Doublet Group distance statistics: 51458

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.016, 0.032, 0.047, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.018, 0.035, 0.052, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.035 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.016, 0.034, 0.053, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.017, 0.036, 0.056, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.036 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.010, 0.032, 0.053, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.032 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.027, 0.054, 0.080, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.054 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.029, 0.068, 0.106, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.068 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.034, 0.075, 0.117, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.075 std_dev=0.041
OP2	B	0, 0.177, 0.317, 0.456, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.317 std_dev=0.140
O4'	A	0, 0.032, 0.203, 0.374, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.203 std_dev=0.171
C2'	A	0, 0.030, 0.235, 0.440, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.235 std_dev=0.205
O2'	A	0, 0.099, 0.346, 0.594, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.346 std_dev=0.248
C4'	A	0, 0.064, 0.320, 0.575, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.320 std_dev=0.255
P	B	0, 0.250, 0.540, 0.830, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.540 std_dev=0.290
C3'	A	0, 0.059, 0.368, 0.677, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.368 std_dev=0.309
C4'	B	0, 0.273, 0.588, 0.903, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.588 std_dev=0.315
OP1	B	0, 0.359, 0.735, 1.111, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.735 std_dev=0.376
O5'	B	0, 0.246, 0.622, 0.998, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.622 std_dev=0.376
C5	B	0, 0.548, 0.953, 1.357, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.953 std_dev=0.405
C8	B	0, 0.628, 1.033, 1.438, 1.308 max_d=1.308 avg_d=1.033 std_dev=0.405
N7	B	0, 0.630, 1.037, 1.444, 1.358 max_d=1.358 avg_d=1.037 std_dev=0.407
N9	B	0, 0.554, 0.972, 1.391, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.972 std_dev=0.418
N6	B	0, 0.563, 0.983, 1.404, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.983 std_dev=0.420
C6	B	0, 0.502, 0.925, 1.348, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.925 std_dev=0.423
O3'	A	0, 0.135, 0.570, 1.005, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.570 std_dev=0.435
C4	B	0, 0.463, 0.905, 1.346, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.905 std_dev=0.441
O5'	A	0, 0.322, 0.780, 1.238, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.780 std_dev=0.458
C2'	B	0, 0.424, 0.883, 1.342, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.883 std_dev=0.459
O4'	B	0, 0.473, 0.932, 1.392, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.932 std_dev=0.459
C5'	A	0, 0.136, 0.596, 1.057, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.596 std_dev=0.460
C1'	B	0, 0.508, 0.976, 1.443, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.976 std_dev=0.467
C3'	B	0, 0.194, 0.675, 1.155, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.675 std_dev=0.480
N1	B	0, 0.365, 0.852, 1.339, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.852 std_dev=0.487
N3	B	0, 0.334, 0.848, 1.361, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.848 std_dev=0.514
C2	B	0, 0.306, 0.836, 1.365, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.836 std_dev=0.530
C5'	B	0, 0.335, 0.866, 1.396, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.866 std_dev=0.530
P	A	0, 0.402, 0.952, 1.501, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.952 std_dev=0.550
OP2	A	0, 0.459, 1.028, 1.598, 1.618 max_d=1.618 avg_d=1.028 std_dev=0.569
OP1	A	0, 0.418, 1.048, 1.679, 1.744 max_d=1.744 avg_d=1.048 std_dev=0.630
O2'	B	0, 0.791, 1.574, 2.358, 2.418 max_d=2.418 avg_d=1.574 std_dev=0.784
