Doublet Group distance statistics: 51473

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 4, 5, 7, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N2	A	0, -0.001, 0.022, 0.044, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.022 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.011, 0.036, 0.061, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.036 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.038 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.006, 0.037, 0.068, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.037 std_dev=0.031
O3'	A	0, 0.051, 0.134, 0.218, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.134 std_dev=0.084
C3'	A	0, -0.056, 0.106, 0.268, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.106 std_dev=0.162
OP1	B	0, 0.179, 0.364, 0.549, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.364 std_dev=0.185
C2'	A	0, -0.089, 0.106, 0.300, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.106 std_dev=0.195
OP2	B	0, 0.094, 0.299, 0.505, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.299 std_dev=0.206
O4'	A	0, -0.097, 0.123, 0.342, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.123 std_dev=0.220
P	B	0, -0.027, 0.213, 0.453, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.213 std_dev=0.240
C4'	A	0, -0.159, 0.143, 0.444, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.143 std_dev=0.302
O2'	A	0, -0.130, 0.193, 0.516, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.193 std_dev=0.323
OP2	A	0, -0.056, 0.372, 0.799, 2.297 max_d=2.297 avg_d=0.372 std_dev=0.427
P	A	0, -0.151, 0.361, 0.872, 2.742 max_d=2.742 avg_d=0.361 std_dev=0.512
O5'	A	0, -0.208, 0.316, 0.840, 2.754 max_d=2.754 avg_d=0.316 std_dev=0.524
C5'	A	0, -0.290, 0.247, 0.784, 2.801 max_d=2.801 avg_d=0.247 std_dev=0.537
OP1	A	0, -0.144, 0.420, 0.983, 3.052 max_d=3.052 avg_d=0.420 std_dev=0.563
O5'	B	0, -0.372, 0.424, 1.220, 4.194 max_d=4.194 avg_d=0.424 std_dev=0.796
C5'	B	0, -0.567, 0.481, 1.529, 5.456 max_d=5.456 avg_d=0.481 std_dev=1.048
C4'	B	0, -0.909, 0.496, 1.901, 7.213 max_d=7.213 avg_d=0.496 std_dev=1.405
O4'	B	0, -0.985, 0.525, 2.034, 7.749 max_d=7.749 avg_d=0.525 std_dev=1.510
C3'	B	0, -1.199, 0.604, 2.406, 9.228 max_d=9.228 avg_d=0.604 std_dev=1.803
C1'	B	0, -1.288, 0.626, 2.540, 9.789 max_d=9.789 avg_d=0.626 std_dev=1.914
C6	B	0, -1.328, 0.597, 2.521, 9.815 max_d=9.815 avg_d=0.597 std_dev=1.924
C2'	B	0, -1.349, 0.678, 2.705, 10.375 max_d=10.375 avg_d=0.678 std_dev=2.027
N1	B	0, -1.445, 0.628, 2.700, 10.555 max_d=10.555 avg_d=0.628 std_dev=2.072
C5	B	0, -1.475, 0.610, 2.696, 10.603 max_d=10.603 avg_d=0.610 std_dev=2.086
O3'	B	0, -1.420, 0.685, 2.791, 10.756 max_d=10.756 avg_d=0.685 std_dev=2.106
O2'	B	0, -1.443, 0.775, 2.994, 11.362 max_d=11.362 avg_d=0.775 std_dev=2.218
C4	B	0, -1.710, 0.671, 3.052, 12.081 max_d=12.081 avg_d=0.671 std_dev=2.381
C2	B	0, -1.728, 0.722, 3.172, 12.458 max_d=12.458 avg_d=0.722 std_dev=2.450
O4	B	0, -1.794, 0.729, 3.251, 12.807 max_d=12.807 avg_d=0.729 std_dev=2.522
N3	B	0, -1.818, 0.740, 3.298, 12.994 max_d=12.994 avg_d=0.740 std_dev=2.558
O2	B	0, -1.888, 0.825, 3.539, 13.817 max_d=13.817 avg_d=0.825 std_dev=2.714

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.20	0.01	0.21	0.18	0.13
C2	0.02	0.00	0.11	0.03	0.00	0.12	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.07	0.14	0.29	0.01	0.26	0.28	0.23
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.04	0.09	0.11	0.10	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.19	0.07	0.27	0.30	0.20
