Doublet Group distance statistics: 51461

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.016, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.011, 0.031, 0.050, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.031 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.013, 0.037, 0.062, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.037 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.001, 0.146, 0.291, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.146 std_dev=0.145
C2'	A	0, 0.000, 0.170, 0.340, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.170 std_dev=0.170
O2'	A	0, 0.054, 0.229, 0.404, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.229 std_dev=0.175
C4'	A	0, 0.026, 0.255, 0.483, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.255 std_dev=0.229
P	B	0, 0.176, 0.411, 0.645, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.411 std_dev=0.235
C3'	A	0, -0.007, 0.253, 0.513, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.253 std_dev=0.260
OP1	B	0, 0.176, 0.452, 0.728, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.452 std_dev=0.276
O5'	A	0, 0.103, 0.442, 0.781, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.442 std_dev=0.339
O3'	A	0, 0.011, 0.381, 0.751, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.381 std_dev=0.370
OP2	B	0, 0.294, 0.666, 1.037, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.666 std_dev=0.372
C5'	A	0, 0.055, 0.441, 0.827, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.441 std_dev=0.386
OP2	A	0, 0.217, 0.614, 1.012, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.614 std_dev=0.397
P	A	0, 0.166, 0.570, 0.975, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.570 std_dev=0.405
O5'	B	0, 0.146, 0.605, 1.063, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.605 std_dev=0.458
OP1	A	0, 0.143, 0.777, 1.410, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.777 std_dev=0.633
C5'	B	0, 0.370, 1.714, 3.057, 3.820 max_d=3.820 avg_d=1.714 std_dev=1.343
C4'	B	0, 0.085, 1.527, 2.968, 3.915 max_d=3.915 avg_d=1.527 std_dev=1.442
O3'	B	0, 0.509, 1.998, 3.486, 4.125 max_d=4.125 avg_d=1.998 std_dev=1.488
O4'	B	0, 0.291, 2.038, 3.784, 4.759 max_d=4.759 avg_d=2.038 std_dev=1.747
C3'	B	0, 0.135, 1.912, 3.689, 4.754 max_d=4.754 avg_d=1.912 std_dev=1.777
C2'	B	0, 0.465, 2.568, 4.671, 5.532 max_d=5.532 avg_d=2.568 std_dev=2.103
O2'	B	0, 0.524, 2.714, 4.904, 5.220 max_d=5.220 avg_d=2.714 std_dev=2.190
C1'	B	0, 0.434, 2.655, 4.877, 5.752 max_d=5.752 avg_d=2.655 std_dev=2.222
N9	B	0, 0.504, 3.210, 5.916, 6.637 max_d=6.637 avg_d=3.210 std_dev=2.706
C8	B	0, 0.539, 3.256, 5.973, 6.558 max_d=6.558 avg_d=3.256 std_dev=2.717
N7	B	0, 0.604, 3.888, 7.173, 7.498 max_d=7.498 avg_d=3.888 std_dev=3.285
C4	B	0, 0.565, 3.903, 7.242, 7.771 max_d=7.771 avg_d=3.903 std_dev=3.338
C5	B	0, 0.608, 4.263, 7.918, 8.320 max_d=8.320 avg_d=4.263 std_dev=3.655
N3	B	0, 0.585, 4.243, 7.900, 8.339 max_d=8.339 avg_d=4.243 std_dev=3.658
C2	B	0, 0.635, 4.924, 9.212, 9.601 max_d=9.601 avg_d=4.924 std_dev=4.288
C6	B	0, 0.654, 4.981, 9.308, 9.765 max_d=9.765 avg_d=4.981 std_dev=4.327
N1	B	0, 0.665, 5.285, 9.906, 10.376 max_d=10.376 avg_d=5.285 std_dev=4.620
N6	B	0, 0.687, 5.426, 10.165, 10.613 max_d=10.613 avg_d=5.426 std_dev=4.739

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.14	0.01	0.17	0.32	0.19
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.13	0.11	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.08	0.05
