Doublet Group distance statistics: 51400

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 2, 4, 3, 6, 3, 3, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.018, 0.028, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.022, 0.034, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.034 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.031, 0.048, 0.064, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.048 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.030, 0.051, 0.072, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.051 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.027, 0.048, 0.070, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.048 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.042, 0.066, 0.090, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.066 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.043, 0.072, 0.102, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.072 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.033, 0.063, 0.093, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.063 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.064, 0.098, 0.131, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.098 std_dev=0.033
O6	A	0, 0.052, 0.090, 0.129, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.090 std_dev=0.038
N7	A	0, 0.040, 0.085, 0.131, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.085 std_dev=0.045
C8	A	0, 0.049, 0.104, 0.158, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.104 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.099, 0.154, 0.210, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.154 std_dev=0.056
C2'	A	0, 0.128, 0.202, 0.276, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.202 std_dev=0.074
C4'	A	0, 0.149, 0.268, 0.388, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.268 std_dev=0.119
OP1	B	0, 0.282, 0.462, 0.641, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.462 std_dev=0.179
P	B	0, 0.251, 0.482, 0.713, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.482 std_dev=0.231
C5'	A	0, 0.102, 0.344, 0.586, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.344 std_dev=0.242
C3'	A	0, 0.040, 0.345, 0.650, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.345 std_dev=0.305
OP2	B	0, 0.164, 0.559, 0.953, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.559 std_dev=0.395
O2'	A	0, -0.011, 0.394, 0.800, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.394 std_dev=0.406
O5'	A	0, -0.066, 0.352, 0.770, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.352 std_dev=0.418
O5'	B	0, -0.008, 0.548, 1.104, 2.395 max_d=2.395 avg_d=0.548 std_dev=0.556
O3'	A	0, -0.197, 0.469, 1.134, 2.754 max_d=2.754 avg_d=0.469 std_dev=0.666
P	A	0, -0.279, 0.474, 1.227, 3.042 max_d=3.042 avg_d=0.474 std_dev=0.753
OP1	A	0, -0.228, 0.633, 1.494, 3.543 max_d=3.543 avg_d=0.633 std_dev=0.861
OP2	A	0, -0.457, 0.454, 1.364, 3.597 max_d=3.597 avg_d=0.454 std_dev=0.910
C5'	B	0, -0.423, 0.648, 1.719, 4.334 max_d=4.334 avg_d=0.648 std_dev=1.071
C5	B	0, -0.184, 1.084, 2.352, 5.372 max_d=5.372 avg_d=1.084 std_dev=1.268
C6	B	0, -0.185, 1.101, 2.386, 5.454 max_d=5.454 avg_d=1.101 std_dev=1.286
C4'	B	0, -0.775, 0.829, 2.434, 6.366 max_d=6.366 avg_d=0.829 std_dev=1.605
C4	B	0, -0.530, 1.102, 2.735, 6.683 max_d=6.683 avg_d=1.102 std_dev=1.632
C3'	B	0, -0.682, 0.991, 2.664, 6.750 max_d=6.750 avg_d=0.991 std_dev=1.673
N4	B	0, -0.587, 1.087, 2.761, 6.813 max_d=6.813 avg_d=1.087 std_dev=1.674
O4'	B	0, -0.711, 0.978, 2.666, 6.791 max_d=6.791 avg_d=0.978 std_dev=1.689
