Doublet Group distance statistics: 51474

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 7, 5, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.007, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.012, 0.027, 0.043, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.025 std_dev=0.019
OP1	B	0, 0.120, 0.269, 0.417, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.269 std_dev=0.148
P	B	0, 0.129, 0.301, 0.473, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.301 std_dev=0.172
OP2	B	0, 0.179, 0.381, 0.583, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.381 std_dev=0.202
OP2	A	0, 0.090, 0.347, 0.603, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.347 std_dev=0.257
O4'	A	0, -0.063, 0.221, 0.506, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.221 std_dev=0.285
C2'	A	0, -0.070, 0.258, 0.586, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.258 std_dev=0.328
O5'	B	0, 0.072, 0.416, 0.760, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.416 std_dev=0.344
C3'	A	0, -0.138, 0.261, 0.659, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.261 std_dev=0.398
C4'	A	0, -0.113, 0.293, 0.700, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.293 std_dev=0.407
C5'	B	0, 0.017, 0.498, 0.978, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.498 std_dev=0.481
O2'	A	0, -0.082, 0.464, 1.011, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.464 std_dev=0.547
O3'	A	0, -0.242, 0.325, 0.892, 2.845 max_d=2.845 avg_d=0.325 std_dev=0.567
O5'	A	0, -0.108, 0.515, 1.137, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.515 std_dev=0.623
C5'	A	0, -0.153, 0.530, 1.213, 2.133 max_d=2.133 avg_d=0.530 std_dev=0.683
P	A	0, -0.146, 0.665, 1.476, 2.379 max_d=2.379 avg_d=0.665 std_dev=0.811
C4'	B	0, -0.085, 0.728, 1.541, 3.169 max_d=3.169 avg_d=0.728 std_dev=0.813
C3'	B	0, -0.149, 0.808, 1.765, 3.666 max_d=3.666 avg_d=0.808 std_dev=0.957
C6	B	0, -0.041, 0.941, 1.923, 3.720 max_d=3.720 avg_d=0.941 std_dev=0.982
O4'	B	0, -0.101, 0.892, 1.884, 3.942 max_d=3.942 avg_d=0.892 std_dev=0.993
C5	B	0, -0.031, 0.990, 2.012, 3.819 max_d=3.819 avg_d=0.990 std_dev=1.022
O3'	B	0, -0.223, 0.816, 1.854, 3.975 max_d=3.975 avg_d=0.816 std_dev=1.039
C1'	B	0, -0.189, 1.053, 2.294, 4.859 max_d=4.859 avg_d=1.053 std_dev=1.242
C2'	B	0, -0.217, 1.041, 2.299, 4.878 max_d=4.878 avg_d=1.041 std_dev=1.258
N1	B	0, -0.184, 1.087, 2.357, 4.995 max_d=4.995 avg_d=1.087 std_dev=1.270
C4	B	0, -0.164, 1.204, 2.572, 5.262 max_d=5.262 avg_d=1.204 std_dev=1.368
O2'	B	0, -0.265, 1.148, 2.562, 5.529 max_d=5.529 avg_d=1.148 std_dev=1.413
O4	B	0, -0.155, 1.296, 2.747, 5.512 max_d=5.512 avg_d=1.296 std_dev=1.451
C2	B	0, -0.287, 1.318, 2.923, 6.443 max_d=6.443 avg_d=1.318 std_dev=1.605
N3	B	0, -0.274, 1.361, 2.995, 6.493 max_d=6.493 avg_d=1.361 std_dev=1.635
OP1	A	0, -0.521, 1.235, 2.991, 4.552 max_d=4.552 avg_d=1.235 std_dev=1.756
O2	B	0, -0.365, 1.493, 3.352, 7.629 max_d=7.629 avg_d=1.493 std_dev=1.859

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.11	0.01	0.39	0.19	0.19
C2	0.02	0.00	0.21	0.14	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.32	0.19	0.13	0.16	0.01	0.85	0.20	0.39
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.10	0.09	0.11	0.16	0.26	0.21	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.07	0.34	0.50	0.29