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.08	0.05	0.11	0.15	0.12	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.08	0.04	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.13	0.00	0.16	0.28	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.05	0.05	0.04	0.10	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.04	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.03	0.16	0.00	0.22	0.35	0.23
C5'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.17	0.18	0.13	0.08	0.07	0.20	0.10	0.04	0.03	0.02	0.01	0.20	0.12	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.17	0.00	0.26	0.40	0.26
C8	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.06	0.14	0.01	0.18	0.25	0.19
N1	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.16	0.01	0.23	0.38	0.24
N2	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.18	0.03	0.14	0.02	0.16	0.32	0.18
N3	0.03	0.00	0.11	0.12	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.13	0.03	0.13	0.01	0.14	0.27	0.16
N7	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.05	0.16	0.01	0.25	0.35	0.25
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.12	0.21	0.14
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.04	0.07	0.03	0.09	0.13	0.10	0.04	0.01	0.00	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.06	0.05
O3'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.08	0.01	0.07	0.03	0.09	0.05	0.13	0.18	0.13	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.17	0.09	0.12	0.18	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.03	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.13	0.04	0.15	0.12	0.11
O5'	0.08	0.14	0.04	0.09	0.13	0.01	0.16	0.01	0.17	0.14	0.16	0.14	0.13	0.16	0.12	0.05	0.17	0.13	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.04	0.19	0.00	0.31	0.44	0.30
OP1	0.09	0.17	0.03	0.04	0.16	0.08	0.22	0.12	0.26	0.18	0.23	0.16	0.14	0.25	0.12	0.05	0.12	0.15	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.32	0.08	0.10	0.28	0.04	0.35	0.04	0.40	0.25	0.38	0.32	0.27	0.35	0.21	0.06	0.18	0.12	0.01	0.44	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.19	0.05	0.08	0.17	0.02	0.23	0.02	0.26	0.19	0.24	0.18	0.16	0.25	0.14	0.05	0.15	0.11	0.00	0.30	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.02	2.68	1.22	0.71	1.79	0.45	1.79	0.81	2.38	0.79	2.81	2.22	2.43	1.14	1.18	1.67	0.96	0.44	0.47	0.15	0.50	0.08
C2	1.07	2.22	1.16	0.51	1.84	0.28	1.97	0.64	2.23	1.27	2.33	1.98	2.26	1.67	1.39	1.35	0.71	0.55	0.40	0.12	0.45	0.06
C2'	1.13	2.81	1.43	1.06	1.80	0.75	1.69	1.02	2.31	0.71	2.91	2.32	2.22	0.91	1.20	1.90	1.31	0.56	0.60	0.24	0.48	0.11
C3'	1.18	2.88	1.44	1.06	1.87	0.80	1.81	1.04	2.47	0.83	3.03	2.37	2.49	1.06	1.28	1.90	1.29	0.64	0.64	0.27	0.41	0.14
C4	1.07	2.57	1.18	0.52	1.95	0.32	2.11	0.65	2.58	1.18	2.77	2.19	2.71	1.64	1.39	1.47	0.72	0.50	0.40	0.14	0.46	0.09
C4'	1.04	2.78	1.27	0.80	1.77	0.56	1.73	0.88	2.37	0.71	2.91	2.27	2.43	1.02	1.16	1.77	1.06	0.46	0.53	0.18	0.44	0.09
C5	1.11	2.54	1.16	0.41	2.02	0.22	2.29	0.46	2.72	1.42	2.80	2.17	2.95	1.93	1.50	1.34	0.51	0.55	0.31	0.16	0.43	0.14
C5'	1.04	2.81	1.23	0.72	1.82	0.55	1.84	0.87	2.50	0.81	2.98	2.29	2.64	1.16	1.20	1.71	0.97	0.47	0.57	0.18	0.35	0.11
C6	1.12	2.36	1.12	0.36	2.00	0.15	2.29	0.29	2.62	1.60	2.61	2.05	2.82	2.09	1.56	1.17	0.36	0.60	0.22	0.16	0.40	0.17
C8	1.09	2.72	1.18	0.49	2.00	0.31	2.19	0.58	2.77	1.21	2.99	2.26	3.02	1.69	1.41	1.48	0.64	0.50	0.37	0.16	0.45	0.12
N1	1.10	2.19	1.12	0.37	1.90	0.16	2.14	0.38	2.37	1.54	2.38	1.95	2.48	1.96	1.52	1.17	0.46	0.62	0.26	0.15	0.42	0.13
N2	1.01	1.94	1.15	0.57	1.65	0.31	1.71	0.74	1.88	1.19	1.98	1.78	1.88	1.51	1.29	1.33	0.82	0.59	0.44	0.09	0.42	0.08
N3	1.04	2.42	1.19	0.60	1.84	0.37	1.92	0.75	2.31	1.05	2.53	2.10	2.33	1.46	1.30	1.50	0.83	0.49	0.45	0.13	0.47	0.07
N7	1.11	2.65	1.16	0.40	2.05	0.23	2.32	0.45	2.83	1.40	2.94	2.23	3.13	1.93	1.50	1.36	0.49	0.54	0.30	0.16	0.42	0.15
