Doublet Group distance statistics: 51378

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
P	B	0, 0.000, 0.231, 0.461, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.231 std_dev=0.231
OP1	B	0, 0.000, 0.370, 0.740, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.370 std_dev=0.370
O5'	B	0, 0.000, 0.420, 0.840, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.420 std_dev=0.420
C5'	B	0, 0.000, 0.453, 0.906, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.453 std_dev=0.453
O4'	A	0, 0.000, 0.457, 0.913, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.457 std_dev=0.457
C4'	A	0, 0.000, 0.505, 1.009, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.505 std_dev=0.505
C2'	A	0, 0.000, 0.548, 1.097, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.548 std_dev=0.548
O4'	B	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
OP2	B	0, 0.000, 0.603, 1.207, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.603 std_dev=0.603
C3'	A	0, 0.000, 0.802, 1.605, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.802 std_dev=0.802
O2'	A	0, 0.000, 0.818, 1.635, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.818 std_dev=0.818
OP2	A	0, 0.000, 0.850, 1.700, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.850 std_dev=0.850
O5'	A	0, 0.000, 0.909, 1.817, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.909 std_dev=0.909
P	A	0, 0.000, 0.980, 1.960, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.980 std_dev=0.980
C5'	A	0, 0.000, 1.116, 2.232, 2.232 max_d=2.232 avg_d=1.116 std_dev=1.116
C4'	B	0, 0.000, 1.139, 2.278, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.139 std_dev=1.139
O3'	A	0, 0.000, 1.150, 2.300, 2.300 max_d=2.300 avg_d=1.150 std_dev=1.150
C2	B	0, 0.000, 1.325, 2.649, 2.649 max_d=2.649 avg_d=1.325 std_dev=1.325
N3	B	0, 0.000, 1.335, 2.669, 2.669 max_d=2.669 avg_d=1.335 std_dev=1.335
C1'	B	0, 0.000, 1.391, 2.782, 2.782 max_d=2.782 avg_d=1.391 std_dev=1.391
N2	B	0, 0.000, 1.549, 3.098, 3.098 max_d=3.098 avg_d=1.549 std_dev=1.549
OP1	A	0, 0.000, 1.651, 3.302, 3.302 max_d=3.302 avg_d=1.651 std_dev=1.651
C4	B	0, 0.000, 1.703, 3.406, 3.406 max_d=3.406 avg_d=1.703 std_dev=1.703
N9	B	0, 0.000, 1.793, 3.586, 3.586 max_d=3.586 avg_d=1.793 std_dev=1.793
N1	B	0, 0.000, 1.843, 3.687, 3.687 max_d=3.687 avg_d=1.843 std_dev=1.843
C2'	B	0, 0.000, 2.285, 4.569, 4.569 max_d=4.569 avg_d=2.285 std_dev=2.285
C3'	B	0, 0.000, 2.379, 4.758, 4.758 max_d=4.758 avg_d=2.379 std_dev=2.379
O2'	B	0, 0.000, 2.535, 5.070, 5.070 max_d=5.070 avg_d=2.535 std_dev=2.535
C5	B	0, 0.000, 2.617, 5.235, 5.235 max_d=5.235 avg_d=2.617 std_dev=2.617
C6	B	0, 0.000, 2.766, 5.532, 5.532 max_d=5.532 avg_d=2.766 std_dev=2.766
C8	B	0, 0.000, 2.788, 5.576, 5.576 max_d=5.576 avg_d=2.788 std_dev=2.788
O3'	B	0, 0.000, 3.273, 6.545, 6.545 max_d=6.545 avg_d=3.273 std_dev=3.273
