Doublet Group distance statistics: 51445

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 6, 9, 16, 16, 13, 13, 6, 2, 1, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.033 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.017, 0.038, 0.060, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.038 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.001, 0.023, 0.046, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.023 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.020, 0.048, 0.075, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.048 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.026, 0.057, 0.089, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.057 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.108, 0.215, 0.323, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.215 std_dev=0.108
O2'	A	0, 0.165, 0.276, 0.387, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.276 std_dev=0.111
O4'	A	0, 0.084, 0.202, 0.319, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.202 std_dev=0.118
C4'	A	0, 0.119, 0.305, 0.491, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.305 std_dev=0.186
P	B	0, 0.239, 0.425, 0.612, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.425 std_dev=0.187
C3'	A	0, 0.133, 0.329, 0.524, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.329 std_dev=0.196
O5'	A	0, 0.146, 0.356, 0.565, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.356 std_dev=0.210
P	A	0, 0.286, 0.515, 0.743, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.515 std_dev=0.229
OP2	B	0, 0.186, 0.436, 0.686, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.436 std_dev=0.250
C5'	A	0, 0.238, 0.494, 0.750, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.494 std_dev=0.256
OP2	A	0, 0.333, 0.593, 0.853, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.593 std_dev=0.260
OP1	A	0, 0.334, 0.635, 0.936, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.635 std_dev=0.301
O3'	A	0, 0.189, 0.501, 0.813, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.501 std_dev=0.312
O5'	B	0, 0.513, 0.946, 1.379, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.946 std_dev=0.433
OP1	B	0, 0.128, 0.590, 1.052, 2.029 max_d=2.029 avg_d=0.590 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.708, 1.315, 1.923, 2.275 max_d=2.275 avg_d=1.315 std_dev=0.607
C8	B	0, 0.794, 1.419, 2.044, 3.809 max_d=3.809 avg_d=1.419 std_dev=0.625
N7	B	0, 0.754, 1.419, 2.084, 4.984 max_d=4.984 avg_d=1.419 std_dev=0.665
C5	B	0, 0.783, 1.482, 2.180, 5.363 max_d=5.363 avg_d=1.482 std_dev=0.698
N9	B	0, 0.907, 1.611, 2.316, 3.408 max_d=3.408 avg_d=1.611 std_dev=0.705
C3'	B	0, 0.783, 1.526, 2.269, 3.004 max_d=3.004 avg_d=1.526 std_dev=0.743
C4	B	0, 0.936, 1.681, 2.426, 4.560 max_d=4.560 avg_d=1.681 std_dev=0.745
C4'	B	0, 0.861, 1.654, 2.447, 3.082 max_d=3.082 avg_d=1.654 std_dev=0.793
C6	B	0, 0.732, 1.526, 2.321, 6.605 max_d=6.605 avg_d=1.526 std_dev=0.795
C1'	B	0, 1.008, 1.856, 2.703, 3.379 max_d=3.379 avg_d=1.856 std_dev=0.848
C2'	B	0, 0.952, 1.812, 2.671, 3.491 max_d=3.491 avg_d=1.812 std_dev=0.859
O4'	B	0, 0.980, 1.845, 2.710, 3.372 max_d=3.372 avg_d=1.845 std_dev=0.865
N1	B	0, 0.884, 1.749, 2.615, 6.990 max_d=6.990 avg_d=1.749 std_dev=0.865
N6	B	0, 0.640, 1.524, 2.408, 7.567 max_d=7.567 avg_d=1.524 std_dev=0.884
O3'	B	0, 0.927, 1.817, 2.707, 3.540 max_d=3.540 avg_d=1.817 std_dev=0.890
N3	B	0, 1.109, 2.014, 2.919, 5.097 max_d=5.097 avg_d=2.014 std_dev=0.905
C2	B	0, 1.092, 2.010, 2.927, 6.300 max_d=6.300 avg_d=2.010 std_dev=0.918
O2'	B	0, 1.199, 2.309, 3.419, 4.382 max_d=4.382 avg_d=2.309 std_dev=1.110

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.02	0.08	0.17	0.07
C2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.15	0.05	0.16	0.01	0.14	0.23	0.16
