Doublet Group distance statistics: 51380

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N3	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C4	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
N2	A	0, 0.000, 0.088, 0.177, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.088 std_dev=0.088
OP1	B	0, 0.000, 0.342, 0.684, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.342 std_dev=0.342
O4'	A	0, 0.000, 0.431, 0.861, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.431 std_dev=0.431
P	B	0, 0.000, 0.520, 1.039, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.520 std_dev=0.520
OP2	B	0, 0.000, 0.546, 1.093, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.546 std_dev=0.546
C2'	A	0, 0.000, 0.546, 1.093, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.546 std_dev=0.546
C4'	A	0, 0.000, 0.691, 1.382, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.691 std_dev=0.691
O2'	A	0, 0.000, 0.738, 1.475, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.738 std_dev=0.738
C3'	A	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
C5'	A	0, 0.000, 1.165, 2.330, 2.330 max_d=2.330 avg_d=1.165 std_dev=1.165
O3'	A	0, 0.000, 1.254, 2.508, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.254 std_dev=1.254
O5'	A	0, 0.000, 1.447, 2.893, 2.893 max_d=2.893 avg_d=1.447 std_dev=1.447
OP1	A	0, 0.000, 1.545, 3.091, 3.091 max_d=3.091 avg_d=1.545 std_dev=1.545
P	A	0, 0.000, 1.665, 3.329, 3.329 max_d=3.329 avg_d=1.665 std_dev=1.665
O5'	B	0, 0.000, 1.846, 3.693, 3.693 max_d=3.693 avg_d=1.846 std_dev=1.846
C5'	B	0, 0.000, 1.986, 3.972, 3.972 max_d=3.972 avg_d=1.986 std_dev=1.986
OP2	A	0, 0.000, 2.064, 4.128, 4.128 max_d=4.128 avg_d=2.064 std_dev=2.064
C4'	B	0, 0.000, 2.743, 5.486, 5.486 max_d=5.486 avg_d=2.743 std_dev=2.743
O3'	B	0, 0.000, 2.824, 5.647, 5.647 max_d=5.647 avg_d=2.824 std_dev=2.824
C3'	B	0, 0.000, 3.302, 6.604, 6.604 max_d=6.604 avg_d=3.302 std_dev=3.302
O4'	B	0, 0.000, 3.848, 7.696, 7.696 max_d=7.696 avg_d=3.848 std_dev=3.848
O2'	B	0, 0.000, 4.051, 8.102, 8.102 max_d=8.102 avg_d=4.051 std_dev=4.051
C2'	B	0, 0.000, 4.308, 8.617, 8.617 max_d=8.617 avg_d=4.308 std_dev=4.308
C1'	B	0, 0.000, 4.755, 9.509, 9.509 max_d=9.509 avg_d=4.755 std_dev=4.755
N9	B	0, 0.000, 5.747, 11.493, 11.493 max_d=11.493 avg_d=5.747 std_dev=5.747
C8	B	0, 0.000, 6.002, 12.003, 12.003 max_d=12.003 avg_d=6.002 std_dev=6.002
C4	B	0, 0.000, 6.836, 13.673, 13.673 max_d=13.673 avg_d=6.836 std_dev=6.836
N7	B	0, 0.000, 7.089, 14.179, 14.179 max_d=14.179 avg_d=7.089 std_dev=7.089
N3	B	0, 0.000, 7.259, 14.518, 14.518 max_d=14.518 avg_d=7.259 std_dev=7.259
C5	B	0, 0.000, 7.562, 15.124, 15.124 max_d=15.124 avg_d=7.562 std_dev=7.562
C2	B	0, 0.000, 8.428, 16.856, 16.856 max_d=16.856 avg_d=8.428 std_dev=8.428
C6	B	0, 0.000, 8.763, 17.526, 17.526 max_d=17.526 avg_d=8.763 std_dev=8.763
N1	B	0, 0.000, 9.094, 18.189, 18.189 max_d=18.189 avg_d=9.094 std_dev=9.094
