Doublet Group distance statistics: 51442

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C6	A	0, -0.001, 0.011, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.013
C4	A	0, -0.002, 0.012, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N1	A	0, -0.003, 0.014, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N3	A	0, -0.002, 0.021, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.006, 0.019, 0.045, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.019 std_dev=0.025
O6	A	0, -0.001, 0.026, 0.053, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.027
C1'	A	0, -0.008, 0.024, 0.055, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.024 std_dev=0.031
N2	A	0, -0.005, 0.042, 0.089, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.042 std_dev=0.047
P	B	0, -0.012, 0.292, 0.596, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.292 std_dev=0.304
OP1	B	0, -0.018, 0.332, 0.682, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.332 std_dev=0.350
O5'	B	0, -0.036, 0.440, 0.916, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.440 std_dev=0.476
O4'	A	0, -0.144, 0.409, 0.963, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.409 std_dev=0.553
C2'	A	0, -0.143, 0.412, 0.966, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.412 std_dev=0.555
OP2	B	0, -0.072, 0.585, 1.243, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.585 std_dev=0.658
C3'	A	0, -0.208, 0.602, 1.411, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.602 std_dev=0.810
C4'	A	0, -0.220, 0.603, 1.426, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.603 std_dev=0.823
O5'	A	0, -0.216, 0.627, 1.471, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.627 std_dev=0.843
OP1	A	0, -0.227, 0.674, 1.575, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.674 std_dev=0.901
P	A	0, -0.238, 0.702, 1.641, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.702 std_dev=0.940
O2'	A	0, -0.277, 0.735, 1.747, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.735 std_dev=1.012
C5'	B	0, -0.164, 0.873, 1.910, 2.331 max_d=2.331 avg_d=0.873 std_dev=1.037
C5'	A	0, -0.271, 0.794, 1.858, 2.298 max_d=2.298 avg_d=0.794 std_dev=1.064
O3'	A	0, -0.310, 0.916, 2.142, 2.649 max_d=2.649 avg_d=0.916 std_dev=1.226
C4'	B	0, -0.389, 1.375, 3.139, 3.865 max_d=3.865 avg_d=1.375 std_dev=1.764
OP2	A	0, -0.535, 1.395, 3.326, 4.125 max_d=4.125 avg_d=1.395 std_dev=1.930
C3'	B	0, -0.443, 1.491, 3.425, 4.222 max_d=4.222 avg_d=1.491 std_dev=1.934
O4'	B	0, -0.448, 1.527, 3.501, 4.314 max_d=4.314 avg_d=1.527 std_dev=1.974
O3'	B	0, -0.546, 1.673, 3.893, 4.810 max_d=4.810 avg_d=1.673 std_dev=2.220
C8	B	0, -0.629, 1.726, 4.080, 5.055 max_d=5.055 avg_d=1.726 std_dev=2.354
C1'	B	0, -0.644, 1.957, 4.559, 5.634 max_d=5.634 avg_d=1.957 std_dev=2.601
C2'	B	0, -0.656, 2.018, 4.693, 5.797 max_d=5.797 avg_d=2.018 std_dev=2.674
N9	B	0, -0.716, 2.008, 4.731, 5.858 max_d=5.858 avg_d=2.008 std_dev=2.724
N7	B	0, -0.810, 2.053, 4.917, 6.103 max_d=6.103 avg_d=2.053 std_dev=2.864
