Doublet Group distance statistics: 51478

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 3, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N2	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.033 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.024, 0.049, 0.074, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.049 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.021, 0.047, 0.073, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.047 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.026, 0.061, 0.096, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.061 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.038, 0.083, 0.127, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.083 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.244, 0.429, 0.614, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.429 std_dev=0.185
P	B	0, 0.206, 0.456, 0.707, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.456 std_dev=0.250
C2'	A	0, 0.330, 0.583, 0.836, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.583 std_dev=0.253
C4'	A	0, 0.342, 0.602, 0.862, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.602 std_dev=0.260
C5'	B	0, 0.225, 0.528, 0.832, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.528 std_dev=0.303
C3'	A	0, 0.469, 0.824, 1.180, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.824 std_dev=0.356
O2'	A	0, 0.458, 0.824, 1.190, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.824 std_dev=0.366
P	A	0, 0.416, 0.818, 1.220, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.818 std_dev=0.402
OP1	A	0, 0.296, 0.721, 1.146, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.721 std_dev=0.425
O5'	B	0, 0.630, 1.059, 1.488, 1.656 max_d=1.656 avg_d=1.059 std_dev=0.429
C3'	B	0, 0.384, 0.823, 1.261, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.823 std_dev=0.438
C4'	B	0, 0.425, 0.880, 1.335, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.880 std_dev=0.455
OP2	B	0, 0.158, 0.615, 1.073, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.615 std_dev=0.458
OP1	B	0, 0.401, 0.862, 1.322, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.862 std_dev=0.461
O5'	A	0, 0.594, 1.072, 1.551, 1.809 max_d=1.809 avg_d=1.072 std_dev=0.479
OP2	A	0, 0.691, 1.170, 1.649, 1.784 max_d=1.784 avg_d=1.170 std_dev=0.479
O3'	A	0, 0.666, 1.171, 1.677, 1.796 max_d=1.796 avg_d=1.171 std_dev=0.505
C5'	A	0, 0.697, 1.205, 1.712, 1.897 max_d=1.897 avg_d=1.205 std_dev=0.508
O4'	B	0, 0.761, 1.403, 2.046, 2.259 max_d=2.259 avg_d=1.403 std_dev=0.642
C2'	B	0, 0.685, 1.342, 2.000, 1.998 max_d=1.998 avg_d=1.342 std_dev=0.658
O3'	B	0, 0.759, 1.418, 2.076, 2.003 max_d=2.003 avg_d=1.418 std_dev=0.659
C6	B	0, 0.812, 1.472, 2.133, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.472 std_dev=0.660
C5	B	0, 0.844, 1.527, 2.210, 2.204 max_d=2.204 avg_d=1.527 std_dev=0.683
N1	B	0, 0.790, 1.511, 2.231, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.511 std_dev=0.721
C1'	B	0, 0.782, 1.519, 2.255, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.519 std_dev=0.737
C4	B	0, 0.845, 1.614, 2.382, 2.485 max_d=2.485 avg_d=1.614 std_dev=0.769
C2	B	0, 0.805, 1.606, 2.406, 2.511 max_d=2.511 avg_d=1.606 std_dev=0.800
N3	B	0, 0.836, 1.649, 2.462, 2.597 max_d=2.597 avg_d=1.649 std_dev=0.813
O4	B	0, 0.880, 1.726, 2.572, 2.726 max_d=2.726 avg_d=1.726 std_dev=0.846
O2	B	0, 0.812, 1.683, 2.553, 2.701 max_d=2.701 avg_d=1.683 std_dev=0.870
O2'	B	0, 0.981, 1.857, 2.732, 2.724 max_d=2.724 avg_d=1.857 std_dev=0.876