N2	B	0, 0.000, 9.156, 18.313, 18.313 max_d=18.313 avg_d=9.156 std_dev=9.156
O6	B	0, 0.000, 9.588, 19.175, 19.175 max_d=19.175 avg_d=9.588 std_dev=9.588

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.47	0.10	0.10
C2	0.03	0.00	0.26	0.24	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.30	0.36	0.04	0.04	0.01	0.68	0.33	0.03
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.12	0.00	0.03	0.01	0.09	0.14	0.18	0.35	0.27	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.28	0.07	0.07
C3'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.23	0.14	0.34	0.24	0.18	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.10	0.08	0.05
C4	0.01	0.01	0.12	0.08	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.13	0.04	0.11	0.00	0.66	0.30	0.01
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.19	0.02	0.16	0.10	0.17	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.06	0.29	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.06	0.24	0.00	0.66	0.55	0.11
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.17	0.00	0.16	0.25	0.07	0.09	0.04	0.27	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.21	0.18	0.37	0.01
C6	0.00	0.01	0.09	0.02	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.06	0.23	0.00	0.67	0.65	0.13
C8	0.03	0.01	0.14	0.23	0.00	0.19	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.24	0.04	0.33	0.01	0.61	0.41	0.11
N1	0.01	0.01	0.18	0.14	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.23	0.24	0.06	0.14	0.00	0.69	0.52	0.06
N2	0.06	0.00	0.35	0.34	0.00	0.16	0.02	0.09	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.41	0.51	0.01	0.04	0.03	0.70	0.26	0.08
N3	0.03	0.00	0.27	0.24	0.00	0.10	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.34	0.03	0.00	0.00	0.67	0.19	0.08
N7	0.02	0.01	0.09	0.18	0.00	0.17	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.19	0.05	0.36	0.01	0.63	0.65	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.13	0.01	0.61	0.17	0.03
O2'	0.01	0.30	0.00	0.01	0.13	0.01	0.07	0.00	0.13	0.09	0.23	0.41	0.28	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.16	0.19	0.05
O3'	0.01	0.36	0.02	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.08	0.24	0.24	0.51	0.34	0.19	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.16	0.10	0.00
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.06	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.07	0.42	0.28	0.13
O5'	0.03	0.04	0.01	0.04	0.11	0.02	0.24	0.00	0.23	0.33	0.14	0.04	0.00	0.36	0.13	0.01	0.05	0.01	0.00	0.30	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.07	0.30	0.00	0.65	0.81	0.20
OP1	0.47	0.68	0.28	0.10	0.66	0.06	0.66	0.18	0.67	0.61	0.69	0.70	0.67	0.63	0.61	0.16	0.16	0.42	0.02	0.65	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.33	0.07	0.08	0.30	0.29	0.55	0.37	0.65	0.41	0.52	0.26	0.19	0.65	0.17	0.19	0.10	0.28	0.02	0.81	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.03	0.07	0.05	0.01	0.05	0.11	0.01	0.13	0.11	0.06	0.08	0.08	0.18	0.03	0.05	0.00	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	2.31	3.13	2.00	1.43	3.35	1.07	4.18	0.59	4.50	3.80	3.89	2.67	2.81	4.48	3.13	1.60	0.81	1.78	0.80	5.14	0.18	0.07	0.18
