Doublet Group distance statistics: 51389

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.007, 0.026, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C5	A	0, -0.001, 0.023, 0.047, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.010, 0.035, 0.059, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.035 std_dev=0.025
C6	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.041 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.009, 0.038, 0.067, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.038 std_dev=0.029
O2	A	0, 0.020, 0.073, 0.126, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.073 std_dev=0.053
O4	A	0, 0.043, 0.148, 0.252, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.148 std_dev=0.104
C2'	A	0, -0.011, 0.336, 0.682, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.336 std_dev=0.347
O4'	A	0, 0.038, 0.437, 0.835, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.437 std_dev=0.398
N2	B	0, 0.230, 0.786, 1.342, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.786 std_dev=0.556
C3'	A	0, 0.213, 0.795, 1.376, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.795 std_dev=0.581
O2'	A	0, 0.245, 0.844, 1.442, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.844 std_dev=0.598
C2	B	0, 0.248, 0.861, 1.475, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.861 std_dev=0.614
N3	B	0, 0.239, 0.869, 1.498, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.869 std_dev=0.629
C4'	A	0, -0.020, 0.650, 1.320, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.650 std_dev=0.670
N1	B	0, 0.286, 0.996, 1.707, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.996 std_dev=0.710
C4	B	0, 0.270, 1.011, 1.753, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.011 std_dev=0.741
C6	B	0, 0.320, 1.140, 1.961, 1.895 max_d=1.895 avg_d=1.140 std_dev=0.820
C5	B	0, 0.311, 1.142, 1.972, 1.951 max_d=1.951 avg_d=1.142 std_dev=0.830
N9	B	0, 0.294, 1.143, 1.992, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.143 std_dev=0.849
C1'	B	0, 0.279, 1.170, 2.061, 2.159 max_d=2.159 avg_d=1.170 std_dev=0.891
C2'	B	0, 0.239, 1.147, 2.056, 2.222 max_d=2.222 avg_d=1.147 std_dev=0.908
O2'	B	0, 0.227, 1.148, 2.068, 2.253 max_d=2.253 avg_d=1.148 std_dev=0.920
O6	B	0, 0.359, 1.284, 2.208, 2.141 max_d=2.141 avg_d=1.284 std_dev=0.925
N7	B	0, 0.354, 1.311, 2.267, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.311 std_dev=0.957
C8	B	0, 0.343, 1.303, 2.263, 2.284 max_d=2.284 avg_d=1.303 std_dev=0.960
C3'	B	0, 0.262, 1.290, 2.318, 2.516 max_d=2.516 avg_d=1.290 std_dev=1.028
O3'	B	0, 0.218, 1.264, 2.310, 2.561 max_d=2.561 avg_d=1.264 std_dev=1.046
O4'	B	0, 0.345, 1.397, 2.449, 2.539 max_d=2.539 avg_d=1.397 std_dev=1.052
O3'	A	0, 0.430, 1.498, 2.566, 2.411 max_d=2.411 avg_d=1.498 std_dev=1.068
C4'	B	0, 0.331, 1.411, 2.491, 2.624 max_d=2.624 avg_d=1.411 std_dev=1.080
C5'	B	0, 0.366, 1.474, 2.582, 2.672 max_d=2.672 avg_d=1.474 std_dev=1.108
O5'	A	0, 0.513, 1.789, 3.066, 2.893 max_d=2.893 avg_d=1.789 std_dev=1.277
C5'	A	0, 0.246, 1.718, 3.190, 3.595 max_d=3.595 avg_d=1.718 std_dev=1.472
O5'	B	0, 0.641, 2.679, 4.717, 4.938 max_d=4.938 avg_d=2.679 std_dev=2.038
OP1	B	0, 0.835, 3.023, 5.211, 5.106 max_d=5.106 avg_d=3.023 std_dev=2.188
P	B	0, 0.820, 3.032, 5.244, 5.215 max_d=5.215 avg_d=3.032 std_dev=2.212
P	A	0, 0.952, 3.295, 5.638, 5.248 max_d=5.248 avg_d=3.295 std_dev=2.343
OP2	B	0, 0.904, 3.259, 5.613, 5.481 max_d=5.481 avg_d=3.259 std_dev=2.354
OP2	A	0, 0.952, 3.469, 5.986, 5.894 max_d=5.894 avg_d=3.469 std_dev=2.517
OP1	A	0, 1.287, 4.397, 7.506, 6.695 max_d=6.695 avg_d=4.397 std_dev=3.110

