Doublet Group distance statistics: 51408

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.015, 0.035, 0.055, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.035 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.016, 0.041, 0.066, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.041 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.015, 0.041, 0.067, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.041 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.014, 0.041, 0.069, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.041 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.021, 0.050, 0.078, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.050 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.020, 0.049, 0.078, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.049 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.019, 0.053, 0.088, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.053 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.025, 0.063, 0.101, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.063 std_dev=0.038
O6	A	0, 0.032, 0.080, 0.128, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.080 std_dev=0.048
N2	A	0, 0.021, 0.071, 0.121, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.071 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.046, 0.103, 0.161, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.103 std_dev=0.058
O4'	A	0, 0.083, 0.203, 0.323, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.203 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.111, 0.273, 0.435, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.273 std_dev=0.162
C3'	A	0, 0.080, 0.245, 0.409, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.245 std_dev=0.164
O3'	A	0, 0.121, 0.363, 0.605, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.363 std_dev=0.242
C4'	A	0, 0.155, 0.405, 0.655, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.405 std_dev=0.250
OP1	B	0, 0.252, 0.634, 1.015, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.634 std_dev=0.382
C5'	A	0, 0.254, 0.643, 1.033, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.643 std_dev=0.390
P	A	0, 0.322, 0.716, 1.109, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.716 std_dev=0.393
O5'	A	0, 0.194, 0.604, 1.014, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.604 std_dev=0.410
P	B	0, 0.357, 0.840, 1.324, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.840 std_dev=0.483
OP2	B	0, 0.360, 0.857, 1.355, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.857 std_dev=0.497
OP2	A	0, 0.384, 0.933, 1.481, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.933 std_dev=0.549
O5'	B	0, 0.469, 1.072, 1.674, 1.589 max_d=1.589 avg_d=1.072 std_dev=0.602
C5'	B	0, 0.499, 1.158, 1.818, 1.814 max_d=1.814 avg_d=1.158 std_dev=0.659
C4'	B	0, 0.579, 1.343, 2.107, 2.071 max_d=2.071 avg_d=1.343 std_dev=0.764
OP1	A	0, 0.533, 1.337, 2.140, 2.254 max_d=2.254 avg_d=1.337 std_dev=0.804
O3'	B	0, 0.596, 1.402, 2.208, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.402 std_dev=0.806
C3'	B	0, 0.613, 1.424, 2.235, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.424 std_dev=0.811
O4'	B	0, 0.639, 1.472, 2.306, 2.236 max_d=2.236 avg_d=1.472 std_dev=0.834
C5	B	0, 0.659, 1.497, 2.334, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.497 std_dev=0.837
C6	B	0, 0.666, 1.507, 2.348, 2.234 max_d=2.234 avg_d=1.507 std_dev=0.841
N4	B	0, 0.698, 1.607, 2.517, 2.340 max_d=2.340 avg_d=1.607 std_dev=0.909
C1'	B	0, 0.712, 1.633, 2.554, 2.451 max_d=2.451 avg_d=1.633 std_dev=0.921
