Doublet Group distance statistics: 51432

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.001, 0.015, 0.030, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.020, 0.035, 0.050, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.004, 0.022, 0.039, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.020, 0.040, 0.060, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.040 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.004, 0.024, 0.045, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.024 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.031, 0.055, 0.079, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.055 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.044, 0.076, 0.107, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.076 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.047, 0.082, 0.117, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.082 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.034, 0.085, 0.136, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.085 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.059, 0.132, 0.206, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.132 std_dev=0.073
C3'	A	0, 0.032, 0.138, 0.245, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.138 std_dev=0.107
C4'	A	0, -0.004, 0.135, 0.274, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.135 std_dev=0.139
O3'	A	0, 0.049, 0.209, 0.370, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.209 std_dev=0.160
O2'	A	0, 0.085, 0.272, 0.458, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.272 std_dev=0.187
C5'	A	0, 0.033, 0.256, 0.478, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.256 std_dev=0.223
O5'	A	0, 0.061, 0.291, 0.521, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.291 std_dev=0.230
OP2	B	0, 0.117, 0.396, 0.675, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.396 std_dev=0.279
N2	B	0, 0.235, 0.518, 0.801, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.518 std_dev=0.283
O5'	B	0, 0.221, 0.523, 0.824, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.523 std_dev=0.302
P	B	0, 0.139, 0.440, 0.742, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.440 std_dev=0.302
OP1	B	0, 0.105, 0.424, 0.743, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.424 std_dev=0.319
C2	B	0, 0.175, 0.548, 0.922, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.548 std_dev=0.374
P	A	0, 0.031, 0.411, 0.791, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.411 std_dev=0.380
OP2	A	0, 0.073, 0.465, 0.858, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.465 std_dev=0.393
N1	B	0, 0.181, 0.580, 0.978, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.580 std_dev=0.399
N3	B	0, 0.119, 0.561, 1.004, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.561 std_dev=0.442
OP1	A	0, 0.120, 0.584, 1.048, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.584 std_dev=0.464
C6	B	0, 0.162, 0.640, 1.119, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.640 std_dev=0.479
O6	B	0, 0.194, 0.706, 1.218, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.706 std_dev=0.512
C4	B	0, 0.087, 0.601, 1.115, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.601 std_dev=0.514
C5	B	0, 0.114, 0.639, 1.165, 1.980 max_d=1.980 avg_d=0.639 std_dev=0.526
O2'	B	0, 0.053, 0.598, 1.143, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.598 std_dev=0.545
C2'	B	0, 0.064, 0.635, 1.207, 2.043 max_d=2.043 avg_d=0.635 std_dev=0.572
O3'	B	0, 0.161, 0.733, 1.306, 2.120 max_d=2.120 avg_d=0.733 std_dev=0.573
N9	B	0, 0.049, 0.633, 1.217, 2.126 max_d=2.126 avg_d=0.633 std_dev=0.584
N7	B	0, 0.098, 0.699, 1.299, 2.282 max_d=2.282 avg_d=0.699 std_dev=0.600
C1'	B	0, 0.020, 0.633, 1.246, 2.196 max_d=2.196 avg_d=0.633 std_dev=0.613
C3'	B	0, 0.074, 0.694, 1.314, 2.211 max_d=2.211 avg_d=0.694 std_dev=0.620
C8	B	0, 0.063, 0.691, 1.320, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.691 std_dev=0.629
O4'	B	0, 0.011, 0.648, 1.284, 2.289 max_d=2.289 avg_d=0.648 std_dev=0.637
C4'	B	0, 0.027, 0.710, 1.393, 2.482 max_d=2.482 avg_d=0.710 std_dev=0.683
C5'	B	0, -0.057, 0.792, 1.641, 3.149 max_d=3.149 avg_d=0.792 std_dev=0.849