O2'	B	0, -0.818, 2.492, 5.802, 7.170 max_d=7.170 avg_d=2.492 std_dev=3.310
C4	B	0, -0.933, 2.515, 5.964, 7.391 max_d=7.391 avg_d=2.515 std_dev=3.448
C5	B	0, -0.985, 2.521, 6.027, 7.479 max_d=7.479 avg_d=2.521 std_dev=3.506
N3	B	0, -1.092, 3.002, 7.095, 8.789 max_d=8.789 avg_d=3.002 std_dev=4.093
C6	B	0, -1.196, 3.091, 7.378, 9.153 max_d=9.153 avg_d=3.091 std_dev=4.287
O6	B	0, -1.284, 3.328, 7.940, 9.849 max_d=9.849 avg_d=3.328 std_dev=4.612
C2	B	0, -1.278, 3.456, 8.189, 10.149 max_d=10.149 avg_d=3.456 std_dev=4.734
N1	B	0, -1.323, 3.507, 8.336, 10.336 max_d=10.336 avg_d=3.507 std_dev=4.829
N2	B	0, -1.459, 3.991, 9.440, 11.696 max_d=11.696 avg_d=3.991 std_dev=5.450

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.09	0.03	0.01	0.04	0.08	0.05	0.03	0.01	0.03	0.32	0.01	0.17	0.02	0.37	0.06	0.18
C2	0.05	0.00	0.30	0.17	0.01	0.10	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.25	0.24	0.08	0.01	0.46	0.22	0.07
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.15	0.00	0.06	0.22	0.13	0.18	0.23	0.34	0.30	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.48	0.10	0.69	0.33	0.56
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.20	0.00	0.26	0.01	0.27	0.20	0.24	0.12	0.15	0.25	0.17	0.03	0.00	0.01	0.04	0.31	0.03	0.04	0.10
C4	0.03	0.01	0.15	0.20	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.16	0.14	0.07	0.00	0.49	0.21	0.07
C4'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.15	0.09	0.05	0.02	0.32	0.03	0.01	0.02	0.02	0.21	0.19	0.03
C5	0.02	0.02	0.06	0.26	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.04	0.10	0.01	0.01	0.55	0.36	0.02
C5'	0.09	0.15	0.22	0.01	0.11	0.01	0.07	0.00	0.08	0.04	0.12	0.19	0.15	0.04	0.08	0.08	0.19	0.01	0.01	0.05	0.38	0.35	0.01
C6	0.03	0.02	0.13	0.27	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.22	0.05	0.14	0.02	0.00	0.54	0.43	0.05
C8	0.01	0.02	0.18	0.20	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.36	0.01	0.06	0.03	0.02	0.59	0.26	0.04
N1	0.04	0.01	0.23	0.24	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.15	0.20	0.02	0.01	0.50	0.35	0.01
N2	0.08	0.01	0.34	0.12	0.02	0.15	0.02	0.19	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.14	0.34	0.30	0.12	0.02	0.44	0.17	0.10
N3	0.05	0.01	0.30	0.15	0.01	0.09	0.02	0.15	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.28	0.22	0.11	0.01	0.44	0.14	0.10
N7	0.03	0.02	0.10	0.25	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.38	0.03	0.01	0.03	0.03	0.61	0.40	0.04
N9	0.01	0.02	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.19	0.13	0.03	0.09	0.00	0.49	0.13	0.10
O2'	0.03	0.04	0.01	0.03	0.12	0.32	0.25	0.08	0.22	0.36	0.09	0.14	0.08	0.38	0.19	0.00	0.01	0.21	0.35	0.27	0.67	0.30	0.50
O3'	0.32	0.25	0.01	0.00	0.16	0.03	0.04	0.19	0.05	0.01	0.15	0.34	0.28	0.03	0.13	0.01	0.00	0.24	0.19	0.01	0.52	0.28	0.21
O4'	0.01	0.24	0.02	0.01	0.14	0.01	0.10	0.01	0.14	0.06	0.20	0.30	0.22	0.01	0.03	0.21	0.24	0.00	0.01	0.11	0.02	0.07	0.04
O5'	0.17	0.08	0.48	0.04	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.12	0.11	0.03	0.09	0.35	0.19	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.31	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.27	0.01	0.11	0.07	0.00	0.55	0.53	0.11