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.10	0.12	0.10	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.11	0.08	0.15	0.12	0.07
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.10	0.08	0.11	0.12	0.09	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.14	0.11	0.20	0.11	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.17	0.01	0.13	0.22	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.10	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.21	0.01	0.18	0.25	0.19
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.10	0.08	0.06	0.05	0.11	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.12	0.11	0.14	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.04	0.21	0.01	0.19	0.27	0.21
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.21	0.02	0.16	0.21	0.17
N1	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.05	0.19	0.01	0.17	0.26	0.19
N2	0.04	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.06	0.15	0.01	0.13	0.23	0.15
N3	0.03	0.01	0.10	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.05	0.15	0.01	0.12	0.21	0.13
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.23	0.02	0.20	0.26	0.21
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.16	0.02	0.12	0.19	0.12
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.06	0.04	0.06	0.04	0.08	0.03	0.11	0.14	0.10	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.08	0.12	0.13	0.04
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.14	0.09	0.15	0.16	0.12	0.11	0.05	0.04	0.00	0.02	0.14	0.16	0.25	0.14	0.14
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.05	0.07	0.21	0.11
O5'	0.08	0.16	0.11	0.14	0.17	0.02	0.21	0.01	0.21	0.21	0.19	0.15	0.15	0.23	0.16	0.04	0.14	0.07	0.00	0.23	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.16	0.05	0.23	0.00	0.22	0.29	0.24
OP1	0.08	0.14	0.15	0.20	0.13	0.10	0.18	0.11	0.19	0.16	0.17	0.13	0.12	0.20	0.12	0.12	0.25	0.07	0.02	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.23	0.12	0.11	0.22	0.14	0.25	0.14	0.27	0.21	0.26	0.23	0.21	0.26	0.19	0.13	0.14	0.21	0.02	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.16	0.07	0.10	0.15	0.03	0.19	0.01	0.21	0.17	0.19	0.15	0.13	0.21	0.12	0.04	0.14	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.49	0.72	0.42	0.31	0.55	0.39	0.62	0.37	0.72	0.66	0.80	0.59	0.81	0.69	0.54	0.42	0.26	0.54	0.32	0.18	0.11	0.14
C2	0.37	0.65	0.36	0.30	0.47	0.31	0.54	0.32	0.69	0.50	0.74	0.51	0.78	0.52	0.41	0.33	0.28	0.42	0.29	0.14	0.11	0.12
C2'	0.57	0.70	0.47	0.38	0.59	0.49	0.67	0.47	0.73	0.73	0.77	0.59	0.83	0.76	0.61	0.49	0.30	0.65	0.35	0.27	0.16	0.23
C3'	0.60	0.70	0.48	0.39	0.61	0.52	0.69	0.50	0.75	0.74	0.78	0.60	0.84	0.77	0.63	0.50	0.31	0.69	0.35	0.33	0.17	0.26
C4	0.45	0.67	0.39	0.32	0.51	0.37	0.58	0.36	0.71	0.60	0.77	0.54	0.82	0.62	0.49	0.38	0.28	0.51	0.31	0.20	0.12	0.15
C4'	0.54	0.72	0.44	0.33	0.59	0.43	0.66	0.41	0.73	0.70	0.78	0.60	0.83	0.74	0.59	0.45	0.26	0.60	0.31	0.23	0.12	0.17
C5	0.46	0.65	0.38	0.32	0.51	0.39	0.59	0.37	0.72	0.58	0.75	0.52	0.84	0.61	0.49	0.37	0.28	0.54	0.32	0.26	0.15	0.17
C5'	0.53	0.71	0.43	0.32	0.58	0.42	0.65	0.40	0.74	0.68	0.78	0.60	0.83	0.72	0.58	0.44	0.27	0.60	0.31	0.25	0.15	0.16
C6	0.42	0.61	0.36	0.31	0.48	0.37	0.57	0.36	0.71	0.53	0.72	0.49	0.83	0.57	0.44	0.34	0.29	0.51	0.32	0.28	0.18	0.19
C8	0.51	0.69	0.42	0.33	0.55	0.42	0.62	0.39	0.74	0.64	0.79	0.57	0.85	0.66	0.54	0.41	0.28	0.58	0.33	0.26	0.14	0.17
N1	0.37	0.61	0.33	0.30	0.46	0.33	0.55	0.33	0.69	0.49	0.71	0.48	0.80	0.53	0.40	0.31	0.28	0.44	0.30	0.20	0.14	0.15
N2	0.33	0.67	0.35	0.28	0.48	0.27	0.54	0.30	0.69	0.43	0.74	0.55	0.73	0.46	0.38	0.33	0.28	0.34	0.29	0.12	0.13	0.11
N3	0.42	0.69	0.39	0.31	0.49	0.34	0.56	0.34	0.70	0.57	0.77	0.54	0.78	0.59	0.46	0.37	0.27	0.46	0.30	0.15	0.11	0.12