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.05
C2	0.03	0.00	0.09	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.09	0.02	0.09	0.01	0.12	0.20	0.13
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.08	0.10	0.09	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.07	0.05	0.02
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.10	0.02	0.07	0.05	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.12	0.09	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.02	0.01	0.11	0.01	0.12	0.17	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.05	0.09	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.04	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.02	0.17	0.01	0.20	0.25	0.20
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.12	0.16	0.08	0.02	0.02	0.17	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.15	0.04	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01	0.18	0.01	0.23	0.29	0.23
C8	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.18	0.01	0.18	0.18	0.17
N1	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.05	0.02	0.14	0.01	0.18	0.25	0.19
N2	0.04	0.00	0.10	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.12	0.03	0.07	0.02	0.09	0.18	0.12
N3	0.04	0.00	0.09	0.05	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.08	0.03	0.07	0.01	0.08	0.15	0.10
N7	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.22	0.01	0.25	0.27	0.24
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.09	0.01	0.09	0.12	0.10
O2'	0.02	0.17	0.00	0.01	0.09	0.03	0.08	0.03	0.12	0.02	0.16	0.19	0.15	0.03	0.03	0.00	0.03	0.05	0.04	0.11	0.08	0.05	0.03
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.09	0.05	0.12	0.08	0.08	0.03	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.17	0.14	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.11	0.10
O5'	0.02	0.09	0.03	0.04	0.11	0.01	0.17	0.01	0.18	0.18	0.14	0.07	0.07	0.22	0.09	0.04	0.05	0.04	0.00	0.21	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.02	0.02	0.21	0.00	0.28	0.34	0.28
OP1	0.02	0.12	0.07	0.12	0.12	0.04	0.20	0.04	0.23	0.18	0.18	0.09	0.08	0.25	0.09	0.08	0.17	0.05	0.01	0.28	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.20	0.05	0.09	0.17	0.03	0.25	0.02	0.29	0.18	0.25	0.18	0.15	0.27	0.12	0.05	0.14	0.11	0.02	0.34	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.13	0.02	0.06	0.13	0.03	0.20	0.02	0.23	0.17	0.19	0.12	0.10	0.24	0.10	0.03	0.09	0.10	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.14	0.06	0.08	0.12	0.14	0.19	0.26	0.25	0.15	0.22	0.13	0.09	0.20	0.10	0.08	0.19	0.08	0.06	0.33	0.11	0.10	0.07
C2	0.16	0.28	0.13	0.08	0.25	0.08	0.31	0.14	0.36	0.26	0.35	0.26	0.23	0.31	0.23	0.07	0.15	0.16	0.05	0.41	0.13	0.16	0.07
C2'	0.06	0.13	0.07	0.12	0.11	0.18	0.17	0.30	0.23	0.14	0.20	0.14	0.10	0.19	0.10	0.12	0.22	0.09	0.10	0.30	0.12	0.12	0.10
C3'	0.06	0.09	0.05	0.12	0.09	0.18	0.14	0.30	0.19	0.12	0.15	0.10	0.08	0.16	0.08	0.10	0.23	0.10	0.08	0.27	0.11	0.09	0.07
C4	0.07	0.17	0.07	0.09	0.15	0.16	0.23	0.29	0.29	0.17	0.26	0.15	0.11	0.23	0.13	0.09	0.21	0.07	0.05	0.36	0.15	0.10	0.08
C4'	0.05	0.10	0.05	0.10	0.09	0.16	0.15	0.28	0.20	0.12	0.16	0.10	0.08	0.17	0.08	0.09	0.21	0.09	0.06	0.28	0.12	0.09	0.07
C5	0.06	0.15	0.10	0.17	0.13	0.25	0.21	0.41	0.28	0.15	0.25	0.12	0.09	0.22	0.10	0.15	0.28	0.07	0.10	0.35	0.21	0.12	0.14
C5'	0.09	0.09	0.05	0.10	0.09	0.15	0.13	0.28	0.17	0.12	0.13	0.11	0.09	0.15	0.09	0.08	0.21	0.13	0.06	0.25	0.09	0.08	0.04
C6	0.06	0.18	0.12	0.19	0.15	0.28	0.24	0.45	0.31	0.17	0.29	0.15	0.11	0.24	0.12	0.18	0.31	0.07	0.13	0.38	0.26	0.15	0.19
C8	0.07	0.13	0.10	0.17	0.12	0.25	0.19	0.41	0.25	0.14	0.21	0.11	0.09	0.19	0.10	0.15	0.27	0.10	0.09	0.33	0.18	0.12	0.13
N1	0.10	0.27	0.10	0.11	0.23	0.17	0.30	0.30	0.36	0.23	0.35	0.25	0.19	0.29	0.19	0.12	0.24	0.08	0.09	0.41	0.23	0.11	0.12
N2	0.25	0.35	0.20	0.16	0.33	0.11	0.37	0.09	0.41	0.33	0.39	0.33	0.31	0.37	0.31	0.09	0.11	0.25	0.11	0.44	0.08	0.24	0.14
N3	0.14	0.23	0.11	0.06	0.21	0.08	0.27	0.16	0.33	0.23	0.30	0.21	0.18	0.28	0.19	0.06	0.14	0.14	0.05	0.38	0.10	0.14	0.07
N7	0.10	0.14	0.14	0.22	0.13	0.30	0.20	0.48	0.26	0.15	0.22	0.12	0.11	0.20	0.11	0.19	0.31	0.13	0.12	0.33	0.22	0.15	0.17