O3'	B	0, 0.268, 1.199, 2.130, 2.471 max_d=2.471 avg_d=1.199 std_dev=0.931

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.05	0.12	0.16	0.14
C2	0.04	0.00	0.16	0.16	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.20	0.05	0.24	0.02	0.26	0.35	0.27
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.09	0.07	0.14	0.18	0.17	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.11	0.10	0.05
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.02	0.11	0.09	0.14	0.17	0.16	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.06	0.10	0.14	0.09	0.06
C4	0.03	0.02	0.09	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.24	0.03	0.26	0.33	0.27
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.07	0.05	0.06	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.09	0.08	0.04	0.02
C5	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.09	0.04	0.28	0.02	0.32	0.40	0.33
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.17	0.18	0.14	0.08	0.09	0.19	0.11	0.05	0.03	0.02	0.01	0.20	0.07	0.03	0.01
C6	0.04	0.01	0.09	0.11	0.02	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.13	0.04	0.29	0.01	0.34	0.43	0.35
C8	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.04	0.28	0.02	0.31	0.33	0.31
N1	0.04	0.01	0.14	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.18	0.04	0.27	0.02	0.31	0.41	0.32
N2	0.04	0.01	0.18	0.17	0.03	0.05	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.19	0.24	0.06	0.22	0.02	0.23	0.34	0.25
N3	0.05	0.01	0.17	0.16	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.19	0.05	0.23	0.02	0.23	0.32	0.25
N7	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.10	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.30	0.02	0.35	0.41	0.36
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.11	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.22	0.04	0.23	0.28	0.24
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.05	0.06	0.05	0.10	0.05	0.14	0.19	0.15	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.10	0.11	0.08	0.04
O3'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.12	0.02	0.09	0.03	0.13	0.11	0.18	0.24	0.19	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.14	0.12	0.24	0.17	0.16
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.13	0.05	0.11	0.14	0.14
O5'	0.13	0.24	0.03	0.06	0.24	0.02	0.28	0.01	0.29	0.28	0.27	0.22	0.23	0.30	0.22	0.04	0.14	0.13	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00
O6	0.05	0.02	0.08	0.10	0.03	0.09	0.02	0.20	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.10	0.12	0.05	0.31	0.00	0.39	0.47	0.39
OP1	0.12	0.26	0.11	0.14	0.26	0.08	0.32	0.07	0.34	0.31	0.31	0.23	0.23	0.35	0.23	0.11	0.24	0.11	0.01	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.35	0.10	0.09	0.33	0.04	0.40	0.03	0.43	0.33	0.41	0.34	0.32	0.41	0.28	0.08	0.17	0.14	0.01	0.47	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.27	0.05	0.06	0.27	0.02	0.33	0.01	0.35	0.31	0.32	0.25	0.25	0.36	0.24	0.04	0.16	0.14	0.00	0.39	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.22	0.25	0.19	0.22	0.17	0.21	0.21	0.21	0.21	0.21	0.23	0.22	0.23	0.21	0.32	0.28	0.20	0.13	0.06	0.07	0.07
C2	0.18	0.14	0.25	0.21	0.16	0.17	0.15	0.21	0.13	0.19	0.13	0.17	0.15	0.19	0.17	0.29	0.21	0.23	0.15	0.10	0.06	0.10
C2'	0.24	0.26	0.30	0.24	0.24	0.21	0.21	0.26	0.20	0.23	0.22	0.27	0.20	0.23	0.24	0.35	0.30	0.23	0.15	0.09	0.09	0.08
C3'	0.20	0.24	0.28	0.23	0.21	0.18	0.21	0.24	0.22	0.21	0.23	0.24	0.26	0.23	0.20	0.34	0.25	0.20	0.15	0.14	0.14	0.13
C4	0.19	0.17	0.30	0.23	0.19	0.16	0.18	0.20	0.16	0.22	0.15	0.19	0.16	0.23	0.20	0.38	0.23	0.20	0.16	0.09	0.08	0.10
C4'	0.21	0.31	0.24	0.18	0.26	0.17	0.27	0.21	0.30	0.22	0.32	0.28	0.34	0.25	0.22	0.31	0.30	0.20	0.12	0.08	0.09	0.07
C5	0.18	0.13	0.35	0.29	0.16	0.13	0.16	0.18	0.14	0.21	0.12	0.15	0.16	0.21	0.18	0.48	0.24	0.18	0.17	0.09	0.09	0.10
C5'	0.19	0.34	0.25	0.21	0.26	0.14	0.29	0.18	0.36	0.21	0.38	0.29	0.42	0.26	0.21	0.32	0.26	0.17	0.16	0.17	0.18	0.15
C6	0.16	0.11	0.37	0.33	0.13	0.12	0.14	0.19	0.13	0.19	0.10	0.12	0.15	0.19	0.16	0.50	0.28	0.19	0.17	0.10	0.10	0.11