C2'	B	0, 0.711, 1.636, 2.561, 2.468 max_d=2.468 avg_d=1.636 std_dev=0.925
C4	B	0, 0.721, 1.648, 2.575, 2.406 max_d=2.406 avg_d=1.648 std_dev=0.927
N1	B	0, 0.730, 1.669, 2.607, 2.483 max_d=2.483 avg_d=1.669 std_dev=0.938
O2'	B	0, 0.750, 1.725, 2.699, 2.603 max_d=2.603 avg_d=1.725 std_dev=0.974
N3	B	0, 0.796, 1.823, 2.851, 2.660 max_d=2.660 avg_d=1.823 std_dev=1.028
C2	B	0, 0.799, 1.842, 2.885, 2.717 max_d=2.717 avg_d=1.842 std_dev=1.043
O2	B	0, 0.865, 2.026, 3.188, 2.991 max_d=2.991 avg_d=2.026 std_dev=1.162

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.21	0.02	0.39	0.17	0.09
C2	0.05	0.00	0.03	0.09	0.01	0.10	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.16	0.08	0.20	0.03	0.38	0.20	0.10
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.34	0.03	0.52	0.10	0.21
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.12	0.09	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.02	0.50	0.07	0.13
C4	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.04	0.23	0.02	0.34	0.18	0.10
C4'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.08	0.06	0.15	0.10	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.37	0.21	0.05
C5	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.26	0.02	0.27	0.19	0.12
C5'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.08	0.15	0.03	0.10	0.06	0.15	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.27	0.14	0.01
C6	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.09	0.03	0.24	0.01	0.27	0.21	0.11
C8	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.04	0.31	0.04	0.25	0.16	0.14
N1	0.04	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.06	0.21	0.02	0.32	0.21	0.10
N2	0.06	0.01	0.06	0.12	0.02	0.15	0.02	0.10	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.20	0.10	0.20	0.04	0.41	0.22	0.12
N3	0.06	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.15	0.09	0.21	0.03	0.40	0.19	0.11
N7	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.03	0.30	0.04	0.23	0.18	0.15
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.26	0.02	0.33	0.17	0.11
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.08	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.35	0.04	0.60	0.10	0.24
O3'	0.03	0.16	0.01	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03	0.13	0.20	0.15	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.07	0.08	0.49	0.16	0.06
O4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.06	0.10	0.09	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.02	0.30	0.25	0.03
O5'	0.21	0.20	0.34	0.21	0.23	0.01	0.26	0.01	0.24	0.31	0.21	0.20	0.21	0.30	0.26	0.35	0.07	0.09	0.00	0.25	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.12	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.08	0.02	0.25	0.00	0.23	0.22	0.12
OP1	0.39	0.38	0.52	0.50	0.34	0.37	0.27	0.27	0.27	0.25	0.32	0.41	0.40	0.23	0.33	0.60	0.49	0.30	0.02	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.20	0.10	0.07	0.18	0.21	0.19	0.14	0.21	0.16	0.21	0.22	0.19	0.18	0.17	0.10	0.16	0.25	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.10	0.21	0.13	0.10	0.05	0.12	0.01	0.11	0.14	0.10	0.12	0.11	0.15	0.11	0.24	0.06	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.06	0.06	0.08	0.07	0.06	0.05	0.06	0.03	0.04	0.07	0.10	0.06	0.08	0.12	0.04	0.07	0.08	0.05	0.06
C2	0.08	0.09	0.12	0.14	0.12	0.10	0.09	0.10	0.06	0.07	0.11	0.15	0.09	0.13	0.18	0.07	0.10	0.14	0.05	0.08
C2'	0.11	0.12	0.11	0.11	0.14	0.09	0.13	0.08	0.12	0.11	0.14	0.15	0.12	0.10	0.13	0.10	0.11	0.10	0.11	0.11
C3'	0.04	0.07	0.05	0.06	0.09	0.05	0.07	0.05	0.04	0.05	0.09	0.13	0.07	0.07	0.11	0.03	0.05	0.07	0.04	0.05