C2	1.94	2.17	1.75	1.41	2.64	1.01	3.25	0.66	3.24	3.35	2.70	1.70	2.06	3.71	2.65	1.26	0.84	1.57	0.88	3.57	0.17	0.18	0.21
C2'	2.37	3.48	1.95	1.31	3.55	1.04	4.40	0.53	4.83	3.84	4.26	3.07	3.08	4.59	3.22	1.55	0.61	1.84	0.74	5.54	0.39	0.11	0.04
C3'	2.20	3.28	1.73	1.09	3.33	0.89	4.16	0.40	4.60	3.64	4.05	2.89	2.88	4.37	3.03	1.37	0.37	1.71	0.67	5.31	0.39	0.13	0.04
C4	1.95	2.29	1.68	1.23	2.74	0.89	3.49	0.49	3.57	3.46	2.93	1.78	2.12	3.98	2.71	1.26	0.65	1.53	0.73	4.04	0.15	0.08	0.17
C4'	2.24	3.24	1.85	1.24	3.33	0.96	4.16	0.47	4.58	3.69	4.02	2.84	2.85	4.39	3.06	1.48	0.58	1.72	0.73	5.30	0.23	0.03	0.15
C5	1.56	1.58	1.29	0.91	2.15	0.62	2.86	0.27	2.85	3.04	2.18	1.03	1.49	3.45	2.24	0.92	0.39	1.21	0.53	3.29	0.12	0.02	0.13
C5'	2.11	2.97	1.71	1.11	3.12	0.88	3.92	0.41	4.30	3.54	3.74	2.56	2.62	4.20	2.89	1.36	0.46	1.63	0.72	5.00	0.13	0.10	0.22
C6	1.26	1.05	1.03	0.74	1.69	0.46	2.32	0.18	2.23	2.67	1.58	0.50	1.02	2.95	1.87	0.66	0.27	0.98	0.44	2.60	0.11	0.01	0.10
C8	1.78	2.03	1.47	0.99	2.51	0.71	3.29	0.29	3.39	3.28	2.71	1.49	1.87	3.80	2.50	1.12	0.43	1.36	0.56	3.95	0.11	0.01	0.14
N1	1.48	1.38	1.28	1.02	1.96	0.68	2.56	0.42	2.47	2.86	1.89	0.88	1.34	3.11	2.10	0.85	0.52	1.19	0.66	2.79	0.14	0.12	0.16
N2	2.09	2.37	1.97	1.70	2.76	1.21	3.28	0.89	3.27	3.32	2.83	1.96	2.26	3.61	2.75	1.44	1.13	1.71	1.04	3.52	0.15	0.29	0.28
N3	2.16	2.65	1.92	1.48	3.03	1.08	3.74	0.67	3.83	3.63	3.25	2.17	2.46	4.15	2.94	1.46	0.89	1.71	0.88	4.24	0.17	0.14	0.21
N7	1.48	1.46	1.19	0.78	2.05	0.53	2.78	0.16	2.78	2.95	2.09	0.90	1.38	3.37	2.14	0.86	0.27	1.12	0.43	3.28	0.09	0.02	0.11
N9	2.05	2.54	1.75	1.25	2.92	0.92	3.72	0.48	3.89	3.57	3.24	2.04	2.32	4.16	2.83	1.36	0.65	1.59	0.72	4.46	0.14	0.07	0.18
O2'	2.55	3.98	2.17	1.49	3.87	1.16	4.71	0.62	5.29	3.97	4.81	3.63	3.48	4.75	3.43	1.76	0.78	1.96	0.78	6.06	0.47	0.13	0.00
O3'	2.21	3.54	1.67	0.98	3.44	0.84	4.25	0.35	4.79	3.59	4.33	3.23	3.06	4.35	3.05	1.32	0.22	1.71	0.60	5.53	0.55	0.25	0.07
O4'	2.21	3.01	1.91	1.35	3.22	1.00	4.04	0.52	4.37	3.68	3.77	2.56	2.69	4.34	3.01	1.53	0.75	1.69	0.76	5.04	0.11	0.12	0.21
O5'	1.90	2.54	1.48	0.92	2.79	0.75	3.56	0.32	3.84	3.32	3.25	2.10	2.26	3.92	2.64	1.15	0.28	1.48	0.67	4.49	0.06	0.12	0.26
O6	0.82	0.34	0.62	0.38	1.07	0.15	1.66	0.08	1.51	2.14	0.84	0.23	0.37	2.33	1.33	0.30	0.01	0.59	0.18	1.86	0.07	0.08	0.03
OP1	0.89	1.34	0.50	0.07	1.65	0.23	2.41	0.68	2.66	2.26	2.05	0.88	1.10	2.81	1.57	0.24	0.63	0.46	0.33	3.31	0.86	0.80	0.63
OP2	2.07	2.31	1.69	1.21	2.75	1.06	3.50	0.70	3.64	3.48	2.99	1.80	2.15	3.98	2.75	1.37	0.63	1.72	1.05	4.23	0.53	0.65	0.77
P	1.61	2.05	1.22	0.68	2.38	0.52	3.14	0.11	3.36	3.00	2.75	1.59	1.83	3.54	2.30	0.92	0.10	1.21	0.48	3.99	0.09	0.03	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.07	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.02	0.27	0.18	0.04