N7	B	0, 0.000, 3.396, 6.793, 6.793 max_d=6.793 avg_d=3.396 std_dev=3.396
O6	B	0, 0.000, 3.666, 7.332, 7.332 max_d=7.332 avg_d=3.666 std_dev=3.666

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.01	0.28	0.55	0.17
C2	0.00	0.00	0.12	0.14	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.04	0.18	0.00	0.59	0.40	0.19
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.12	0.06	0.16	0.13	0.11	0.04	0.00	0.03	0.02	0.22	0.03	0.10	0.29	0.00
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.01	0.07	0.27	0.05	0.23	0.15	0.25	0.11	0.00	0.01	0.01	0.28	0.11	0.08	0.06	0.14
C4	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.03	0.25	0.00	0.47	0.40	0.14
C4'	0.01	0.11	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.08	0.13	0.10	0.06	0.02	0.11	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.38	0.09
C5	0.00	0.01	0.04	0.12	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.15	0.05	0.34	0.01	0.49	0.30	0.08
C5'	0.04	0.23	0.01	0.01	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.09	0.19	0.27	0.20	0.04	0.02	0.09	0.07	0.03	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00
C6	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.06	0.32	0.00	0.57	0.26	0.11
C8	0.02	0.01	0.12	0.27	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.28	0.04	0.41	0.01	0.31	0.35	0.02
N1	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.09	0.02	0.05	0.25	0.00	0.61	0.33	0.16
N2	0.01	0.00	0.16	0.23	0.01	0.13	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.24	0.03	0.14	0.00	0.61	0.42	0.22
N3	0.01	0.00	0.13	0.15	0.01	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.16	0.00	0.52	0.44	0.19
N7	0.01	0.01	0.11	0.25	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.05	0.43	0.01	0.39	0.23	0.00
N9	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.03	0.27	0.01	0.36	0.45	0.11
O2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.11	0.03	0.09	0.05	0.02	0.09	0.13	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.17	0.04	0.00	0.37	0.01
O3'	0.01	0.13	0.03	0.01	0.04	0.03	0.15	0.07	0.11	0.28	0.02	0.24	0.13	0.28	0.12	0.02	0.00	0.02	0.24	0.16	0.28	0.05	0.22
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.08	0.02	0.00	0.01	0.06	0.29	0.66	0.25
O5'	0.12	0.18	0.22	0.28	0.25	0.00	0.34	0.00	0.32	0.41	0.25	0.14	0.16	0.43	0.27	0.17	0.24	0.01	0.00	0.35	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.02	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.16	0.06	0.35	0.00	0.57	0.18	0.08
OP1	0.28	0.59	0.10	0.08	0.47	0.06	0.49	0.00	0.57	0.31	0.61	0.61	0.52	0.39	0.36	0.00	0.28	0.29	0.01	0.57	0.00	0.00	0.00
OP2	0.55	0.40	0.29	0.06	0.40	0.38	0.30	0.19	0.26	0.35	0.33	0.42	0.44	0.23	0.45	0.37	0.05	0.66	0.02	0.18	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.19	0.00	0.14	0.14	0.09	0.08	0.00	0.11	0.02	0.16	0.22	0.19	0.00	0.11	0.01	0.22	0.25	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.50	0.35	0.02	0.61	0.03	0.85	0.17	0.90	0.86	0.71	0.36	0.42	1.01	0.59	0.04	0.80	0.15	0.24	1.06	0.09	0.12	0.01
