Doublet Group distance statistics: 51379

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C6	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.000, 0.033, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C2	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O2'	A	0, 0.000, 0.041, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.041
N2	A	0, 0.000, 0.045, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.045 std_dev=0.045
C1'	A	0, 0.000, 0.046, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.046 std_dev=0.046
O6	A	0, 0.000, 0.061, 0.122, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.061 std_dev=0.061
C3'	A	0, 0.000, 0.077, 0.153, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.077 std_dev=0.077
O4'	A	0, 0.000, 0.094, 0.189, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.094 std_dev=0.094
C4'	A	0, 0.000, 0.097, 0.194, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.097 std_dev=0.097
O3'	A	0, 0.000, 0.104, 0.209, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.104 std_dev=0.104
OP1	B	0, 0.000, 0.161, 0.322, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.161 std_dev=0.161
OP2	A	0, 0.000, 0.165, 0.330, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.165 std_dev=0.165
C5'	A	0, 0.000, 0.183, 0.366, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.183 std_dev=0.183
P	A	0, 0.000, 0.190, 0.381, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.190 std_dev=0.190
OP1	A	0, 0.000, 0.191, 0.383, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.191 std_dev=0.191
O5'	A	0, 0.000, 0.244, 0.487, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.244 std_dev=0.244
P	B	0, 0.000, 0.371, 0.743, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.371 std_dev=0.371
OP2	B	0, 0.000, 0.419, 0.839, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.419 std_dev=0.419
C2'	B	0, 0.000, 0.594, 1.187, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.594 std_dev=0.594
O3'	B	0, 0.000, 0.600, 1.199, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.600 std_dev=0.600
C3'	B	0, 0.000, 0.606, 1.211, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.606 std_dev=0.606
C1'	B	0, 0.000, 0.612, 1.223, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.612 std_dev=0.612
O2'	B	0, 0.000, 0.613, 1.225, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.613 std_dev=0.613
O4'	B	0, 0.000, 0.619, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.619 std_dev=0.619
C8	B	0, 0.000, 0.622, 1.244, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.622 std_dev=0.622
C4'	B	0, 0.000, 0.633, 1.266, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.633 std_dev=0.633
O5'	B	0, 0.000, 0.634, 1.267, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.634 std_dev=0.634
N9	B	0, 0.000, 0.636, 1.272, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.636 std_dev=0.636
N7	B	0, 0.000, 0.663, 1.326, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.663 std_dev=0.663
C5'	B	0, 0.000, 0.684, 1.367, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.684 std_dev=0.684
C4	B	0, 0.000, 0.686, 1.373, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.686 std_dev=0.686
C5	B	0, 0.000, 0.701, 1.401, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.701 std_dev=0.701
N3	B	0, 0.000, 0.720, 1.440, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.720 std_dev=0.720
C6	B	0, 0.000, 0.753, 1.506, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.753 std_dev=0.753
C2	B	0, 0.000, 0.765, 1.530, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.765 std_dev=0.765
N1	B	0, 0.000, 0.780, 1.560, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.780 std_dev=0.780
O6	B	0, 0.000, 0.781, 1.562, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.781 std_dev=0.781
N2	B	0, 0.000, 0.804, 1.608, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.804 std_dev=0.804

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.00	0.05	0.05	0.05	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.07	0.03	0.03
C2	0.05	0.00	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.11	0.05	0.12	0.11	0.10
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.05	0.07	0.05	0.03
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.05	0.03
C4	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.10	0.04	0.10	0.09	0.08
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.00
C5	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.11	0.02	0.11	0.10	0.10
C5'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.08	0.07	0.07	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.01
C6	0.05	0.02	0.04	0.04	0.03	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04	0.11	0.02	0.11	0.11	0.11
C8	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.12	0.02	0.12	0.09	0.10
N1	0.05	0.01	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.11	0.04	0.12	0.11	0.10
N2	0.05	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.05	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.06	0.10	0.07	0.12	0.12	0.10
N3	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.10	0.03	0.11	0.09	0.09
N7	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.11	0.10	0.11
N9	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.04	0.10	0.07	0.07
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.08	0.05	0.03
O3'	0.04	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.05	0.00	0.02	0.04	0.05	0.05	0.03	0.00
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02
