Doublet Group distance statistics: 51450

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 3, 9, 1, 1, 3, 1, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.013, 0.027, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.015, 0.035, 0.054, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.035 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.015, 0.035, 0.055, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.035 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.017, 0.040, 0.063, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.040 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.019, 0.044, 0.068, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.044 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.014, 0.040, 0.066, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.040 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.025, 0.054, 0.083, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.054 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.047, 0.188, 0.329, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.188 std_dev=0.141
C2'	A	0, 0.053, 0.216, 0.380, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.216 std_dev=0.164
OP2	B	0, 0.171, 0.350, 0.529, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.350 std_dev=0.179
O2'	A	0, 0.073, 0.261, 0.449, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.261 std_dev=0.188
C4'	A	0, 0.096, 0.344, 0.592, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.344 std_dev=0.248
C3'	A	0, 0.076, 0.336, 0.596, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.336 std_dev=0.260
P	B	0, 0.218, 0.489, 0.761, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.489 std_dev=0.271
C5'	A	0, 0.182, 0.563, 0.945, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.563 std_dev=0.382
O5'	A	0, 0.239, 0.623, 1.008, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.623 std_dev=0.384
O5'	B	0, 0.283, 0.684, 1.086, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.684 std_dev=0.402
O3'	A	0, 0.102, 0.517, 0.931, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.517 std_dev=0.414
OP1	B	0, 0.151, 0.573, 0.994, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.573 std_dev=0.422
P	A	0, 0.350, 0.840, 1.329, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.840 std_dev=0.490
OP2	A	0, 0.324, 0.817, 1.310, 2.466 max_d=2.466 avg_d=0.817 std_dev=0.493
C5'	B	0, 0.296, 0.831, 1.365, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.831 std_dev=0.535
OP1	A	0, 0.506, 1.113, 1.721, 2.648 max_d=2.648 avg_d=1.113 std_dev=0.607
C4'	B	0, 0.181, 0.961, 1.741, 2.509 max_d=2.509 avg_d=0.961 std_dev=0.780
O3'	B	0, 0.181, 1.061, 1.941, 2.962 max_d=2.962 avg_d=1.061 std_dev=0.880
C3'	B	0, 0.066, 1.015, 1.964, 3.000 max_d=3.000 avg_d=1.015 std_dev=0.949
O4'	B	0, 0.045, 1.131, 2.217, 3.406 max_d=3.406 avg_d=1.131 std_dev=1.086
C2'	B	0, -0.029, 1.256, 2.541, 3.992 max_d=3.992 avg_d=1.256 std_dev=1.285
N3	B	0, 0.339, 1.624, 2.910, 4.259 max_d=4.259 avg_d=1.624 std_dev=1.286