C2	0.05	0.39	0.08	0.48	0.36	0.19	0.49	0.06	0.57	0.37	0.51	0.35	0.30	0.51	0.26	0.38	1.20	0.06	0.19	0.66	0.01	0.11	0.03
C2'	0.08	0.24	0.05	0.28	0.34	0.17	0.55	0.07	0.59	0.55	0.42	0.11	0.17	0.69	0.32	0.26	1.07	0.01	0.13	0.73	0.07	0.22	0.03
C3'	0.25	0.33	0.27	0.04	0.43	0.01	0.60	0.19	0.62	0.62	0.47	0.22	0.29	0.72	0.43	0.01	0.78	0.15	0.18	0.73	0.07	0.25	0.02
C4	0.27	0.49	0.31	0.04	0.53	0.02	0.69	0.16	0.74	0.65	0.63	0.42	0.42	0.77	0.48	0.00	0.76	0.15	0.22	0.84	0.11	0.13	0.01
C4'	0.39	0.50	0.48	0.13	0.62	0.06	0.83	0.20	0.86	0.85	0.69	0.37	0.45	0.98	0.62	0.23	0.60	0.20	0.19	1.01	0.18	0.27	0.08
C5	0.36	0.55	0.50	0.21	0.56	0.12	0.65	0.21	0.69	0.59	0.64	0.51	0.50	0.68	0.51	0.21	0.41	0.20	0.23	0.75	0.16	0.12	0.01
C5'	0.46	0.54	0.64	0.29	0.64	0.13	0.80	0.18	0.82	0.83	0.68	0.43	0.50	0.92	0.64	0.45	0.36	0.22	0.10	0.93	0.35	0.45	0.23
C6	0.31	0.55	0.42	0.15	0.49	0.13	0.52	0.20	0.57	0.40	0.58	0.56	0.50	0.48	0.41	0.14	0.39	0.19	0.22	0.59	0.16	0.10	0.00
C8	0.46	0.59	0.65	0.36	0.66	0.15	0.81	0.23	0.83	0.80	0.72	0.51	0.54	0.90	0.64	0.38	0.27	0.23	0.23	0.93	0.17	0.13	0.01
N1	0.13	0.46	0.09	0.26	0.38	0.06	0.44	0.10	0.51	0.28	0.51	0.46	0.39	0.39	0.27	0.20	0.86	0.11	0.20	0.55	0.07	0.10	0.03
N2	0.12	0.28	0.37	0.79	0.22	0.33	0.37	0.03	0.47	0.21	0.41	0.25	0.17	0.38	0.10	0.65	1.52	0.03	0.14	0.57	0.06	0.10	0.04
N3	0.13	0.41	0.05	0.35	0.44	0.15	0.63	0.10	0.69	0.56	0.57	0.33	0.33	0.71	0.37	0.27	1.12	0.09	0.21	0.81	0.04	0.12	0.03
N7	0.48	0.61	0.72	0.47	0.64	0.22	0.73	0.25	0.76	0.70	0.69	0.56	0.57	0.77	0.61	0.45	0.08	0.25	0.23	0.82	0.19	0.12	0.02
N9	0.34	0.52	0.43	0.09	0.60	0.03	0.79	0.19	0.83	0.78	0.69	0.42	0.46	0.91	0.57	0.13	0.63	0.17	0.23	0.95	0.13	0.13	0.00
O2'	0.13	0.05	0.23	0.58	0.19	0.39	0.48	0.07	0.52	0.48	0.30	0.11	0.03	0.66	0.17	0.59	1.43	0.16	0.06	0.72	0.07	0.21	0.05
O3'	0.15	0.21	0.13	0.16	0.32	0.04	0.50	0.17	0.51	0.53	0.36	0.09	0.17	0.63	0.33	0.15	0.92	0.10	0.17	0.63	0.00	0.24	0.01
O4'	0.46	0.62	0.58	0.20	0.74	0.08	0.98	0.22	1.02	1.00	0.83	0.48	0.55	1.15	0.73	0.31	0.54	0.24	0.24	1.18	0.19	0.20	0.05
O5'	0.92	0.97	1.13	0.84	1.07	0.61	1.21	0.64	1.22	1.24	1.10	0.88	0.94	1.32	1.07	0.93	0.22	0.67	0.56	1.32	0.12	0.07	0.26
O6	0.40	0.60	0.59	0.42	0.49	0.30	0.45	0.26	0.50	0.29	0.57	0.66	0.57	0.33	0.40	0.33	0.03	0.25	0.21	0.47	0.22	0.08	0.01
OP1	0.21	0.24	0.53	0.24	0.29	0.11	0.36	0.20	0.37	0.37	0.31	0.19	0.22	0.42	0.29	0.44	0.23	0.12	0.35	0.43	0.86	0.94	0.73
OP2	0.49	0.51	0.80	0.59	0.58	0.20	0.66	0.13	0.67	0.69	0.58	0.44	0.49	0.73	0.58	0.64	0.12	0.19	0.04	0.72	0.40	0.38	0.22
P	0.67	0.70	0.97	0.69	0.78	0.34	0.89	0.28	0.90	0.91	0.80	0.63	0.68	0.97	0.78	0.82	0.17	0.35	0.17	0.97	0.33	0.35	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.03	0.00	0.05	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.41	0.24	0.01	0.18	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.38	0.00	0.37	0.40	0.00	0.45	0.68	0.54
