Doublet Group distance statistics: 51479

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.007
O6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.037 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.014, 0.042, 0.069, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.042 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.016, 0.062, 0.107, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.062 std_dev=0.045
C2'	A	0, 0.016, 0.089, 0.162, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.089 std_dev=0.073
C3'	A	0, 0.021, 0.121, 0.221, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.121 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.013, 0.168, 0.323, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.168 std_dev=0.155
O3'	A	0, 0.033, 0.214, 0.395, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.214 std_dev=0.181
OP2	B	0, 0.114, 0.316, 0.518, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.316 std_dev=0.202
O2'	A	0, 0.032, 0.265, 0.497, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.265 std_dev=0.233
O5'	A	0, 0.041, 0.276, 0.511, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.276 std_dev=0.235
C5'	A	0, 0.003, 0.252, 0.502, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.252 std_dev=0.249
O5'	B	0, 0.213, 0.514, 0.816, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.514 std_dev=0.302
P	B	0, 0.044, 0.471, 0.897, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.471 std_dev=0.426
P	A	0, -0.026, 0.431, 0.889, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.431 std_dev=0.458
OP1	A	0, 0.011, 0.607, 1.204, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.607 std_dev=0.596
OP1	B	0, 0.108, 0.725, 1.341, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.725 std_dev=0.616
C5'	B	0, 0.063, 0.709, 1.355, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.709 std_dev=0.646
OP2	A	0, -0.055, 0.612, 1.280, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.612 std_dev=0.668
C4'	B	0, -0.081, 0.922, 1.925, 2.517 max_d=2.517 avg_d=0.922 std_dev=1.003
C3'	B	0, -0.006, 1.002, 2.011, 2.605 max_d=2.605 avg_d=1.002 std_dev=1.009
O4'	B	0, -0.077, 1.020, 2.117, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.020 std_dev=1.097
O3'	B	0, -0.041, 1.286, 2.614, 3.368 max_d=3.368 avg_d=1.286 std_dev=1.328
C2'	B	0, -0.065, 1.321, 2.707, 3.440 max_d=3.440 avg_d=1.321 std_dev=1.386
C1'	B	0, -0.136, 1.330, 2.796, 3.512 max_d=3.512 avg_d=1.330 std_dev=1.466
C2	B	0, -0.158, 1.315, 2.789, 3.545 max_d=3.545 avg_d=1.315 std_dev=1.474
N1	B	0, -0.166, 1.383, 2.933, 3.541 max_d=3.541 avg_d=1.383 std_dev=1.550
N3	B	0, -0.184, 1.455, 3.094, 3.826 max_d=3.826 avg_d=1.455 std_dev=1.639
O2	B	0, -0.239, 1.611, 3.460, 4.445 max_d=4.445 avg_d=1.611 std_dev=1.849
O2'	B	0, -0.128, 1.788, 3.704, 4.693 max_d=4.693 avg_d=1.788 std_dev=1.916
C6	B	0, -0.309, 1.977, 4.262, 4.945 max_d=4.945 avg_d=1.977 std_dev=2.285
C4	B	0, -0.348, 2.096, 4.539, 5.375 max_d=5.375 avg_d=2.096 std_dev=2.443
C5	B	0, -0.431, 2.448, 5.328, 6.183 max_d=6.183 avg_d=2.448 std_dev=2.880
O4	B	0, -0.430, 2.471, 5.373, 6.391 max_d=6.391 avg_d=2.471 std_dev=2.902

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.07	0.06
C2	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.05	0.02	0.13	0.01	0.16	0.28	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.09	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.07	0.06	0.02
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.03	0.00	0.00	0.03	0.06	0.09	0.11	0.05
