Doublet Group distance statistics: 51415

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C2	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
C5	A	0, 0.000, 0.059, 0.118, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.059 std_dev=0.059
C1'	A	0, 0.000, 0.063, 0.125, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.063 std_dev=0.063
N3	A	0, 0.000, 0.072, 0.143, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.072 std_dev=0.072
N1	A	0, 0.000, 0.073, 0.145, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.073 std_dev=0.073
C3'	A	0, 0.000, 0.073, 0.146, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.073 std_dev=0.073
N9	A	0, 0.000, 0.085, 0.170, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.085 std_dev=0.085
C4	A	0, 0.000, 0.085, 0.171, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.085 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.000, 0.094, 0.189, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.094 std_dev=0.094
N2	A	0, 0.000, 0.098, 0.196, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.098 std_dev=0.098
O6	A	0, 0.000, 0.100, 0.199, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.100 std_dev=0.100
N7	A	0, 0.000, 0.123, 0.246, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.123 std_dev=0.123
C8	A	0, 0.000, 0.147, 0.293, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.147 std_dev=0.147
O3'	A	0, 0.000, 0.210, 0.419, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.210 std_dev=0.210
O4'	A	0, 0.000, 0.219, 0.438, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.219 std_dev=0.219
C5'	A	0, 0.000, 0.264, 0.528, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.264 std_dev=0.264
OP1	A	0, 0.000, 0.320, 0.639, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.320 std_dev=0.320
P	A	0, 0.000, 0.350, 0.700, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.350 std_dev=0.350
C2'	A	0, 0.000, 0.367, 0.735, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.367 std_dev=0.367
O5'	A	0, 0.000, 0.408, 0.815, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.408 std_dev=0.408
C2'	B	0, 0.000, 0.428, 0.857, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.428 std_dev=0.428
OP2	A	0, 0.000, 0.429, 0.858, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.429 std_dev=0.429
OP1	B	0, 0.000, 0.483, 0.966, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.483 std_dev=0.483
O2'	B	0, 0.000, 0.578, 1.155, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.578 std_dev=0.578
O3'	B	0, 0.000, 0.626, 1.252, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.626 std_dev=0.626
P	B	0, 0.000, 0.651, 1.302, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.651 std_dev=0.651
C5'	B	0, 0.000, 0.667, 1.335, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.667 std_dev=0.667
C3'	B	0, 0.000, 0.676, 1.352, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.676 std_dev=0.676
O5'	B	0, 0.000, 0.691, 1.383, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.691 std_dev=0.691
OP2	B	0, 0.000, 0.703, 1.407, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.703 std_dev=0.703
C4'	B	0, 0.000, 0.772, 1.544, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.772 std_dev=0.772
O2'	A	0, 0.000, 0.885, 1.771, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.885 std_dev=0.885
C1'	B	0, 0.000, 0.984, 1.968, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.984 std_dev=0.984
N1	B	0, 0.000, 1.139, 2.279, 2.279 max_d=2.279 avg_d=1.139 std_dev=1.139
O4'	B	0, 0.000, 1.140, 2.280, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.140 std_dev=1.140
C6	B	0, 0.000, 1.176, 2.352, 2.352 max_d=2.352 avg_d=1.176 std_dev=1.176
C2	B	0, 0.000, 1.254, 2.508, 2.508 max_d=2.508 avg_d=1.254 std_dev=1.254
C5	B	0, 0.000, 1.257, 2.514, 2.514 max_d=2.514 avg_d=1.257 std_dev=1.257