O5'	0.05	0.11	0.02	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.11	0.12	0.11	0.10	0.10	0.11	0.09	0.02	0.04	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00
O6	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.02	0.08	0.02	0.02	0.04	0.07	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04	0.11	0.00	0.11	0.10	0.10
OP1	0.07	0.12	0.07	0.08	0.10	0.06	0.11	0.05	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.10	0.08	0.05	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.11	0.05	0.05	0.09	0.01	0.10	0.01	0.11	0.09	0.11	0.12	0.09	0.10	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.10	0.03	0.03	0.08	0.00	0.10	0.01	0.11	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.05	0.19	0.21	0.04	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.05	0.26	0.24	0.03	0.08	0.05	0.06	0.03	0.01
C2	0.09	0.03	0.19	0.27	0.00	0.17	0.08	0.13	0.09	0.08	0.04	0.07	0.05	0.13	0.01	0.22	0.30	0.06	0.23	0.14	0.01	0.05	0.10
C2'	0.09	0.06	0.18	0.20	0.04	0.09	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.07	0.03	0.05	0.25	0.24	0.03	0.09	0.05	0.05	0.00	0.02
C3'	0.05	0.02	0.13	0.14	0.00	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.01	0.20	0.18	0.02	0.02	0.07	0.06	0.04	0.02
C4	0.07	0.02	0.17	0.21	0.00	0.09	0.06	0.01	0.07	0.05	0.03	0.05	0.04	0.09	0.01	0.23	0.26	0.01	0.09	0.11	0.04	0.03	0.02
C4'	0.05	0.03	0.13	0.14	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.02	0.21	0.18	0.02	0.02	0.06	0.07	0.06	0.02
C5	0.02	0.02	0.11	0.16	0.05	0.02	0.10	0.10	0.11	0.10	0.07	0.00	0.01	0.14	0.04	0.19	0.23	0.05	0.01	0.14	0.06	0.08	0.02
C5'	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.06	0.08	0.14	0.09	0.08	0.06	0.02	0.03	0.10	0.05	0.13	0.10	0.10	0.07	0.11	0.11	0.12	0.08
C6	0.01	0.06	0.09	0.16	0.09	0.01	0.15	0.13	0.16	0.16	0.11	0.03	0.04	0.19	0.09	0.16	0.24	0.07	0.04	0.20	0.06	0.10	0.03
C8	0.04	0.01	0.13	0.14	0.01	0.01	0.05	0.10	0.06	0.05	0.03	0.03	0.02	0.07	0.00	0.21	0.20	0.03	0.02	0.08	0.06	0.08	0.03
N1	0.03	0.03	0.13	0.22	0.07	0.11	0.14	0.02	0.15	0.14	0.10	0.01	0.01	0.19	0.06	0.18	0.28	0.01	0.13	0.20	0.02	0.02	0.05
N2	0.09	0.03	0.18	0.27	0.00	0.20	0.08	0.20	0.10	0.08	0.04	0.07	0.06	0.14	0.01	0.21	0.29	0.08	0.28	0.15	0.02	0.10	0.13
N3	0.11	0.06	0.21	0.27	0.04	0.17	0.03	0.12	0.05	0.03	0.00	0.09	0.08	0.07	0.04	0.26	0.30	0.07	0.20	0.09	0.00	0.04	0.09
N7	0.00	0.03	0.08	0.10	0.05	0.04	0.09	0.16	0.10	0.10	0.07	0.01	0.02	0.12	0.05	0.18	0.18	0.08	0.08	0.13	0.07	0.11	0.05
N9	0.07	0.03	0.17	0.19	0.02	0.06	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.05	0.06	0.02	0.24	0.24	0.00	0.05	0.07	0.06	0.05	0.00
O2'	0.14	0.11	0.23	0.25	0.09	0.15	0.05	0.11	0.04	0.05	0.07	0.13	0.12	0.02	0.10	0.28	0.28	0.08	0.16	0.00	0.02	0.05	0.06
O3'	0.04	0.01	0.12	0.14	0.00	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.02	0.03	0.02	0.07	0.00	0.19	0.18	0.03	0.02	0.08	0.06	0.03	0.02
O4'	0.08	0.04	0.16	0.17	0.03	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.05	0.04	0.03	0.24	0.22	0.01	0.05	0.06	0.07	0.06	0.01
O5'	0.10	0.12	0.03	0.03	0.13	0.15	0.16	0.24	0.17	0.17	0.15	0.10	0.11	0.18	0.13	0.06	0.03	0.18	0.16	0.19	0.15	0.19	0.14
O6	0.09	0.13	0.01	0.08	0.16	0.10	0.22	0.29	0.22	0.23	0.18	0.09	0.11	0.26	0.16	0.10	0.19	0.16	0.24	0.26	0.11	0.18	0.12
OP1	0.11	0.12	0.04	0.07	0.13	0.18	0.15	0.28	0.15	0.15	0.14	0.11	0.12	0.16	0.13	0.06	0.01	0.19	0.21	0.17	0.17	0.21	0.18
OP2	0.13	0.15	0.07	0.10	0.16	0.22	0.17	0.33	0.18	0.17	0.16	0.14	0.14	0.18	0.15	0.04	0.03	0.23	0.27	0.19	0.19	0.25	0.21
P	0.11	0.12	0.05	0.07	0.13	0.18	0.15	0.28	0.15	0.15	0.14	0.11	0.12	0.16	0.13	0.06	0.01	0.19	0.21	0.16	0.17	0.22	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.17	0.06
C2	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.05	0.00	0.10	0.12	0.05
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.11	0.02
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.09
C4	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.15	0.20	0.10
C4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.09	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03
C5	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.25	0.14
C5'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.11	0.14	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.22	0.23	0.13
C8	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.00	0.23	0.29	0.16
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.00	0.16	0.17	0.09
N2	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.02	0.09	0.07	0.00	0.05	0.06	0.01
N3	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.04	0.00	0.08	0.13	0.04
N7	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.26	0.29	0.18
N9	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.23	0.11
O2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.09	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.05	0.10	0.04
O3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.12
O4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.09	0.07	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.10	0.17	0.08
O5'	0.01	0.05	0.04	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.07	0.04	0.03	0.01	0.05	0.05	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.25	0.25	0.16
OP1	0.08	0.10	0.01	0.10	0.15	0.02	0.21	0.04	0.22	0.23	0.16	0.05	0.08	0.26	0.15	0.05	0.16	0.10	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.12	0.11	0.02	0.20	0.03	0.25	0.01	0.23	0.29	0.17	0.06	0.13	0.29	0.23	0.10	0.01	0.17	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.05	0.02	0.09	0.10	0.03	0.14	0.00	0.13	0.16	0.09	0.01	0.04	0.18	0.11	0.04	0.12	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00