C4	0.06	0.08	0.08	0.09	0.10	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07	0.10	0.12	0.09	0.10	0.13	0.05	0.07	0.08	0.04	0.05
C4'	0.08	0.12	0.08	0.10	0.13	0.10	0.10	0.11	0.08	0.10	0.14	0.17	0.13	0.11	0.15	0.08	0.09	0.09	0.09	0.07
C5	0.10	0.14	0.10	0.10	0.15	0.10	0.13	0.10	0.11	0.12	0.15	0.17	0.14	0.12	0.14	0.09	0.06	0.08	0.06	0.06
C5'	0.10	0.14	0.11	0.13	0.15	0.11	0.11	0.11	0.09	0.11	0.15	0.19	0.15	0.14	0.18	0.09	0.10	0.10	0.09	0.07
C6	0.13	0.18	0.12	0.12	0.21	0.13	0.19	0.13	0.17	0.16	0.20	0.23	0.18	0.14	0.14	0.13	0.10	0.10	0.12	0.11
C8	0.08	0.11	0.09	0.10	0.11	0.09	0.09	0.09	0.07	0.09	0.12	0.13	0.12	0.12	0.14	0.07	0.05	0.07	0.03	0.05
N1	0.08	0.14	0.09	0.10	0.19	0.08	0.17	0.08	0.13	0.12	0.17	0.22	0.14	0.10	0.14	0.07	0.06	0.08	0.09	0.06
N2	0.15	0.10	0.20	0.22	0.11	0.18	0.09	0.18	0.10	0.11	0.11	0.15	0.11	0.20	0.26	0.14	0.18	0.23	0.13	0.17
N3	0.09	0.08	0.12	0.13	0.09	0.10	0.07	0.09	0.07	0.08	0.09	0.11	0.08	0.12	0.17	0.09	0.11	0.13	0.08	0.10
N7	0.12	0.15	0.12	0.12	0.16	0.12	0.14	0.12	0.12	0.13	0.16	0.17	0.16	0.15	0.16	0.11	0.07	0.09	0.06	0.07
N9	0.06	0.08	0.08	0.09	0.09	0.07	0.06	0.07	0.05	0.06	0.09	0.11	0.08	0.10	0.13	0.05	0.07	0.08	0.05	0.06
O2'	0.20	0.24	0.20	0.18	0.26	0.15	0.25	0.13	0.23	0.22	0.26	0.27	0.23	0.17	0.17	0.18	0.18	0.13	0.19	0.17
O3'	0.04	0.08	0.06	0.07	0.11	0.07	0.08	0.08	0.05	0.06	0.11	0.14	0.09	0.07	0.12	0.04	0.05	0.09	0.05	0.05
O4'	0.08	0.10	0.09	0.11	0.10	0.11	0.07	0.12	0.07	0.09	0.11	0.13	0.12	0.12	0.15	0.09	0.11	0.10	0.10	0.08
O5'	0.13	0.15	0.14	0.15	0.14	0.17	0.11	0.18	0.12	0.13	0.15	0.16	0.17	0.17	0.20	0.14	0.16	0.17	0.15	0.15
O6	0.22	0.26	0.19	0.19	0.28	0.21	0.27	0.21	0.25	0.25	0.28	0.30	0.26	0.21	0.19	0.22	0.18	0.18	0.20	0.19
OP1	0.38	0.40	0.36	0.37	0.39	0.39	0.38	0.39	0.38	0.39	0.40	0.39	0.41	0.38	0.39	0.38	0.38	0.38	0.38	0.38
OP2	0.22	0.24	0.22	0.20	0.29	0.18	0.29	0.17	0.26	0.24	0.27	0.32	0.23	0.20	0.16	0.21	0.22	0.18	0.24	0.21
P	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.10	0.05	0.12	0.04	0.06	0.08	0.10	0.09	0.09	0.13	0.08	0.10	0.10	0.08	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.07	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.08	0.10	0.11	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.05
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.10	0.12	0.12	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.05	0.03	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.10	0.11	0.11	0.12
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.08	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02
C6	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.09	0.10	0.09	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.09	0.09	0.08
N3	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.03	0.09	0.11	0.12	0.11
N4	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.06	0.02	0.04	0.11	0.12	0.13	0.13
O2	0.02	0.01	0.07	0.07	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.06	0.07	0.02	0.08	0.10	0.10	0.08
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.06	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.07	0.07	0.05
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.07	0.05
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.05	0.06	0.05	0.04
O5'	0.05	0.08	0.02	0.03	0.10	0.02	0.10	0.01	0.09	0.07	0.09	0.11	0.08	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.10	0.07	0.07	0.12	0.05	0.11	0.05	0.10	0.09	0.11	0.12	0.10	0.07	0.07	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.08	0.07	0.12	0.04	0.11	0.03	0.09	0.09	0.12	0.13	0.10	0.07	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.05	0.04	0.12	0.03	0.12	0.02	0.10	0.08	0.11	0.13	0.08	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00