0.66	0.56	0.65	0.50	0.60	0.52	0.42	0.59	0.69	0.64	0.42	0.53	0.57	0.50	0.56	0.40	0.50	0.24	0.20	0.20
N3	0.73	0.68	0.88	0.84	0.59	0.81	0.45	0.66	0.46	0.40	0.57	0.77	0.71	0.34	0.57	0.75	0.71	0.69	0.36	0.40	0.13	0.21	0.11
N7	0.75	0.53	0.96	0.90	0.47	0.80	0.26	0.59	0.22	0.28	0.35	0.64	0.61	0.15	0.51	0.98	0.79	0.67	0.29	0.17	0.13	0.29	0.15
N9	0.81	0.70	0.98	0.96	0.60	0.89	0.41	0.67	0.39	0.37	0.54	0.81	0.76	0.27	0.60	0.91	0.86	0.76	0.34	0.30	0.09	0.24	0.09
O2'	1.02	1.13	1.08	1.09	0.95	1.06	0.78	0.83	0.81	0.64	0.99	1.28	1.13	0.59	0.88	0.90	1.02	1.00	0.53	0.70	0.17	0.14	0.20
O3'	1.29	1.43	1.30	1.32	1.20	1.28	0.98	0.94	1.01	0.82	1.24	1.62	1.43	0.74	1.11	1.16	1.30	1.25	0.63	0.86	0.14	0.10	0.21
O4'	0.90	0.81	1.05	1.05	0.68	0.98	0.46	0.72	0.44	0.41	0.62	0.95	0.86	0.30	0.67	0.98	1.00	0.85	0.36	0.34	0.09	0.26	0.09
O5'	1.05	0.96	1.17	1.17	0.80	1.07	0.56	0.74	0.53	0.51	0.74	1.12	1.02	0.39	0.79	1.16	1.15	0.97	0.40	0.39	0.10	0.22	0.07
O6	0.57	0.30	0.82	0.69	0.28	0.59	0.12	0.46	0.10	0.16	0.16	0.36	0.38	0.10	0.34	0.88	0.53	0.48	0.28	0.19	0.24	0.31	0.24
OP1	1.09	1.01	1.19	1.18	0.84	1.07	0.58	0.71	0.55	0.53	0.77	1.19	1.07	0.41	0.82	1.22	1.18	0.99	0.39	0.41	0.13	0.24	0.09
OP2	0.90	0.74	1.04	1.01	0.63	0.88	0.43	0.57	0.41	0.41	0.54	0.88	0.82	0.35	0.64	1.11	0.98	0.80	0.28	0.37	0.16	0.31	0.15
P	0.99	0.86	1.12	1.11	0.72	0.99	0.48	0.67	0.45	0.45	0.64	1.02	0.93	0.35	0.72	1.16	1.09	0.90	0.34	0.35	0.12	0.28	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.17	0.03	0.17	0.27	0.18
C2	0.04	0.00	0.17	0.13	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.14	0.16	0.20	0.03	0.20	0.27	0.22
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.08	0.02	0.04	0.14	0.07	0.12	0.13	0.21	0.17	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.31	0.05	0.37	0.50	0.38
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.15	0.01	0.20	0.02	0.20	0.20	0.17	0.11	0.11	0.22	0.14	0.02	0.01	0.02	0.09	0.22	0.12	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.08	0.15	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.09	0.18	0.02	0.18	0.27	0.21
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.12	0.06	0.11	0.07	0.10	0.05	0.20	0.03	0.01	0.02	0.07	0.08	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.08	0.06	0.17	0.02	0.19	0.28	0.22
C5'	0.07	0.16	0.14	0.02	0.12	0.01	0.12	0.00	0.14	0.10	0.15	0.18	0.14	0.12	0.08	0.06	0.16	0.03	0.01	0.14	0.07	0.04	0.02
C6	0.03	0.02	0.07	0.20	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.17	0.07	0.09	0.19	0.01	0.21	0.29	0.23
C8	0.01	0.01	0.12	0.20	0.01	0.12	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.24	0.13	0.07	0.14	0.04	0.16	0.27	0.18
N1	0.03	0.01	0.13	0.17	0.02	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.07	0.13	0.19	0.02	0.21	0.28	0.23
N2	0.05	0.01	0.21	0.11	0.02	0.11	0.02	0.18	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.20	0.19	0.21	0.04	0.21	0.27	0.23
N3	0.03	0.01	0.17	0.11	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.15	0.19	0.02	0.19	0.27	0.21
N7	0.01	0.01	0.08	0.22	0.01	0.10	0.00	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.25	0.15	0.05	0.16	0.04	0.19	0.28	0.21
N9	0.01	0.02	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.04	0.03	0.16	0.03	0.16	0.27	0.19
O2'	0.03	0.12	0.00	0.02	0.10	0.20	0.18	0.06	0.17	0.24	0.12	0.18	0.12	0.25	0.12	0.00	0.05	0.15	0.22	0.21	0.28	0.57	0.33
O3'	0.17	0.14	0.01	0.01	0.06	0.03	0.08	0.16	0.07	0.13	0.07	0.20	0.15	0.15	0.04	0.05	0.00	0.12	0.20	0.11	0.20	0.10	0.17
O4'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.09	0.01	0.06	0.03	0.09	0.07	0.13	0.19	0.15	0.05	0.03	0.15	0.12	0.00	0.12	0.08	0.08	0.15	0.08
O5'	0.17	0.20	0.31	0.09	0.18	0.02	0.17	0.01	0.19	0.14	0.19	0.21	0.19	0.16	0.16	0.22	0.20	0.12	0.00	0.19	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.03	0.05	0.22	0.02	0.07	0.02	0.14	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.21	0.11	0.08	0.19	0.00	0.23	0.30	0.25
OP1	0.17	0.20	0.37	0.12	0.18	0.08	0.19	0.07	0.21	0.16	0.21	0.21	0.19	0.19	0.16	0.28	0.20	0.08	0.02	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.27	0.50	0.10	0.27	0.07	0.28	0.04	0.29	0.27	0.28	0.27	0.27	0.28	0.27	0.57	0.10	0.15	0.02	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.22	0.38	0.07	0.21	0.02	0.22	0.02	0.23	0.18	0.23	0.23	0.21	0.21	0.19	0.33	0.17	0.08	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00