O2	B	0, 0.000, 1.281, 2.563, 2.563 max_d=2.563 avg_d=1.281 std_dev=1.281
C4	B	0, 0.000, 1.321, 2.643, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.321 std_dev=1.321
N3	B	0, 0.000, 1.347, 2.693, 2.693 max_d=2.693 avg_d=1.347 std_dev=1.347
N4	B	0, 0.000, 1.347, 2.694, 2.694 max_d=2.694 avg_d=1.347 std_dev=1.347

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.10	0.05	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.01	0.02	0.10	0.20	0.07
C2	0.07	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.20	0.00	0.04	0.08	0.01	0.08	0.18	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.09	0.07	0.17	0.00	0.12	0.06	0.16	0.07	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.22	0.34	0.20
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.13	0.21	0.09
C4	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.11	0.20	0.09
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.09	0.02	0.00	0.00	0.03	0.09	0.19	0.08
C5	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.10	0.07	0.06	0.07	0.00	0.08	0.17	0.07
C5'	0.03	0.09	0.09	0.02	0.11	0.00	0.08	0.00	0.06	0.08	0.07	0.07	0.12	0.07	0.09	0.02	0.07	0.01	0.00	0.04	0.02	0.12	0.00
C6	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.08	0.06	0.00	0.05	0.16	0.05
C8	0.02	0.01	0.17	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.26	0.11	0.03	0.04	0.01	0.09	0.16	0.07
N1	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.07	0.07	0.01	0.05	0.16	0.05
N2	0.10	0.02	0.12	0.07	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.04	0.03	0.00	0.03	0.03	0.05	0.31	0.04	0.05	0.07	0.04	0.06	0.16	0.06
N3	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.21	0.03	0.01	0.10	0.01	0.11	0.20	0.10
N7	0.01	0.01	0.16	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.25	0.10	0.05	0.06	0.01	0.08	0.15	0.06
N9	0.00	0.02	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.00	0.10	0.19	0.08
O2'	0.04	0.20	0.00	0.00	0.03	0.09	0.10	0.02	0.06	0.26	0.08	0.31	0.21	0.25	0.06	0.00	0.06	0.10	0.00	0.14	0.29	0.46	0.26
O3'	0.09	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.07	0.07	0.05	0.11	0.02	0.04	0.03	0.10	0.09	0.06	0.00	0.08	0.15	0.06	0.06	0.16	0.03
O4'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.07	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.08	0.00	0.01	0.10	0.05	0.15	0.02
O5'	0.01	0.08	0.04	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.07	0.07	0.10	0.06	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.05	0.03	0.03	0.00
O6	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.14	0.06	0.10	0.05	0.00	0.03	0.14	0.03
OP1	0.10	0.08	0.22	0.13	0.11	0.09	0.08	0.02	0.05	0.09	0.05	0.06	0.11	0.08	0.10	0.29	0.06	0.05	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.18	0.34	0.21	0.20	0.19	0.17	0.12	0.16	0.16	0.16	0.16	0.20	0.15	0.19	0.46	0.16	0.15	0.03	0.14	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.07	0.20	0.09	0.09	0.08	0.07	0.00	0.05	0.07	0.05	0.06	0.10	0.06	0.08	0.26	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.12	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.16	0.08	0.13	0.06	0.06	0.16	0.17	0.19	0.27	0.19	0.17	0.12	0.15
C2	0.15	0.06	0.06	0.02	0.10	0.13	0.10	0.13	0.01	0.07	0.02	0.18	0.12	0.11	0.17	0.26	0.11	0.05	0.05	0.01
C2'	0.17	0.12	0.04	0.00	0.03	0.09	0.04	0.12	0.09	0.13	0.08	0.02	0.15	0.14	0.11	0.24	0.16	0.11	0.10	0.13
C3'	0.18	0.14	0.04	0.03	0.04	0.12	0.05	0.15	0.10	0.15	0.09	0.02	0.17	0.12	0.16	0.27	0.19	0.16	0.14	0.16
C4	0.11	0.05	0.07	0.01	0.10	0.08	0.10	0.11	0.02	0.05	0.02	0.16	0.10	0.12	0.14	0.20	0.09	0.06	0.01	0.03
C4'	0.20	0.17	0.03	0.06	0.06	0.15	0.07	0.18	0.13	0.17	0.11	0.01	0.21	0.09	0.19	0.30	0.21	0.18	0.15	0.18
C5	0.04	0.00	0.09	0.06	0.13	0.02	0.15	0.07	0.08	0.01	0.06	0.19	0.06	0.10	0.10	0.11	0.04	0.02	0.03	0.01
C5'	0.07	0.07	0.16	0.07	0.04	0.03	0.03	0.08	0.02	0.06	0.02	0.10	0.11	0.07	0.07	0.17	0.09	0.07	0.05	0.07
