Doublet Group distance statistics: 51417

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.017, 0.029, 0.042, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.017, 0.031, 0.044, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.011, 0.029, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.040 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.018, 0.043, 0.069, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.043 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.018, 0.052, 0.085, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.052 std_dev=0.034
N6	A	0, 0.024, 0.062, 0.099, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.062 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.023, 0.069, 0.116, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.069 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.111, 0.238, 0.364, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.238 std_dev=0.126
C2'	A	0, 0.105, 0.232, 0.359, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.232 std_dev=0.127
O2'	A	0, 0.086, 0.265, 0.445, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.265 std_dev=0.180
C4'	A	0, 0.200, 0.403, 0.606, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.403 std_dev=0.203
C3'	A	0, 0.190, 0.395, 0.601, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.395 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.305, 0.569, 0.834, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.569 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.346, 0.612, 0.877, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.612 std_dev=0.266
C5'	A	0, 0.336, 0.623, 0.911, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.623 std_dev=0.287
N2	B	0, 0.436, 0.743, 1.050, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.743 std_dev=0.307
C6	B	0, 0.383, 0.699, 1.015, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.699 std_dev=0.316
N3	B	0, 0.428, 0.745, 1.062, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.745 std_dev=0.317
O6	B	0, 0.374, 0.700, 1.027, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.700 std_dev=0.327
O5'	A	0, 0.306, 0.681, 1.055, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.681 std_dev=0.375
O3'	A	0, 0.268, 0.645, 1.022, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.645 std_dev=0.377
OP2	A	0, 0.632, 1.049, 1.467, 1.392 max_d=1.392 avg_d=1.049 std_dev=0.418
P	A	0, 0.417, 0.850, 1.282, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.850 std_dev=0.432
C4	B	0, 0.453, 0.918, 1.382, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.918 std_dev=0.464
C5	B	0, 0.440, 0.925, 1.410, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.925 std_dev=0.485
OP1	A	0, 0.656, 1.144, 1.633, 1.733 max_d=1.733 avg_d=1.144 std_dev=0.488
N9	B	0, 0.499, 1.213, 1.927, 2.066 max_d=2.066 avg_d=1.213 std_dev=0.714
N7	B	0, 0.486, 1.223, 1.960, 2.044 max_d=2.044 avg_d=1.223 std_dev=0.737
C3'	B	0, 0.709, 1.459, 2.209, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.459 std_dev=0.750
C2'	B	0, 0.990, 1.749, 2.508, 2.522 max_d=2.522 avg_d=1.749 std_dev=0.759
C4'	B	0, 0.571, 1.352, 2.133, 2.319 max_d=2.319 avg_d=1.352 std_dev=0.781
C5'	B	0, 0.652, 1.480, 2.308, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.480 std_dev=0.828
C1'	B	0, 0.570, 1.403, 2.236, 2.448 max_d=2.448 avg_d=1.403 std_dev=0.833
O4'	B	0, 0.435, 1.289, 2.143, 2.337 max_d=2.337 avg_d=1.289 std_dev=0.854
C8	B	0, 0.511, 1.379, 2.247, 2.408 max_d=2.408 avg_d=1.379 std_dev=0.868
O3'	B	0, 0.590, 1.486, 2.381, 2.549 max_d=2.549 avg_d=1.486 std_dev=0.896
O5'	B	0, 0.674, 1.577, 2.480, 2.570 max_d=2.570 avg_d=1.577 std_dev=0.903
P	B	0, 0.705, 1.792, 2.879, 3.123 max_d=3.123 avg_d=1.792 std_dev=1.087
OP2	B	0, 0.670, 1.792, 2.913, 3.305 max_d=3.305 avg_d=1.792 std_dev=1.122
O2'	B	0, 1.710, 2.839, 3.968, 3.984 max_d=3.984 avg_d=2.839 std_dev=1.129