O2'	B	0, 0.087, 1.418, 2.749, 4.382 max_d=4.382 avg_d=1.418 std_dev=1.331
C2	B	0, 0.525, 1.863, 3.202, 4.496 max_d=4.496 avg_d=1.863 std_dev=1.338
C1'	B	0, -0.085, 1.273, 2.630, 4.172 max_d=4.172 avg_d=1.273 std_dev=1.358
C4	B	0, 0.029, 1.491, 2.953, 4.476 max_d=4.476 avg_d=1.491 std_dev=1.462
N9	B	0, -0.130, 1.354, 2.838, 4.437 max_d=4.437 avg_d=1.354 std_dev=1.484
N1	B	0, 0.441, 1.957, 3.473, 4.981 max_d=4.981 avg_d=1.957 std_dev=1.516
C8	B	0, -0.152, 1.478, 3.107, 4.757 max_d=4.757 avg_d=1.478 std_dev=1.630
C5	B	0, -0.053, 1.602, 3.257, 4.959 max_d=4.959 avg_d=1.602 std_dev=1.655
C6	B	0, 0.137, 1.822, 3.508, 5.228 max_d=5.228 avg_d=1.822 std_dev=1.685
N7	B	0, -0.133, 1.608, 3.350, 5.129 max_d=5.129 avg_d=1.608 std_dev=1.741
N6	B	0, 0.097, 1.971, 3.845, 5.750 max_d=5.750 avg_d=1.971 std_dev=1.874

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.03	0.14	0.16	0.14
C2	0.06	0.00	0.22	0.23	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.30	0.04	0.26	0.01	0.29	0.42	0.33
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.13	0.02	0.09	0.02	0.14	0.06	0.19	0.25	0.21	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.13	0.13	0.15	0.09	0.12
C3'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.15	0.01	0.13	0.02	0.17	0.08	0.22	0.26	0.21	0.08	0.07	0.01	0.01	0.02	0.17	0.16	0.18	0.10	0.14
C4	0.03	0.01	0.13	0.15	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.18	0.03	0.26	0.01	0.28	0.38	0.31
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.08	0.11	0.09	0.10	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.09	0.11	0.02
C5	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.07	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.04	0.32	0.01	0.39	0.48	0.41
C5'	0.04	0.13	0.02	0.02	0.14	0.01	0.20	0.00	0.20	0.21	0.17	0.12	0.11	0.24	0.12	0.06	0.05	0.02	0.01	0.24	0.13	0.18	0.01
C6	0.04	0.01	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.23	0.04	0.33	0.01	0.42	0.54	0.44
C8	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.32	0.03	0.35	0.38	0.36
N1	0.05	0.01	0.19	0.22	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.21	0.29	0.04	0.30	0.01	0.36	0.50	0.39
N2	0.06	0.01	0.25	0.26	0.01	0.11	0.02	0.12	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.27	0.35	0.04	0.24	0.03	0.26	0.40	0.30
N3	0.06	0.01	0.21	0.21	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.26	0.04	0.23	0.01	0.24	0.35	0.27
N7	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.10	0.01	0.24	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.04	0.36	0.03	0.44	0.51	0.45
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.24	0.02	0.24	0.29	0.26
O2'	0.02	0.23	0.01	0.01	0.12	0.06	0.10	0.06	0.15	0.04	0.21	0.27	0.21	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.15	0.12	0.07	0.06
O3'	0.02	0.30	0.02	0.01	0.18	0.02	0.17	0.05	0.23	0.09	0.29	0.35	0.26	0.11	0.07	0.04	0.00	0.02	0.19	0.22	0.23	0.20	0.18
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.12	0.05	0.13	0.13	0.11