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.19	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.22	0.02	0.00	0.07	0.15	0.61	0.22
C2	0.00	0.00	0.10	0.03	0.02	0.04	0.02	0.34	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.25	0.00	0.07	0.26	0.10	0.50	0.10
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.15	0.24	0.17	0.03	0.07	0.19	0.01	0.03	0.06	0.03	0.26	0.58	0.85	0.56
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.09	0.01	0.15	0.04	0.16	0.06	0.05	0.08	0.02	0.00	0.09	0.02	0.33	0.33	0.48	0.35
C4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.00	0.11	0.01	0.44	0.03	0.02	0.00	0.02	0.21	0.10	0.01	0.03	0.46	0.08	0.40	0.10
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.11	0.00	0.13	0.02	0.12	0.07	0.08	0.02	0.14	0.02	0.11	0.01	0.03	0.24	0.31	0.09
C5	0.05	0.02	0.15	0.15	0.01	0.13	0.00	0.44	0.01	0.03	0.01	0.02	0.27	0.06	0.01	0.06	0.47	0.05	0.44	0.08
C5'	0.19	0.34	0.24	0.04	0.44	0.02	0.44	0.00	0.41	0.35	0.41	0.28	0.11	0.13	0.45	0.04	0.02	0.26	0.27	0.06
C6	0.04	0.01	0.17	0.16	0.03	0.12	0.01	0.41	0.00	0.01	0.04	0.01	0.25	0.05	0.03	0.07	0.37	0.06	0.54	0.08
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.07	0.03	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.01	0.01	0.26	0.09	0.54	0.11
N3	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.08	0.01	0.41	0.04	0.01	0.00	0.02	0.17	0.20	0.01	0.05	0.38	0.09	0.43	0.08
O2	0.01	0.01	0.19	0.08	0.02	0.02	0.02	0.28	0.01	0.01	0.02	0.00	0.28	0.35	0.01	0.11	0.18	0.13	0.52	0.13
O2'	0.04	0.15	0.01	0.02	0.21	0.14	0.27	0.11	0.25	0.12	0.17	0.28	0.00	0.03	0.23	0.09	0.36	0.77	0.98	0.70
O3'	0.22	0.25	0.03	0.00	0.10	0.02	0.06	0.13	0.05	0.14	0.20	0.35	0.03	0.00	0.09	0.20	0.30	0.16	0.37	0.24
O4	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.11	0.01	0.45	0.03	0.01	0.01	0.01	0.23	0.09	0.00	0.03	0.50	0.12	0.34	0.15
O4'	0.00	0.07	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.04	0.07	0.01	0.05	0.11	0.09	0.20	0.03	0.00	0.19	0.20	0.40	0.09
O5'	0.07	0.26	0.26	0.33	0.46	0.03	0.47	0.02	0.37	0.26	0.38	0.18	0.36	0.30	0.50	0.19	0.00	0.01	0.02	0.02
OP1	0.15	0.10	0.58	0.33	0.08	0.24	0.05	0.26	0.06	0.09	0.09	0.13	0.77	0.16	0.12	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.61	0.50	0.85	0.48	0.40	0.31	0.44	0.27	0.54	0.54	0.43	0.52	0.98	0.37	0.34	0.40	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.10	0.56	0.35	0.10	0.09	0.08	0.06	0.08	0.11	0.08	0.13	0.70	0.24	0.15	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.12	0.09	0.12	0.07	0.10	0.09	0.11	0.12	0.05	0.14	0.15	0.08	0.08	0.04	0.10	0.16	0.05	0.17	0.13	0.30	0.44	0.03
C2	0.06	0.06	0.12	0.15	0.04	0.12	0.05	0.13	0.05	0.03	0.06	0.09	0.05	0.04	0.03	0.11	0.18	0.08	0.16	0.03	0.31	0.45	0.09
C2'	0.10	0.28	0.10	0.13	0.22	0.09	0.24	0.14	0.27	0.18	0.30	0.32	0.23	0.22	0.17	0.08	0.17	0.08	0.10	0.26	0.21	0.55	0.09
C3'	0.04	0.11	0.08	0.10	0.09	0.08	0.10	0.11	0.11	0.07	0.13	0.12	0.09	0.10	0.07	0.08	0.13	0.05	0.16	0.10	0.26	0.48	0.04
C4	0.11	0.05	0.18	0.23	0.07	0.19	0.09	0.20	0.07	0.11	0.07	0.08	0.05	0.10	0.09	0.16	0.27	0.15	0.17	0.07	0.41	0.45	0.21
C4'	0.02	0.14	0.12	0.17	0.09	0.11	0.12	0.14	0.15	0.07	0.16	0.16	0.09	0.11	0.05	0.10	0.23	0.05	0.11	0.16	0.26	0.47	0.06
C5	0.09	0.06	0.15	0.20	0.05	0.18	0.05	0.19	0.04	0.08	0.06	0.11	0.04	0.06	0.06	0.14	0.24	0.13	0.15	0.03	0.40	0.43	0.18
C5'	0.37	0.39	0.49	0.58	0.41	0.46	0.43	0.52	0.42	0.42	0.41	0.36	0.39	0.44	0.40	0.39	0.66	0.37	0.35	0.41	0.31	0.84	0.45
C6	0.07	0.09	0.13	0.17	0.05	0.15	0.05	0.16	0.06	0.05	0.09	0.13	0.07	0.05	0.05	0.12	0.21	0.10	0.11	0.05	0.35	0.45	0.13
N1	0.06	0.08	0.12	0.15	0.04	0.13	0.05	0.14	0.06	0.01	0.08	0.12	0.05	0.03	0.02	0.12	0.19	0.09	0.14	0.06	0.33	0.44	0.09