OP1	0.37	0.46	0.69	0.03	0.49	0.21	0.55	0.38	0.54	0.59	0.50	0.44	0.44	0.61	0.49	0.67	0.52	0.02	0.02	0.55	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.22	0.33	0.04	0.21	0.19	0.36	0.35	0.43	0.26	0.35	0.17	0.14	0.40	0.13	0.30	0.28	0.07	0.01	0.53	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.07	0.56	0.10	0.07	0.03	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.10	0.10	0.04	0.10	0.50	0.21	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.55	0.64	0.44	0.10	0.79	0.07	1.01	0.28	1.02	1.04	0.82	0.52	0.61	1.19	0.78	0.29	0.33	0.25	0.06	1.18	0.38	0.05	0.16
C2	0.83	0.93	0.78	0.47	1.03	0.29	1.16	0.05	1.13	1.21	1.02	0.86	0.91	1.29	1.02	0.66	0.14	0.53	0.15	1.18	0.35	0.12	0.08
C2'	1.15	1.44	1.01	0.59	1.50	0.42	1.74	0.12	1.81	1.66	1.64	1.34	1.36	1.87	1.42	0.87	0.12	0.78	0.34	1.99	0.15	0.44	0.18
C3'	0.80	1.03	0.60	0.21	1.14	0.13	1.41	0.12	1.48	1.36	1.27	0.90	0.96	1.58	1.08	0.46	0.29	0.50	0.14	1.71	0.19	0.30	0.07
C4	0.57	0.77	0.45	0.13	0.87	0.05	1.10	0.25	1.14	1.09	0.96	0.67	0.71	1.27	0.83	0.28	0.28	0.29	0.06	1.30	0.35	0.17	0.09
C4'	0.23	0.34	0.06	0.32	0.52	0.39	0.80	0.56	0.84	0.83	0.59	0.18	0.29	1.03	0.50	0.15	0.81	0.07	0.28	1.08	0.51	0.06	0.29
C5	0.42	0.75	0.26	0.06	0.80	0.18	1.08	0.36	1.16	1.00	0.97	0.65	0.64	1.23	0.72	0.06	0.46	0.17	0.06	1.36	0.33	0.25	0.06
C5'	0.06	0.25	0.22	0.55	0.41	0.60	0.75	0.73	0.83	0.74	0.55	0.06	0.16	0.99	0.37	0.44	1.10	0.22	0.39	1.12	0.59	0.08	0.35
C6	0.42	0.79	0.27	0.04	0.81	0.14	1.06	0.33	1.15	0.95	0.99	0.71	0.68	1.19	0.72	0.07	0.38	0.18	0.06	1.33	0.32	0.31	0.04
C8	0.35	0.66	0.17	0.15	0.75	0.26	1.06	0.42	1.15	0.99	0.92	0.54	0.56	1.24	0.68	0.09	0.62	0.11	0.08	1.40	0.32	0.22	0.08
N1	0.65	0.88	0.55	0.27	0.94	0.13	1.11	0.14	1.13	1.08	1.01	0.82	0.82	1.23	0.88	0.39	0.06	0.39	0.11	1.24	0.35	0.27	0.05
N2	1.10	1.04	1.11	0.78	1.17	0.57	1.19	0.21	1.09	1.34	1.04	0.99	1.09	1.30	1.21	1.04	0.50	0.76	0.24	1.04	0.30	0.02	0.08
N3	0.76	0.85	0.70	0.36	0.97	0.19	1.12	0.11	1.11	1.17	0.97	0.77	0.83	1.28	0.96	0.57	0.02	0.45	0.10	1.20	0.36	0.09	0.11
N7	0.29	0.68	0.10	0.20	0.74	0.31	1.06	0.45	1.16	0.94	0.95	0.56	0.55	1.22	0.64	0.17	0.66	0.08	0.08	1.42	0.29	0.27	0.06
N9	0.50	0.71	0.36	0.06	0.81	0.11	1.07	0.31	1.12	1.05	0.92	0.59	0.64	1.25	0.77	0.18	0.41	0.22	0.06	1.31	0.35	0.15	0.11
O2'	1.26	1.52	1.25	0.78	1.55	0.51	1.69	0.11	1.74	1.61	1.64	1.47	1.46	1.75	1.47	1.17	0.40	0.81	0.27	1.84	0.36	0.16	0.04
O3'	0.44	0.69	0.25	0.18	0.77	0.24	1.02	0.49	1.10	0.94	0.91	0.57	0.61	1.16	0.69	0.16	0.65	0.14	0.32	1.32	0.61	0.17	0.37
O4'	0.06	0.08	0.15	0.45	0.27	0.53	0.54	0.68	0.55	0.61	0.31	0.08	0.05	0.78	0.28	0.31	0.91	0.22	0.39	0.77	0.61	0.20	0.42
O5'	0.23	0.56	0.06	0.38	0.67	0.44	1.03	0.57	1.15	0.94	0.88	0.39	0.43	1.23	0.58	0.29	0.94	0.06	0.22	1.46	0.42	0.11	0.18
O6	0.27	0.75	0.10	0.15	0.73	0.28	1.00	0.42	1.13	0.82	0.97	0.68	0.61	1.09	0.59	0.16	0.51	0.07	0.07	1.34	0.26	0.37	0.04
OP1	0.06	0.54	0.31	0.70	0.54	0.82	0.95	1.01	1.16	0.71	0.91	0.41	0.34	1.08	0.37	0.59	1.28	0.38	0.61	1.52	0.90	0.25	0.60