O5'	0.14	0.26	0.13	0.17	0.26	0.02	0.32	0.01	0.33	0.32	0.30	0.24	0.23	0.36	0.24	0.06	0.19	0.12	0.00	0.36	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.24	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.15	0.22	0.05	0.36	0.00	0.49	0.60	0.49
OP1	0.14	0.29	0.15	0.18	0.28	0.09	0.39	0.13	0.42	0.35	0.36	0.26	0.24	0.44	0.24	0.12	0.23	0.13	0.02	0.49	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.42	0.09	0.10	0.38	0.11	0.48	0.18	0.54	0.38	0.50	0.40	0.35	0.51	0.29	0.07	0.20	0.13	0.03	0.60	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.33	0.12	0.14	0.31	0.02	0.41	0.01	0.44	0.36	0.39	0.30	0.27	0.45	0.26	0.06	0.18	0.11	0.01	0.49	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.46	0.32	0.29	0.28	0.22	0.29	0.20	0.37	0.39	0.49	0.35	0.40	0.38	0.28	0.32	0.42	0.37	0.23	0.15	0.12	0.19
C2	0.19	0.38	0.26	0.26	0.19	0.16	0.22	0.15	0.34	0.31	0.41	0.27	0.39	0.28	0.18	0.23	0.39	0.28	0.20	0.13	0.10	0.15
C2'	0.24	0.59	0.32	0.27	0.32	0.23	0.36	0.26	0.54	0.35	0.68	0.42	0.64	0.35	0.26	0.29	0.39	0.38	0.25	0.30	0.26	0.32
C3'	0.24	0.60	0.32	0.27	0.33	0.23	0.36	0.26	0.55	0.33	0.68	0.43	0.65	0.34	0.26	0.29	0.38	0.37	0.24	0.33	0.27	0.32
C4	0.19	0.47	0.30	0.28	0.25	0.17	0.26	0.16	0.41	0.25	0.51	0.35	0.46	0.22	0.19	0.28	0.40	0.25	0.20	0.13	0.11	0.14
C4'	0.31	0.46	0.32	0.28	0.31	0.24	0.33	0.21	0.39	0.41	0.49	0.36	0.42	0.41	0.32	0.32	0.40	0.42	0.21	0.16	0.13	0.20
C5	0.17	0.50	0.27	0.26	0.29	0.16	0.31	0.16	0.47	0.17	0.55	0.38	0.54	0.19	0.18	0.25	0.35	0.19	0.18	0.16	0.13	0.13
C5'	0.25	0.46	0.31	0.28	0.28	0.16	0.30	0.13	0.39	0.33	0.49	0.36	0.41	0.33	0.26	0.31	0.42	0.33	0.14	0.15	0.13	0.11
C6	0.16	0.46	0.23	0.22	0.28	0.15	0.32	0.16	0.47	0.14	0.52	0.35	0.55	0.20	0.17	0.21	0.30	0.18	0.16	0.18	0.14	0.14
C8	0.20	0.54	0.31	0.28	0.31	0.17	0.32	0.16	0.48	0.20	0.59	0.41	0.54	0.21	0.21	0.29	0.38	0.22	0.19	0.15	0.12	0.13
N1	0.15	0.41	0.22	0.22	0.23	0.14	0.27	0.14	0.40	0.17	0.46	0.31	0.47	0.19	0.14	0.20	0.32	0.20	0.16	0.15	0.12	0.13
N2	0.23	0.30	0.25	0.27	0.17	0.18	0.24	0.17	0.29	0.47	0.33	0.21	0.35	0.46	0.25	0.23	0.42	0.35	0.24	0.14	0.11	0.19
N3	0.22	0.41	0.30	0.29	0.21	0.18	0.23	0.16	0.34	0.35	0.44	0.30	0.38	0.33	0.21	0.28	0.43	0.31	0.22	0.13	0.10	0.16
N7	0.19	0.54	0.28	0.26	0.32	0.17	0.35	0.17	0.51	0.17	0.60	0.41	0.59	0.21	0.20	0.26	0.34	0.19	0.18	0.16	0.14	0.13
N9	0.22	0.51	0.32	0.30	0.28	0.19	0.28	0.17	0.43	0.26	0.55	0.38	0.47	0.25	0.21	0.31	0.41	0.27	0.21	0.13	0.11	0.14
O2'	0.35	0.57	0.34	0.31	0.35	0.35	0.39	0.37	0.50	0.47	0.63	0.42	0.57	0.48	0.36	0.32	0.42	0.53	0.36	0.37	0.31	0.42
O3'	0.29	0.67	0.35	0.30	0.38	0.31	0.43	0.37	0.64	0.39	0.78	0.48	0.76	0.41	0.31	0.32	0.39	0.45	0.35	0.47	0.39	0.46
O4'	0.31	0.43	0.33	0.31	0.30	0.23	0.32	0.20	0.35	0.42	0.44	0.35	0.38	0.43	0.32	0.34	0.44	0.39	0.23	0.14	0.11	0.16
O5'	0.23	0.52	0.37	0.39	0.30	0.26	0.31	0.28	0.44	0.25	0.56	0.40	0.48	0.24	0.23	0.36	0.52	0.25	0.25	0.33	0.30	0.27
O6	0.18	0.47	0.20	0.19	0.31	0.17	0.36	0.20	0.50	0.17	0.54	0.36	0.59	0.26	0.20	0.19	0.26	0.19	0.16	0.22	0.15	0.17