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.16	0.01	0.16	0.18	0.15	0.16	0.12	0.19	0.11	0.02	0.01	0.01	0.12	0.18	0.62	0.27	0.32
C4	0.01	0.01	0.11	0.12	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.10	0.08	0.17	0.01	0.91	0.20	0.41
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.05	0.08	0.06	0.08	0.04	0.15	0.02	0.01	0.02	0.05	0.13	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.06	0.05	0.20	0.01	1.18	0.21	0.53
C5'	0.04	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.06	0.11	0.06	0.08	0.06	0.10	0.06	0.07	0.11	0.01	0.01	0.08	0.13	0.35	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.08	0.07	0.20	0.00	1.23	0.21	0.55
C8	0.01	0.01	0.11	0.18	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.09	0.07	0.20	0.01	1.18	0.21	0.53
N1	0.02	0.00	0.16	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.13	0.11	0.18	0.01	1.06	0.21	0.48
N2	0.03	0.00	0.26	0.16	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.40	0.26	0.15	0.16	0.01	0.74	0.19	0.35
N3	0.02	0.00	0.21	0.12	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.30	0.20	0.13	0.15	0.01	0.72	0.19	0.34
N7	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.10	0.03	0.22	0.01	1.35	0.21	0.61
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.06	0.01	0.16	0.01	0.83	0.20	0.38
O2'	0.02	0.32	0.00	0.02	0.17	0.15	0.16	0.07	0.19	0.21	0.26	0.40	0.30	0.19	0.10	0.00	0.05	0.09	0.15	0.18	0.44	0.61	0.31
O3'	0.15	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.06	0.11	0.08	0.09	0.13	0.26	0.20	0.10	0.06	0.05	0.00	0.11	0.18	0.08	0.65	0.28	0.33
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.07	0.11	0.15	0.13	0.03	0.01	0.09	0.11	0.00	0.11	0.06	0.53	0.18	0.27
O5'	0.11	0.16	0.20	0.12	0.17	0.02	0.20	0.01	0.20	0.20	0.18	0.16	0.15	0.22	0.16	0.15	0.18	0.11	0.00	0.22	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.08	0.06	0.22	0.00	1.37	0.21	0.61
OP1	0.39	0.85	0.34	0.62	0.91	0.13	1.18	0.13	1.23	1.18	1.06	0.74	0.72	1.35	0.83	0.44	0.65	0.53	0.01	1.37	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.20	0.50	0.27	0.20	0.14	0.21	0.35	0.21	0.21	0.21	0.19	0.19	0.21	0.20	0.61	0.28	0.18	0.02	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.39	0.29	0.32	0.41	0.04	0.53	0.01	0.55	0.53	0.48	0.35	0.34	0.61	0.38	0.31	0.33	0.27	0.00	0.61	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.38	0.31	0.25	0.30	0.32	0.27	0.24	0.29	0.35	0.35	0.44	0.36	0.22	0.29	0.39	0.18	0.09	0.08	0.10
C2	0.27	0.26	0.20	0.15	0.19	0.23	0.18	0.20	0.19	0.23	0.23	0.30	0.21	0.11	0.19	0.30	0.13	0.11	0.08	0.08
C2'	0.65	0.68	0.55	0.45	0.58	0.53	0.52	0.44	0.54	0.62	0.65	0.74	0.58	0.37	0.57	0.64	0.37	0.17	0.26	0.27
C3'	0.68	0.70	0.57	0.46	0.56	0.55	0.49	0.43	0.52	0.63	0.65	0.78	0.63	0.38	0.54	0.66	0.35	0.14	0.18	0.22
C4	0.27	0.25	0.22	0.20	0.21	0.24	0.21	0.20	0.21	0.24	0.23	0.28	0.25	0.19	0.21	0.28	0.15	0.09	0.09	0.10
C4'	0.47	0.47	0.37	0.27	0.32	0.37	0.27	0.26	0.31	0.41	0.41	0.56	0.45	0.22	0.30	0.47	0.16	0.15	0.10	0.08
C5	0.21	0.20	0.22	0.21	0.21	0.21	0.22	0.18	0.21	0.20	0.20	0.20	0.24	0.24	0.22	0.21	0.14	0.12	0.12	0.12
C5'	0.53	0.51	0.44	0.33	0.35	0.42	0.30	0.29	0.35	0.45	0.45	0.60	0.54	0.28	0.32	0.52	0.19	0.14	0.08	0.07
