Doublet Group distance statistics: 51483

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.012, 0.029, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.033 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.019, 0.039, 0.059, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.039 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.019, 0.040, 0.060, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.040 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.020, 0.041, 0.062, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.041 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.020, 0.044, 0.067, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.044 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.020, 0.044, 0.068, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.044 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.026, 0.053, 0.080, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.053 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.027, 0.057, 0.087, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.057 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.023, 0.054, 0.085, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.054 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.038, 0.076, 0.114, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.076 std_dev=0.038
O4'	A	0, 0.054, 0.160, 0.266, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.160 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.080, 0.212, 0.343, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.212 std_dev=0.132
O2'	A	0, 0.108, 0.243, 0.378, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.243 std_dev=0.135
C4'	A	0, 0.049, 0.252, 0.454, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.252 std_dev=0.202
C3'	A	0, 0.088, 0.297, 0.506, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.297 std_dev=0.209
O5'	A	0, 0.162, 0.377, 0.593, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.377 std_dev=0.216
P	A	0, 0.096, 0.338, 0.580, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.338 std_dev=0.242
OP2	A	0, 0.269, 0.544, 0.819, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.544 std_dev=0.275
OP2	B	0, 0.181, 0.472, 0.762, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.472 std_dev=0.291
O3'	A	0, 0.194, 0.486, 0.778, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.486 std_dev=0.292
P	B	0, 0.223, 0.541, 0.859, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.541 std_dev=0.318
C5'	A	0, 0.025, 0.354, 0.684, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.354 std_dev=0.330
O5'	B	0, 0.215, 0.549, 0.883, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.549 std_dev=0.334
OP1	B	0, 0.296, 0.633, 0.971, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.633 std_dev=0.337
OP1	A	0, 0.285, 0.635, 0.985, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.635 std_dev=0.350
C5'	B	0, 0.309, 0.672, 1.036, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.672 std_dev=0.364
C6	B	0, 0.277, 0.678, 1.080, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.678 std_dev=0.401
C4'	B	0, 0.337, 0.749, 1.160, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.749 std_dev=0.411
O4'	B	0, 0.358, 0.770, 1.183, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.770 std_dev=0.413
C5	B	0, 0.311, 0.773, 1.234, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.773 std_dev=0.461
C3'	B	0, 0.320, 0.782, 1.244, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.782 std_dev=0.462
O2'	B	0, 0.292, 0.769, 1.245, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.769 std_dev=0.476
C2'	B	0, 0.335, 0.815, 1.295, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.815 std_dev=0.480
C1'	B	0, 0.390, 0.874, 1.358, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.874 std_dev=0.484
N1	B	0, 0.371, 0.864, 1.358, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.864 std_dev=0.493
O3'	B	0, 0.327, 0.852, 1.376, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.852 std_dev=0.525
C4	B	0, 0.432, 1.047, 1.663, 1.889 max_d=1.889 avg_d=1.047 std_dev=0.615
C2	B	0, 0.473, 1.118, 1.763, 1.973 max_d=1.973 avg_d=1.118 std_dev=0.645
N3	B	0, 0.496, 1.184, 1.873, 2.124 max_d=2.124 avg_d=1.184 std_dev=0.688
O4	B	0, 0.458, 1.169, 1.880, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.169 std_dev=0.711
O2	B	0, 0.574, 1.351, 2.128, 2.398 max_d=2.398 avg_d=1.351 std_dev=0.777

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.17	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.09	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.04	0.21	0.01	0.16	0.12	0.08
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.06	0.11	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.15	0.03	0.08	0.21	0.09
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.08	0.05	0.09	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.19	0.04	0.10	0.29	0.15
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.23	0.00	0.16	0.12	0.08
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.11	0.03
C5	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.29	0.00	0.17	0.14	0.12
C5'	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.05	0.06	0.11	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.30	0.00	0.17	0.14	0.13
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.30	0.01	0.17	0.14	0.11
N1	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.03	0.26	0.01	0.16	0.13	0.10
N2	0.02	0.01	0.11	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.05	0.19	0.01	0.16	0.11	0.07