C2	0.06	0.00	0.46	0.05	0.02	0.37	0.01	0.75	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.68	0.21	0.51	0.63	0.01	0.68	0.39	0.60
C2'	0.00	0.46	0.00	0.00	0.23	0.00	0.11	0.00	0.20	0.22	0.35	0.55	0.45	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.20	0.15	0.30	0.13	0.01
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.02	0.12	0.11	0.10
C4	0.03	0.02	0.23	0.02	0.00	0.17	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.29	0.09	0.27	0.03	0.00	0.24	0.23	0.00
C4'	0.01	0.37	0.00	0.00	0.17	0.00	0.07	0.00	0.16	0.20	0.29	0.46	0.34	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.11	0.30	0.17	0.15
C5	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.06	0.12	0.27	0.00	0.06	0.64	0.36
C5'	0.00	0.75	0.00	0.01	0.32	0.00	0.16	0.00	0.33	0.35	0.60	0.96	0.66	0.20	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.25	0.09	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.20	0.02	0.00	0.16	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.28	0.11	0.22	0.07	0.00	0.06	0.47	0.18
C8	0.02	0.02	0.22	0.00	0.00	0.20	0.00	0.35	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.29	0.06	0.28	0.88	0.01	0.48	1.16	0.91
N1	0.04	0.00	0.35	0.03	0.01	0.29	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.51	0.17	0.40	0.35	0.01	0.42	0.03	0.27
N2	0.07	0.00	0.55	0.06	0.02	0.46	0.02	0.96	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.86	0.26	0.62	0.99	0.02	0.99	0.82	0.99
N3	0.06	0.00	0.45	0.04	0.00	0.34	0.00	0.66	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.63	0.18	0.52	0.55	0.00	0.66	0.34	0.54
N7	0.01	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.17	0.02	0.14	0.77	0.01	0.47	1.18	0.87
N9	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.35	0.00	0.00	0.53	0.33
O2'	0.00	0.68	0.00	0.01	0.29	0.01	0.13	0.01	0.28	0.29	0.51	0.86	0.63	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.62	0.15	0.26
O3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.09	0.02	0.06	0.02	0.11	0.06	0.17	0.26	0.18	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.09	0.26	0.11	0.08
O4'	0.00	0.51	0.00	0.00	0.27	0.00	0.12	0.00	0.22	0.28	0.40	0.62	0.52	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.16	0.21	0.06	0.00
O5'	0.15	0.63	0.20	0.27	0.03	0.01	0.27	0.00	0.07	0.88	0.35	0.99	0.55	0.77	0.35	0.01	0.16	0.06	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.15	0.02	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.20	0.09	0.16	0.21	0.00	0.10	0.69	0.37
OP1	0.27	0.68	0.30	0.12	0.24	0.30	0.06	0.09	0.06	0.48	0.42	0.99	0.66	0.47	0.00	0.62	0.26	0.21	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.39	0.13	0.11	0.23	0.17	0.64	0.22	0.47	1.16	0.03	0.82	0.34	1.18	0.53	0.15	0.11	0.06	0.00	0.69	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.60	0.01	0.10	0.00	0.15	0.36	0.01	0.18	0.91	0.27	0.99	0.54	0.87	0.33	0.26	0.08	0.00	0.00	0.37	0.01	0.00	0.00