C6	0.02	0.01	0.10	0.07	0.14	0.01	0.17	0.06	0.11	0.03	0.07	0.20	0.06	0.08	0.10	0.08	0.02	0.01	0.04	0.04
C8	0.05	0.01	0.09	0.07	0.12	0.02	0.13	0.06	0.07	0.00	0.05	0.18	0.06	0.10	0.08	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01
N1	0.07	0.02	0.09	0.03	0.13	0.07	0.15	0.10	0.07	0.01	0.05	0.20	0.09	0.08	0.14	0.16	0.05	0.01	0.06	0.03
N2	0.20	0.08	0.05	0.07	0.09	0.19	0.09	0.16	0.03	0.11	0.01	0.18	0.14	0.10	0.20	0.33	0.15	0.07	0.07	0.02
N3	0.17	0.08	0.05	0.03	0.08	0.14	0.07	0.14	0.02	0.09	0.00	0.15	0.13	0.13	0.18	0.27	0.13	0.07	0.02	0.04
N7	0.01	0.02	0.11	0.09	0.14	0.01	0.16	0.04	0.10	0.03	0.07	0.20	0.04	0.09	0.07	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02
N9	0.11	0.05	0.07	0.01	0.08	0.07	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.15	0.10	0.12	0.13	0.19	0.10	0.08	0.02	0.05
O2'	0.31	0.28	0.10	0.11	0.23	0.19	0.24	0.21	0.26	0.28	0.26	0.21	0.29	0.29	0.19	0.36	0.31	0.24	0.29	0.29
O3'	0.18	0.13	0.05	0.03	0.04	0.11	0.05	0.12	0.10	0.14	0.08	0.01	0.15	0.11	0.15	0.26	0.18	0.16	0.15	0.16
O4'	0.22	0.16	0.00	0.10	0.03	0.18	0.04	0.20	0.12	0.17	0.10	0.04	0.21	0.14	0.24	0.31	0.22	0.22	0.16	0.19
O5'	0.06	0.06	0.18	0.09	0.04	0.02	0.03	0.07	0.02	0.05	0.01	0.11	0.10	0.10	0.04	0.17	0.07	0.05	0.03	0.05
O6	0.04	0.04	0.12	0.11	0.16	0.05	0.19	0.03	0.15	0.07	0.08	0.21	0.03	0.07	0.06	0.00	0.03	0.03	0.04	0.06
OP1	0.06	0.08	0.15	0.06	0.01	0.03	0.01	0.09	0.03	0.07	0.04	0.07	0.12	0.05	0.07	0.16	0.10	0.09	0.09	0.09
OP2	0.09	0.10	0.27	0.21	0.21	0.12	0.21	0.06	0.16	0.11	0.15	0.27	0.05	0.13	0.07	0.01	0.07	0.07	0.09	0.08
P	0.04	0.05	0.16	0.09	0.05	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.11	0.10	0.06	0.05	0.14	0.07	0.06	0.05	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00
C2	0.01	0.00	0.05	0.15	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.15	0.01	0.21	0.11	0.18	0.05	0.03	0.17	0.23	0.00	0.01	0.01	0.27	0.25	0.30	0.28
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.09	0.12	0.05	0.09
C4	0.00	0.01	0.15	0.03	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.01	0.02	0.11	0.09	0.06	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.00	0.06	0.08	0.16	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00
C5	0.00	0.01	0.21	0.02	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.04	0.04	0.12	0.10	0.05	0.10
C5'	0.04	0.07	0.11	0.00	0.18	0.00	0.21	0.00	0.18	0.09	0.11	0.20	0.00	0.05	0.13	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00
C6	0.00	0.00	0.18	0.01	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.04	0.03	0.07	0.05	0.01	0.04
N1	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00
N3	0.01	0.00	0.03	0.11	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.20	0.04	0.00	0.06	0.03	0.01	0.03
N4	0.01	0.02	0.17	0.01	0.01	0.06	0.00	0.20	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.32	0.03	0.03	0.15	0.15	0.13	0.15
O2	0.02	0.00	0.23	0.23	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.13	0.03	0.03	0.06	0.10	0.06
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.27	0.16	0.26	0.05	0.19	0.11	0.20	0.32	0.06	0.00	0.05	0.11	0.20	0.21	0.37	0.25
O3'	0.08	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.13	0.04	0.00	0.04	0.03	0.13	0.05	0.00	0.05	0.00	0.02	0.05	0.02
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.03	0.11	0.05	0.00	0.15	0.12	0.17	0.15
O5'	0.01	0.01	0.27	0.09	0.11	0.01	0.12	0.00	0.07	0.02	0.06	0.15	0.03	0.20	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.02	0.01	0.25	0.12	0.09	0.01	0.10	0.06	0.05	0.01	0.03	0.15	0.06	0.21	0.02	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.05	0.30	0.05	0.06	0.03	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.13	0.10	0.37	0.05	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.00	0.01	0.28	0.09	0.09	0.00	0.10	0.00	0.04	0.00	0.03	0.15	0.06	0.25	0.02	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00