N9	1.06	2.68	1.20	0.58	1.92	0.37	2.04	0.70	2.61	1.05	2.89	2.24	2.75	1.48	1.32	1.55	0.79	0.47	0.43	0.15	0.47	0.09
O2'	1.07	2.68	1.44	1.13	1.60	0.74	1.34	1.02	1.88	0.52	2.61	2.22	1.63	0.56	1.05	1.98	1.41	0.51	0.55	0.21	0.57	0.09
O3'	1.29	2.93	1.58	1.27	1.89	0.97	1.76	1.17	2.37	0.93	3.02	2.42	2.31	1.05	1.34	2.04	1.51	0.79	0.70	0.32	0.42	0.19
O4'	1.02	2.73	1.16	0.58	1.81	0.37	1.85	0.75	2.46	0.85	2.89	2.25	2.58	1.23	1.20	1.63	0.84	0.45	0.43	0.12	0.48	0.09
O5'	1.08	2.82	1.25	0.73	1.90	0.58	1.99	0.85	2.65	0.96	3.05	2.30	2.87	1.36	1.29	1.67	0.94	0.52	0.59	0.28	0.28	0.15
O6	1.12	2.29	1.09	0.37	1.98	0.16	2.33	0.10	2.63	1.73	2.57	1.98	2.89	2.22	1.60	1.03	0.21	0.64	0.12	0.17	0.36	0.24
OP1	1.12	2.88	1.28	0.76	1.94	0.65	2.03	0.89	2.69	1.00	3.11	2.35	2.92	1.40	1.33	1.70	0.96	0.60	0.66	0.33	0.19	0.21
OP2	1.12	2.79	1.23	0.71	1.97	0.68	2.17	0.89	2.82	1.17	3.09	2.28	3.15	1.64	1.39	1.56	0.89	0.63	0.73	0.45	0.14	0.31
P	1.07	2.82	1.21	0.65	1.93	0.57	2.06	0.83	2.72	1.04	3.08	2.30	2.99	1.47	1.32	1.59	0.85	0.53	0.63	0.31	0.19	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.00	0.44	0.97	0.44	0.50
C2	0.03	0.00	0.12	0.17	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.32	0.20	0.02	0.60	1.50	0.84	0.88
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.16	0.09	0.05	0.11	0.11	0.10	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.58	0.82	0.56	0.52
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.18	0.00	0.26	0.03	0.27	0.29	0.21	0.13	0.31	0.32	0.18	0.01	0.01	0.01	0.35	0.34	0.37	0.14
C4	0.01	0.01	0.07	0.18	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.12	0.01	0.58	1.47	0.87	0.88
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.13	0.07	0.05	0.12	0.13	0.07	0.20	0.03	0.00	0.01	0.35	0.32	0.11
C5	0.00	0.01	0.07	0.26	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.19	0.02	0.60	1.67	1.11	1.06
C5'	0.09	0.11	0.16	0.03	0.11	0.01	0.13	0.00	0.14	0.15	0.12	0.11	0.16	0.16	0.10	0.06	0.17	0.02	0.01	0.28	0.40	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.27	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.21	0.02	0.62	1.73	1.16	1.10
C8	0.01	0.02	0.05	0.29	0.01	0.13	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.22	0.03	0.55	1.55	1.07	1.01
N1	0.01	0.00	0.11	0.21	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.19	0.02	0.62	1.66	1.03	1.02
N3	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.19	0.02	0.57	1.37	0.72	0.78
N6	0.00	0.02	0.10	0.31	0.01	0.12	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.26	0.03	0.61	1.83	1.31	1.20
N7	0.01	0.02	0.06	0.32	0.01	0.13	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.26	0.03	0.57	1.72	1.25	1.14
N9	0.01	0.01	0.03	0.18	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.09	0.01	0.55	1.34	0.79	0.80
O2'	0.01	0.32	0.00	0.01	0.22	0.20	0.21	0.06	0.25	0.08	0.30	0.29	0.24	0.14	0.11	0.00	0.04	0.13	0.36	0.55	0.48	0.32
O3'	0.14	0.20	0.02	0.01	0.12	0.03	0.19	0.17	0.21	0.22	0.19	0.19	0.26	0.26	0.09	0.04	0.00	0.12	0.46	0.30	0.52	0.43
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.13	0.12	0.00	0.37	0.80	0.21	0.38
O5'	0.44	0.60	0.58	0.35	0.58	0.01	0.60	0.01	0.62	0.55	0.62	0.57	0.61	0.57	0.55	0.36	0.46	0.37	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.97	1.50	0.82	0.34	1.47	0.35	1.67	0.28	1.73	1.55	1.66	1.37	1.83	1.72	1.34	0.55	0.30	0.80	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.44	0.84	0.56	0.37	0.87	0.32	1.11	0.40	1.16	1.07	1.03	0.72	1.31	1.25	0.79	0.48	0.52	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.50	0.88	0.52	0.14	0.88	0.11	1.06	0.02	1.10	1.01	1.02	0.78	1.20	1.14	0.80	0.32	0.43	0.38	0.01	0.00	0.00	0.00