C4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.01	0.13	0.01	0.15	0.24	0.19
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.03	0.05	0.03	0.08	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.06	0.06	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.02	0.18	0.00	0.24	0.32	0.25
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.13	0.14	0.10	0.04	0.04	0.16	0.07	0.07	0.03	0.01	0.00	0.15	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.07	0.02	0.19	0.00	0.28	0.37	0.28
C8	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.03	0.17	0.00	0.21	0.22	0.21
N1	0.03	0.00	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.05	0.02	0.17	0.01	0.23	0.34	0.25
N2	0.04	0.00	0.09	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.08	0.03	0.11	0.02	0.13	0.27	0.19
N3	0.04	0.00	0.07	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.05	0.02	0.10	0.00	0.12	0.22	0.16
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.21	0.01	0.28	0.33	0.27
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.11	0.01	0.12	0.17	0.14
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.11	0.07	0.09	0.07	0.13	0.01	0.16	0.22	0.16	0.04	0.03	0.00	0.02	0.09	0.04	0.12	0.03	0.02	0.05
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.02	0.07	0.03	0.07	0.10	0.05	0.08	0.05	0.10	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.08	0.13	0.16	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.06
O5'	0.03	0.13	0.02	0.03	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.17	0.17	0.11	0.10	0.21	0.11	0.04	0.05	0.02	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.08	0.02	0.21	0.00	0.33	0.41	0.31
OP1	0.03	0.16	0.07	0.09	0.15	0.06	0.24	0.05	0.28	0.21	0.23	0.13	0.12	0.28	0.12	0.03	0.13	0.04	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.28	0.06	0.11	0.24	0.02	0.32	0.01	0.37	0.22	0.34	0.27	0.22	0.33	0.17	0.02	0.16	0.06	0.01	0.41	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.20	0.02	0.05	0.19	0.01	0.25	0.01	0.28	0.21	0.25	0.19	0.16	0.27	0.14	0.05	0.09	0.06	0.01	0.31	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.68	0.65	0.45	0.10	2.18	0.08	2.52	0.36	1.96	1.10	1.19	0.21	0.44	0.23	2.67	0.28	0.27	0.43	0.22	0.35
C2	0.47	0.32	0.29	0.10	1.96	0.14	2.58	0.41	2.01	0.95	0.85	0.63	0.22	0.29	2.25	0.14	0.25	0.31	0.20	0.28
C2'	0.78	0.79	0.58	0.15	2.16	0.09	2.39	0.31	1.88	1.16	1.28	0.13	0.62	0.11	2.64	0.35	0.31	0.54	0.27	0.43
C3'	0.88	0.90	0.65	0.20	2.22	0.15	2.47	0.22	1.97	1.25	1.37	0.23	0.69	0.09	2.69	0.46	0.24	0.49	0.19	0.35
C4	0.64	0.59	0.40	0.08	2.26	0.07	2.75	0.35	2.13	1.13	1.15	0.34	0.35	0.26	2.69	0.27	0.23	0.38	0.19	0.29
C4'	0.75	0.74	0.51	0.11	2.15	0.07	2.44	0.31	1.92	1.14	1.24	0.11	0.52	0.20	2.61	0.35	0.26	0.44	0.19	0.33
C5	0.65	0.61	0.39	0.09	2.29	0.07	2.83	0.34	2.21	1.17	1.17	0.32	0.31	0.30	2.69	0.31	0.19	0.39	0.17	0.26
C5'	0.82	0.81	0.55	0.13	2.24	0.10	2.57	0.24	2.04	1.23	1.32	0.11	0.55	0.19	2.70	0.43	0.20	0.36	0.12	0.24
C6	0.57	0.50	0.32	0.10	2.15	0.10	2.77	0.36	2.19	1.09	1.04	0.43	0.22	0.34	2.48	0.26	0.17	0.36	0.16	0.22
C8	0.75	0.75	0.47	0.09	2.38	0.06	2.82	0.32	2.20	1.24	1.31	0.17	0.42	0.26	2.85	0.37	0.20	0.42	0.17	0.28
N1	0.48	0.35	0.27	0.12	1.98	0.15	2.65	0.41	2.09	0.98	0.88	0.60	0.18	0.34	2.25	0.17	0.20	0.32	0.18	0.24
N2	0.33	0.10	0.21	0.14	1.63	0.20	2.28	0.43	1.80	0.76	0.58	0.87	0.16	0.27	1.82	0.07	0.29	0.23	0.19	0.26
N3	0.56	0.46	0.36	0.08	2.10	0.10	2.61	0.38	2.01	1.02	1.00	0.48	0.31	0.24	2.48	0.20	0.26	0.34	0.20	0.30