N1	B	0, -0.599, 1.166, 2.930, 7.216 max_d=7.216 avg_d=1.166 std_dev=1.764
C1'	B	0, -0.799, 1.174, 3.148, 7.964 max_d=7.964 avg_d=1.174 std_dev=1.973
O3'	B	0, -0.964, 1.073, 3.111, 8.107 max_d=8.107 avg_d=1.073 std_dev=2.038
N3	B	0, -0.859, 1.183, 3.225, 8.202 max_d=8.202 avg_d=1.183 std_dev=2.042
C2'	B	0, -0.854, 1.211, 3.277, 8.322 max_d=8.322 avg_d=1.211 std_dev=2.065
C2	B	0, -0.922, 1.233, 3.388, 8.650 max_d=8.650 avg_d=1.233 std_dev=2.155
O2'	B	0, -1.241, 1.376, 3.993, 10.407 max_d=10.407 avg_d=1.376 std_dev=2.617
O2	B	0, -1.267, 1.364, 3.996, 10.443 max_d=10.443 avg_d=1.364 std_dev=2.632

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.12	0.01	0.12	0.14	0.10
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.34	0.03	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.13	0.05	0.04	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.06	0.33	0.40	0.32
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.10	0.21	0.05	0.10	0.05	0.20	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.11	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.18	0.02	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.03	0.05	0.03	0.06	0.03	0.18	0.02	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.08	0.02	0.06	0.00	0.06	0.08	0.06
C5'	0.05	0.05	0.13	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.04	0.05	0.13	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.13	0.02	0.06	0.00	0.06	0.07	0.06
C8	0.01	0.01	0.04	0.21	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.11	0.03	0.07	0.01	0.07	0.10	0.09
N1	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.24	0.03	0.07	0.01	0.07	0.08	0.05
N2	0.04	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.43	0.05	0.09	0.01	0.09	0.09	0.06
N3	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.34	0.03	0.09	0.01	0.09	0.10	0.06
N7	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.10	0.03	0.07	0.01	0.06	0.08	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.09	0.01	0.09	0.01	0.09	0.11	0.08
O2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.21	0.18	0.25	0.05	0.29	0.16	0.28	0.22	0.19	0.23	0.14	0.00	0.03	0.11	0.21	0.32	0.27	0.45	0.27
O3'	0.20	0.34	0.02	0.01	0.18	0.02	0.08	0.13	0.13	0.11	0.24	0.43	0.34	0.10	0.09	0.03	0.00	0.13	0.14	0.08	0.16	0.12	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.11	0.13	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05
O5'	0.12	0.08	0.28	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.06	0.07	0.07	0.09	0.09	0.07	0.09	0.21	0.14	0.02	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.08	0.03	0.06	0.00	0.05	0.07	0.06
OP1	0.12	0.08	0.33	0.11	0.08	0.04	0.06	0.04	0.06	0.07	0.07	0.09	0.09	0.06	0.09	0.27	0.16	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.09	0.40	0.07	0.09	0.03	0.08	0.02	0.07	0.10	0.08	0.09	0.10	0.08	0.11	0.45	0.12	0.05	0.02	0.07	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.06	0.32	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.09	0.05	0.06	0.06	0.08	0.08	0.27	0.14	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.91	0.90	0.87	0.77	0.79	0.84	0.75	0.66	0.79	0.87	0.86	0.76	0.96	0.95	0.76	0.89	0.38	0.09	0.17	0.09
C2	0.56	0.60	0.49	0.44	0.63	0.52	0.63	0.46	0.62	0.60	0.62	0.64	0.59	0.47	0.38	0.57	0.28	0.10	0.13	0.10
C2'	1.18	1.14	1.14	0.99	0.94	1.08	0.86	0.83	0.94	1.09	1.06	0.88	1.25	1.29	1.01	1.13	0.48	0.09	0.19	0.10
C3'	1.08	1.07	1.04	0.90	0.90	0.97	0.82	0.74	0.88	1.01	1.01	0.85	1.17	1.18	0.91	1.03	0.42	0.08	0.18	0.09
C4	0.69	0.68	0.69	0.66	0.61	0.70	0.59	0.57	0.62	0.67	0.65	0.59	0.71	0.74	0.68	0.68	0.31	0.10	0.18	0.08