OP1	0.25	0.54	0.38	0.39	0.33	0.26	0.34	0.29	0.47	0.27	0.58	0.42	0.51	0.28	0.26	0.37	0.52	0.26	0.27	0.38	0.35	0.31
OP2	0.34	0.63	0.48	0.51	0.44	0.41	0.45	0.46	0.58	0.33	0.67	0.52	0.64	0.36	0.35	0.47	0.62	0.30	0.43	0.54	0.50	0.47
P	0.23	0.52	0.38	0.41	0.31	0.29	0.31	0.34	0.44	0.22	0.55	0.41	0.47	0.22	0.23	0.37	0.55	0.23	0.32	0.43	0.39	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.09	0.19	0.09
C2	0.04	0.00	0.31	0.34	0.01	0.09	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.26	0.44	0.13	0.21	0.22	0.35	0.22
C2'	0.01	0.31	0.00	0.01	0.17	0.02	0.09	0.02	0.15	0.14	0.25	0.31	0.11	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.11	0.10	0.12	0.08
C3'	0.02	0.34	0.01	0.00	0.21	0.01	0.17	0.02	0.23	0.18	0.31	0.31	0.21	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.18	0.14	0.11	0.13
C4	0.02	0.01	0.17	0.21	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.24	0.07	0.17	0.17	0.27	0.18
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.12	0.09	0.08	0.12	0.13	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.08	0.12	0.03
C5	0.02	0.02	0.09	0.17	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.21	0.04	0.23	0.24	0.33	0.25
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.13	0.01	0.19	0.00	0.20	0.21	0.17	0.10	0.24	0.24	0.11	0.07	0.04	0.02	0.01	0.09	0.13	0.02
C6	0.03	0.01	0.15	0.23	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.29	0.06	0.26	0.29	0.40	0.30
C8	0.02	0.02	0.14	0.18	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.20	0.10	0.19	0.18	0.25	0.19
N1	0.04	0.01	0.25	0.31	0.02	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.20	0.39	0.10	0.25	0.27	0.40	0.28
N3	0.05	0.01	0.31	0.31	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.25	0.39	0.13	0.16	0.17	0.29	0.17
N6	0.02	0.02	0.11	0.21	0.01	0.12	0.01	0.24	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.10	0.28	0.05	0.30	0.36	0.45	0.36
N7	0.02	0.02	0.08	0.15	0.01	0.13	0.00	0.24	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.07	0.18	0.06	0.24	0.26	0.31	0.27
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.12	0.12	0.22	0.12
O2'	0.02	0.26	0.01	0.02	0.12	0.08	0.08	0.07	0.13	0.10	0.20	0.25	0.10	0.07	0.03	0.00	0.05	0.07	0.05	0.08	0.13	0.06
O3'	0.02	0.44	0.02	0.01	0.24	0.02	0.21	0.04	0.29	0.20	0.39	0.39	0.28	0.18	0.09	0.05	0.00	0.02	0.24	0.22	0.21	0.21
O4'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.10	0.10	0.13	0.05	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.17	0.14	0.25	0.16
O5'	0.07	0.21	0.11	0.18	0.17	0.02	0.23	0.01	0.26	0.19	0.25	0.16	0.30	0.24	0.12	0.05	0.24	0.17	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.09	0.22	0.10	0.14	0.17	0.08	0.24	0.09	0.29	0.18	0.27	0.17	0.36	0.26	0.12	0.08	0.22	0.14	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.35	0.12	0.11	0.27	0.12	0.33	0.13	0.40	0.25	0.40	0.29	0.45	0.31	0.22	0.13	0.21	0.25	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.22	0.08	0.13	0.18	0.03	0.25	0.02	0.30	0.19	0.28	0.17	0.36	0.27	0.12	0.06	0.21	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00