OP1	B	0, 0.755, 1.908, 3.061, 3.217 max_d=3.217 avg_d=1.908 std_dev=1.153

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.67	0.32	0.29
C2	0.04	0.00	0.10	0.07	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.09	0.13	0.25	0.57	0.26	0.21
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.09	0.09	0.08	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00	0.07	0.57	0.27	0.20
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.11	0.09	0.06	0.12	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.17	0.43	0.26	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.08	0.07	0.22	0.61	0.28	0.23
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.07	0.07	0.06	0.07	0.07	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.47	0.27	0.18
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.07	0.26	0.55	0.28	0.20
C5'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.11	0.11	0.12	0.09	0.13	0.12	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.30	0.27	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.14	0.10	0.28	0.51	0.26	0.18
C8	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.13	0.03	0.22	0.57	0.31	0.23
N1	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.12	0.13	0.28	0.53	0.25	0.18
N3	0.03	0.00	0.09	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.11	0.22	0.61	0.27	0.23
N6	0.04	0.01	0.08	0.12	0.02	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.17	0.11	0.31	0.46	0.26	0.16
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.16	0.03	0.25	0.52	0.29	0.20
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.19	0.63	0.30	0.25
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.03	0.07	0.03	0.11	0.12	0.06	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.61	0.33	0.29
O3'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.08	0.03	0.13	0.04	0.14	0.13	0.12	0.07	0.17	0.16	0.06	0.04	0.00	0.02	0.30	0.30	0.33	0.12
O4'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.10	0.03	0.13	0.11	0.11	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.21	0.65	0.33	0.31
O5'	0.13	0.25	0.07	0.17	0.22	0.01	0.26	0.01	0.28	0.22	0.28	0.22	0.31	0.25	0.19	0.06	0.30	0.21	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.67	0.57	0.57	0.43	0.61	0.47	0.55	0.30	0.51	0.57	0.53	0.61	0.46	0.52	0.63	0.61	0.30	0.65	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.26	0.27	0.26	0.28	0.27	0.28	0.27	0.26	0.31	0.25	0.27	0.26	0.29	0.30	0.33	0.33	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.21	0.20	0.09	0.23	0.18	0.20	0.01	0.18	0.23	0.18	0.23	0.16	0.20	0.25	0.29	0.12	0.31	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.12	0.23	0.23	0.21	0.22	0.26	0.20	0.23	0.30	0.15	0.11	0.15	0.32	0.24	0.23	0.22	0.22	0.12	0.27	0.08	0.05	0.06
C2	0.13	0.10	0.14	0.13	0.13	0.12	0.18	0.13	0.18	0.19	0.11	0.14	0.11	0.22	0.15	0.18	0.13	0.11	0.16	0.24	0.16	0.25	0.20
C2'	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.10	0.08	0.10	0.13	0.05	0.12	0.06	0.15	0.08	0.08	0.08	0.07	0.11	0.14	0.13	0.19	0.13
C3'	0.13	0.08	0.13	0.14	0.12	0.16	0.17	0.17	0.15	0.21	0.08	0.14	0.08	0.24	0.15	0.12	0.13	0.16	0.11	0.20	0.08	0.06	0.06
C4	0.20	0.12	0.21	0.20	0.20	0.18	0.25	0.14	0.24	0.28	0.15	0.10	0.14	0.30	0.22	0.24	0.20	0.18	0.07	0.28	0.06	0.09	0.03
C4'	0.35	0.18	0.36	0.36	0.32	0.38	0.38	0.39	0.34	0.46	0.22	0.13	0.23	0.48	0.37	0.33	0.33	0.37	0.32	0.38	0.28	0.21	0.27
C5	0.27	0.16	0.28	0.26	0.27	0.25	0.33	0.22	0.31	0.36	0.21	0.10	0.20	0.38	0.30	0.30	0.26	0.25	0.14	0.35	0.14	0.06	0.09
C5'	0.47	0.25	0.49	0.50	0.43	0.52	0.50	0.55	0.43	0.60	0.29	0.18	0.32	0.61	0.50	0.45	0.45	0.51	0.49	0.48	0.46	0.40	0.46
C6	0.27	0.17	0.28	0.25	0.28	0.23	0.34	0.19	0.33	0.36	0.24	0.09	0.20	0.39	0.30	0.32	0.25	0.23	0.11	0.36	0.13	0.06	0.07
C8	0.30	0.16	0.30	0.30	0.29	0.30	0.34	0.29	0.30	0.39	0.20	0.11	0.21	0.40	0.32	0.31	0.29	0.30	0.21	0.34	0.20	0.12	0.17
N1	0.18	0.11	0.20	0.17	0.20	0.14	0.26	0.11	0.27	0.26	0.18	0.11	0.14	0.30	0.21	0.25	0.18	0.14	0.09	0.32	0.08	0.16	0.10