C4'	0.93	0.93	0.89	0.78	0.80	0.84	0.75	0.64	0.79	0.89	0.89	0.77	1.00	0.99	0.78	0.90	0.37	0.08	0.17	0.08
C5	0.57	0.54	0.66	0.67	0.46	0.64	0.43	0.52	0.47	0.53	0.50	0.43	0.57	0.70	0.78	0.54	0.26	0.12	0.21	0.10
C5'	0.94	0.93	0.94	0.84	0.80	0.87	0.74	0.66	0.79	0.89	0.88	0.76	1.01	1.05	0.88	0.90	0.39	0.09	0.14	0.09
C6	0.41	0.40	0.52	0.57	0.37	0.51	0.35	0.43	0.37	0.40	0.39	0.35	0.42	0.53	0.69	0.38	0.21	0.14	0.21	0.13
C8	0.72	0.66	0.81	0.79	0.53	0.77	0.49	0.60	0.55	0.64	0.61	0.48	0.73	0.91	0.91	0.68	0.30	0.12	0.23	0.09
N1	0.41	0.44	0.43	0.44	0.46	0.44	0.46	0.40	0.46	0.44	0.46	0.47	0.43	0.40	0.46	0.40	0.22	0.11	0.17	0.10
N2	0.52	0.61	0.37	0.29	0.70	0.41	0.71	0.37	0.67	0.61	0.66	0.73	0.56	0.32	0.16	0.55	0.27	0.13	0.07	0.15
N3	0.70	0.72	0.62	0.55	0.70	0.65	0.69	0.54	0.70	0.71	0.72	0.70	0.72	0.64	0.50	0.71	0.32	0.10	0.14	0.10
N7	0.59	0.53	0.74	0.76	0.41	0.69	0.38	0.54	0.43	0.52	0.48	0.37	0.59	0.81	0.93	0.54	0.26	0.13	0.24	0.11
N9	0.79	0.76	0.80	0.75	0.65	0.78	0.62	0.62	0.66	0.74	0.72	0.62	0.81	0.88	0.79	0.76	0.34	0.10	0.19	0.08
O2'	1.63	1.60	1.53	1.33	1.39	1.46	1.30	1.19	1.38	1.54	1.53	1.32	1.72	1.68	1.29	1.58	0.83	0.30	0.12	0.41
O3'	1.35	1.35	1.28	1.13	1.20	1.22	1.12	1.00	1.18	1.30	1.31	1.16	1.44	1.39	1.10	1.31	0.70	0.32	0.14	0.38
O4'	0.79	0.79	0.76	0.68	0.72	0.74	0.68	0.57	0.71	0.77	0.77	0.70	0.84	0.83	0.68	0.78	0.32	0.09	0.17	0.08
O5'	1.00	0.97	1.05	0.96	0.81	0.96	0.75	0.73	0.81	0.93	0.91	0.76	1.07	1.17	1.04	0.95	0.44	0.12	0.11	0.12
O6	0.26	0.26	0.45	0.56	0.23	0.41	0.22	0.34	0.23	0.25	0.25	0.22	0.28	0.45	0.77	0.21	0.16	0.17	0.23	0.19
OP1	1.10	1.09	1.17	1.06	0.89	1.03	0.81	0.77	0.88	1.02	1.02	0.84	1.20	1.32	1.15	1.02	0.48	0.13	0.09	0.14
OP2	1.01	0.97	1.14	1.08	0.78	0.99	0.71	0.74	0.78	0.92	0.90	0.73	1.09	1.29	1.22	0.93	0.46	0.14	0.08	0.13
P	0.97	0.95	1.06	0.97	0.78	0.93	0.71	0.69	0.77	0.90	0.88	0.73	1.05	1.19	1.08	0.90	0.42	0.10	0.11	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.07	0.17	0.12
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.20	0.20	0.36	0.27
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.09	0.07	0.13	0.09
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.07	0.06	0.09	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.27	0.35	0.51	0.40
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.04	0.05	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.28	0.37	0.50	0.41
C5'	0.03	0.09	0.01	0.02	0.16	0.01	0.17	0.00	0.15	0.10	0.12	0.17	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.25	0.29	0.39	0.34
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.19	0.19	0.31	0.25
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.24	0.28	0.45	0.34
N4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.29	0.40	0.56	0.44
O2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.02	0.17	0.14	0.31	0.22
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.05	0.04	0.07	0.00	0.04	0.02	0.04	0.10	0.07	0.03
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.07	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.08	0.08	0.10	0.04	0.00	0.02	0.04	0.11	0.06	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.05	0.08	0.07
O5'	0.10	0.20	0.09	0.07	0.27	0.03	0.28	0.01	0.25	0.19	0.24	0.29	0.17	0.04	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.20	0.07	0.08	0.35	0.05	0.37	0.06	0.29	0.19	0.28	0.40	0.14	0.10	0.11	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.36	0.13	0.07	0.51	0.03	0.50	0.02	0.39	0.31	0.45	0.56	0.31	0.07	0.06	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.27	0.09	0.06	0.40	0.02	0.41	0.01	0.34	0.25	0.34	0.44	0.22	0.03	0.05	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00