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.15	0.10	0.06
C4	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.04	0.07	0.28	0.01	0.27	0.29	0.24
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.08	0.09	0.16	0.11	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.13	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.04	0.30	0.01	0.31	0.35	0.29
C5'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.14	0.08	0.15	0.10	0.12	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.06	0.17	0.15	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.07	0.31	0.00	0.32	0.37	0.30
C8	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.08	0.27	0.01	0.30	0.34	0.28
N1	0.02	0.00	0.09	0.03	0.01	0.09	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.06	0.12	0.31	0.00	0.30	0.33	0.28
N2	0.03	0.00	0.11	0.04	0.01	0.16	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.08	0.18	0.28	0.01	0.25	0.26	0.22
N3	0.02	0.00	0.10	0.03	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.06	0.14	0.27	0.01	0.25	0.26	0.21
N7	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.29	0.01	0.32	0.38	0.31
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.26	0.01	0.27	0.28	0.22
O2'	0.01	0.22	0.00	0.02	0.12	0.01	0.08	0.03	0.12	0.09	0.18	0.26	0.21	0.06	0.03	0.00	0.06	0.01	0.17	0.11	0.27	0.36	0.20
O3'	0.03	0.07	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.06	0.04	0.04	0.06	0.00	0.02	0.05	0.05	0.11	0.10	0.14
O4'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.12	0.18	0.14	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.06	0.15	0.06	0.05
O5'	0.20	0.29	0.19	0.04	0.28	0.01	0.30	0.00	0.31	0.27	0.31	0.28	0.27	0.29	0.26	0.17	0.05	0.16	0.00	0.32	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.05	0.06	0.32	0.00	0.34	0.40	0.33
OP1	0.21	0.26	0.27	0.15	0.27	0.09	0.31	0.17	0.32	0.30	0.30	0.25	0.25	0.32	0.27	0.27	0.11	0.15	0.02	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.28	0.30	0.10	0.29	0.13	0.35	0.15	0.37	0.34	0.33	0.26	0.26	0.38	0.28	0.36	0.10	0.06	0.02	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.23	0.20	0.06	0.24	0.09	0.29	0.01	0.30	0.28	0.28	0.22	0.21	0.31	0.22	0.20	0.14	0.05	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.13	0.27	0.21	0.20	0.30	0.17	0.49	0.10	0.10	0.16	0.17	0.26	0.23	0.28	0.19	0.36	0.15	0.17	0.11
C2	0.11	0.18	0.16	0.15	0.43	0.23	0.51	0.43	0.39	0.21	0.27	0.11	0.12	0.17	0.50	0.09	0.34	0.15	0.16	0.11
C2'	0.09	0.16	0.20	0.17	0.33	0.31	0.29	0.51	0.17	0.12	0.24	0.15	0.19	0.19	0.45	0.18	0.42	0.17	0.07	0.21
C3'	0.18	0.18	0.31	0.24	0.11	0.35	0.10	0.51	0.07	0.13	0.14	0.25	0.31	0.27	0.17	0.26	0.39	0.16	0.14	0.14
C4	0.19	0.34	0.12	0.09	0.52	0.17	0.48	0.41	0.36	0.29	0.44	0.29	0.12	0.11	0.61	0.09	0.30	0.14	0.15	0.09
C4'	0.19	0.23	0.35	0.26	0.17	0.31	0.12	0.46	0.13	0.18	0.22	0.27	0.36	0.28	0.17	0.23	0.31	0.23	0.27	0.08
C5	0.44	0.69	0.16	0.10	0.82	0.07	0.71	0.31	0.59	0.58	0.79	0.66	0.23	0.10	0.89	0.28	0.20	0.13	0.15	0.08
C5'	0.13	0.16	0.31	0.23	0.13	0.27	0.11	0.45	0.11	0.13	0.16	0.19	0.30	0.25	0.14	0.16	0.31	0.24	0.24	0.09
C6	0.60	0.84	0.27	0.18	0.95	0.14	0.88	0.23	0.78	0.76	0.93	0.79	0.35	0.18	0.98	0.44	0.14	0.13	0.15	0.09
C8	0.34	0.58	0.12	0.08	0.67	0.09	0.50	0.36	0.40	0.44	0.69	0.60	0.17	0.08	0.78	0.18	0.24	0.13	0.15	0.08
N1	0.39	0.53	0.11	0.07	0.73	0.06	0.77	0.30	0.66	0.54	0.62	0.45	0.19	0.06	0.76	0.28	0.20	0.14	0.15	0.08
N2	0.14	0.12	0.29	0.26	0.26	0.36	0.40	0.48	0.27	0.07	0.08	0.27	0.22	0.29	0.33	0.22	0.43	0.16	0.16	0.18