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.06	0.04	0.19	0.00	0.16	0.11	0.06
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.33	0.01	0.18	0.15	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.21	0.01	0.16	0.11	0.07
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.07	0.12	0.08	0.03	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.03	0.09	0.19	0.03
O3'	0.03	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.06	0.05	0.09	0.06	0.10	0.06	0.08	0.04	0.05	0.00	0.02	0.13	0.06	0.11	0.32	0.16
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.20	0.03	0.14
O5'	0.09	0.21	0.15	0.19	0.23	0.01	0.29	0.01	0.30	0.30	0.26	0.19	0.19	0.33	0.21	0.06	0.13	0.03	0.00	0.33	0.02	0.03	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.33	0.00	0.19	0.16	0.16
OP1	0.17	0.16	0.08	0.10	0.16	0.07	0.17	0.06	0.17	0.17	0.16	0.16	0.16	0.18	0.16	0.09	0.11	0.20	0.02	0.19	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.12	0.21	0.29	0.12	0.11	0.14	0.11	0.14	0.14	0.13	0.11	0.11	0.15	0.11	0.19	0.32	0.03	0.03	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.09	0.15	0.08	0.03	0.12	0.02	0.13	0.11	0.10	0.07	0.06	0.15	0.07	0.03	0.16	0.14	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.26	0.22	0.23	0.33	0.22	0.27	0.21	0.21	0.21	0.31	0.26	0.22	0.26	0.41	0.22	0.22	0.18	0.18	0.17
C2	0.21	0.21	0.22	0.23	0.28	0.23	0.24	0.22	0.18	0.19	0.25	0.22	0.23	0.26	0.34	0.23	0.23	0.20	0.18	0.18
C2'	0.19	0.25	0.20	0.21	0.34	0.20	0.29	0.20	0.22	0.21	0.31	0.24	0.20	0.24	0.42	0.19	0.19	0.16	0.16	0.15
C3'	0.19	0.25	0.20	0.21	0.32	0.20	0.26	0.20	0.20	0.20	0.30	0.25	0.21	0.25	0.38	0.19	0.20	0.16	0.16	0.15
C4	0.21	0.25	0.22	0.24	0.31	0.22	0.26	0.22	0.20	0.21	0.29	0.26	0.23	0.27	0.38	0.23	0.23	0.18	0.16	0.17
C4'	0.22	0.26	0.22	0.23	0.32	0.21	0.25	0.21	0.20	0.22	0.30	0.27	0.23	0.27	0.38	0.22	0.22	0.17	0.18	0.17
C5	0.22	0.27	0.23	0.25	0.32	0.23	0.26	0.23	0.20	0.22	0.31	0.28	0.24	0.29	0.38	0.22	0.23	0.17	0.16	0.17
C5'	0.21	0.25	0.22	0.23	0.28	0.21	0.22	0.21	0.18	0.21	0.29	0.27	0.22	0.27	0.34	0.22	0.21	0.16	0.17	0.16
C6	0.22	0.26	0.23	0.25	0.30	0.23	0.25	0.23	0.20	0.22	0.29	0.28	0.24	0.29	0.36	0.22	0.23	0.17	0.16	0.18
C8	0.22	0.28	0.23	0.25	0.33	0.23	0.26	0.23	0.21	0.23	0.32	0.30	0.24	0.29	0.40	0.23	0.23	0.17	0.17	0.17
N1	0.21	0.23	0.22	0.24	0.28	0.23	0.24	0.23	0.19	0.20	0.26	0.24	0.23	0.28	0.34	0.23	0.23	0.18	0.14	0.17
N2	0.21	0.19	0.22	0.23	0.25	0.23	0.22	0.22	0.17	0.18	0.21	0.19	0.23	0.26	0.30	0.24	0.24	0.22	0.24	0.21
N3	0.21	0.22	0.22	0.23	0.29	0.22	0.25	0.22	0.19	0.20	0.26	0.23	0.22	0.26	0.36	0.23	0.23	0.20	0.19	0.18
N7	0.22	0.29	0.24	0.25	0.33	0.23	0.26	0.23	0.21	0.23	0.33	0.31	0.25	0.30	0.39	0.22	0.23	0.17	0.17	0.18
N9	0.22	0.26	0.23	0.24	0.33	0.22	0.26	0.22	0.20	0.22	0.31	0.27	0.23	0.27	0.40	0.23	0.22	0.18	0.17	0.17
O2'	0.17	0.25	0.18	0.19	0.37	0.18	0.32	0.18	0.23	0.21	0.32	0.23	0.18	0.22	0.45	0.18	0.18	0.15	0.16	0.14
O3'	0.18	0.24	0.19	0.20	0.31	0.19	0.27	0.19	0.20	0.20	0.29	0.24	0.20	0.24	0.38	0.18	0.19	0.14	0.15	0.14
O4'	0.23	0.27	0.24	0.24	0.32	0.23	0.25	0.21	0.21	0.23	0.31	0.28	0.24	0.27	0.39	0.25	0.23	0.19	0.19	0.18
O5'	0.31	0.29	0.32	0.32	0.26	0.30	0.21	0.25	0.23	0.27	0.28	0.31	0.32	0.35	0.30	0.34	0.30	0.23	0.25	0.23
O6	0.22	0.28	0.24	0.26	0.30	0.24	0.25	0.25	0.20	0.23	0.30	0.30	0.26	0.32	0.35	0.22	0.24	0.18	0.22	0.20
OP1	0.16	0.25	0.17	0.17	0.32	0.17	0.24	0.20	0.18	0.18	0.31	0.26	0.17	0.19	0.41	0.16	0.18	0.20	0.18	0.19
OP2	0.18	0.22	0.18	0.19	0.27	0.17	0.19	0.15	0.13	0.17	0.27	0.25	0.19	0.22	0.36	0.20	0.18	0.13	0.11	0.11
P	0.17	0.22	0.18	0.18	0.27	0.16	0.19	0.14	0.13	0.16	0.27	0.25	0.18	0.21	0.35	0.18	0.16	0.11	0.11	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.07	0.07
C2	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.17	0.20	0.20	0.21
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.07	0.07	0.01	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.28	0.35	0.34	0.36
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.05	0.06	0.02	0.04	0.02	0.10	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04
C5	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.11	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.30	0.35	0.30	0.36
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.20	0.00	0.22	0.00	0.19	0.11	0.15	0.05	0.04	0.03	0.22	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.04	0.25	0.27	0.18	0.26
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.16	0.17	0.14	0.17
N3	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.23	0.28	0.28	0.29
O2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.08	0.02	0.02	0.13	0.15	0.18	0.17
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.07
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.02	0.11	0.03	0.10	0.05	0.07	0.08	0.03	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.09	0.07
O4	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.10	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.09	0.00	0.03	0.31	0.39	0.40	0.40
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.05	0.10	0.06
O5'	0.06	0.17	0.05	0.05	0.28	0.01	0.30	0.01	0.25	0.16	0.23	0.13	0.05	0.08	0.31	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.20	0.04	0.02	0.35	0.03	0.35	0.03	0.27	0.17	0.28	0.15	0.04	0.03	0.39	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.20	0.07	0.07	0.34	0.05	0.30	0.02	0.18	0.14	0.28	0.18	0.07	0.09	0.40	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.21	0.07	0.06	0.36	0.04	0.36	0.02	0.26	0.17	0.29	0.17	0.07	0.07	0.40	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00