C2'	0.00	0.41	0.00	0.00	0.20	0.00	0.09	0.18	0.18	0.22	0.32	0.49	0.39	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.13	0.09	0.13	0.01
C3'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.20	0.00	0.24	0.01	0.28	0.16	0.28	0.23	0.19	0.22	0.14	0.02	0.00	0.01	0.32	0.29	0.31	0.32	0.18
C4	0.00	0.01	0.20	0.20	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.20	0.13	0.00	0.12	0.16	0.14
C4'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.06	0.14	0.13	0.24	0.18	0.10	0.02	0.24	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.18	0.16
C5	0.00	0.00	0.09	0.24	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.09	0.01	0.01	0.02	0.17	0.10
C5'	0.08	0.35	0.18	0.01	0.22	0.00	0.15	0.00	0.22	0.06	0.30	0.41	0.32	0.01	0.09	0.06	0.19	0.00	0.00	0.19	0.13	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.18	0.28	0.00	0.06	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.17	0.11	0.00	0.11	0.01	0.04
C8	0.00	0.00	0.22	0.16	0.00	0.14	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.20	0.39	0.01	0.40	0.69	0.55
N1	0.01	0.00	0.32	0.28	0.01	0.13	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.06	0.28	0.29	0.00	0.33	0.41	0.34
N2	0.02	0.01	0.49	0.23	0.01	0.24	0.01	0.41	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.55	0.02	0.43	0.53	0.01	0.62	0.98	0.76
N3	0.01	0.01	0.39	0.19	0.00	0.18	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.37	0.06	0.36	0.36	0.00	0.38	0.61	0.49
N7	0.00	0.01	0.11	0.22	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.38	0.07	0.10	0.29	0.01	0.33	0.67	0.50
N9	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.07	0.01	0.09	0.01	0.10	0.14	0.11
O2'	0.00	0.38	0.00	0.02	0.07	0.24	0.12	0.06	0.01	0.45	0.21	0.55	0.37	0.38	0.15	0.00	0.02	0.15	0.20	0.10	0.28	0.18	0.13
O3'	0.24	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.19	0.09	0.00	0.06	0.02	0.06	0.07	0.07	0.02	0.00	0.18	0.37	0.13	0.53	0.31	0.23
O4'	0.00	0.37	0.01	0.01	0.20	0.00	0.09	0.00	0.17	0.20	0.28	0.43	0.36	0.10	0.01	0.15	0.18	0.00	0.04	0.13	0.01	0.27	0.15
O5'	0.03	0.40	0.07	0.32	0.13	0.01	0.01	0.00	0.11	0.39	0.29	0.53	0.36	0.29	0.09	0.20	0.37	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00
O6	0.00	0.00	0.13	0.29	0.00	0.03	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.13	0.04	0.00	0.03	0.18	0.09
OP1	0.05	0.45	0.09	0.31	0.12	0.04	0.02	0.13	0.11	0.40	0.33	0.62	0.38	0.33	0.10	0.28	0.53	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.68	0.13	0.32	0.16	0.18	0.17	0.01	0.01	0.69	0.41	0.98	0.61	0.67	0.14	0.18	0.31	0.27	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.54	0.01	0.18	0.14	0.16	0.10	0.00	0.04	0.55	0.34	0.76	0.49	0.50	0.11	0.13	0.23	0.15	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00