N3	0.13	0.10	0.14	0.13	0.13	0.11	0.17	0.10	0.17	0.19	0.11	0.13	0.10	0.21	0.15	0.17	0.14	0.11	0.12	0.21	0.13	0.22	0.16
N6	0.35	0.24	0.36	0.33	0.36	0.31	0.42	0.28	0.39	0.44	0.31	0.11	0.28	0.46	0.38	0.39	0.32	0.32	0.21	0.40	0.23	0.14	0.18
N7	0.33	0.19	0.34	0.33	0.32	0.33	0.38	0.31	0.34	0.42	0.24	0.11	0.24	0.44	0.36	0.35	0.31	0.33	0.24	0.37	0.24	0.15	0.20
N9	0.23	0.13	0.24	0.23	0.23	0.23	0.28	0.20	0.25	0.31	0.16	0.10	0.16	0.34	0.26	0.25	0.23	0.23	0.12	0.29	0.10	0.06	0.07
O2'	0.09	0.10	0.10	0.10	0.10	0.10	0.12	0.11	0.11	0.14	0.09	0.13	0.09	0.16	0.11	0.09	0.08	0.09	0.14	0.14	0.16	0.22	0.17
O3'	0.07	0.09	0.08	0.08	0.07	0.11	0.13	0.13	0.11	0.16	0.05	0.17	0.07	0.20	0.09	0.07	0.10	0.10	0.09	0.17	0.07	0.07	0.06
O4'	0.41	0.23	0.42	0.42	0.38	0.42	0.44	0.40	0.39	0.51	0.27	0.16	0.29	0.53	0.43	0.41	0.39	0.42	0.33	0.43	0.30	0.22	0.28
O5'	0.64	0.40	0.65	0.67	0.58	0.69	0.63	0.72	0.55	0.74	0.42	0.30	0.48	0.74	0.65	0.61	0.61	0.68	0.67	0.57	0.64	0.59	0.64
OP1	0.21	0.42	0.21	0.21	0.24	0.22	0.23	0.23	0.29	0.25	0.40	0.55	0.32	0.25	0.21	0.21	0.20	0.21	0.20	0.30	0.19	0.20	0.20
OP2	0.28	0.20	0.28	0.29	0.23	0.31	0.23	0.31	0.18	0.33	0.17	0.26	0.21	0.31	0.27	0.26	0.27	0.31	0.23	0.16	0.19	0.17	0.19
P	0.27	0.12	0.28	0.30	0.19	0.33	0.23	0.35	0.14	0.36	0.09	0.22	0.13	0.35	0.27	0.25	0.25	0.31	0.28	0.15	0.24	0.19	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.12	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.06	0.03	0.01	0.09	0.02	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.13	0.11	0.25	0.01	0.21	0.32	0.28
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.06	0.04	0.08	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.18	0.22	0.16
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.18	0.18	0.11
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.08	0.06	0.21	0.01	0.20	0.27	0.24
C4'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.05	0.07	0.10	0.08	0.05	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.06	0.04
C5	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.03	0.23	0.01	0.25	0.33	0.28
C5'	0.03	0.18	0.05	0.01	0.13	0.00	0.13	0.00	0.16	0.09	0.18	0.20	0.16	0.11	0.07	0.02	0.05	0.01	0.01	0.16	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.05	0.26	0.00	0.27	0.38	0.32
C8	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.04	0.06	0.15	0.01	0.21	0.22	0.20
N1	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.08	0.27	0.00	0.25	0.37	0.31
N2	0.03	0.01	0.08	0.04	0.01	0.10	0.02	0.20	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.19	0.15	0.13	0.26	0.01	0.21	0.32	0.28
N3	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.12	0.11	0.23	0.01	0.19	0.27	0.24
N7	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.03	0.04	0.19	0.02	0.27	0.31	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.14	0.01	0.16	0.19	0.17
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.06	0.06	0.07	0.02	0.08	0.14	0.11	0.19	0.14	0.12	0.04	0.00	0.02	0.03	0.07	0.09	0.19	0.29	0.18
O3'	0.07	0.13	0.01	0.00	0.08	0.01	0.05	0.05	0.07	0.04	0.10	0.15	0.12	0.03	0.05	0.02	0.00	0.05	0.06	0.06	0.23	0.20	0.13
O4'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.13	0.11	0.04	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.04	0.09	0.05	0.05
O5'	0.06	0.25	0.09	0.04	0.21	0.01	0.23	0.01	0.26	0.15	0.27	0.26	0.23	0.19	0.14	0.07	0.06	0.05	0.00	0.26	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.06	0.04	0.26	0.00	0.29	0.41	0.34
OP1	0.12	0.21	0.18	0.18	0.20	0.13	0.25	0.07	0.27	0.21	0.25	0.21	0.19	0.27	0.16	0.19	0.23	0.09	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.32	0.22	0.18	0.27	0.06	0.33	0.02	0.38	0.22	0.37	0.32	0.27	0.31	0.19	0.29	0.20	0.05	0.02	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.28	0.16	0.11	0.24	0.04	0.28	0.01	0.32	0.20	0.31	0.28	0.24	0.27	0.17	0.18	0.13	0.05	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00