N3	0.09	0.05	0.16	0.20	0.07	0.16	0.07	0.17	0.07	0.08	0.07	0.06	0.05	0.08	0.07	0.14	0.23	0.12	0.16	0.06	0.36	0.45	0.16
O2	0.03	0.07	0.09	0.11	0.05	0.08	0.06	0.09	0.06	0.03	0.07	0.08	0.05	0.05	0.02	0.09	0.15	0.05	0.20	0.04	0.26	0.46	0.03
O2'	0.18	0.33	0.22	0.27	0.25	0.22	0.27	0.26	0.30	0.21	0.35	0.40	0.27	0.24	0.21	0.21	0.36	0.18	0.16	0.29	0.25	0.56	0.13
O3'	0.34	0.28	0.34	0.34	0.29	0.35	0.28	0.35	0.28	0.30	0.27	0.28	0.29	0.29	0.31	0.31	0.34	0.35	0.38	0.29	0.44	0.40	0.27
O4	0.13	0.09	0.22	0.30	0.13	0.23	0.14	0.25	0.14	0.16	0.12	0.08	0.09	0.17	0.14	0.18	0.35	0.18	0.24	0.14	0.45	0.48	0.28
O4'	0.10	0.15	0.11	0.13	0.11	0.14	0.13	0.13	0.16	0.10	0.17	0.17	0.11	0.12	0.09	0.14	0.19	0.12	0.20	0.18	0.37	0.37	0.09
O5'	0.26	0.20	0.31	0.37	0.24	0.30	0.22	0.34	0.17	0.26	0.17	0.19	0.24	0.24	0.27	0.28	0.43	0.27	0.25	0.12	0.04	0.72	0.33
OP1	0.20	0.21	0.28	0.36	0.20	0.27	0.25	0.29	0.30	0.23	0.27	0.17	0.17	0.26	0.20	0.24	0.45	0.21	0.30	0.36	0.54	0.30	0.24
OP2	0.55	0.50	0.63	0.68	0.53	0.62	0.56	0.64	0.57	0.56	0.53	0.45	0.49	0.57	0.53	0.60	0.74	0.57	0.61	0.60	0.81	0.59	0.61
P	0.10	0.09	0.16	0.24	0.08	0.15	0.12	0.18	0.15	0.10	0.13	0.09	0.07	0.12	0.07	0.14	0.32	0.10	0.15	0.19	0.39	0.39	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.22	0.04	0.18	0.49	0.05
C2	0.05	0.00	0.06	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.07	0.05	0.37	0.03	0.16	0.43	0.06
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.07	0.05	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.08	0.26	0.41	0.04
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.15	0.09	0.30	0.33	0.09
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.38	0.02	0.13	0.43	0.05
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.26	0.40	0.06
C5	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.45	0.01	0.09	0.40	0.11
C5'	0.04	0.08	0.02	0.03	0.09	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.10	0.08	0.08	0.11	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.28	0.31	0.01
C6	0.04	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.10	0.03	0.46	0.01	0.10	0.40	0.13
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.45	0.01	0.07	0.42	0.08
N1	0.04	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.10	0.04	0.42	0.03	0.12	0.41	0.10
N2	0.05	0.00	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.33	0.03	0.18	0.43	0.04
N3	0.05	0.00	0.05	0.05	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.34	0.03	0.18	0.44	0.02
N7	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.48	0.01	0.07	0.38	0.13
N9	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.36	0.02	0.12	0.46	0.03
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.01	0.06	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.07	0.29	0.44	0.09
O3'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.10	0.07	0.10	0.06	0.06	0.09	0.03	0.01	0.00	0.02	0.14	0.12	0.34	0.28	0.09
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.20	0.03	0.19	0.50	0.10
O5'	0.22	0.37	0.14	0.15	0.38	0.02	0.45	0.01	0.46	0.45	0.42	0.33	0.34	0.48	0.36	0.04	0.14	0.20	0.00	0.48	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.03	0.08	0.09	0.02	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.07	0.12	0.03	0.48	0.00	0.11	0.40	0.18
OP1	0.18	0.16	0.26	0.30	0.13	0.26	0.09	0.28	0.10	0.07	0.12	0.18	0.18	0.07	0.12	0.29	0.34	0.19	0.02	0.11	0.00	0.02	0.01
OP2	0.49	0.43	0.41	0.33	0.43	0.40	0.40	0.31	0.40	0.42	0.41	0.43	0.44	0.38	0.46	0.44	0.28	0.50	0.02	0.40	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.06	0.04	0.09	0.05	0.06	0.11	0.01	0.13	0.08	0.10	0.04	0.02	0.13	0.03	0.09	0.09	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00