N7	0.50	0.67	0.40	0.33	0.53	0.42	0.61	0.39	0.74	0.61	0.77	0.54	0.86	0.64	0.52	0.39	0.29	0.58	0.34	0.29	0.16	0.19
N9	0.48	0.70	0.41	0.32	0.54	0.39	0.61	0.37	0.73	0.64	0.79	0.57	0.83	0.66	0.52	0.41	0.28	0.55	0.32	0.21	0.12	0.15
O2'	0.59	0.74	0.50	0.38	0.63	0.48	0.71	0.44	0.77	0.75	0.81	0.64	0.88	0.80	0.64	0.52	0.31	0.63	0.36	0.24	0.16	0.22
O3'	0.68	0.73	0.55	0.46	0.68	0.59	0.75	0.56	0.79	0.80	0.80	0.66	0.87	0.82	0.71	0.58	0.37	0.76	0.39	0.39	0.22	0.33
O4'	0.49	0.73	0.42	0.32	0.56	0.37	0.62	0.35	0.72	0.65	0.80	0.60	0.81	0.69	0.54	0.43	0.28	0.53	0.32	0.17	0.12	0.13
O5'	0.51	0.71	0.43	0.33	0.57	0.40	0.63	0.36	0.74	0.64	0.79	0.59	0.83	0.67	0.55	0.43	0.30	0.58	0.37	0.23	0.21	0.17
O6	0.43	0.59	0.35	0.31	0.47	0.38	0.58	0.36	0.71	0.52	0.70	0.47	0.84	0.58	0.44	0.33	0.29	0.52	0.33	0.35	0.22	0.22
OP1	0.55	0.71	0.45	0.35	0.59	0.43	0.65	0.39	0.74	0.66	0.79	0.60	0.83	0.68	0.58	0.46	0.31	0.62	0.35	0.28	0.20	0.17
OP2	0.52	0.72	0.43	0.36	0.58	0.43	0.65	0.40	0.77	0.61	0.81	0.60	0.87	0.65	0.55	0.42	0.34	0.59	0.35	0.38	0.27	0.23
P	0.50	0.71	0.41	0.33	0.57	0.39	0.63	0.36	0.74	0.62	0.79	0.59	0.84	0.65	0.54	0.41	0.31	0.57	0.34	0.28	0.22	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.15	0.25	0.20
C2	0.04	0.00	0.13	0.22	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.26	0.04	0.41	0.39	0.62	0.51
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.13	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.26	0.17	0.12
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.15	0.00	0.14	0.02	0.18	0.09	0.21	0.20	0.18	0.10	0.07	0.02	0.01	0.01	0.24	0.37	0.16	0.16
C4	0.02	0.01	0.07	0.15	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.15	0.02	0.38	0.37	0.51	0.47
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.12	0.11	0.11	0.08	0.13	0.12	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.17	0.22	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.11	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.15	0.02	0.46	0.51	0.63	0.60
C5'	0.04	0.20	0.02	0.02	0.19	0.01	0.24	0.00	0.27	0.22	0.24	0.16	0.30	0.26	0.15	0.04	0.04	0.02	0.01	0.20	0.28	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.18	0.01	0.12	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.20	0.02	0.49	0.57	0.72	0.66
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.11	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.38	0.44	0.42	0.49
N1	0.03	0.00	0.10	0.21	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.25	0.03	0.47	0.50	0.71	0.61
N3	0.04	0.00	0.13	0.20	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.22	0.04	0.35	0.31	0.51	0.43
N6	0.02	0.01	0.07	0.18	0.01	0.13	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.21	0.03	0.53	0.66	0.80	0.73
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.04	0.46	0.57	0.59	0.62
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.30	0.30	0.37	0.38
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.07	0.04	0.07	0.04	0.09	0.04	0.11	0.11	0.08	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.09	0.26	0.16	0.07
O3'	0.01	0.26	0.02	0.01	0.15	0.01	0.15	0.04	0.20	0.09	0.25	0.22	0.21	0.11	0.06	0.04	0.00	0.01	0.24	0.54	0.22	0.25
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.13	0.16	0.28	0.20
O5'	0.14	0.41	0.18	0.24	0.38	0.01	0.46	0.01	0.49	0.38	0.47	0.35	0.53	0.46	0.30	0.09	0.24	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.39	0.26	0.37	0.37	0.17	0.51	0.20	0.57	0.44	0.50	0.31	0.66	0.57	0.30	0.26	0.54	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.62	0.17	0.16	0.51	0.22	0.63	0.28	0.72	0.42	0.71	0.51	0.80	0.59	0.37	0.16	0.22	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.51	0.12	0.16	0.47	0.05	0.60	0.02	0.66	0.49	0.61	0.43	0.73	0.62	0.38	0.07	0.25	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00