N9	0.05	0.13	0.07	0.11	0.12	0.18	0.20	0.31	0.26	0.14	0.23	0.12	0.09	0.20	0.10	0.10	0.22	0.07	0.06	0.34	0.14	0.10	0.08
O2'	0.11	0.18	0.12	0.15	0.16	0.22	0.21	0.30	0.26	0.17	0.24	0.19	0.15	0.22	0.14	0.17	0.25	0.10	0.17	0.33	0.18	0.18	0.16
O3'	0.07	0.10	0.07	0.14	0.09	0.20	0.14	0.31	0.18	0.12	0.15	0.11	0.09	0.16	0.08	0.13	0.25	0.11	0.12	0.26	0.13	0.10	0.09
O4'	0.05	0.13	0.06	0.09	0.11	0.16	0.18	0.27	0.24	0.14	0.21	0.12	0.09	0.19	0.09	0.09	0.20	0.07	0.05	0.32	0.11	0.10	0.07
O5'	0.13	0.12	0.09	0.11	0.12	0.13	0.15	0.27	0.18	0.14	0.13	0.14	0.13	0.17	0.13	0.08	0.20	0.16	0.10	0.25	0.10	0.10	0.07
O6	0.12	0.17	0.19	0.28	0.15	0.38	0.23	0.58	0.30	0.17	0.28	0.13	0.11	0.23	0.13	0.25	0.38	0.15	0.20	0.37	0.32	0.25	0.26
OP1	0.19	0.18	0.15	0.14	0.18	0.14	0.19	0.28	0.19	0.19	0.16	0.22	0.20	0.21	0.18	0.13	0.20	0.22	0.15	0.25	0.10	0.10	0.08
OP2	0.22	0.22	0.18	0.18	0.20	0.19	0.20	0.32	0.20	0.21	0.18	0.27	0.23	0.22	0.21	0.17	0.23	0.26	0.20	0.26	0.15	0.14	0.14
P	0.17	0.16	0.12	0.14	0.16	0.16	0.17	0.30	0.18	0.17	0.15	0.20	0.18	0.19	0.16	0.12	0.22	0.21	0.14	0.25	0.11	0.09	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.02	0.22	0.09	0.16
C2	0.03	0.00	0.07	0.17	0.01	0.27	0.01	0.53	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.21	0.07	0.26	0.02	0.25	0.21	0.25
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.04	0.06	0.04	0.07	0.09	0.06	0.11	0.07	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.17	0.05	0.08
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.03	0.11	0.05	0.14	0.21	0.15	0.05	0.05	0.02	0.01	0.03	0.06	0.11	0.18	0.07	0.05
C4	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.15	0.00	0.34	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.03	0.27	0.01	0.25	0.14	0.21
C4'	0.02	0.27	0.04	0.01	0.15	0.00	0.13	0.00	0.18	0.03	0.23	0.32	0.24	0.06	0.06	0.09	0.04	0.00	0.01	0.17	0.12	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.13	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.03	0.27	0.01	0.27	0.19	0.23
C5'	0.05	0.53	0.04	0.03	0.34	0.00	0.35	0.00	0.43	0.17	0.50	0.59	0.45	0.26	0.19	0.12	0.11	0.03	0.01	0.44	0.20	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.18	0.01	0.43	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.04	0.28	0.01	0.29	0.25	0.26
C8	0.03	0.02	0.09	0.05	0.01	0.03	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.14	0.07	0.01	0.25	0.02	0.26	0.13	0.20
N1	0.01	0.00	0.06	0.14	0.01	0.23	0.01	0.50	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.17	0.05	0.27	0.02	0.28	0.26	0.27
N2	0.06	0.01	0.11	0.21	0.02	0.32	0.01	0.59	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.16	0.28	0.09	0.23	0.02	0.25	0.25	0.27
N3	0.03	0.01	0.07	0.15	0.01	0.24	0.01	0.45	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.06	0.26	0.02	0.22	0.13	0.20
N7	0.03	0.01	0.09	0.05	0.01	0.06	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.08	0.02	0.27	0.02	0.27	0.17	0.22
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.25	0.02	0.25	0.11	0.19
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.03	0.09	0.08	0.12	0.07	0.14	0.05	0.16	0.09	0.14	0.05	0.00	0.02	0.06	0.08	0.10	0.08	0.14	0.10
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.10	0.04	0.09	0.11	0.13	0.07	0.17	0.28	0.18	0.08	0.04	0.02	0.00	0.03	0.17	0.14	0.05	0.19	0.12
O4'	0.00	0.07	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.01	0.05	0.09	0.06	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.23	0.04	0.25	0.12	0.18
O5'	0.20	0.26	0.09	0.06	0.27	0.01	0.27	0.01	0.28	0.25	0.27	0.23	0.26	0.27	0.25	0.08	0.17	0.23	0.00	0.28	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.11	0.01	0.17	0.01	0.44	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.10	0.14	0.04	0.28	0.00	0.31	0.28	0.28
OP1	0.22	0.25	0.17	0.18	0.25	0.12	0.27	0.20	0.29	0.26	0.28	0.25	0.22	0.27	0.25	0.08	0.05	0.25	0.02	0.31	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.21	0.05	0.07	0.14	0.16	0.19	0.28	0.25	0.13	0.26	0.25	0.13	0.17	0.11	0.14	0.19	0.12	0.02	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.25	0.08	0.05	0.21	0.02	0.23	0.01	0.26	0.20	0.27	0.27	0.20	0.22	0.19	0.10	0.12	0.18	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00