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.01	0.08	0.31	0.09
C2	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01	0.27	0.00	0.18	0.20	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.06	0.08	0.06	0.10	0.09	0.08	0.03	0.00	0.02	0.00	0.20	0.07	0.22	0.17	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.08	0.12	0.08	0.13	0.10	0.12	0.05	0.01	0.01	0.01	0.27	0.10	0.30	0.11	0.18
C4	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.28	0.00	0.16	0.21	0.12
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.07	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.28	0.05
C5	0.00	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.01	0.37	0.01	0.20	0.18	0.18
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.12	0.09	0.08	0.07	0.13	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.13	0.28	0.01
C6	0.00	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.12	0.01	0.38	0.00	0.23	0.18	0.21
C8	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.14	0.02	0.36	0.01	0.17	0.21	0.15
N1	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.34	0.00	0.21	0.18	0.18
N2	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.24	0.01	0.17	0.21	0.12
N3	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.23	0.00	0.15	0.23	0.11
N7	0.00	0.00	0.08	0.12	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.15	0.02	0.41	0.01	0.21	0.17	0.21
N9	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.25	0.01	0.13	0.25	0.10
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.10	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.06	0.17	0.21	0.06
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.12	0.14	0.11	0.16	0.11	0.15	0.06	0.03	0.00	0.01	0.24	0.15	0.39	0.09	0.23
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.02	0.04	0.41	0.17
O5'	0.10	0.27	0.20	0.27	0.28	0.01	0.37	0.01	0.38	0.36	0.34	0.24	0.23	0.41	0.25	0.08	0.24	0.07	0.00	0.42	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.02	0.42	0.00	0.25	0.20	0.25
OP1	0.08	0.18	0.22	0.30	0.16	0.11	0.20	0.13	0.23	0.17	0.21	0.17	0.15	0.21	0.13	0.17	0.39	0.04	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00
OP2	0.31	0.20	0.17	0.11	0.21	0.28	0.18	0.28	0.18	0.21	0.18	0.21	0.23	0.17	0.25	0.21	0.09	0.41	0.01	0.20	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.13	0.11	0.18	0.12	0.05	0.18	0.01	0.21	0.15	0.18	0.12	0.11	0.21	0.10	0.06	0.23	0.17	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.59	0.26	0.16	0.60	0.17	0.44	0.25	0.39	0.46	0.66	0.64	0.25	0.29	0.78	0.35	0.23	0.39	0.09	0.16
C2	0.39	0.59	0.24	0.16	0.64	0.16	0.51	0.24	0.43	0.48	0.65	0.61	0.21	0.32	0.76	0.37	0.23	0.36	0.10	0.16
C2'	0.42	0.60	0.31	0.21	0.58	0.22	0.42	0.32	0.39	0.47	0.65	0.65	0.32	0.29	0.75	0.35	0.19	0.41	0.17	0.20
C3'	0.45	0.62	0.34	0.24	0.61	0.25	0.45	0.35	0.42	0.50	0.68	0.68	0.35	0.31	0.77	0.37	0.18	0.37	0.13	0.17
C4	0.41	0.62	0.25	0.16	0.70	0.16	0.55	0.24	0.46	0.50	0.70	0.65	0.23	0.33	0.88	0.37	0.22	0.35	0.09	0.14
C4'	0.42	0.61	0.30	0.19	0.60	0.21	0.45	0.30	0.40	0.48	0.67	0.67	0.30	0.29	0.77	0.35	0.20	0.37	0.08	0.14
C5	0.44	0.65	0.25	0.17	0.76	0.16	0.63	0.23	0.52	0.54	0.74	0.66	0.22	0.36	0.94	0.40	0.20	0.32	0.16	0.12
C5'	0.41	0.60	0.28	0.20	0.61	0.21	0.45	0.33	0.40	0.47	0.67	0.66	0.28	0.32	0.78	0.34	0.23	0.30	0.09	0.09
C6	0.45	0.65	0.25	0.18	0.77	0.16	0.67	0.22	0.55	0.56	0.74	0.65	0.21	0.38	0.92	0.42	0.20	0.29	0.22	0.12
C8	0.43	0.65	0.26	0.16	0.73	0.16	0.58	0.24	0.49	0.52	0.74	0.67	0.23	0.34	0.93	0.39	0.21	0.33	0.13	0.12
N1	0.43	0.62	0.25	0.17	0.71	0.15	0.62	0.22	0.51	0.53	0.69	0.62	0.21	0.36	0.83	0.40	0.21	0.32	0.14	0.13