OP2	0.25	0.69	0.16	0.46	0.81	0.41	1.27	0.44	1.43	1.13	1.10	0.49	0.52	1.50	0.69	0.48	1.12	0.09	0.06	1.83	0.07	0.51	0.19
P	0.19	0.59	0.12	0.44	0.69	0.48	1.08	0.58	1.23	0.96	0.94	0.42	0.44	1.28	0.58	0.39	1.03	0.07	0.20	1.58	0.36	0.18	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.50	0.22
C2	0.01	0.00	0.34	0.34	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.19	0.42	0.19	0.13	0.03	0.15	0.51	0.28
C2'	0.01	0.34	0.00	0.01	0.20	0.01	0.15	0.00	0.21	0.05	0.29	0.38	0.32	0.02	0.07	0.00	0.03	0.02	0.05	0.19	0.02	0.44	0.18
C3'	0.02	0.34	0.01	0.00	0.22	0.01	0.19	0.01	0.26	0.02	0.32	0.37	0.30	0.09	0.10	0.02	0.02	0.03	0.08	0.24	0.09	0.29	0.10
C4	0.01	0.02	0.20	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.26	0.10	0.11	0.01	0.17	0.55	0.28
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.03	0.04	0.07	0.00	0.01	0.03	0.14	0.24	0.07
C5	0.00	0.02	0.15	0.19	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.25	0.05	0.14	0.01	0.24	0.55	0.29
C5'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.10	0.04	0.08	0.04	0.07	0.02	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.19	0.08	0.02
C6	0.00	0.02	0.21	0.26	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.34	0.09	0.16	0.01	0.26	0.51	0.29
C8	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.16	0.13	0.00	0.21	0.59	0.24
N1	0.00	0.01	0.29	0.32	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.41	0.15	0.15	0.03	0.21	0.50	0.29
N2	0.02	0.00	0.38	0.37	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.22	0.47	0.23	0.12	0.04	0.13	0.50	0.29
N3	0.01	0.00	0.32	0.30	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.17	0.36	0.17	0.11	0.02	0.12	0.52	0.27
N7	0.03	0.02	0.02	0.09	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.16	0.01	0.27	0.56	0.26
N9	0.00	0.03	0.07	0.10	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.00	0.08	0.02	0.15	0.56	0.26
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.09	0.04	0.07	0.04	0.11	0.03	0.16	0.22	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.10	0.13	0.39	0.11
O3'	0.01	0.42	0.03	0.02	0.26	0.07	0.25	0.05	0.34	0.03	0.41	0.47	0.36	0.13	0.12	0.01	0.00	0.04	0.10	0.33	0.23	0.14	0.02
O4'	0.01	0.19	0.02	0.03	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.16	0.15	0.23	0.17	0.08	0.00	0.03	0.04	0.00	0.07	0.07	0.02	0.37	0.15
O5'	0.02	0.13	0.05	0.08	0.11	0.01	0.14	0.01	0.16	0.13	0.15	0.12	0.11	0.16	0.08	0.02	0.10	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.03	0.19	0.24	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.10	0.33	0.07	0.17	0.00	0.31	0.48	0.30
OP1	0.05	0.15	0.02	0.09	0.17	0.14	0.24	0.19	0.26	0.21	0.21	0.13	0.12	0.27	0.15	0.13	0.23	0.02	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.50	0.51	0.44	0.29	0.55	0.24	0.55	0.08	0.51	0.59	0.50	0.50	0.52	0.56	0.56	0.39	0.14	0.37	0.01	0.48	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.28	0.18	0.10	0.28	0.07	0.29	0.02	0.29	0.24	0.29	0.29	0.27	0.26	0.26	0.11	0.02	0.15	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00