C6	0.17	0.19	0.20	0.20	0.22	0.18	0.22	0.16	0.21	0.19	0.20	0.18	0.22	0.24	0.23	0.16	0.12	0.13	0.13	0.12
C8	0.28	0.26	0.28	0.26	0.24	0.26	0.24	0.21	0.25	0.26	0.25	0.28	0.32	0.28	0.24	0.27	0.16	0.11	0.11	0.12
N1	0.13	0.13	0.10	0.11	0.15	0.12	0.16	0.11	0.14	0.12	0.13	0.14	0.11	0.13	0.17	0.14	0.09	0.10	0.10	0.10
N2	0.37	0.35	0.28	0.21	0.25	0.30	0.22	0.25	0.25	0.32	0.31	0.41	0.29	0.14	0.24	0.39	0.17	0.17	0.09	0.09
N3	0.33	0.32	0.25	0.19	0.24	0.27	0.22	0.22	0.24	0.29	0.29	0.37	0.27	0.15	0.23	0.35	0.15	0.10	0.08	0.09
N7	0.26	0.25	0.29	0.28	0.25	0.26	0.25	0.20	0.25	0.26	0.25	0.26	0.33	0.31	0.26	0.25	0.16	0.13	0.13	0.13
N9	0.31	0.29	0.27	0.23	0.24	0.27	0.23	0.22	0.24	0.28	0.27	0.33	0.30	0.23	0.23	0.31	0.16	0.10	0.09	0.10
O2'	0.71	0.75	0.62	0.54	0.70	0.60	0.66	0.52	0.66	0.70	0.74	0.78	0.64	0.48	0.70	0.70	0.47	0.26	0.38	0.38
O3'	0.64	0.66	0.55	0.43	0.53	0.51	0.48	0.39	0.50	0.59	0.62	0.76	0.61	0.36	0.52	0.61	0.30	0.12	0.20	0.20
O4'	0.32	0.30	0.26	0.21	0.20	0.26	0.20	0.18	0.21	0.27	0.25	0.36	0.32	0.22	0.20	0.33	0.12	0.20	0.16	0.13
O5'	0.69	0.67	0.62	0.52	0.54	0.59	0.49	0.47	0.53	0.63	0.62	0.75	0.71	0.47	0.51	0.67	0.38	0.14	0.20	0.25
O6	0.31	0.32	0.35	0.33	0.33	0.31	0.32	0.24	0.31	0.32	0.33	0.33	0.38	0.37	0.33	0.28	0.16	0.18	0.16	0.15
OP1	1.34	1.33	1.41	1.39	1.22	1.32	1.18	1.22	1.21	1.29	1.29	1.38	1.45	1.46	1.20	1.27	1.21	1.10	1.09	1.09
OP2	0.28	0.26	0.32	0.30	0.26	0.26	0.28	0.20	0.28	0.27	0.26	0.27	0.39	0.34	0.26	0.25	0.19	0.19	0.17	0.18
P	0.92	0.90	0.90	0.83	0.78	0.84	0.73	0.72	0.77	0.86	0.86	0.97	0.98	0.83	0.76	0.87	0.68	0.48	0.52	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.07	0.06
C2	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.01	0.02	0.09	0.10	0.11	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.11	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.07	0.06	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.10	0.11	0.01	0.00	0.10	0.01	0.05	0.08	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.03	0.14	0.16	0.18	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.05	0.15	0.16	0.18	0.14
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.11	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.13	0.13	0.14	0.11
N1	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.09	0.09	0.10	0.07
N3	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.02	0.12	0.13	0.15	0.11
O2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.14	0.01	0.05	0.08	0.09	0.10	0.07
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.09	0.00	0.04	0.04	0.03	0.03	0.07	0.05	0.03
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.09	0.05	0.11	0.14	0.04	0.00	0.13	0.01	0.07	0.12	0.09	0.07
O4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.03	0.15	0.18	0.20	0.15
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.07	0.08	0.07
O5'	0.05	0.09	0.03	0.05	0.14	0.01	0.15	0.01	0.13	0.09	0.12	0.08	0.03	0.07	0.15	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.07	0.08	0.16	0.05	0.16	0.05	0.13	0.09	0.13	0.09	0.07	0.12	0.18	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.06	0.06	0.18	0.03	0.18	0.02	0.14	0.10	0.15	0.10	0.05	0.09	0.20	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.04	0.04	0.13	0.02	0.14	0.02	0.11	0.07	0.11	0.07	0.03	0.07	0.15	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00