N2	0.36	0.53	0.23	0.16	0.49	0.17	0.38	0.25	0.35	0.42	0.55	0.56	0.21	0.28	0.56	0.34	0.25	0.36	0.23	0.19
N3	0.39	0.59	0.25	0.16	0.62	0.17	0.47	0.25	0.40	0.46	0.66	0.62	0.23	0.30	0.78	0.35	0.23	0.37	0.11	0.16
N7	0.45	0.66	0.26	0.17	0.78	0.16	0.64	0.24	0.53	0.55	0.76	0.67	0.23	0.37	0.96	0.41	0.20	0.31	0.19	0.12
N9	0.41	0.62	0.26	0.16	0.68	0.17	0.52	0.25	0.44	0.49	0.70	0.65	0.24	0.32	0.87	0.37	0.22	0.36	0.08	0.14
O2'	0.41	0.57	0.32	0.21	0.51	0.22	0.36	0.30	0.35	0.44	0.61	0.65	0.34	0.26	0.64	0.35	0.20	0.46	0.24	0.24
O3'	0.50	0.66	0.41	0.29	0.60	0.30	0.45	0.38	0.44	0.53	0.69	0.73	0.44	0.31	0.72	0.41	0.18	0.40	0.21	0.22
O4'	0.40	0.59	0.26	0.16	0.61	0.17	0.45	0.25	0.40	0.46	0.66	0.64	0.25	0.29	0.79	0.35	0.23	0.37	0.08	0.15
O5'	0.65	0.82	0.45	0.25	0.88	0.34	0.75	0.25	0.68	0.72	0.90	0.85	0.45	0.22	1.05	0.64	0.48	0.33	0.39	0.34
O6	0.47	0.66	0.26	0.19	0.79	0.16	0.72	0.22	0.59	0.58	0.75	0.65	0.22	0.40	0.93	0.44	0.19	0.24	0.32	0.13
OP1	0.64	0.83	0.43	0.21	0.87	0.29	0.73	0.24	0.66	0.71	0.90	0.86	0.44	0.24	1.04	0.59	0.35	0.27	0.27	0.20
OP2	0.50	0.69	0.31	0.25	0.78	0.24	0.64	0.33	0.56	0.58	0.78	0.71	0.30	0.42	0.97	0.45	0.23	0.28	0.19	0.11
P	0.57	0.76	0.36	0.18	0.83	0.25	0.69	0.24	0.61	0.65	0.84	0.78	0.35	0.29	1.01	0.53	0.31	0.26	0.25	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.22	0.25	0.58	0.36
C2	0.03	0.00	0.11	0.07	0.00	0.04	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.01	0.05	0.30	0.39	0.76	0.49
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.03	0.11	0.07	0.12	0.04	0.08	0.20	0.01	0.04	0.06	0.02	0.09	0.15	0.48	0.21
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.17	0.01	0.27	0.04	0.27	0.10	0.08	0.18	0.02	0.02	0.17	0.02	0.05	0.20	0.43	0.18
C4	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.15	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.20	0.01	0.02	0.22	0.53	0.81	0.54
C4'	0.03	0.04	0.03	0.01	0.15	0.00	0.21	0.02	0.21	0.09	0.07	0.08	0.03	0.03	0.15	0.01	0.02	0.10	0.32	0.08
C5	0.01	0.00	0.11	0.27	0.00	0.21	0.00	0.40	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.31	0.01	0.02	0.19	0.53	0.82	0.54
C5'	0.09	0.17	0.07	0.04	0.32	0.02	0.40	0.00	0.37	0.20	0.23	0.12	0.05	0.03	0.34	0.04	0.02	0.19	0.29	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.27	0.01	0.21	0.01	0.37	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.29	0.03	0.02	0.19	0.43	0.77	0.49
N1	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.09	0.02	0.02	0.24	0.36	0.71	0.45
N3	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.01	0.04	0.28	0.46	0.80	0.52
O2	0.04	0.01	0.20	0.18	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.20	0.26	0.01	0.08	0.34	0.36	0.73	0.47
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.07	0.03	0.10	0.20	0.00	0.07	0.06	0.06	0.04	0.16	0.41	0.12
O3'	0.03	0.10	0.04	0.02	0.20	0.03	0.31	0.03	0.29	0.09	0.10	0.26	0.07	0.00	0.20	0.03	0.25	0.46	0.47	0.35
O4	0.03	0.01	0.06	0.17	0.01	0.15	0.01	0.34	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.20	0.00	0.03	0.23	0.61	0.84	0.58
O4'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.08	0.06	0.03	0.03	0.00	0.25	0.33	0.49	0.38
O5'	0.22	0.30	0.09	0.05	0.22	0.02	0.19	0.02	0.19	0.24	0.28	0.34	0.04	0.25	0.23	0.25	0.00	0.06	0.04	0.01
OP1	0.25	0.39	0.15	0.20	0.53	0.10	0.53	0.19	0.43	0.36	0.46	0.36	0.16	0.46	0.61	0.33	0.06	0.00	0.01	0.01
OP2	0.58	0.76	0.48	0.43	0.81	0.32	0.82	0.29	0.77	0.71	0.80	0.73	0.41	0.47	0.84	0.49	0.04	0.01	0.00	0.05
P	0.36	0.49	0.21	0.18	0.54	0.08	0.54	0.02	0.49	0.45	0.52	0.47	0.12	0.35	0.58	0.38	0.01	0.01	0.05	0.00