N3	0.09	0.12	0.23	0.20	0.32	0.29	0.37	0.47	0.25	0.12	0.18	0.14	0.19	0.22	0.40	0.15	0.37	0.15	0.16	0.12
N7	0.51	0.82	0.23	0.16	0.90	0.10	0.69	0.29	0.58	0.65	0.94	0.84	0.29	0.16	0.99	0.33	0.18	0.13	0.14	0.08
N9	0.16	0.31	0.14	0.11	0.45	0.19	0.37	0.43	0.26	0.24	0.40	0.29	0.14	0.12	0.55	0.08	0.31	0.14	0.15	0.09
O2'	0.08	0.18	0.16	0.14	0.48	0.33	0.44	0.54	0.27	0.15	0.32	0.13	0.15	0.18	0.65	0.21	0.48	0.27	0.12	0.34
O3'	0.29	0.35	0.39	0.29	0.16	0.41	0.08	0.51	0.12	0.26	0.30	0.46	0.40	0.33	0.14	0.37	0.39	0.17	0.19	0.13
O4'	0.15	0.18	0.33	0.25	0.13	0.29	0.10	0.45	0.11	0.14	0.17	0.22	0.33	0.27	0.14	0.19	0.30	0.24	0.28	0.09
O5'	0.23	0.27	0.12	0.12	0.24	0.11	0.21	0.25	0.21	0.23	0.27	0.29	0.13	0.11	0.26	0.15	0.17	0.35	0.42	0.23
O6	0.88	1.17	0.51	0.36	1.16	0.33	1.04	0.11	0.99	1.05	1.22	1.16	0.59	0.36	1.15	0.69	0.11	0.13	0.15	0.13
OP1	0.14	0.18	0.17	0.13	0.16	0.17	0.15	0.32	0.14	0.15	0.18	0.20	0.18	0.15	0.17	0.13	0.22	0.31	0.40	0.19
OP2	0.27	0.34	0.16	0.16	0.24	0.16	0.18	0.29	0.19	0.26	0.33	0.40	0.17	0.16	0.23	0.20	0.22	0.33	0.43	0.26
P	0.15	0.19	0.16	0.12	0.14	0.16	0.13	0.33	0.12	0.14	0.18	0.22	0.17	0.14	0.14	0.12	0.23	0.29	0.38	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.14	0.01	0.00	0.09	0.04	0.39	0.22
C2	0.01	0.00	0.14	0.14	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.01	0.10	0.08	0.05	0.47	0.19
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.10	0.13	0.01	0.10	0.26	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.13	0.19	0.08
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.17	0.00	0.15	0.02	0.12	0.11	0.17	0.15	0.02	0.01	0.19	0.02	0.09	0.18	0.15	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.09	0.00	0.02	0.25	0.31	0.73	0.43
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.12	0.04	0.04	0.07	0.16	0.02	0.08	0.00	0.01	0.16	0.11	0.04
C5	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.08	0.01	0.09	0.38	0.47	0.85	0.58
C5'	0.04	0.09	0.10	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.13	0.06	0.10	0.13	0.06	0.11	0.11	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.12	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.05	0.01	0.12	0.38	0.41	0.78	0.55
N1	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.05	0.01	0.01	0.17	0.14	0.56	0.33
N3	0.01	0.00	0.10	0.17	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.08	0.13	0.11	0.57	0.26
O2	0.03	0.00	0.26	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.25	0.08	0.01	0.17	0.12	0.20	0.33	0.06
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.17	0.16	0.29	0.06	0.29	0.09	0.05	0.25	0.00	0.05	0.18	0.11	0.13	0.08	0.25	0.20
O3'	0.14	0.07	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.11	0.05	0.05	0.08	0.08	0.05	0.00	0.11	0.09	0.11	0.24	0.11	0.03
O4	0.01	0.01	0.03	0.19	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.11	0.00	0.02	0.26	0.35	0.76	0.44
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.08	0.17	0.11	0.09	0.02	0.00	0.07	0.05	0.36	0.23
O5'	0.09	0.08	0.03	0.09	0.25	0.01	0.38	0.01	0.38	0.17	0.13	0.12	0.13	0.11	0.26	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.05	0.13	0.18	0.31	0.16	0.47	0.08	0.41	0.14	0.11	0.20	0.08	0.24	0.35	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.47	0.19	0.15	0.73	0.11	0.85	0.11	0.78	0.56	0.57	0.33	0.25	0.11	0.76	0.36	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.19	0.08	0.06	0.43	0.04	0.58	0.01	0.55	0.33	0.26	0.06	0.20	0.03	0.44	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00