C8	0.20	0.19	0.34	0.27	0.20	0.15	0.21	0.18	0.20	0.23	0.18	0.20	0.21	0.24	0.21	0.47	0.24	0.18	0.16	0.10	0.10	0.10
N1	0.15	0.11	0.32	0.28	0.13	0.13	0.14	0.18	0.13	0.19	0.11	0.13	0.16	0.19	0.15	0.40	0.21	0.21	0.16	0.08	0.06	0.10
N2	0.21	0.19	0.19	0.17	0.19	0.19	0.16	0.26	0.16	0.17	0.16	0.21	0.17	0.17	0.19	0.19	0.26	0.25	0.14	0.12	0.07	0.12
N3	0.21	0.19	0.26	0.21	0.21	0.19	0.18	0.23	0.16	0.22	0.16	0.21	0.15	0.21	0.21	0.30	0.27	0.23	0.16	0.09	0.06	0.10
N7	0.19	0.16	0.37	0.31	0.18	0.13	0.18	0.17	0.17	0.22	0.15	0.17	0.18	0.22	0.19	0.52	0.26	0.17	0.17	0.11	0.11	0.11
N9	0.20	0.19	0.29	0.23	0.21	0.16	0.21	0.20	0.19	0.22	0.18	0.21	0.20	0.24	0.21	0.39	0.24	0.19	0.15	0.08	0.08	0.09
O2'	0.30	0.36	0.30	0.25	0.32	0.28	0.27	0.30	0.26	0.26	0.30	0.37	0.23	0.25	0.30	0.35	0.43	0.30	0.18	0.10	0.11	0.11
O3'	0.23	0.28	0.30	0.25	0.24	0.22	0.21	0.29	0.22	0.22	0.25	0.28	0.24	0.22	0.23	0.34	0.29	0.24	0.19	0.18	0.17	0.17
O4'	0.21	0.27	0.24	0.19	0.25	0.18	0.26	0.21	0.29	0.23	0.28	0.25	0.32	0.26	0.22	0.31	0.29	0.21	0.15	0.09	0.09	0.10
O5'	0.15	0.16	0.34	0.33	0.13	0.16	0.16	0.21	0.19	0.18	0.19	0.13	0.26	0.19	0.14	0.41	0.21	0.14	0.28	0.30	0.29	0.27
O6	0.18	0.13	0.42	0.41	0.15	0.13	0.15	0.22	0.14	0.19	0.12	0.14	0.16	0.19	0.17	0.59	0.40	0.20	0.19	0.13	0.13	0.13
OP1	0.14	0.25	0.31	0.31	0.16	0.17	0.18	0.22	0.25	0.15	0.28	0.20	0.30	0.16	0.13	0.39	0.21	0.15	0.31	0.37	0.36	0.34
OP2	0.20	0.11	0.41	0.44	0.09	0.26	0.09	0.29	0.13	0.17	0.14	0.09	0.19	0.12	0.15	0.49	0.32	0.22	0.43	0.50	0.47	0.45
P	0.15	0.19	0.33	0.33	0.12	0.18	0.14	0.23	0.20	0.14	0.22	0.15	0.25	0.13	0.12	0.41	0.22	0.16	0.32	0.38	0.36	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.18	0.01	0.12	0.12	0.11	0.10
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.02	0.09	0.02	0.16	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.22	0.42	0.13	0.09	0.10	0.12	0.08
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.03	0.06	0.16	0.06	0.13	0.07	0.10	0.07	0.11	0.05	0.00	0.03	0.01	0.34	0.33	0.27	0.32
C3'	0.03	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.14	0.06	0.11	0.05	0.12	0.03	0.01	0.01	0.01	0.32	0.39	0.29	0.35
C4	0.01	0.02	0.06	0.03	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.28	0.07	0.13	0.12	0.13	0.11
C4'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.06	0.06	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.07	0.11	0.03
C5	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.21	0.04	0.19	0.16	0.16	0.16
C5'	0.06	0.16	0.16	0.02	0.08	0.01	0.07	0.00	0.10	0.08	0.14	0.14	0.10	0.07	0.06	0.12	0.11	0.02	0.01	0.09	0.17	0.03
C6	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.27	0.06	0.17	0.15	0.16	0.15
C8	0.02	0.03	0.13	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.17	0.06	0.07	0.26	0.20	0.19	0.21
N1	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.16	0.36	0.10	0.12	0.11	0.13	0.11
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.22	0.40	0.13	0.09	0.10	0.13	0.08
N6	0.02	0.03	0.07	0.05	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.02	0.08	0.23	0.06	0.21	0.19	0.20	0.20
N7	0.02	0.03	0.11	0.12	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.14	0.09	0.05	0.26	0.21	0.21	0.23
N9	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.17	0.01	0.16	0.14	0.14	0.13
O2'	0.02	0.22	0.00	0.01	0.10	0.04	0.06	0.12	0.09	0.17	0.16	0.22	0.08	0.14	0.02	0.00	0.05	0.02	0.36	0.42	0.36	0.38
O3'	0.18	0.42	0.03	0.01	0.28	0.02	0.21	0.11	0.27	0.06	0.36	0.40	0.23	0.09	0.17	0.05	0.00	0.12	0.22	0.44	0.26	0.31
O4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.10	0.13	0.06	0.05	0.01	0.02	0.12	0.00	0.13	0.12	0.26	0.15
O5'	0.12	0.09	0.34	0.32	0.13	0.02	0.19	0.01	0.17	0.26	0.12	0.09	0.21	0.26	0.16	0.36	0.22	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.12	0.10	0.33	0.39	0.12	0.07	0.16	0.09	0.15	0.20	0.11	0.10	0.19	0.21	0.14	0.42	0.44	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.12	0.27	0.29	0.13	0.11	0.16	0.17	0.16	0.19	0.13	0.13	0.20	0.21	0.14	0.36	0.26	0.26	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.08	0.32	0.35	0.11	0.03	0.16	0.03	0.15	0.21	0.11	0.08	0.20	0.23	0.13	0.38	0.31	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00