N7	0.72	0.71	0.43	0.09	2.37	0.06	2.86	0.32	2.25	1.24	1.28	0.21	0.36	0.29	2.80	0.37	0.18	0.41	0.16	0.25
N9	0.70	0.68	0.45	0.09	2.31	0.07	2.72	0.34	2.11	1.17	1.24	0.22	0.41	0.24	2.78	0.32	0.23	0.41	0.19	0.30
O2'	0.57	0.56	0.42	0.12	1.76	0.15	1.95	0.46	1.50	0.88	0.99	0.17	0.48	0.21	2.20	0.18	0.47	0.66	0.42	0.58
O3'	0.94	0.96	0.72	0.25	2.10	0.21	2.28	0.18	1.85	1.25	1.38	0.38	0.80	0.10	2.52	0.50	0.25	0.52	0.20	0.37
O4'	0.66	0.64	0.42	0.10	2.17	0.09	2.52	0.36	1.96	1.10	1.18	0.22	0.40	0.28	2.64	0.28	0.26	0.39	0.20	0.31
O5'	0.90	0.89	0.62	0.20	2.39	0.17	2.76	0.17	2.21	1.34	1.42	0.12	0.60	0.15	2.84	0.52	0.14	0.31	0.09	0.16
O6	0.56	0.49	0.30	0.12	2.09	0.11	2.72	0.34	2.18	1.08	1.02	0.42	0.19	0.37	2.40	0.28	0.12	0.34	0.13	0.16
OP1	0.95	0.93	0.65	0.24	2.35	0.24	2.73	0.11	2.22	1.37	1.42	0.18	0.64	0.13	2.78	0.59	0.13	0.26	0.12	0.09
OP2	1.02	0.98	0.73	0.34	2.49	0.32	2.94	0.10	2.39	1.47	1.49	0.17	0.68	0.11	2.91	0.66	0.17	0.22	0.23	0.07
P	0.95	0.93	0.65	0.25	2.44	0.23	2.84	0.11	2.30	1.40	1.45	0.14	0.62	0.12	2.88	0.58	0.13	0.25	0.13	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.16	0.27	0.21
C2	0.06	0.00	0.08	0.27	0.01	0.23	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.24	0.01	0.18	0.41	0.28	0.19	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.18	0.05	0.04	0.20	0.00	0.01	0.10	0.00	0.19	0.21	0.17	0.21
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.23	0.00	0.54	0.00	0.57	0.13	0.11	0.69	0.01	0.00	0.23	0.02	0.29	0.24	0.15	0.19
C4	0.03	0.01	0.10	0.23	0.00	0.16	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.26	0.00	0.03	0.34	0.56	1.17	0.71
C4'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.16	0.00	0.43	0.01	0.47	0.09	0.12	0.53	0.04	0.02	0.15	0.00	0.03	0.16	0.21	0.08
C5	0.01	0.01	0.18	0.54	0.01	0.43	0.00	0.74	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.55	0.01	0.20	0.88	1.16	1.90	1.38
C5'	0.04	0.31	0.01	0.00	0.30	0.01	0.74	0.00	0.77	0.18	0.16	0.78	0.04	0.04	0.30	0.02	0.01	0.18	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.18	0.57	0.01	0.47	0.00	0.77	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.55	0.01	0.26	0.89	1.07	1.66	1.31
N1	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.09	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.03	0.17	0.31	0.62	0.44
N3	0.05	0.00	0.04	0.11	0.00	0.12	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.01	0.12	0.22	0.08	0.34	0.07
O2	0.09	0.00	0.20	0.69	0.01	0.53	0.01	0.78	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.66	0.01	0.33	0.93	0.84	0.92	0.84
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.04	0.04	0.08	0.04	0.09	0.03	0.09	0.24	0.00	0.02	0.04	0.08	0.14	0.18	0.15	0.18
O3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.26	0.02	0.55	0.04	0.55	0.12	0.09	0.66	0.02	0.00	0.27	0.02	0.35	0.25	0.24	0.17
O4	0.03	0.01	0.10	0.23	0.00	0.15	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.27	0.00	0.02	0.35	0.59	1.25	0.73
O4'	0.00	0.18	0.00	0.02	0.03	0.00	0.20	0.02	0.26	0.03	0.12	0.33	0.08	0.02	0.02	0.00	0.20	0.14	0.15	0.08
O5'	0.06	0.41	0.19	0.29	0.34	0.03	0.88	0.01	0.89	0.17	0.22	0.93	0.14	0.35	0.35	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.16	0.28	0.21	0.24	0.56	0.16	1.16	0.18	1.07	0.31	0.08	0.84	0.18	0.25	0.59	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.19	0.17	0.15	1.17	0.21	1.90	0.35	1.66	0.62	0.34	0.92	0.15	0.24	1.25	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.20	0.21	0.19	0.71	0.08	1.38	0.02	1.31	0.44	0.07	0.84	0.18	0.17	0.73	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00